医学文献检索

.9中国医科大学医学信息系医学文献检索医学文献检索1/86为何要学习文件检索？科学研究普通工作流程：

检索相关研究分析现有研究结果发觉问题提出假说

制订试验方案

定义试验步骤

试验

数据汇总

数据可视化

数据验证

调整试验

重新校验假说

写作研究论文

发表研究论文发觉问题试验数据分析发觉研究活动：重复、重复、动态、以人为中心依赖于各种不一样资源医学文献检索2/86为何要学习文件检索？据美国科学基金会统计，一个科研人员花费在查找和消化科技资料上时间需占全部科研时间51%，计划思索占8%，试验研究占32%，书面总结占9%。由上述统计数字能够看出，科研人员花费在科技出版物上时间为全部科研时间60%。医学文献检索3/86基础知识一.文件及其类型

1.文件(documents，literature)：是统计有知识一切载体。四要素：（1）统计知识详细内容（2）统计知识伎俩，如文字、图像、符号、声频、视频等（3）统计知识物质载体，如纸张、光盘、录像带等（4）统计知识表现形态，如图书、期刊、专利说明书等医学文献检索4/86基础知识2.文件类型：（按载体类型、出版形式、内容加工深度、获取难易程度等进行分类）

A.文件按内容加工深度可分四类：（1）一次文件（PrimaryDocument)：指作者以其本人研究结果（如试验、观察、调查研究等结果）为基本素材写成原始创作。

所统计是作者最新发觉或创造，以及新看法、新理论、新方法等新奇、详细而详尽知识，因而成为科学研究等工作最主要信息起源，尤其是期刊论文，已成为科技文件主体，但因为其量大、分散而无序，给读者查找和利用带来了极大不便。（2）二次文件（SecondaryDocument)：即检索工具，是指将大量无序、分散一次文件搜集、整理、加工、著录其特征如著者、篇名、分类、主题、出处等，并按一定次序加以编排，形成供读者检索所需一次文件线索新文件形式。包含索引、文摘、目录及对应数据库。

医学文献检索5/86基础知识（3）三次文件(TertiaryDocument)：科技人员围绕某一主题，利用二次文件检索，在吸收一次文件内容基础上，即经过阅读、分析、归纳、概括，撰写而成新文件，或综述已取得结果进展，或加评论、或预测发展趋势。形如综述（review）、述评（comment）、进展（advance;progress）、现实状况（update）、发展趋势（trend）等期刊文件和百科全书、年鉴、手册等参考工具书。（4）零次文件(ZeroDocument)：指未经信息加工，直接统计在载体上原始信息，如试验数据、观察统计、调查材料等。医学文献检索6/86

研究活动（试验、观察、思索）

信息直接统计或传递

零次文件（创造知识素材）

将知识以文字等形式固化

一次文件（初始知识产品）

将分散文件序列化

二次文件（一次文件替换品）将知识重新组合，使知识序列化

三次文件（浓缩新信息产品）各级文件形成及相互关系医学文献检索7/86基础知识B.文件按获取难易程度可分三类：

(1)白色文件：完全公开

(2)黑色文件：完全不公开

(3)灰色文件：内部交流医学文献检索8/86基础知识3.文件信息特点（1）数量庞大，增加快速（2）文种繁多，但呈显著英文化趋势（3）内容交叉重复（4）文件形式展现多样化（5）文件分布既集中又分散，但呈专题化或专集化趋势（6）知识老化加紧，文件寿命（半衰期）缩短（7）交流传输及改变速度加紧医学文献检索9/86基础知识4.文件信息社会功效（作用）（1）是科学表现形式，是聚集人类财富主要场所（2）是衡量科学技术水平主要依据（3）是传输科学知识最基本、最主要伎俩（4）是确认科学发觉与技术创造优先权认证统计医学文献检索10/86基础知识5.医学文件结构（1）图书结构：主要包含封面、封底、书脊、书名页、出版说明、序言（序）、目次、附录、后记等。参考文件格式(NLM采取ANSI标准格式）

Norman

IJ,

Redfern

SJ,editors.

