人类基因体计划Human Genome Project (HGP)_第1页
人类基因体计划Human Genome Project (HGP)_第2页
人类基因体计划Human Genome Project (HGP)_第3页
人类基因体计划Human Genome Project (HGP)_第4页
人类基因体计划Human Genome Project (HGP)_第5页
已阅读5页,还剩16页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

人類基因體計劃HumanGenomeProject(HGP)

約翰薩爾斯頓JohnE.Sulston國際人類基因組團隊版(InternationalHumanGenomeConsortium)

美國國家衛生研究院NIH(NationalInstituteofHealth)

美國國家能源部

英國Sanger中心(衛康信託基金會贊助)

德國法國日本中國………等十五個國家

超過六十個各別的大學和研究機構,分工進行定序工作負責總單位美國國家人類基因研究院(NationalHumanGenomeResearchInstitute)塞雷拉版國際人類基因組團隊版DNA資訊來源基因藍圖由公立Gene基因藍圖由公立GeneBank和獨立資料庫同組成Bank單一來源築構基因組樣本5位不同性別種族人體數名匿名捐贈者定序鹼基長度99%連續90%(43%不連續)定序基因數目26,383完成23,147主要定序方法散彈定序法傳統physicalmapping+大片段逐步定序定位的SNPs

約兩百一十萬約一百四十萬數量耗時9個月14+年計劃主持人CraigVenterPh.D

FrancisCollinsPh.D

1968高中畢業,入伍從軍參加越戰

1972畢業於加大聖地牙哥分校學士

1975加大聖地牙哥分校生理藥學博士

1976-79任教於紐約州立大學水牛城分校

1979-91任職於美國國衛院(NIH)研究中心

1992成立非營利基因研究機構TIGR(TheInstituteofGenomicResearch)

1998與Perkin

Elmar

合作成立賽雷拉基因組公司

HumanGenomeProjectGoalsandCompletionDates

AreaGoalAchievedDateAchieved

GeneticMap2-to5-cM1-cM

(600–1,500markers)(3,000markers)September1994

PhysicalMap30,000STSs52,000STSsOctober1998

DNASequence95%gene-containingpart99%finishedto99.99%accuracyofApril2003

Cost500Mb/yearat>1,400Mb<$0.25base<$0.09baseNovember2002

Variation100,000SNPs3.7millionSNPsFebruary2003

GeneFull-lengthcDNAs15,000cDNAsMarch20031.1%的基因組為製造人體"零件"的表現序列(exons)

24%為不被蛋白序列表達的裡序列(introns)75%左右的基因序列不是沒有實際作用就是功能未知HowManyGenesAreintheHumanGenome?

冠狀病毒0.03Mb黴漿菌0.58嗜血桿菌1.8大腸桿菌4.6酵母菌12瘧原蟲23果蠅180斑馬魚1700小鼠3000人類3150阿拉伯介125Mb稻米430蕃茄1000(2x)大豆1100馬鈴薯1800棉花2118大麥4900小麥16000(6x)阿米巴原蟲類Amoebadubia

670,000Mb

阿米巴原蟲類Amoebaproteus

270,000狹葉瓶爾小草

Ophioglossum

petiolatum

160,000非洲肺魚Protopterus

aethiopicus139,000川貝母Fritillaria

assyriaca124,900

鐵炮百合Lilium

longiflorum90,000雙指兩棲螈Amphiumameans

84,000泥蠑Necturus

maculosus81,300蘚苔松類Pinus

resinosa68,000台灣百合Lilium

formosanum36,000圓篩藻屬Coscinodiscus25,000蠑螈Triturus

cristatus20,600洋蔥Allium

cepa18,000沙漠蝗蟲Schistocerca

gregaria9,300草履蟲Parameciumcaudatum8600盤古蟾蜍Bufo

bufo6900貓鯊屬Scyliorhinus[軟骨魚綱]6000土豚Orycteropus

afer5763鼠類Peromyscus

eremiticus5295原猴科Tarsius

syrichta5152猴科Cercopithecus

cephus5142猴科Cercopithecus

nigroviridis5117玉米Zea

mays5000大麥Hordeum

vulgare5000鼠類Thomomys

townsendii

4934http://www.cbs.dtu.dk/databases/DOGS/index.phpBAC100-300kb(bacterialartificialchromosome)YAC1000kb(yeastartificialchromosome)Cosmid45kbPhage20-30kbContig

連續性序列Scaffold由多個contig所連接城的大片段DNA架構GeneticMap遺傳圖譜PhysicalMap(物理)實質圖譜Draftsequence序列草圖-有片段不完整順序方向可能有些錯誤EST(ExpressedSequenceTag)

會表現的基因中所選出的小片段可作為定位標記FinishedSequence每萬(10萬)個核酸錯誤少於一個排列位置或方向均正確幾乎沒有缺口人類基因組於2003年4月15日宣佈STS(sequenceTaggedSite)當做定位或序列組合時的標記

1995嗜血桿菌1.83Mb,1740基因黴漿菌0.58Mb,517基因1996酵母菌12Mb,6000基因

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论