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文档简介
会计学1DNA的粗提取与鉴定使用课题目标
目标:1本课题通过尝试对植物或动物组织中的DNA进行粗提取,了解DNA的物理化学性质,2理解DNA粗提取以及DNA鉴定的原理。课题重点:DNA的粗提取和鉴定方法。知识要点:
1.
DNA的物理化学性质,尤其是DNA的溶解性2.
二苯胺法鉴定DNA的方法和原理。第1页/共53页基础知识1、提取大分子的基本思路是什么?
选用一定的物理、化学方法分离具有不同物理或化学性质的大分子。2、提取DNA分子的基本思路又是什么?
利用DNA与RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质上的差异,提取DNA,去除其他成分。第2页/共53页3、提取和鉴定DNA的具体的依据有哪些方面?(原理)1)、DNA的溶解性
①DNA和蛋白质等其它成分在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同。
1、在什么浓度下,DNA的溶解度最小?DNA在Nacl溶液中的溶解度是如何变化的?在NaCl溶液浓度低于0.14mol/L时,DNA的溶解度随NaCl溶液浓度的增加而逐渐降低;在0.14mol/L时,DNA溶解度最小;当NaCl溶液浓度继续增加时,DNA的溶解度又逐渐增大。第3页/共53页2、如何通过控制NaCl溶液的浓度使DNA在盐溶液中溶解或析出?
当氯化钠的物质的量浓度为2mol/L时,DNA的溶解度最大,浓度为0.14mol/L时,DNA的溶解度最低。利用这一原理,可以使DNA在盐溶液中溶解或析出第4页/共53页3、提取和鉴定DNA的具体的依据有哪些方面?1)DNA的溶解性
①DNA和蛋白质等其它成分在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同。
②DNA不溶于酒精溶液,但是细胞中的某些蛋白质则溶于酒精第5页/共53页2)、DNA对酶、高温和洗涤剂的耐受性①蛋白酶只能使蛋白质水解②大多数蛋白质不能忍受60—80℃的高温而变性,但DNA在80℃以上才变性。③洗涤剂能瓦解细胞膜,但对DNA没有影响。第6页/共53页3、DNA的鉴定①沸水浴下,DNA遇二苯胺被染成蓝色;二苯胺鉴定DNA的化学原理:
DNA中嘌呤核苷酸上的脱氧核糖遇酸生成ω-羟基-γ酮基戊醛,它再和二苯胺作用而呈现蓝色(溶液呈浅蓝色)。鉴定时溶液蓝色的深浅,与溶液中DNA含量的多少有关。②紫外灯照射法:
紫外灯照射法用蒸馏水配制质量分数为0.05%的溴化乙锭(EB)溶液,将玻璃棒上缠绕的白色絮状物抹到蜡纸上,再滴1滴EB溶液染色。将蜡纸放在紫外灯(260nm)下照射(暗室中),可呈现橙红色的萤光(DNA的紫外吸收高峰在260nm处)。③甲基绿(蓝绿色)第7页/共53页实验设计(一)实验材料的选取(二)破碎细胞,获取含DNA的滤液(三)去除滤液中的杂质(四)DNA的析出与鉴定第8页/共53页实验设计(一)实验材料的选取含有DNA的组织且DNA含量较多的组织。比较下列材料哪些DNA含量高、适于提取DNA?为什么?第9页/共53页哺乳动物红细胞:大肠杆菌:
鸡血细胞:没有细胞核,没有DNA。原核生物,DNA含量少。DNA含量丰富,材料易得,易吸水胀破。DNA含量相对较高的生物组织。第10页/共53页。较好的实验材料应该满足以下几个条件
:1.组织中DNA的含量比较丰富,能够适合大量提取。2.该组织中所含化合物种类应比较单纯,避免由于其他
物质化学性质与DNA相近,从而对实验现象产生某
些干扰。3.实验材料的价格适宜,从而能相对的降低实验成本。4.实验材料在实验过程中的可操作性较强,在相对简单
的条件下能大量提取出DNA,便于学生实验操作第11页/共53页(二)破碎细胞,获取含DNA的滤液1、动物细胞:蒸馏水搅拌1、为什么加入蒸馏水能使鸡血细胞破裂?
蒸馏水对于鸡血细胞来说是一种低渗液体,水分可以大量进入血细胞内,使血细胞胀裂,再加上搅拌的机械作用,就加速了鸡血细胞的破裂(细胞膜和核膜的破裂),从而释放出DNA。
旁栏问题第12页/共53页(二)破碎细胞,获取含DNA的滤液1、动物细胞:蒸馏水搅拌2、植物细胞:洗涤剂和食盐搅拌和研磨若探究提取效果,可设置对照实验。2、加入洗涤剂和食盐的作用分别是什么?
