地球化学-第四章生物标志物1课件

第四章生物标志化合物生物标志化合物（Biomarker，Biologicalmarkers,Biologicalfossils,molecularfossils.），也称为分子化石，它是存在于岩石和沉积物中的一类复杂有机化合物，是石油源于有机体的一种重要信息。生物标志化合物的研究有助于加深人们对有机沉积环境、有机母源特征及有机质的演化特征的认识，同时也是油源对比、油气运移研究不可缺少的手段，因而是油气地球化学研究的又一重要内容。第一节基本概念一、生物标志化合物的概念及形成

生物标志化合物二、生物标志化合物的研究意义

三、生物标志化合物的分析

第一节基本概念一、生物标志化合物的概念及形成

生物标志化合物：是沉积物（岩）、原油、油页岩和煤中那些来源于生物体，在有机质演化过程中具有一定稳定性，没有或很少发生变化，基本保存了原始生化组分的碳骨架，记载了原始生物母质特殊分子结构信息的有机化合物。生物标志化合物从何而来？生物标志化合物正构烷烃无环类异戊二烯烷烃二环－四环异戊二烯烷烃藿烷系列甾烷芳香烃含氮化合物、卟啉生物标志物的类别一、生物标志化合物的概念及形成

二、生物标志化合物的研究意义

三、生物标志化合物的分析

第一节

基本概念

二、生物标志化合物的研究意义

生物标志化合物在有机质热演化过程中：

一方面在各种作用下，发生一定的结构变化，以达到热力学上的稳定性。这些变化包括失去不稳定的官能团，不饱和的链加氢变为饱和的结构，发生芳构化以及异构化和分子的重排等。另一方面仍然保留其母体基本碳骨架结构上的“变异性”使其能够用于追溯有机质的演化历程。正是这种结构上的继承性使其具有标志有机质来源及沉积环境的作用。油气运移提供证据：烃源岩和疏导层对油气运移起到色层效应，利用这种效应可以追溯油气运移路径和方向。研究原油生物降解程度：成藏以后油藏进入细菌活动带，细菌会选择性地破坏一些生物标志物，通过检测生物标志物被细菌降解的情况，可以确定油藏形成以后演化的历史。第一节

基本概念

一、生物标志化合物的概念及形成

生物标志化合物二、生物标志化合物的研究意义

三、生物标志化合物的分析

原油及烃源岩样品分析流程三、生物标志化合物的分析

近些年来，相继出现了超声抽提、搅拌抽提、气体加压抽提等一系列新的抽提装置和方法。但是还没有推广使用，目前较普遍的仍是索氏抽提法。用氯仿抽提岩石中的可溶有机质，其萃取物称氯仿沥青。样品制备（1）将岩心外层有污染部分剥离掉，在低于50℃下烘干。（2）样品粉碎至粒径在40-80目，碎样机温度应小于50℃分析步骤（1）称取100-500g样品，装入经过氯仿抽提的滤纸筒中，包好后置于抽提器中，纸筒不得超过虹吸管高度。（2）在抽提器底瓶中，加入不超过2/3容积的氯仿，在75-82℃水浴或电热套中抽提，每25-30min回流一次。（3）一般样品的抽提时间在60h以上，荧光检查样品在三级以下方为合格。（4）抽提前将少量铜片放入底瓶，供脱硫用。（5）浓缩温度应低于40℃计算M=mG1-G2×100%式中M—氯仿沥青百分含量，%G1—容器加氯仿沥青量，gG2—容器重量，gm—样品量，g柱层析法族组分分离测定方法（一）沉淀沥青质称取0.02-0.05g氯仿沥青或原油样品（需脱水，40℃在真空度为5.33×104Pa下恒重），放入50ml具塞三角瓶中，加入30ml正己烷（有的实验室用30-60℃石油醚）摇匀，静置过夜，使沥青质沉淀。（二）饱和烃、芳烃及胶质分离和测定1.装置及化学试剂吸附柱内径为10~12mm；氧化铝与硅胶为0.15mm粒径；正己烷、苯和无水乙醇（分析纯）。2.柱色层分离条件（1）氧化铝与硅胶比为4:6，吸附剂用量为样品量的150~200倍。吸附剂填充的松紧要合适，流速在每分钟40滴左右。硅胶氧化铝脱脂棉脱脂棉硅胶氧化铝脱脂棉脱脂棉（2）冲洗剂与样品比例为1:1500；用正己烷冲洗饱和烃用苯冲洗芳烃酒苯（苯:无水乙醇1:1）冲洗非烃（胶质）。2.色谱技术（Chromatography）

色谱法是俄国植物学家茨维特于1906年首先提出的。他将植物色素的石油醚萃取液倒入装有CaCO3吸附剂的竖直玻璃管中，再加入纯石油醚任其流下，结果在管内形成不同颜色的谱带，溶液中的不同色素得到了分离。“色谱”一词由此得名。后来这种方法逐渐用于无色物质的分离，但色谱一词却沿袭使用下来。目前是将原油、氯仿沥青等混合物分离成单个化合物从而进行鉴定的主要技术。（1）色谱技术原理利用流动的稳定流体带着待分离样品在装有吸附剂的细管中流动，使混合物在流动过程中不断吸附－解吸，最终分子结构简单、分子量小的组分先从色谱柱出口流出，分子结构复杂、分子量大的组分后从色谱柱口流出，达到对混合样品的分离作用。再利用检测仪器进行检测。气相色谱仪基本设备可分做气路系统、进样系统、分离系统、检测和放大记录系统以及温度控制系统。气相色谱常用难挥发的高沸点固定液或固体吸附剂作为固定相。