Mental

health

care

for

elderly

people.

New

York:

Churchill

Livingstone

;1996医学文献检索11/86基础知识书中章节：

Philips

SJ,

Whisnant

JP.

Hypertension

and

stroke.

In:

Laragh

JH,

Brenner

BM,

editors.

Hypertension:

pathophysiology,

diagnosis,

and

management.

2nd

ed.

New

York:

Raven

Press;

1995.p.465-78.医学文献检索12/86基础知识

（2）期刊论文结构：期刊论文包含文章题目、作者、摘要、关键词、（分类号）、正文、参考文件。参考文件格式：

1)

Vega

KJ,

Pina

I,

Krevsky

B.

Heart

transplantation

is

associated

with

an

increased

risk

for

pancreatobiliary

disease.

Am

Intern

Med

1996

Jun

1;124(11):980-3医学文献检索13/86基础知识

2)

Semin

Oncol

1996;23(1

Suppl

2):80-97

3)

Clin

Orthop

1995;(320):110-4医学文献检索14/86基础知识6.参考工具书类型与使用参考工具书（reference

books,

reference

tools)是聚集某一学科范围知识信息，按照一定体例和检索方法编排而成专供查考资料或资料线索特种图书。类型：词典、百科全书、年鉴、手册、名目、医学图谱、药典等。

医学文献检索15/86基础知识参考工具书特点：

查考性：参考工具书编写目标是综合某首先知识，供人们查询考证处理特定问题；而普通图书提供比较系统知识和观点、供人们系统学习和阅读。概括性：参考工具书内容取材广泛，提供信息完整翔实又高度概括，含有一定权威性；而普通图书围绕某一特定问题或学科做深入、系统地阐述，内容比较连贯完整。

易检性：参考工具书在编制上含有严谨结构、详细体例和各种检索路径，便于快速查找；而普通图书普通按照学科或问题本身系统分章节叙述。

医学文献检索16/86基础知识二.检索语言检索语言是用于描述信息系统中信息内容特征或外表特征和表示用户信息提问专门语言，是人与信息系统对话媒介。在各种信息检索系统中，信息都必须被标引或赋予某种简练，大多数还含有唯一性、科学性、实用性及一定权威性和标准化标识或编码，即便于计算机处理，又有利于信息广泛交流与共享。医学文献检索17/86检索语言检索语言主要包含：文件外表特征检索语言和文件内容特征检索语言。前者是以文件外表特征作为标识和检索点而设计检索语言，主要应用有：文件题名索引系统、著者索引系统、文件序号索引系统和引文索引系统后者是以文件内容特征作为标识和检索点而设计检索语言，主要有分类检索语言和主题描述语言两大类。医学文献检索18/86分类检索语言分类检索语言是将各种知识领域（学科及其研究问题）类目按知识分类原理进行系统排列，以代表类目标分类号（如字母符号、数字等）作为文件标识一类检索语言。医学文献检索19/86分类检索语言文件分类法是依据文件所反应学科知识内容及其它特征，分门别类地、系统地揭示和组织文件一个方法。其主要目标是为了满足人们按学科知识体系检索文件要求。文件分类法通常分为等级体系分类法（亦称等级列举式分类法或体系分类法）、分面组配分类法两种基本类型，也有将二者结合编制而成等级—组配分类法。其中以体系分类法最为惯用，重点介绍《中国图书馆分类法》医学文献检索20/86中国图书馆分类法《中国图书馆分类法》（简称《中图法》）是我国各类图书馆应用最广泛分类法，图书馆使用它进行馆藏文件分类排架和编制分类目录。同时《中图法》在我国图书发行、数据库科学论文标引、以及网络信息资源组织与检索等多个领域也有广泛应用。当前《中图法》最新版是年出版第五版。

