第三章 RNA的转录

1引言2RNA聚合酶3启动子与增强子4RNA转录的基本过程5原核生物与真核生物mRNA的特征比较6终止和抗终止7内含子的剪接、编辑及化学修饰第三章RNA的转录1.1中心法则1.2转录和翻译1.3转录产物的类型1.4DNA转录序列的区分1.5基因表达盒结构组成1引言—几个基本概念(1)DNA序列是遗传信息的贮存者，通过自主复制得到永存；(2)DNA通过转录生成RNA;(3)含遗传信息的mRNA通过翻译生成蛋白质来控制生命现象；(4)同时某些RNA可以通过逆转录将遗传信息传到DNA；(5)某些RNA自身还可进行复制使其遗传信息得以永存。1.1中心法则

(centraldogma)

1.2转录和翻译(transcription&translation)

转录：从DNA到RNA的过程，基因表达的核心步骤。

翻译：从RNA到蛋白质的过程，基因表达的最终目的。转录(transcription)是生物体以DNA为模板合成RNA的过程。转录RNADNA

复制和转录的区别

◆信使RNA(messengerRNA,mRNA)

◆转移RNA(transferRNA,tRNA)

◆核糖体RNA(ribosomalRNA,rRNA)

◆其他一些小RNA（smallRNA,sRNA)

1.3转录产物类型编码链（codingstrand）或有意义链（sensestrand)：与RNA序列相同的那条DNA链模板链（templatestrand）或称反义链（antisensestrand)：据碱基互补原则指导RNA合成的那条DNA链1.4DNA转录序列的区分

不对称转录

(asymmetrictranscription)

双链DNA分子上分布着很多基因，并不是所有基因的转录均在同一条DNA单链上，而是一些基因在这条单链转录，另一些基因的转录在另一条单链上，DNA双链一次只有一条链(或某一区段)可作为模板转录，称之为不对称转录。

在DNA分子双链上某一区段，一股链可转录，另一股链不转录；模板链并非永远在同一单链上。RNApolymeraeseRNA聚合酶（RNApolymerase);启动子(Promoter);转录起始点(startpoint);终止子(Terminator);上游(Upstream);下游（Downstream);近端(proximal);远端(distal)1.5基因表达盒结构组成转录起始于RNA聚合酶和启动子(promoter)结合之后，转录起始的第一个碱基称为转录起始点(startpoint)。在RNA聚合酶的作用下合成RNA，至终止子(terminator)终止。由启动子到终止子之间的序列称为转录单位(transcriptionunit)。转录起始点前面的序列称为上游序列(upstream)，后面的序列称为下游序列(downstream)。2.1原核生物RNA聚合酶2.2真核生物RNA聚合酶2RNA聚合酶2.1原核生物RNA聚合酶2.1.1细菌RNA聚合酶的结构组成2.1.2细菌RNA聚合酶的形成过程2.1.3细菌RNA聚合酶的三维结构2.1.1细菌RNA聚合酶的结构组成

有四种不同类型的亚基；

在不同的菌种之间，α、β和β`亚基的大小相似，但σ亚基的变化较大。Functions核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)转录起始阶段转录延长阶段亚基可能参与核心酶的组装及启动子的识别。并参与RNA聚合酶与一些转录调控因子间的作用。亚基具有与底物（NTP及新生的RNA链）结合的能力。’亚基可能与模板结合。亚基和’亚基提供了RNA聚合酶的活性中心，其一级结构与真核生物RNA聚合酶大亚基有同源性。亚基的功能是帮助全酶识别启动子并与之结合。亚基也可被看作一种辅助因子，因此又可称为因子（sigmafactor）。2.1.2细菌RNA聚合酶的形成过程

α2+β→α2βα2β+β`→α2ββ`(coreenzyme)α2ββ`+σ→α2ββ`σ(Holoenzyme)