洗涤剂是一些离子去污剂,能溶解细胞膜,有利于DNA的释放;食盐的主要成分是NaCl,有利于DNA的溶解。
旁栏问题第13页/共53页3.如果研磨不充分,会对实验结果产生怎样的影响?
研磨不充分会使细胞核内的DNA释放不完全,提取的DNA量变少,影响实验结果,导致看不到丝状沉淀物、用二苯胺鉴定不显示蓝色等。旁栏问题4.此步骤获得的滤液中可能含有哪些细胞成分?
可能含有核蛋白、多糖和RNA等杂质。第14页/共53页(三)去除滤液中的杂质方案一:
DNA在不同浓度NaCl中溶解度不同;实验设计旁栏问题5.为什么反复地溶解与析出DNA,能够去除杂质?
用高盐浓度的溶液溶解DNA,能除去在高盐中不能溶解的杂质;用低盐浓度使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。因此,通过反复溶解与析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质。第15页/共53页(三)去除滤液中的杂质方案一:
DNA在不同浓度NaCl中溶解度不同;方案二:
加入嫩肉粉(含木瓜蛋白酶)方案三:
60—75℃恒温水浴保温10—15min实验设计第16页/共53页旁栏问题6.方案二与方案三的原理有什么不同?方案二是利用蛋白酶分解杂质蛋白,从而使提取的DNA与蛋白质分开;方案三利用的是DNA和蛋白质对高温耐受性的不同,从而使蛋白质变性,与DNA分离。第17页/共53页(四)DNA的析出与鉴定:95%的冷酒精静置2—3min,出现白色丝状物玻璃棒卷起加入2mol/L氯化钠溶解,加入4mL二苯胺试剂,摇匀,沸水浴5min,观察颜色变化。
(注意设置空白对照)实验设计第18页/共53页使用冷的乙醇溶液具哪些优点?一、抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;二、降低分子运动,易于形成沉淀析出;三、低温有利于增加DNA分子柔韧性,减少断裂。第19页/共53页P56操作提示1、血液应加入柠檬酸钠(抗凝剂)防止血液凝固;2、加洗涤剂,动作要轻缓,防止产生大量气泡;加酒精、玻棒搅拌,动作要轻缓,以免加剧DNA分子的断裂。3、二苯胺试剂现配现用。第20页/共53页结果分析与评价(一)是否提取出了DNA
观察你提取的DNA颜色,如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多;二苯胺鉴定出现蓝色说明实验基本成功,如果不呈现蓝色,可能所提取的DNA含量低,或是实验操作中出现错误,需要重新制备。第21页/共53页结果分析与评价(二)分析DNA中的杂质
本实验提取的DNA粗制品有可能仍然含有核蛋白、多糖等杂质。(三)不同实验方法的比较
对于不同的实验方法,本课题可以采用分组的方法进行研究。首先选取不同的实验材料,其次同种材料还可以采用不同方法,从多方面比较实验结果,如DNA的纯度、DNA的颜色、二苯胺显色的深浅等,看看哪种实验材料、哪种提取方法的效果更好。第22页/共53页练习
提取DNA的第一步是材料的选取,其目的是一定要选取DNA含量较高的生物材料,否则会由于实验过程中或多或少的损失而造成检测的困难;第二步是DNA的释放和溶解,这一步是实验成功与否的关键,要尽可能使细胞内的DNA全部溶解;第三步是DNA的纯化,即根据DNA的溶解特性、对酶及高温的耐受性的不同等特性,最大限度地将DNA与杂质分开;最后一步是对DNA进行鉴定,这是对整个实验的结果的检测。1、请解释提取DNA的实验操作中主要步骤的目的。第23页/共53页练习
提取蛋白质比提取DNA的难度大。这是因为,与DNA相比,蛋白质对温度、盐浓度、pH等条件要敏感得多,很容易失活;并且蛋白质的空间结构多种多样,理化性质各不相同,使得蛋白质的提取没有一种统一的方法,只能根据特定蛋白质的特性摸索提取的条件,设计特定的方法。
