GCMS6890-5975内部培训教材 好资料

第一章

气相色谱/质谱基础主要内容：MS和GC检测器的对比MS的基本理论5973MSD和6890GC5973MSD和GC68505975MSD和6890GC5975在外观上与5973的不同INTERFACEGCMSD10-5Torr<2mL/min760Torr0.5-15mL/min传输线色谱柱流量控制器稳压器空气氢气载气分子筛脱水管固定进样口检测器电子部件PC限流器典型的气相色谱pptrillionppbppmppthousandpercent1ppm=1ng1Lm1mgLiter1LmLiter==TCDFIDECDAEDPIDNPD(N)NPD(P)MSD(SIM)(SCAN)FPD(S)IRDELCDELCD(SorN)(X)10-15fg10-12pg10-9ng10-6mg10-3mgGC检测器比较保留时间用于确定样品组分，即进行样品定性分析。峰面积用于测定样品的含量，即定量分析。典型色谱图柱长(米)I.D.(mm).5-102-45-100.5305-100.1-.25填充柱530系列柱细孔径柱填充柱开管柱（毛细管柱）壁涂开管柱色谱柱类型这些气体必须：根据所使用的检测器类型而选择惰性干燥纯净使用压缩气体的安全性请从贵公司的安全部门或当地气体供应商处获得安全知识。载气和检测器支持气氧气捕集器微量的氧气会破坏色谱柱，特别是对毛细管柱。氧气也会降低ECD检测器的功能。氧气捕集器应连接在分子筛干燥器和仪器安装设备的进样口之间。分子筛干燥器须使用GC专用铜管或不锈钢管。塑料管会渗透O2和其它污染物。还可能会释放其它可被检测到的干扰物。管子使用前先用溶剂冲洗，载气吹干。根据工厂的推荐，每用完3瓶气，应更换过滤器，以防止发生气体的污染。每隔一定时间，应对所有外加接头进检漏（大约每隔4-6个月。管路和净化器根据所用的柱类型，载气压力应在60-100psi(大孔径柱即取60，细孔径柱即取100)。空气压力应为80psi。推荐管线压力氢气压力应为60psi。载气必须通过控制形成恒定的压力和恒定的流量。上下游控制器压差保持1公斤以上。减压阀和流量控制器Agilent6890前视图Agilent6890侧后视图即时功能键功能键快捷键信息键数字键多功能键方法存贮与自动运行Agilent6890键盘介绍质谱基础质谱常用术语丰度质荷比(m/z)基峰分子离子碎片离子母离子子离子偶电子离子奇电子离子510152025303540455055606570758085909510010505001000150020002500300035004000450050005500600065007000750080008500900095008541561006727CH3O常见元素同位素表M/ZAbundance8216618230350100150200250

1000000Scan32(5.281min):ALKDEMO.DM/ZAbundance8216618230350100150200250

1000000Scan33(5.289min):ALKDEMO.DM/ZAbundance8216618230350100150200250

1000000Scan34(5.297min):ALKDEMO.DM/ZAbundance8216618230350100150200250

1000000Scan35(5.305min):ALKDEMO.DTimeAbundance5.255.265.275.285.295.305.315.325.33

2000000400000060000008000000TIC:ALKDEMO.D32333435313630总离子色谱125010015020025030011109876Time[minutes]Mass[daltons]气质联用数据是三维的出口气相高真空泵传输线化学工作站软件（电脑）离子源质量分析器机械泵检测器质谱仪器内部连接示意图质谱仪器分类磁质谱射频质谱（四极质谱，离子阱质谱）飞行时间质谱傅立叶变换质谱飞行时间质谱离子阱质谱傅立叶变换质谱磁质谱+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++------------------四级杆检测器离子聚焦高能打拿极电子倍增器电子正离子信号输出高能打拿极和电子倍增器(0to-3000V)+IncomingIonX-RayLens(0to218V)SignalOutEMVoltage电子倍增器电压有使用上限（3000伏）电压的提高，可以提高检测器的信号电子倍增器的寿命曲线提供足够的平均自由程提供无碰撞的离子轨道减少离子-分子反应减少背景干扰延长灯丝寿命消除放电增加灵敏度

为什么MS需要真空电离技术简介REPELLER

FILAMENTeeeeeeeeeMMMMM+.M+.FF+.12Meeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee电子电离（EI）化学电离（CI）化学式观测M/Z电荷转移X+•+MX+M+•M电子捕获M+e-(热) M- M质子转移CH5++MCH4+MH+ M+1CH3++M CH4+M-H+ M-1OH-+M H2O+M-H- M-1加成C2H5++M MC2H5+ M+29 PCI甲烷反应机理CH4e-(热电子)HCH3CH4CH4+•CH3+MMM-H+CH5+CH3•CH4M+H+230eVPCISpectraNCISpectra第二章