医学文献检索21/86中国图书馆分类法1.层累标识制

《中图法》分类号采取字母与阿拉伯数字相结合混合制编码，用一个字母标志一个大类，以字母次序反应大类序列，在字母后用数字表示大类下类目标划分。数字编号制度，使用小数制，即首先次序字母后第一位数字，然后次序第二位，以下类推。数字位置，基本上遵从层累制标准，即尽可能使号码位数代表类目标等级数，当一个分类号数字超出三位时，为了醒目而加上小圆点“.”，并无其它意义。医学文献检索22/86中国图书馆分类法类目按概念间逻辑隶属关系，由上至下逐层展开，划分出更专指、更详细类目。如“R323.123静脉”上下级类目从上至下依次是：R医药卫生R3基础医学R32人体形态学R322人体解剖学R322.1心脏血管系R322.12血管R322.121动脉R322.123静脉医学文献检索23/86中国图书馆分类法2.复分号复分是增强类目标细分化程度，提升类目专指度分类办法，是图书馆分类法主要组成部分。《中图法》复分表主要有通用复分表和专类复分表两种，这些复分表号码不能单独使用，只能加在主分类号后面作为共性区分标识。《中图法》通用复分表有8个，如总论、地理、时代、民族复分表。医学文献检索24/86中国图书馆分类法

总论复分表中描述图书外部特征如教材、工具书等复分号及其含义举例以下表：图书分类号举例：R28《中药学》R28-61《中药学辞典》R28-64《中药学图谱》-43教材-61名词术语、词典、百科全书（类书）-44习题、试题和题解-62手册、名目、指南、一览表、年表-53论文集-64表解、图解、图册、谱录、数据、公式、地图-532会议录-65条例、规程、标准-6参考工具书-66统计资料医学文献检索25/86中国图书馆分类法

专类复分表专供一些类目标深入细分之用。比如，专供R5-R8（临床医学各类）复分表如上：比如：

R581甲状腺疾病R512.6病毒性肝炎

R581.04甲状腺疾病诊疗R512.603病毒性肝炎免疫学01预防、控制和卫生059.7急症、抢救处理02病理学、病因学06并发症03微生物学、免疫学07预后04诊疗学08诊疗器械、用具05治疗学09康复医学文献检索26/86中国图书馆分类法3.基本大类（22个）A马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论N自然科学总论B哲学、宗教O数理科学和化学C社会科学总论P天文学、地球科学D政治、法律Q生物科学E军事R医药、卫生F经济S农业科学G文化、科学、教育、体育T工业技术H语言、文字U交通运输I文学V航空、航天J艺术X环境科学、安全科学K历史、地理Z综合性图书医学文献检索27/86中国图书馆分类法4.R医药、卫生大类下设17个二级类目R1预防医学、卫生学R74神经病学与精神病学R2中国医学R75皮肤病学与性病学R3基础医学R76耳鼻喉科学R4临床医学R77眼科学R5内科学R78口腔科学R6外科学R79外国民族医学R71妇产科学R8特种医学R72儿科学R9药学R73肿瘤学医学文献检索28/86主题描述语言主题描述语言是用于表示文件主题内容词语标识系统，应用较多是主题词法和关键词法。1.主题词法：主题词（SubjectHeadings）又称叙词（Dscriptor），其主要特点是：（1）采取指定词语――“主题词”，来专指或网罗对应概念，也就是适当归并某个概念同义词、近义词、拼法变异词及缩写等，以确保这个“主题词”与这个概念唯一对应；（2）采取参考系统将一些非主题词指向主题词或者显示相关主题词间词义相关关系；（3）采取类似分类方法编制主题词分类索引（范围表）和等级索引（树状结构），采取类似关键词法编制主题词（词素）轮排索引，以从多方面显示词间关系并便于查找主题词；（4）以上内容和规则组成一部主题词表，其中主题词还伴随科学发展及文件中用词改变而不停有增删修订定时更新。医学文献检索29/86主题描述语言2.关键词法：关键词法是为适应计算机自动编制索引需要而产生。所谓关键词（Key-word）是指出现在文件或网页标题（篇名、章节名）或文摘、全文中，能表示文件实质内容，而且能被人们作为检索入口关键性名词术语。关键词法最大优点是因为语词直接采取出现在最新文件或网页中专业自然语言，一些在科学发展中最新出现专业名词术语能及时进入索引系统；同时计算机编制关键词索引还含有成本低、速度快、时差短等优点。但关键词法也有很多缺点：（1）同一概念存在同义词、近义词、拼法变异词等，轻易造成漏检；（2）若平均每篇文件标引关键词较多，即使降低漏检，不过误检增加；（3）关键词法不对文件实质主题内容进行分析，关键词难以准确揭示文件实质内容，检索准确性较差。医学文献检索30/86医学主题词表《医学主题词表》（MedicalSubjectHeadings，简称MeSH表），美国国立医学图书馆（NLM）研制用于标引、编目和检索生物医学文件英文受控词表。MeSH表聚集了由著名医学教授、医学编辑和医学图书馆教授推荐、在生物医学领域里使用频繁且使用者认可主题词2.5万多个，副主题词83个。医学文献检索31/86NLM提供4种方式联机无偿获取其电子版及相关信息：一是MeSHBrowser；二是UMLSMetathesaurus（超级叙词表）；三是MeSH网站（/mesh）；四是MeSHdatabases应用及获取医学文献检索32/86概念体系MeSH表概念体系是由主题词、限定词、补充概念和款目词组成。1．主题词(mainheadings)主题词又称叙词（Descriptors），是用于描述主题事物或内容规范化词汇。医学文献检索33/86（1）主题词形式：MeSH表词汇以名词为主，可数名词多采取复数形式，如BloodCells；不可数名词或表示抽象概念名词采取单数形式，如BrainStem；主题词能够是单个词，也能够是词组，词组形式主题词普通按自然语序采取顺置形，如Lung