大肠杆菌RNA聚合酶的核心酶除含有4个多肽亚基外，还含有2个Zn原子有关RNA聚合酶的几个知识点：只有全酶才能在正确位置起始转录。核心酶能在DNA模板上合成RNA，但不能在正确位置起始转录。亚基与核心酶结合疏松，很容易与核心酶分离。σ因子仅能保证细菌RNA聚合酶稳定地结合到启动子上，它通常在RNA链合成8~9个碱基后释放。在某些细胞内含有能识别不同启动子的σ因子。2.1.3细菌RNA聚合酶的三维结构2.2真核生物RNA聚合酶2.2.1

细胞核中RNA聚合酶的种类2.2.2

酵母RNA聚合酶Ⅱ的晶体结构

2.2.1细胞核中RNA聚合酶的种类

酶细胞内定位主要转录产物相对活性RNA聚合酶I核仁rRNA，大多数snRNA50%~70%RNA聚合酶II核质mRNA前体20%~40%RNA聚合酶III核质tRNA、5SRNA和部分snRNA约10%但在细菌中，一种RNA聚合酶几乎负责所有mRNA、tRNA和rRNA的合成。真核生物的RNA聚合酶的分子量都很大，由8至16个亚基组成。经纯化的RNA聚合酶具有以DNA为模板合成RNA的能力，但不能正确地选择启动子。目前尚不能完成RNA聚合酶的体外重建，无法确定哪些亚基是活性所必需的。酵母RNA聚合酶II晶体结构的侧面显示DNA被一对钳子夹住2.2.2酵母RNA聚合酶Ⅱ的晶体结构3.1启动子与增强子的定义

3.2启动子与增强子的结构比较

3.3启动子与增强子的作用特点

3.3启动子与增强子边界及关键序列元件的实验确定

3.4原核生物启动子

3.5真核生物启动子3启动子与增强子3.1启动子与增强子的定义启动子(Promoter)：位于转录起始点附近，且为转录起始所必需的序列元件。能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。增强子(Enhancer)：位于离转录起始点较远的位置上，具有参与激活和增强转录起始功能的序列元件。

Transcriptioniscontrolledbyapromoterandenhancer3.2启动子与增强子的结构比较3.3启动子与增强子的作用特点3.3.1启动子的作用特点（1）一个基因可同时拥有一个及以上启动子（2）启动子位置不定，一般在转录起始点上游。（3）可与增强子共同控制转录起始和强度。（4）发挥功能时除需RNA聚合酶外，还需转录调控因子与启动子区各种调控元件相互作用①可提高相应基因转录效率，可远距离起作用，在基因的上游或下游都可；②作用与其序列的正反方向无关；③要有启动子才能发挥作用；④必须与特定蛋白质因子结合后才能发挥增强转录的作用；⑤一般具有组织或细胞特异性。3.3.2增强子的作用特点

EnhanceractivityrequiresproximitytothepromoterAnenhancermayfunctionbybringingproteinsintothevicinityofthepromoter.AnenhancerdoesnotactonapromoterattheoppositeendofalonglinearDNA,butbecomeseffectivewhentheDNAisjoinedintoacirclebyaproteinbridge.AnenhancerandpromoteronseparatecircularDNAsdonotinteract,butcaninteractwhenthetwomoleculesarecatenated3.4启动子与增强子边界及关键序列元件的实验确定以启动子为例

边界序列确定:

从一段特定的含有启动子的DNA片段入手，从DNA的两侧不断缩短长度直至短到停止产生活性的某一位置。Promoterboundariescanbedeterminedbymakingdeletionsthatprogressivelyremovemorematerialfromoneside.WhenonedeletionfailstopreventRNAsynthesisbutthenextstopstranscription,theboundaryofthepromotermustliebetweenthem.Promoterboundariesaredefinedbydeletions保守序列确定：A:对已知启动子序列，可通过缺失或突变确定哪些碱基为必需；B:还可通过比较不同的启动子间的同源比较，确定哪些序列为保守序列。