用氮、氢、氦等气体作为载气，携带溶质作为流动相。气相色谱流程及组成（1）气路系统：主要由载气和检测器用的助燃气、燃气等气路组成。（2）分离系统：主要有进样器、柱箱及色谱柱，控温系统及电气控制单元。（3）检测、纪录及数据处理系统：包括检测器，以及控温单元、放大器、记录仪、积分仪或微处理机等。（2）仪器结构气相色谱仪器示意图

色谱柱是气相色谱的心脏，它是一细长的毛细柱（一般直径0.25mm，长一般大于40m，高级毛细柱的质地一般为弹性熔融石英毛细柱），固定相位于其内壁。质谱法（massspectrometry）是通过研究分子量和离子化的分子碎片来认识分子结构的一种现代分析技木。3.质谱法（massspectrometry）—MS色谱的优点是将同类化合物分离开；色谱的缺点是不能鉴定未知化合物。以高能电子将单个分子击碎，用碎片的质量组成特征，推测分子的结构组成和分子量，以达到分子鉴定的目的。（1）质谱分析原理经过GC的有机化合物被气化；

进入MS的接口时受到能量较高的(10-70eV)电子束轰击；分子失去一个外层电子变成带正电荷的分子离子(M+)。一般有机化合物分子电离成分子离子所需要的能量为7～15eV。常用质谱仪电子束的能量远大于有机分子的电离势，为50～70eV。这样多余的能量可以继续使分子离子裂解为稳定的质量较小的正离子和一些中性碎片。形成分子离子M+形成多个碎片离子A+和中性碎片B每一类化合物的碎裂有相似的规律，即有相同的碎片。因此，可以用它可以鉴定混合在一起的多种同系物分子的结构。（2）仪器及检测过程典型的分析用质谱仪主要由四个部分组成，即：①试样注入系统；②离子源③静电加速系统；④检测器和记录系统质谱仪主要部件示意图质谱仪中离子源是最重要的组成部分。常用的电子轰击型离子源是由发热的钨丝产生的电子流轰击试样分子，使其中相当大的一部分离子化，产生以正离子为主的离子流。利用几百到几千伏高压电场使正离子加速。正离子束在质量分析器中受到磁场H作用，它将依m/e（质荷比即质量与电荷的比值）的大小分离。质荷比大的离子轨道弯曲半径大，相同质荷比的离子偏转程度相同。通过改变粒子速度或场强，质量分析器就将不同质荷比的正离子分离开来，它们依次被收集、放大并按m/e大小记录下来为质谱图。（3）质谱图的初步判读

分子在高能量电子束的轰击下可以形成各种不同质量的碎片，表现为质谱图上的峰，这些峰的位置和相对强度与分子的结构组成和含量有关。通过对大量分子质谱的研究，目前对分子碎片化的机理有了更多的认识。根据分子碎片的形成机理及特征，可将质谱峰分为分子离子峰、碎片离子峰、亚稳峰、同位素峰等。C29D-单芳8，14-断藿烷的质谱图

在质谱图中对应于分子离子的峰为分子离子蜂或母峰，一般位于谱图中m/e最高的位置，也即最后位置。因为正离子电荷常为１，所以分子离子蜂的质荷比值即为该化合物的分子量，这就为鉴定有机化合物提供了重要依据。高灵敏度的质谱仪可以区分质量数差值小于0.1的化合物。1）分子离子峰分子离子峰的强度与化合物结构有关。如果分子结构较稳定，则分子离子蜂强度较大，其它的碎片峰则不发育，如环状结构化合物的分子离子蜂较强，而一些链状结构的化合物质谱图中分子离子峰很弱，碎片峰强度大。此外，为了得到较好的分子离子蜂可以降低电离电压。峰值最高，对应离子浓度最大的蜂是基峰。将该峰值定为100，其它离子的峰与基峰相比所得的百分数叫做相对丰度，质谱图上横坐标为质荷比m/e，纵坐标为相对丰度。2）基蜂各类化合物的分于离子裂解成不同的碎片具有一定的规律性，它取决于化合物的结构和键的强度。化合物分子具有其特征碎片蜂，不会有两种分子在受电子轰击时会以完全相同的方式碎片化，因此化合物的质谱可以成为结构鉴定的指纹3）碎片离子蜂一些常见生物标志化合物的特征碎片离子

4）同位素蜂有机化合物一般含有C、H、O、N、S、Cl、Br等元素，这些元素都有其稳定同位素。因此，在质谱上会出现由不同质量的同位素形成的离子峰（主要是分子离子峰）。如前所述，色谱法的特点是高分辨能力，质谱法的特点是高鉴别能力，因此，将两个仪器连接在一起即色质联机（GC-MS），用色谱仪作为分离器、质谱仪作为鉴定器便可发挥两个仪器的长处，甚至还可以得到两种方法单独使用时无法获取的信息。4．色谱—质谱联用技术色谱－质谱（GC-MS）分析是在分子结构或分子级水平上研究地质作用是高科技用于地质研究的具体体现。目前色谱－质谱分析在许多领域均有应用。小型化、自动化简单化是GC－MS发展方向。（1）GC-MS分析得到的成果总离子流图：按到达检测器的离子先后、数量多少排列出的谱图(TIC图)该图与色谱图基本一样。石油的TIC和GC图十分相似，可以用于检查样品的分离情况和信号强弱，并且相互验证，互为补充。质谱图：

将每一次扫描的记录，应用质荷比对检测器响应值作图，就可以得到由色谱分离的某一种化合物的质谱图。质