开机关机与工作站简介质谱的本地控制面板诊断放空/抽真空调谐运行/停止开机与关机真空系统高真空泵（扩散泵）加热区.......................................................................................出口(到机械泵)机械泵转子吸油阱进油口油液面排油口定子泵腔油液面观察窗10-1-10-2torr10-5-10-6torr真空泵到前级泵轴转速可达60,000每分钟旋转叶片固定叶片MOTORMOTORLubricatingWick分子涡轮泵开机前的准备:放气阀须关好MSD连接到接地的电源上MSD的接口伸入柱温箱老化好的毛细柱接好两端99.999%的氦载气接到GC上,推荐使用净化器.597XMSD开机顺序打开计算机打开气相色谱及597X质谱电源。待气相色谱完成自检，597X质谱真空泵工作正常（如果机械泵声音不正常，检查侧门和放空阀是否关闭）进入化学工作站从view菜单选tune/vacuumcontrol从vacuum菜单选pumpdown开机图标系统放气,关机系统放气（续）5975的位置5975开盖装置放空阀和调谐液的位置不同工作站介绍注意：所有窗口之间的切换均通过view进入工作站

用于编辑运行方法、序列、设定工作站控制级别等Qualify下拉菜单包括仪器性能检验（灵敏度测试、调谐评价等）调谐与真空控制窗口DataAnalysis数据分析窗口用于数据后处理（积分、本底扣除、谱库检索、定量分析等）ParametricRetrival参数检索窗口用于反向检索、结构库编辑等ReviewPeakPurity峰纯度检测窗口用于判断色谱峰的纯度化学工作站文件夹第三章调谐本节内容MS调谐的基本原理化学工作站中的不同调谐调谐做什么?设定离子源部件的电压,以得到良好的灵敏度设定amugain和offset以得到正确峰宽设定massgain和massoffset以保证正确的质量分配设定EM电压稳定可挥发碎片涵盖质量范围宽仅有C-13和N-15同位素无质量缺陷全氟三丁胺(PFTBA)调谐标样AMUgain,offset高能打拿极电子倍增器入口透镜推斥极离子化区域样品入口灯丝灯丝拉出极离子聚焦Massaxisgain,offset补偿调谐参数EI部件电压影响灯丝通常为70ev电子束能量推斥极0–42.7volts推离子出离子源拉出极不加电孔径入口离子聚焦0–242.0volts相对丰度入口透镜0–128mV/amu相对丰度入口透镜补偿t0–127.5volts相对丰度AMUGain0–4095AMUOffset0–255HED-10,000volts将离子转换为电子电子倍增器0–3000volts灵敏度MassAxisGain2047质量分配MassAxisOffset499质量分配离子源结构电离室：永久磁铁、灯丝、靶透镜：推斥极、拉出极、离子聚焦、入口透镜ParameterRamps四极杆质谱0+-RF振幅DC振幅极性RF频率-0+负棒RF振幅0+-正棒DC振幅两对电极上的复合电压大小相等，直流电压极性相反过滤高质量-0+负棒电位负棒M+*M+*PositiveRodPositiveRod正棒电位过滤低质量0+-{RF电压扫描线50221969DC电压斜率=AMUGAINMathieuStabilityDiagramAMUOFFSETAMUGain及其偏移AMUGAIN69219502AMUOFFSET69219502AMUGain渐增会:峰宽受影响大的是

影响高质量和低质量区AMUOffset渐增会:减小

AMUGain及其偏移如何影响峰宽?予期质量观测质量MassAxisGain100 200 300 400 50050040030020010069219502质量轴校正MassAxisoffsetMethodsofTuninganMSD方法调谐文件AutotuneATUNE.UStandardSpectraTuneSTUNE.UQuickTuneATUNE.ULowMassAutotuneLOMASS.UManualTuneUserDefinedTargetTuneBFB.UDFTPP.UTARGET.UPCITune(withCIoption)PCICH4.UNCITune(withCIoption)NCICH4.U化学工作站中提供的调谐方法为什么做自动调谐?提供:1.诊断2.编写系统性能变化表3.提高灵敏度寻找质量峰粗调EM电压和峰宽调节离子源部件使502达到最佳调节EM和峰宽达到最佳质量轴校正保存文件自动调谐流程图例如:*ThisisknownasAutoTuneontheHP5973MSD上述丰度值不是精确值，只做演示用(DefaultValue)mVamu(){69502m/zEnt.LensOffset入口透镜电压ENTR(SettoMaximizem/z69)m/z{69 502Ent.LensOffsetEntranceLensVoltageENTRmV(amu)自动调谐与标准谱图调谐比较