Abscess（肺脓肿）、Hepatic

Coma（肝昏迷）等。概念体系医学文献检索34/86概念体系不过，为了使概念相近族性主题词集中在一起，有些复合主题词采取倒置形式，将复合主题目词中被修饰名词放在前面，起修饰限定形容词放在名词之后，并用“，”分开。比如：

Shock,

Cardiogenic

(心源性休克)

Shock,Hemorrhagic

(出血性休克)

Shock,Septic

(败血性休克)倒置后，凡相关休克文件都对应集中在“Shock”这个主题词下，为检索者提供了族性选词方便。医学文献检索35/86概念体系（2）主题词单一性：一个词语只表示一个概念，一个概念只用一个词语表示，有利于提升文件查全率。（3）主题词动态性：MeSH表是医学惯用规范化词汇浓缩，必定伴随医学科学不停发展而不停增删、调整，方便及时反应医学科学最新发展、新主题和新事物，有一定动态性。医学文献检索36/86概念体系2.树状结构号：依据每个主题词词义范围和学科属性，可将全部主题词归入16个大类（以大写字母A-N，V，Z表示），每个大类又细分为100多个二级类目，二级类目再层层划分，逐层展开，使同一概念范围主题词成族展示它们之间并列、隶属等相互关系，每一个主题词均给予一个对应树状结构号，最多可达11级，形成主题词状结构体系，少数主题词按其属性须跨两个或多个类，这么主题词被同时给予多个树状结构号。医学文献检索37/86概念体系医学文献检索38/86概念体系医学文献检索39/863．限定词（qualifiers）又称副主题词（subheadings），是对文件主题起限定作用，组成主题一些通用性概念，本身无独立检索意义。限定词数量及其可组配主题词范围都有严格要求。到，MeSH表要求使用限定词有83个概念体系医学文献检索40/864．补充概念（supplementconcept）补充概念又称补充化学物质名称，用于标引MEDLINE中出现化学物质和毒品等并在PubMed中可用化学物质名称字段[NM]进行检索概念。当前MeSH表收录有455000多个补充概念。概念体系医学文献检索41/865．款目词（entryterms）款目词又称见参考（seereferences），是主题词同义词或相关词，作用是将自由词引见到主题词概念体系医学文献检索42/86MeSHBrowserMeSHBrowser（医学主题词浏览器，/mesh/mbrowser.html）是MeSH表网络版，意在帮助用户快速查询相关主题词并显示主题词等级结构体系。医学文献检索43/86MeSHBrowser提供了2种查询方式：①输词查询（Entertermorthebeginningofanyrootfragments②树形结构导航查询（Navigatefromtreetop）医学文献检索44/86MeSHBrowser检索界面医学文献检索45/86基础知识三.文件检索