3.5原核生物启动子3.5.1-10区和-35区的结构特征3.5.2-10区和-35区间的间距与转录起始

3.5.3RNA聚合酶与启动子区的识别

原核生物启动子的结构

在原核生物的启动子中有4个区域：转录起始点、－10区、－35区、－10与－35之间的序列。

转录起始点

转录起始点在多数情况下为嘌呤，常见的序列为CAT，A为转录起始点。3.5.1-10区和-35区的结构特征

-10区：TATA区（又称Pribnowbox)T89A89T50A65A65T100-35区：TTGACA区

T82T84G78A65C54A45

这两个区域是RNA聚合酶与启动子的结合位点，能与σ因子相互识别。

---TTTACA----TATGTT----TTGACATATAAT(-35)(-10)

Lac启动子的-10区和-35区

－10区在转录起始点的上游有一个6bp的保守序列，几乎在目前已知的所有启动子中均存在。保守序列的中心位于转录起始点上游约－10bp处，这一保守序列又称为－10序列。其一致序列为TATAAT，又称Pribnow框、结合位点，在RNA聚合酶的作用下首先解链。

－35区

在转录起始点上游－35bp处，有另一个保守序列，称为－35序列。其保守序列为TTGACA，RNA聚合酶的σ因子可以识别该位点，所以称为识别位点，RNA聚合酶首先与识别位点结合，然后与结合位点相互作用。

该区域是启动子强弱的决定因素。3.5.2-10区和-35区间的间距与转录起始

最佳间距：

原核生物中，-10区与-35区之间距离约是16~19bp(90%)，少数15~20bp。少于15bp或大于20bp都会降低启动子的活性，17bp最佳。该区域的碱基序列并不重要，但该距离的长短是至关重要的。适宜的距离可以为RNA聚合酶提供合适的空间结构，便于转录的起始。

应用：

1）正确认识已有启动子，分析其活性；2）据研究目的人工构建启动子。下降突变、上升突变

研究启动子功能的主要方法是启动子的突变。使启动子的碱基序列发生变化，可以改变启动的强弱，即增强或减弱该启动子所控制的结构基因的转录。大多数突变是使启动子的功能减弱或消失。这种突变称为下降突变（downmutation）;

少数突变能使启动子的功能增强，称为上升突变（upmutation）。典型的原核生物的启动子的结构为：－35区、16～19bp的间隔区、－10区和转录起始点，－10区到转录起始点的距离为7bp。转录起始点左右的碱基也可影响转录的起始。例如，＋1至＋30的转录区可以影响RNA聚合酶对启动子的清除，从而影响启动子的强度。

3.5.3RNA聚合酶与启动子区的识别

一般认为，RNA聚合酶并不直接识别碱基对本身，而是通过氢键互补的方式加以识别。因此启动子功能既受DNA序列影响，又受其构象影响。

3.6真核生物启动子

1.RNA聚合酶Ⅰ启动子的结构

RNA聚合酶Ⅰ的启动子主要由两部分组成的(bipartite)：核心启动子（corepromoter）位于－45至＋20的区域内，足以使转录起始。上游调控元件（upsreamcontrolelement）位于－180至－107，可提高转录起始效率。RNA聚合酶Ⅱ启动子的结构RNA聚合酶Ⅱ主要负责编码蛋白质和部分核内小rRNA（smallnuclearRNA，snRNA）的基因的转录，其启动子结构最为复杂。RNA聚合酶Ⅱ单独并不能起始转录，必须和其他的辅助因子共同作用形成转录起始复合物才能起始转录。-25~-35区含TATA序列(TATAbox)-70~-80区含CCAAT序列(CAATbox)在-80~-110区含有GCCACCC或GGGCGGG序列（GCbox)另：上游启动子元件(UPE),或上游激活序列(UAS)3.6.1RNA聚合酶Ⅱ启动子的结构特征-25~-35区控制起始；-70~-80区、-80~-110区、增强子区都是控制起始效率3.6.2真核生物启动子与转录起始3.RNA聚合酶Ⅲ启动子的结构RNA聚合酶Ⅲ转录5SrRNA、tRNA和部分snRNA。这三种启动子的结构是不同的，RNA聚合酶Ⅲ也必须和其他的辅助因子共同作用，才能识别不同的启动子。5SrRNA和tRNA基因的启动子位于转录起始点的下游，称为内部启动子（internalpromoter）。snRNA基因的启动子位于转录起始点的上游，和其他基因的启动子比较相似。4RNA转录的基本过程4.1转录的起始4.2RNA链延伸4.3转录的终止起始(Initiation)延伸(Elongation)终止(Termination)转录分三个阶段进行RNApolymerasecatalyzestranscription:RNA在转录泡(transcriptionbubble)中起始合成RNAsynthesisoccursinthetranscriptionbubble随着转录泡的迁移，RNA不断被合成，其后的DNA双链体重新形成双螺旋，取代单链的RNA和DNA单链的配对4.1转录的起始4.1.1转录起始位点的特异性控制4.1.2几种起始复合物的变换4.1.1转录起始位点的特异性控制