2、你认为从细胞中提取某种特定的蛋白质与提取DNA一样容易吗?为什么?第24页/共53页案例一:以鸡血为实验材料进行DNA的粗提取实验案例②鸡血细胞极易吸水胀破,而用动物肝脏细胞作实验材料常常需要匀浆和离心,对设备要求较高,操作繁琐,历时较长1、鸡血细胞做实验材料的原因①鸡血细胞核的DNA含量丰富,材料易得第25页/共53页2、实验原理①DNA在NaCl溶液中的溶解度,是随着NaCl的浓度的变化而改变的。当NaCl的物质的量浓度为0.14mol/L时,DNA的溶解度最低。利用这一原理,可以使溶解在NaCl溶液中的DNA析出。②DNA不溶于酒精溶液,但是细胞中的某些蛋白质可以溶于酒精溶液。利用这一原理,可以进一步提取出含杂质较少的DNA。③DNA遇二苯胺(沸水浴)会染成蓝色,因此,二苯胺可以作为鉴定DNA的试剂。第26页/共53页4、课前准备鸡血细胞液取质量浓度为0.1g/ml的柠檬酸纳溶液(抗凝剂)100ml,置于500ml烧杯中。注入新鲜的鸡血(约180ml),同时用玻璃棒搅拌,使血液与柠檬酸纳溶液充分混合,以免凝血。将烧杯中的血液置于冰箱内,精置一天,使血细胞自行沉淀。(也可以将血液倒入离心管内,用1000r/min(转每分)的离心机离心2min,血细胞沉淀于离心管底部。实验时。用吸管除去离心管上部的澄清液,就可以得到鸡血细胞液。)①过程第27页/共53页②柠檬酸钠作用防止血液凝固③作用机理柠檬酸钠能与血浆中的Ca2+发生反应,生成柠檬酸钙络合物,血浆中游离的Ca2+大大减少,血液就不会凝固鸡血细胞破碎以后释放出的DNA,容易被玻璃容器吸附,所以在提取过程中为了减少DNA的损失,最好使用塑料的烧杯和试管盛放鸡血细胞液④注意事项第28页/共53页讨论:提取鸡血中的DNA时,为什么除去血液中的上清液?答:血液分为两部分,一部分是血浆,一部分是血细胞,离心后除去的上清液是血浆5、方法步骤将制备好的鸡血细胞液5mL~10mL,注入到50mL烧杯中。向烧杯中加入蒸馏水20mL,同时用玻璃棒充分搅拌5min,使血细胞加速破裂。然后,用放有纱布的漏斗将血细胞液过滤至500mL。取其滤液。①提取鸡血细胞的细胞核物质第29页/共53页第30页/共53页讨论:答:让细胞内浓度大于周围溶液的浓度,细胞会吸水以至胀破(1)为什么要加入蒸馏水?加入蒸馏水后细胞会有什么变化?(2)用玻璃棒搅拌有什么意义?答:用玻璃棒搅拌可以加速血细胞和细胞核的破裂。注意应沿一个方向快速搅拌,但也不能太快太猛,防止打碎DNA(3)滤去的是什么物质?得到的是什么?答:过滤将滤去的是细胞膜和核膜等物质;得到的是与蛋白质等物质结合在一起的DNA第31页/共53页②溶解细胞核内的DNA将氯化钠的物质的量浓度为2mol的溶40mL加入到滤液中,并用玻璃棒沿一个方向搅拌1min,使其混合均匀,这时DNA在溶液中呈溶解状态沿烧杯内壁缓缓加入蒸馏水,同时用玻璃棒不停地轻轻搅拌,这时烧杯中有丝状物出现,注意观察丝状物呈什么颜色。继续加入蒸馏水,溶液中出现的粘稠物会越来越多。当粘稠物不再增加时停止加入蒸馏水(这时溶液中氯化钠的物质的量浓度相当于0.14mol/L)③析出含DNA的粘稠物第32页/共53页第33页/共53页讨论:加入蒸馏水的目的?降低NaCl溶液浓度到使DNA溶解度最低点,使DNA从NaCl溶液中析出将溶液中的DNA与其他杂质分离,这一步骤是实验成败的关键。实验中应该缓慢贴壁加入蒸馏水,并轻轻地沿一个方向不停地均匀搅拌,以利于DNA分子的附着和缠绕注意事项:第34页/共53页④滤取含DNA的粘稠物用放有多层纱布的漏斗,过滤步骤3中的溶液至500mL的烧杯中,含DNA的粘稠物被留在纱布上⑤将DNA的粘稠物再溶解取1个50mL烧杯,向烧杯内注入氯化钠的物质的量浓度为2mol/L的溶液20mL。用钝头镊子将纱布上的粘稠物夹至氯化钠溶液中,用玻璃择不停地搅拌,使粘稠物尽可能多地溶解于溶液中第35页/共53页第36页/共53页⑥过滤含有DNA的氯化钠溶液取1个100mL烧杯,用放有两层纱布的漏斗过滤步骤5中的溶液。