1.定义：依据用户需要，利用检索工具和检索系统，查找出符适用户特定需要文件过程。

2.方法：（1）惯使用方法（工具法）：顺查法，倒查法，抽查法（2）追溯法（3）分段法（4）浏览法医学文献检索46/86基础知识3.文件检索意义和作用：（1）获取科学知识最正确捷径（2）防止科研工作重复、少走弯路。（3）提升科研、生产效率，节约时间。（4）提升信息素养。医学文献检索47/86基础知识4.文件信息检索系统

定义：是指依据人类社会对知识信息普遍性需要，由一定硬件设备和软件条件所组成，含有选择、整理、加工、存放和检索文件信息功效有序化信息资源集合体。医学文献检索48/86基础知识文件信息检索系统组成

（1）文件信息资源

（2）硬件设备

（3）软件条件

（4）人力资源医学文献检索49/86基础知识文件信息检索系统功效

（1）聚集文件信息

（2）组织文件信息

（3）检索文件信息

医学文献检索50/86基础知识文件信息数据库结构（1）统计（record)：组成文件信息数据库基本单元，它揭示了文件内容特征和外表特征。（2）字段(field):比统计更小单位，是组成统计基本单元，在数据库检索时，也是一个检索点或检索入口。（3）文档(document):两重含义：一是指数据库中一部分统计集合二是从数据库组成方式分：顺排文档（按统计次序号排列）、倒排文档（按主题词或作者排列）医学文献检索51/86基础知识上述数据库结构，可用英文单词单复数形式更直观地表述为：

record

Fields（统计）

database

flies（数据库）

File

Records（文档）

field

searchingentry（字段）（检索入口）医学文献检索52/86基础知识数据库类型：按其收录内容和功效不一样可分为以下类型：（1）书目型数据库（BibliographicDatabase）（2）事实数值型数据库（Fact-DataDatabase）（3）全文数据库（Full-textDatabase）医学文献检索53/86基础知识5.文件信息检索路径：

（1）主题词检索：推荐！《医学主题词表》MeSH

（2）自由词（文本词）检索：包含标题词、关键词、文摘词、全文词，注意同义词！（3）分类检索：中国图书馆分类法（中图法）

（4）著者检索：姓前用全称，名后用首字，注意东西方人名书写习惯。医学文献检索54/86基础知识（5）题名检索路径：（书名，刊名，篇名）（6）序号检索：文件特有序号（ISSN、ISBN、专利号、公开号、汇报号、协议号、化学物质登记号等）（7）机构检索：文章发表时作者所任职单位（8）引文检索：被引文件引用文件（9）缺省检索：预先设定多字段组合检索

（10）其它路径：分子式索引、生物体索引等医学文献检索55/86基础知识7.文件检索步骤：分析检索课题,明确实质需求选择适当工具数据库分析主题概念，换成系统检索用词制订检索策略检索检索结果是否满意修正检索策略输出检索结果是否医学文献检索56/86文件检索技术医学文献检索57/86布尔逻辑检索技术最惯用方法；用户信息需求经过检索提问式表示；采取布尔代数中逻辑符AND、OR和NOT作为逻辑组配算符；计算机依据表示式确定命汉字献基本条件与查找路径，同文档中各篇文件标识进行匹配。凡符合条件文件即为命汉字献，给予输出。医学文献检索58/86布尔逻辑检索技术布尔运算符AND、OR、NOT，分别表示逻辑与、逻辑或、逻辑非三种逻辑运算关系，以下列图所表示。布尔逻辑运算示意图