核心酶均等地结合到任意DNA序列上。σ因子降低了这种非序列依赖型结合，而增强了与启动子序列的特异地结合。4.1.2几种起始复合物的变换(P73)

closedbinarycomplex(闭合二元复合物)→openbinary(开放二元复合物)complex→

ternarycomplex(三元复合物)ThereareseveralstagesininitiationRNA聚合酶全酶在转录起始区的结合:三元复合物(ternarycomplex)的组成：RNA聚合酶、DNA和新生RNA4.2RNA链延伸4.2.1RNA链延伸的基本过程4.2.2RNA链延伸的暂停4.2.3RNA链延伸的再次启动4.2.1RNA链延伸的基本过程（1）核苷酸不断加到RNA链的3`-OH上，RNA链就延长。在起始到延伸过程中，DNA分子和酶分子可能发生构象变化以适应延伸过程需要。RNApolymerasechangessizeatinitiation（2）当酶从起始位点往下游移动时，解旋也随酶一起进行，而转录完成部分的DNA则重新形成完整的双螺旋，这表明DNA螺旋在酶作用下有一个可逆的过程。Elongation:polymerasesynthesizesRNA4.2.2RNA链延伸的暂停链延伸的速度不是恒定的，在DNA的某些区域，转录速度减慢或停止，这种速度的降低叫Pause，常发生在富含GC区。4.2.3RNA链延伸的再次启动被停止的RNA聚合酶可以再次启动，所有被终止的RNA聚合酶都可以通过剪切RNA转录产物产生的3`端来重新开始转录。切除反应需除RNA聚合酶以外的一些因子参与。AstalledRNApolymerasecanbereleasedbycleavingthe3endofthetranscript.RNApolymerasecanrecoverfrompausingRNApolymeraseduringelongationRNApolymeraseisstalled&backtracks3`regionofRNAiscleavedNew3`endislocatedincatalyticsiteCatalyticsiteresumeselongation53DNA原核生物转录过程中的羽毛状现象核糖体RNARNA聚合酶在同一DNA模板上，有多个转录同时在进行；转录尚未完成，翻译已在进行。这种形状说明：4.3转录的终止4.3.1转录终止概述4.3.2大肠杆菌的两类终止子4.3.3真核生物RNA合成的终止4.3.4RNA合成的抗终止4.3.1转录终止概述一旦RNA聚合酶开始转录，酶就沿模板向前移动合成RNA，直到遇到终止子序列。终止时：酶停止向正在延伸的RNA链添加核苷酸，开放三元复合物解体。终止可能既需DNA上可识别的终止序列，也需RNA产物的发夹结构。

4.3.2大肠杆菌的两类终止子

根据RNA聚合酶是否需要辅助因子参与才能终止RNA链的延伸，可将大肠杆菌中的终止子分为：（1）不依赖ρ因子型终止子内源性终止子（intrinsicterminator）在体外无其他因子参与，核心酶也能在某些位点终止转录，这些位点称内源性终止子。

