标准解读
《LY/T 1772-2008 杨树品种分子鉴定实验方法 DNA扩增片段长度多态性法(AFLP)》是一项针对杨树品种进行分子水平上鉴定的标准。该标准详细规定了利用AFLP技术对不同杨树品种进行遗传多样性分析的具体步骤和要求,以达到准确区分不同杨树品种的目的。
AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism),即扩增片段长度多态性,是一种基于PCR的DNA指纹技术。它结合了RFLP(限制性片段长度多态性)与RAPD(随机扩增多态性DNA)的优点,通过使用特定的限制性内切酶切割基因组DNA,并将得到的片段连接到接头序列上,随后选择性地扩增这些片段来揭示个体间的遗传差异。
根据此标准,整个实验流程主要包括以下几个关键环节:
- 样品准备:包括从新鲜或干燥的叶片中提取高质量的总DNA。
- 酶切及接头连接:采用两种不同的限制性内切酶同时消化样品DNA,并立即与特制的人工合成接头相连接。
- 预扩增:利用带有一个碱基选择性的引物对连接产物进行初步扩增。
- 选择性扩增:在预扩增的基础上,使用具有更多选择性碱基的引物进一步放大目标片段。
- 电泳分离与检测:通过聚丙烯酰胺凝胶电泳或毛细管电泳等手段分离扩增产物,并借助银染或其他化学发光试剂显色后观察记录。
- 数据分析:基于获得的带型图谱,运用适当的软件工具进行比对分析,从而识别出不同样本之间的相似性和差异性。
该标准还特别强调了实验过程中需要注意的一些技术细节,如如何保证酶切效率、提高接头连接率以及优化PCR反应条件等,旨在确保实验结果的可靠性和重复性。此外,对于数据分析部分也给出了指导建议,帮助研究人员正确解读AFLP谱带信息,有效应用于杨树种质资源的保护与利用研究当中。
如需获取更多详尽信息,请直接参考下方经官方授权发布的权威标准文档。
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- 现行
- 正在执行有效
- 2008-09-03 颁布
- 2008-12-01 实施
文档简介
犐犆犛65.020
犅61
中华人民共和国林业行业标准
犔犢/犜1772—2008
杨树品种分子鉴定实验方法
犇犖犃扩增片段长度多态性法(犃犉犔犘)
犕狅犾犲犮狌犾犪狉犻犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀犿犲狋犺狅犱犳狅狉狏犪狉犻犲狋犻犲狊狅犳狆狅狆犾犪狉—
犃犿狆犾犻犳犻犲犱犳狉犪犵犿犲狀狋犾犲狀犵狋犺狆狅犾狔犿狅狉狆犺犻狊犿(犃犉犔犘)
20080903发布20081201实施
国家林业局发布
书
犔犢/犜1772—2008
前言
本标准的附录A为资料性附录。
本标准由国家林业局提出。
本标准由全国林木种子标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:中国林业科学研究院林业研究所、中国科学院遗传与发育生物学研究所和国家林
业局北方林木种子检验中心。
本标准主要起草人:李金花、张绮纹、王斌、宋红竹、周春江、卢孟柱、李庆梅、牛正田。
Ⅰ
书
犔犢/犜1772—2008
杨树品种分子鉴定实验方法
犇犖犃扩增片段长度多态性法(犃犉犔犘)
1范围
本标准规定了以杨树新鲜组织(叶片、芽等)为材料,利用扩增片段长度多态性DNA法(Amplified
FragmentLengthPolymorphism,简称AFLP)对杨树品种进行分子鉴定的实验方法。
本标准适用于杨树品种的分子鉴定。
2原理
杨树基因组DNA经限制性内切酶双酶切后,形成分子量大小不等的随机片段,将针对犈犮狅RI和
犕狊犲I的特定接头连接在这些DNA片段的两端,形成带特异接头的DNA片段,随后利用一对与接头和
邻接酶切位点相匹配的引物进行扩增,最终通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将这些特异性片段分离开来,
通过比较待测品种和对照品种间DNA指纹谱带数据的差异,来判定待测品种与对照品种是否为相同
品种。
3仪器和设备
3.1通用实验室仪器设备。
3.2梯度PCR扩增仪。
3.3琼脂糖胶电泳系统。
3.4变性聚丙烯酰胺凝胶电泳系统。
3.5紫外透射仪。
3.6凝胶成像系统或照相系统。
3.7重蒸馏水仪。
4试剂与溶液
除非另有说明,在分析中使用分析纯试剂。配制好的溶液经高压灭菌后使用。实验中所使用的水
均为无菌超纯水。
4.1犇犖犃限制性内切酶犈犮狅犚犐和犕狊犲犐(10犝/μ犔)及其10×反应缓冲液
-20℃保存。
4.2犜犪狇犇犖犃聚合酶(1犝/μ犔)及其10×犘犆犚反应缓冲液
10×PCR反应缓冲液含200mmol/LTrisHCl(pH8.4)、15mmol/L氯化镁(MgCl2)和
500mmol/L氯化钾(KCl),-20℃保存。
4.3犜4犇犖犃连接酶(1犝/μ犔)及其10×连接反应缓冲液
10×反应缓冲液含350mmol/LTrisHCl(pH7.6)、50mmol/LMgCl2和500mmol/LKCl和
5mmol/Lβ巯基乙醇;-20℃保存。
4.4四种脱氧核糖核苷酸(犱犃犜犘,犱犆犜犘,犱犌犜犘,犱犜犜犘)混合溶液(各10犿犿狅
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