AANDBAORBANOTB医学文献检索59/86布尔逻辑检索技术名称符号表示式功效逻辑与ANDAANDB同时含有提问词A和B文件，为命汉字献逻辑或ORAORB凡是含有提问词A或B文件，为命汉字献逻辑非NOTANOTB凡是含有提问词A但不含有B文件，为命汉字献布尔逻辑运算一览表医学文献检索60/86布尔逻辑检索技术逻辑“与”,检索表示式为“AandB”。数据库中同时含有检索同A和B文件为命汉字献；作用是缩小检索范围，提升查准率；比如，查找“胰岛素治疗糖尿病”文件，检索式为insulin(胰岛素)anddiabetes(糖尿病)。医学文献检索61/86布尔逻辑检索技术逻辑“或”,检索表示式为“AorB”。数据库中文件中含有检索词A或B文件为命汉字献；作用是扩大检索范围；比如，查找“肿瘤”文件，检索式为cancer(癌)ortumor(瘤)orcarcinoma(癌)orneoplasm(新生物)。医学文献检索62/86布尔逻辑检索技术逻辑“非”，检索表示式为“AnotB”。数据库中凡含有检索词A而不含B文件为命汉字献；作用是缩小检索范围，提升查准率；比如，查“动物乙肝病毒（不要人）”文件，检索式为hepatitisBvirus(乙肝病毒)nothuman(人类)。医学文献检索63/86布尔逻辑检索技术布尔逻辑运算优先次序当一个检索表示式含有多个布尔算符时，执行次序为not优先运算，and其次，or最终。可用圆括号改变运算次序，将需要优先运算者置于圆括号中。比如，查找“维生素C或维生素E对糖尿病患者肾脏保护作用”，检索式为：（维生素Cor维生素E）and糖尿病

and肾。医学文献检索64/86截词检索截词检索，利用截断词一个局部即截词，进行检索技术；自动地对同一概念检索词不一样词尾改变、词根相同等一类提问词进行检索，并自动用OR连接各词检出结果，防止文件漏检和逐词键入麻烦，提升查全率；惯用截词符号有“*”、“？”。医学文献检索65/86医学文献检索66/86截词检索分类按是否采取截词符号分为，采取截词符号、不用截词符号；按截断位置不一样分为，右截词、左截词、中间截词；按截断字符数量不一样分为，无限截词、有限截词。医学文献检索67/86邻近检索邻近检索（proximitysearching）是用来表示检索词与检索词之间位置关系检索技术，通惯用位置算符来实现；采取位置算符有near，with。“near”，表示检索词位置相邻，检索词出现次序可前可后，如geneNEARapoptosis；“with”，表示检索词位置相邻，且两词出现次序与输入次序一致，如liverWITHcancer。医学文献检索68/86限定检索限定检索（limitSearching）又称限定字段检索（limitFieldSearching），是利用检索词出现字段进行检索；用户能够指定检索某一字段或某几个字段以使检索结果更为准确，降低误检；检索系统限定检索会采取缩写形式字段标识符；如TI表示Title，AD表示Address。医学文献检索69/86医学文献检索70/86扩展检索扩展检索（expandsearching）是同时对多个相关检索词执行逻辑或检索技术；即当用户输入一个检索词后，系统不但能检出该检索词文件，还能检出与该检索词同属于一个概念同义词或下位词文件，如PubMed中主题词扩展检索。医学文献检索71/86加权检索加权检索（weighingsearching）不但检索提问词是否存在，而且计算提问词权值，当权值之和超出阈值统计才能在数据库中被检出来。在一些数据库中表现为仅检索主要概念主题词，如MEDLINE；而有些数据库表现为词频检索，如中国学术期刊全文数据库。医学文献检索72/86准确检索和含糊检索准确检索（exactsearching）是指所检信息与输入词组完全一致匹配检索技术；在许多系统中用引号来表示，如检索“AcutePancreatitis”；含糊检索（fuzzysearching）允许所检信息与检索提问之间存在一定差异。如检索AcutePanc