DNA模板上靠近终止处，有些特殊的碱基序列，转录出RNA后，RNA产物形成特殊的结构来终止转录。①内源性终止子的基本结构1)二级结构中的发夹(长度7-20bp);发夹靠近基部通常有一个G-C富集区。2)转录单位最末端的连续约6个U残基组成的片段。这两个特点都是终止所必需的。在大肠杆菌基因组中，符合这些标准的序列约有1100个，这暗示了约一半基因拥有内源性终止子。终止需要的DNA序列位于终止位点序列之前；RNA发夹结构的形成也可能是必要的。②内源性终止子作用机理

ρ因子是大肠杆菌的一种基本蛋白质，只在终止阶段发挥作用，由6个相同亚基组成。作为RNA聚合酶的辅助因子行使功能。大肠杆菌中的ρ-依赖型终止子占所有终止子的一半左右。（2）ρ-依赖型终止子(rho-dependentterminator)①ρ因子的基本结构RhohasanN-terminalRNA-bindingdomainandaC-terminalATPasedomain.AhexamerintheformofagappedringbindsRNAalongtheexterioroftheN-terminaldomains.②ρ因子的作用机理“热追踪（hot-pursuit）”模型：

ρ因子最初结合到RNA终止子上游一个伸展的（约70个核苷酸）单链区。ρ因子结合到RNA上后，发挥它的ATP酶活性以提供在RNA上滑动的能量，直到它到达RNA-DNA杂合链区域，再发挥它的解旋酶活性，使双链体结构解开。可能ρ因子沿RNA的移动比聚合酶沿DNA移动的速度快。当酶遇到终止子时就暂停，如果ρ因子在此处赶上，则终止就发生（见下图）。ρ因子终止转录RNA聚合酶转录DNAρ因子结合到RNA上的识别位点ρ因子沿RNA移动，跟着RNA的伸展方向RNA聚合酶在终止处停止，ρ因子赶上ρ因子使DNA-RNA杂合链解旋终止：所有的组分分开RhoterminatestranscriptionRNApolymerasetranscribesDNARhoattachestorutsiteonRNARhotranslocatesalongRNARNApolymerasepausesathairpinandrhocatchesupRhounwindsDNA-RNAhybidTermination:allcomponentsreleasedArutsitehasasequencerichinCandpoorinGprecedingtheactualsite(s)oftermination.Thesequencecorrespodnstothe3`endoftheRNA.4.3.3真核生物RNA合成的终止(1)RNA聚合酶Ⅰ在18个碱基形成的终止子序列处终止转录；(2)RNA聚合酶Ⅱ终止位点的专一性可能不强，终止可发生在对应mRNA（专一序列处切割产生）成熟的3`端下游1000bp以外的位点上。(3)RNA聚合酶Ⅲ在G-C富含序列中poly(U)序列处终止转录；Whena3`endisgeneratedbytermination,RNApolymeraseandRNAarereleasedatadiscrete(terminator)sequenceinDNA.Whena3`endisgeneratedbycleavage,RNApolymerasecontinuestranscriptionwhileanendonucleasecleavesatadefinedsequenceintheRNA.

4.3.4RNA合成的抗终止(1)抗终止的定义RNA聚合酶越过一个或多个终止子实现通读。(2)抗终止的两种作用方式

①抗终止蛋白作用于RNA聚合酶。②破坏终止点RNA的茎-环结构，即破坏mRNA终止子特定的二级结构。Terminationoftranscriptioncanberegulated抗终止作用决定RNA聚合酶在终止子位点处终止还是读下去。Antiterminationextendsthetranscriptionunit抗终止蛋白可作用在RNA聚合酶上，使之越过特定终止子而通读。5原核生物与真核生物mRNA

的特征比较5.1转录发生的区域化部位5.2结构特征5.3生命周期5.1转录发生的区域化部位细菌mRNA的转录和翻译发生在单一的细胞区域化部位；其转录、翻译、降解间隔时间很短，甚至有时是偶联在一起。真核生物mRNA合成与成熟完全在细胞核内发生，而翻译在细胞质中完成；其转录、翻译、降解三者间间隔时间较长。Transcription→Translation→DegradationTranscriptionbeginsRibosomesbegintranslationDegradationbeginsat5`endRNApolymeraseterminatesat3`endDegradationcontinues,ribosomescompletetranslation原核生物mRNATranscriptionstarts:5`endismodified3`endofmRNAisreleasedbycleavage3`endispolyadenylatedmRNAistransportedtocytoplasmRibosomestranslatemRNA真核生物mRNA5.2.1原核生物mRNA