取其滤液,DNA溶于滤液中⑦提取含杂质较少的DNA在上述滤过的溶液中,加入冷却的、酒精的体积分数为95%的溶液50mL(使用冷却的酒精,对DNA的凝集效果较佳),并用玻璃棒搅拌,溶液中会出现含杂质较少的丝状物。用玻璃棒将丝状物卷起,并用滤纸吸取上面的水分。这种丝状物的主要成分就是DNA第37页/共53页第38页/共53页答:因为DNA不溶于冷酒精,而其他物质可以溶解在酒精中,使含杂质较少的DNA丝状物可以析出,悬浮于溶液中讨论:(2)观察丝状物呈什么颜色?答:白色(1)为什么要加50mL的冷酒精?第39页/共53页取两支20mL的试管,各加入氯化钠的物质的量浓度为0.015mol/L的溶液5mL,将丝状物放入其中一支试管中,用玻璃棒搅拌,使丝状物溶解。然后,向两支试管中各加入4mlL的二苯胺试剂。混合均匀后,将试管置于沸水中加热5min,待试管冷却后,观察并且比较两支试管中溶液颜色的变化⑧DNA的鉴定第40页/共53页第41页/共53页讨论:答:有丝状物的试管变成蓝色,另一试管还是原来颜色(2)这一鉴定结果说明什么问题?(1)比较两个试管中溶液的颜色有什么不同?答:提取出的丝状物是DNA(3)DNA的直径约为20×10-10m,实验中出现的丝状物的粗细是否表示1个DNA分子直径的大小?答:DNA分子直径只有2nm。丝状物是多个DNA子聚在一起形成的
第42页/共53页第43页/共53页答:整个实验共“两次蒸馏水,三次过滤,两次析出,六次搅拌”6、讨论:①两次蒸馏水第一次:细胞吸水胀破第一步第二次:使DNA黏稠物析出第三步(1)此实验过程中有几次使用蒸馏水?几次过滤,几次析出,几次搅拌?分别在哪一步?第44页/共53页
过滤时使用的纱布层数与需用滤液或黏稠物有关,第二次要用其滤出的黏稠物有关,所以要使用多层纱布,第一次和第三次均要用其滤液,使用的纱布为1-2层②三次过滤第一次:DNA存在于滤液里第一步第二次:DNA被留在纱布上第四步第三次:DNA存在于滤液里第六步第45页/共53页③两次析出第一次:用0.14mol/L的NaCI溶液含杂质多第三步第二次:用冷却的95%的酒精第七步④六次搅拌:第一、二、三、五、七步
其中除第八步外,其余均要朝一个方向搅拌,在第三、五步搅动还要轻缓,玻璃棒不要直插烧杯底部,这样才能保证得到完整的DNA第46页/共53页(2)为什么反复地溶解与析出DNA,能够去除杂质?答:用高盐浓度的溶液溶解DNA,能除去在高盐中不能溶解的杂质;用低盐浓度使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。因此,通过反复溶解与析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质第47页/共53页方法步骤
加入物质
目的
1.制备鸡血细胞液
柠檬酸钠溶液
①
2.提取鸡血细胞细胞核物质
20m1蒸馏水
②
3.溶解细胞核内的DNA
2m1/L的NaCI溶液40mL
③
4.析出含DNA的黏稠物
蒸馏水
④
5.滤取含DNA的黏稠物
⑤
6.将DNA的黏稠物再溶解
2mol/L的NaCl溶液20mL
⑥
7.过滤含DNA的NaCl溶液
⑦
8.提取含有杂质较少的DNA
冷却的95%的酒精50mL
⑧
A:(1)向试管中加入0.015mol/L的NaCl溶液5mL
(2)加入DNA
(3)4mL二苯胺试剂
9.DNA的鉴定
B:(1)向试管中加入0.015mol/L
的NaCl溶液5mL
(2)4mL二苯胺试剂
⑨
以鸡血为实验材料进行DNA的粗提取第48页/共53页案例二
以菜花为实验材料进行DNA的粗提取课前准备
将新鲜菜花和体积分数为95%的乙醇溶液放入冰箱冷冻室24h。提取DNA的具体步骤1.取材
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