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文档简介

分子模拟基础与应用课程教学大纲课程编号：课程名称：分子模拟基础与应用学时：36学分：3适用专业：化学教育/应用化学开课学期：6开课部门：化学与生物工程学院先修课程：高等数学、普通物理、无机化学、有机化学、分析化学考核要求：开卷/上机考试使用教材及主要参考书：一、课程的性质和任务（1）课程的性质分子模拟基础与应用是化学类必修的专业课程。该课程是从原子、分子的尺度研究物质的结构及结构与物质的物理、化学性质的关系的一门基础学科。结合先进计算软件和绘图工具，探究分子三维空间结构和基本性质的计算。（2）课程的任务本课程的主要任务是使学生掌握部分绘图和计算软件的使用，加深学生对于分子立体结构的认识，以及学会简单分子性质的理论计算方法。一方面加深对先行课程（如无机化学、有机化学、物理化学、结构化学）中某些内容的理解，另一方面为后继课程和科学研究打下必要的理论基础。提高学生的动手能力和空间思维能力。二、课程的目的与要求1、了解现行构建分子的各类软件以及掌握部分软件的安装和使用。2、掌握分子构型优化和性能计算的方法。三、学时分配章节教学内容学时1绪论12软件的安装及使用83分子的构建、构型优化和能量计算154分子性能计算和轨道分析12总计36四、教学中应注意的问题为了培养学生的独立工作能力，讲授内容应分清主次。在教师示范的前提下，注重学生的动手操作能力的培养。除了课堂上机讲授之外，更需要落实课后上机练习以达到学生对于所学知识的真正掌握。五、教学内容第一章软件的安装及使用1、基本内容1.1WeblabViewer软件的安装及使用

1.2ChemDraw软件的安装及使用

1.3MaterialStudio软件的安装及使用1.4Gaussian09软件的安装及使用

2、教学基本要求（1）掌握上述几类软件的安装。（2）弄清软件中各控件的操作目的。（3）学会绘制各类简单分子并进行部分性能的分析。3、教学重点难点分子的绘制第二章分子的构建、构型优化和能量计算1、基本内容2.1分子构型的建立

2.2分子构型的优化2.3分子能量计算2、教学基本要求掌握使用ChemDraw、WeblabViewer、MaterialStudio和Gaussian09软件实现简单分子的构建；学会使用MaterialStudio和Gaussian09软件进行分子构型的优化和能量的计算。3、教学重点难点使用MaterialStudio及Gaussian09软件进行分子构型的优化和能量的计算。第三章分子性能计算和轨道分析1、基本内容3.1能带的计算与分析3.2态密度图的计算与分析3.3分子轨道的计算与分析2、教学基本要求借助MaterialStudio软件学习分子各类性质的计算，让学生理解电子性质的意义，掌握对于能带结构、态密度的计

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