(1)许多是以多顺反子形式存在；

(2)5`端无帽子结构；

(3)3`端没有或只有较短的poly(A)。5.2结构特征

5.2.2真核生物mRNA结构特征

(1)许多是以单顺反子形式存在；转录始于核苷三磷酸（经常是A或G）。初始序列：5`pppA/GpNpNpNp…但在体外：GpppA/GpNpNpNpNp…

鸟苷酸转移酶5`5`5`-5`Gppp+pppApNpNp…

→GpppApNpNp…+PP+P

(2)真核生物mRNA的5`端存在“帽子”结构帽子覆盖了mRNA的5`端，它可在几个位点被甲基化GAAGuanine-7-methyl-transferase2`-O-methyl-transferaseCap010~15%100%mRNA5`末端帽子特征的生物学功能：I:使mRNA免遭核酸酶的破坏，保持其结构的稳定性；II:利于蛋白质起始因子的识别，从而促进翻译的起始。高等真核生物（不包括酵母）的mRNA，还具有一个共同特征：即在poly(A)添加位点的上游11-30个核苷酸区域内存在一段高度保守的AAUAAA序列。

3`端含poly(A)尾巴生物学功能：

I:保持mRNA的稳定性，防止被降解；

II:与翻译起始有关。(3)绝大部分真核生物mRNA3`端含poly(A)尾巴应用一：★Poly(A用来从总RNA中分离mRNA可设计寡聚Oligo(dT)片段合成cDNA应用二：mRNA:5`NNNN…..NNNNNNAAA…AA3`

TTT…TT5`

cDNA:3`NNNN…..NNNNNNTTT…TT5`(4)真核生物mRNA中常含有内含子EukaryoticmRNAismodified,processed,andtransported5.3生命周期原核生物mRNA寿命较短，通常只能翻译几分钟；真核生物mRNA寿命较长，可持续翻译几小时。7转录产物的加工修饰及转运降解1引言--几个重要概念2tRNA和rRNA的加工

3真核生物mRNA的加工、修饰4RNA的转运及降解

5小结1引言-几个重要概念1.1基因和顺反子1.2断裂基因、内含子和外显子1.3hnRNA、hnRNP、sRNA基因（gene):指能编码独立产物序列的特有DNA序列，基因表达的过程可以终止于RNA或蛋白质。顺反子(cistron):

指由编码一种蛋白质的DNA单位组成。Or编码单条多肽链的一个遗传功能单位，即转录单位。1.1基因和顺反子断裂基因(interruptedgene):

对一个可表达为蛋白质的基因，如果其初始转录产物(前体mRNA)与有生物学功能的成熟mRNA相比，如其间含有不能编码为蛋白质的间隔序列，则这个基因称为断裂基因。1.2断裂基因、内含子和外显子interruptedgene含有：内含子(intron)：断裂基因中，转录但通过将两端的序列（外显子）剪接在一起而被去除的转录产物所对应的DNA片段。外显子(exon):

断裂基因中，在成熟mRNA产物中存在的任何片段。IntronsareremovedtomakemRNAfromaninterruptedgeneNote:TheorderofexonsdoesnotchangebetweenDNAandRNAhnRNA(heterogeneousnuclearRNA)：不均一核RNA高等真核生物中，如果细胞核基因与其产物间在长度上存在差异，则其初始转录产物称之为hnRNA。hnRNP:核糖核蛋白颗粒hnRNA的物理结构是核糖核蛋白颗粒(hnRNP)，颗粒中蛋白质包围着hnRNA，这种hnRNA和蛋白质组成的复合物称为hnRNP。

1.3hnRNA、hnRNP、sRNA

sRNA(100-300base,0-106/cell):1）snRNA:细胞核中的小分子RNA称细胞核小RNA(smallnuclearRNA)

