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本文格式为Word版,下载可任意编辑——4基因工程的操作过程
4基因工程的操作过程
ADNA的体外重组(切、接)B重组DNA分子的转化和扩增(转、增)C转化子的筛选和鉴定(检)
4基因工程的操作过程切接转
增检
4基因工程的操作过程ADNA的体外重组(切与接)同种内切酶生产的粘性末端的连接同尾酶生产的粘性末端的连接重组率
同种内切酶生产的粘性末端的连接5'GAATTCCTTAAGEcoRI5'GCTTAA5'5'AATTCGGCTTAA5'5'AATTCGGAATTCCTTAAG5'
5'
退火5'5'GAATTCCTTAAGGAATTCCTTAAGT4-DNAligase5'5'GAATTCCTTAAGGAATTCCTTAAGGAATTCCTTAAGGAATTCCTTAAG
5'
5'
5'5'
GAATTCCTTAAG
GAATTCCTTAAG
同尾酶生产的粘性末端的连接5'BclI5'TACTAG5'5'GATCATTGATCAACTAGT5'
5'
GGATCCCCTAGGBamHI5'GATCCG
GGATCCCCTAGG
5'
5'
GCCTAG5'
退火5'5'TGATCCACTAGGTGATCCACTAGGT4-DNAligase5'5'TGATCCACTAGGGGATCACCTAGTGGATCACCTAGTGGATCACCTAGT
5'
5'
5'5'
TGATCCACTAGG
GGATCACCTAGT
重组率重组率的定义重组率=含有外源DNA的重组分子数/载体分子总数在常规试验条件下,重组率一般为25-75%
重组率是衡量连接反应效率的重要指标,较高的重组率可以大大简化DNA重组的后续操作。
重组率提高重组率的方法提高外源DNA片段与载体的分子比:5:1-10:1
载体DNA分子在连接前先除去磷酸基团:5'GAATTCCTTAAGEcoRI5'pAATTCGGCTTAAp5'GAATTCCTTAAG5'
碱性磷酸单酯酶5'GCTTAAOH5'
碱性磷酸单酯酶5'HOAATTCG
5'
退火HOOH5'G-A-A-T-T-CC-T-T-A-AGHOOHGA-A-T-T-CC-T-T-A-A-G
5'
4基因工程的操作过程B重组DNA分子的转化和扩增(转与增)转化的原理与技术转化率
转化细胞的扩增
转化的原理与技术Ca2+诱导的完整细菌细胞的转化Ca2+诱导的完整细胞的转化适用于革兰氏阴性细菌(如大肠杆菌等),1970年建立此技术,其原理是Ca2+与细菌外膜磷脂在低温下形成液晶结构,后者经热脉冲发生收缩作用,使细胞膜出现空隙,细菌细胞此时的状态叫做感受态
转化的原理与技术Ca2+诱导的完整细菌细胞的转化大肠杆菌感受态细胞的制备:100ml菌体培养至OD600=0.5,离心收集菌体用10ml冰冷的20mMCaCl2溶液悬浮菌体,离心收集菌体用1ml冰冷的100mMCaCl2溶液悬浮菌体冰浴放置12-24小时,备用
转化的原理与技术Ca2+诱导的完整细菌细胞的转化大肠杆菌感受态细胞的质粒转化:取100ml感受态细胞,参与相当于50ng载体的重组DNA连接液,混匀冰浴放置半小时在42℃保温2分钟(热脉冲)快速将转化细胞转移至冰浴中放置1-2分钟参与1ml新鲜培养基,于37℃培养1小时(扩增)涂在适合的固体培养基平板上进行筛选
转化的原理与技术细菌原生质体的转化革兰氏阳性细菌(
如枯草杆菌、链霉菌等)接纳外源DNA的主要屏障是细胞壁,因而这类细菌寻常采用原生质体(细胞去壁后的形态)转化的方法转移质粒或重组DNA分子酵母菌、霉菌、植物细胞也可用原生质体法进行转化
转化的原理与技术电穿孔转化将待转化的质粒或DNA重组连接液加在电穿孔转化仪的样品池中,两极施加高压电场。在强大电场的作用下,细菌细胞壁和细胞膜产生缝隙,质粒或DNA重组分子便可进入细胞内电穿孔转化法操作简单,而且几乎对所有含细胞壁结构的受体细胞均有效,但转化效率区别很大同样的原理,电穿孔法也可用于质粒消除试验
转化率转化率的定义转化率是衡量转化效率的重要指标,其定义为:每微克载体DNA在最正确转化条件下进入受体细胞的分子数。由于在一般的转化试验规模下,每个受体细胞最多只能接受一个载体分子,因此转化率的定义也可以表征为:每微克载体DNA转化后,受体细胞接纳DNA的个数,即克隆数(在筛选时,未接纳载体或重组子的
受体细胞不长)
转化率转化率的定义例如,pUC18对大肠杆菌的转化率为108,即每微克pUC18中只有108个分子能进入受体细胞。一微克pUC18共有3.4X1011个分子(6.02X1017/2686X660),也就是说,每3400个pUC18分子才有一个分子进入受体细胞另一方面,在实际操作过程中,转化一微克pUC18共需2ml感受态细胞,大约含有2X1010个大肠杆菌细胞,也就是说,每200个细胞只有一个细胞能接纳pUC18DNA
转化率转化率的用途利用转化率和重组率等参数可以帮助设计DNA重组试验规模例如,某一DNA重组试验的重组率为20%,转化率为107/mg载体,经切接处理后的载体转化率比自然的载体低100倍,欲获得104个重组克隆,需投入多少载体DNA进行重组试验?若重组率为100%,则转化后产生104个重组克隆需要:104/107X10-2=0.1mg载体DNA考虑到试验系统的重组率为20%,所以实际投入载体应为:0.1/20%=0.5mg载体DNA
载体投入量确定后,外源DNA的投入量即可按10∶1的要求算出(5mg),甚至还可以估算需要涂布多少块平板进行筛选
转化率转化率的影响因素载体及DNA重组分子方面:载体本身的性质:不同的载体转化同一株受体细胞,其转化率不同载体的空间构象:质粒的超螺旋构象转化率最高,经酶切连接操作后的载体由于空间构象难以恢复,其转化率一般要比新制备的
超螺旋质粒低两个数量级插入片段的大小:对质粒载体而言,插入片段越大,转化效率越低
转化率转化率的影响因素受体细胞方面:受体细胞必需与载体相匹配,例如:pBR322转化大
肠杆菌JM83株,转化率很低;但对
大肠杆菌ED8767株的转化率则较高
转化率转化率的影响因素转化方法方面:受体细胞的预处理:影响最大供受体的比例:Ca2+诱导转化原生质体转化转化方法:Ca2+诱导转化原生质体转化106-107/mgDNA105-106/mgDNA0.1ml感受态细胞109个原生质体50ngDNA50ngDNA
l-DNA转染电穿孔转化
107-108/mgDNA106-109/mgDNA
转化细胞的扩增扩增操作转化细胞的扩增操作是指转化完成之后细胞的短时间培养。在试验时,扩
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