2）scRNA:细胞质中小分子RNA称细胞质小RNA(smallcytoplasmicRNA)。

3）snoRNA:在核仁中存在的一类小的RNA，称为核仁小RNA(smallnucleolarRNA)。2tRNA和rRNA的加工2.1前体tRNA的加工2.2前体rRNA的加工2.3RNA的编辑及化学修饰rRNA和tRNA有以下三点特性：1）所有RNA初级转录产物的5`末端均是5`-三磷酸，而成熟rRNA和tRNA分子的5`末端是5`单磷酸；2）rRNA和tRNA分子比初级转录产物小很多；3）所有tRNA含有稀有碱基。

tRNA和rRNA被加工的实验证据2.1前体tRNA的加工

tRNA的加工内容：①在核酸内切酶RNaseP作用下，从5′末端切除多余的核苷酸。②在核酸外切酶RNaseD作用下，从3′末端切除多余的核苷酸。③核苷酸转移酶催化，3′末端加CCA-OH，为tRNA加工特有反应。④核酸内切酶催化进行剪切反应，剪掉内含子，由连接酶连接外显子部分。⑤化学修饰，如甲基化、脱氨基、还原反应。TheintroninyeasttRNAPhebasepairswiththeanticodontochangethestructureoftheanticodonarm.SplicingofyeasttRNAinvitrocanbefollowedbyassayingtheRNAprecursorandproductsbygelelectro­phoresis.tRNAsplicinghasseparatecleavageandligationstages2.2前体rRNA的加工大部分rRNA是作为单一初始转录物的一部分进行合成，经过加工后才产生成熟产物。真核生物中前体包括了18SrRNA、5.8SrRNA和28SrRNA序列。在高等真核生物中，前体以沉降速率来命名，命名为45SRNA，在低等真核生物中，它比较小（如酵母中为35S）rRNAarecleavedfromacommonprecursor原核生物中前体包括了16SrRNA、23SrRNA和5SrRNA和tRNA序列。前体为30SRNA。tRNAsarecleavedfromtranscriptsofrRNAoperons2.3RNA的编辑及化学修饰RNA的编辑(RNAediting):

某些RNA，特别是mRNA的一种加工方式，它导致了DNA所编码的遗传信息的改变（如单碱基突变）（P95、96）。RNA的修饰（RNAmodification）：有些RNA，特别是前体rRNA和tRNA可能有特异性的化学修饰。

3真核生物mRNA的加工、修饰3.1mRNA5`端的加帽3.2mRNA3`端的多聚腺苷酸化3.3前体mRNA内含子的删除EukaryoticmRNAismodified,processed,andtransported

3.1mRNA5`端的加帽GAAGuanine-7-methyl-transferase2`-O-methyl-transferaseCap010~15%100%The3`endsofmRNAsaregeneratedbycleavageandpolyadenylation；ThesequenceAAUAAAisnecessaryforcleavagetogeneratea3`endforpoly­adenylation.3.2mRNA3`端的多聚腺苷酸化3.3前体mRNA内含子的删除3.3.1生物体内内含子的种类3.3.2内含子的删除机理3.3.3内含子的不同剪接方式3.3.1生物体内内含子的种类内含子类型细胞内定位GU-AG,GC-AG,AU-AC细胞核I类细胞器，细菌，低等真核生物细胞核中II类细胞器，细菌双内含子细胞器tRNA前体中的内含子细胞核3.3.2内含子的删除机理（1）GU-AG型内含子（2）GC-AG型和AU-AC型内含子（3）I类内含子和II类内含子5`splicesite含：共有序列GU3`splicesite含：保守序列AGGU-AG（最初称GT-AG）规则：描述了在前体mRNA中内含子的最初及最末位置上必须出现的恒定的双碱基Intron-exonboudarieshaveshortconsensussequencesintheintron

（1）GU-AG型内含子Correctsplicingremoves3intronsbypairwiserecognitionofthejunctionsPairingofwrongjunctionswouldremoveexons