相近的峰宽平滑对称的峰形适当的EM电压合适的丰度值Lowwaterandair正确的质量分配典型的相对丰度自动调谐报告合适的同位素比例

质量数的峰宽平滑对称的峰合适的电子倍增器电压适当的丰度值低水峰及空气峰正确的质量分配合适的相对丰度合适的同位素比例标准谱图调谐报告Amugain和offset,EM电压及质量轴校正调整所有其它源参数不变调谐69，219，502三个质量数快速调谐69131219502m/zEntranceLensOffset目标调谐BFB调谐的评价DFTPP（十氟三苯磷）调谐评价基峰m/z=198.00可替换基峰m/z=442Mass Rel.tom/z %Low %High Alt.Base51.00 198.00 30.0 80.0 N68.00 69.00 0.0 2.0 N69.00 198.00 0.0 100.0 N70.00 198.00 0.0 2.0 N127.00 198.00 25.0 75.0 N197.00 198.00 0.0 1.0 N199.00 198.00 5.0 9.0 N275.00 198.00 10.0 30.0 N365.00 198.00 0.75 100.0 N441.00 443.00 0.01 100.0 N442.00 198.00 40.0 110.0 Y443.00 442.00 15.0 24.0 N有权使用MS参数易于建立用户调谐文件诊断手动调谐手动调谐电离室参数四极杆参数离子源参数电子倍增器电压轮廓图连续扫描离子丰度随离子源参数变化曲线影响质量轴影响峰宽(分辨与灵敏度)影响灵敏度(传输效率)通过手动调谐检漏Vacuum菜单Execute菜单Calibrate菜单Parameters菜单Edittuneanddisplayparameters选择参数把当前修改纳入调谐参数Status菜单第四章色谱进样技术分流/不分流毛细管柱进样口分解图插入件组件衬管绝缘层垫圈变径接头保温层垫圈柱螺母进样垫固定螺母进样垫O形环分流出口管线分流/不分流进样口实体固定螺母分流平板保温套衬管的作用保护色谱柱：不挥发组分滞留在衬管内。但当污染物积攒到一定量时，会吸附样品造成峰拖尾/分裂或出现鬼峰衬管内少量经硅烷化处理的石英玻璃毛可防止注射器针尖的歧视（即针尖内的溶剂和易挥发组分首先汽化）；加速样品汽化；避免固体物质进入并堵塞色谱柱等硅烷化处理可以选用DMDCS（二甲基二氯硅胺）如果使用ECD检测器或CI源，一定要选择不含卤素的硅烷化试剂。如：HMDS、BSTFA、BSA、TSIM等。如果衬管太脏，可以用盐酸或硝酸浸泡8小时，清洗烘干后用硅烷化试剂配制成10％甲苯溶液，浸泡8小时，再依次用甲苯、甲醇清洗。注意：高温下工作3，硅烷化的有效期只有几天。因此衬管需要及时清洗或更换。溶剂膨胀方程溶剂蒸汽体积=22,400xAxBxCx

I A=溶剂密度/溶剂分子量 B=15/(15+柱头压[inpsi]) C=(进样口温度[C]+273)/273

I=液体进样体积[L]例如1L水于250C15psi柱头压产生22,400x1/18x15/30x523/273x1=1,192L蒸汽18740-8022019251-6054018740-60840900uL250uL1000uL<1000uL工厂去活处理杀虫剂衬管未去活普通型250uL直接进样不分流分流/不分流不分流分流5183-47115181-8818直接连接衬管可以减少进样时样品损失底部分流平板的维护在溶剂中超声处理烘干用非氯化剂去活化HMDSBSTFABSATSIM

用溶剂清洗先惰性洗涤-甲苯再用醇类清洗-甲醇 烘干此部件须非常清洁分流过滤装置(CartridgeAssembly)CartridgeSplitVentTrapAssemblyP/NG1544-60610分流进样需注意的问题尽量减少分流歧视：分流比越大，越有可能造成分流歧视保证样品快速汽化（适当添加经硅烷化处理的玻璃毛）分流进样时，柱的初始温度尽可能高一些柱安装时注意柱与衬管同轴分流进样总流量50mL/min隔垫吹扫流量3mL/min分流出口流量46mL/min柱流量1mL/minInternalDetail衬管密封圈柱子槽进样

ColumnFlow1mL/minSplitVentFlow46mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/minTotalFlow50mL/min注射针Sample3mL/min柱流量1mL/min分流出口流量46mL/min隔垫吹扫总流量50mL/min样品汽化过载ColumnFlow1mL/minSplitVentFlow46mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/minTotalFlow50mL/min1mL/minSplitVentFlow46mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/minTotalFlow50mL/min=Solvent=Analyte节省载气节省载气功能会在样品进入色谱柱后，减少分流出口的载气流量以节约载气。柱前压和柱流速仍保持不变，只有分流出口的流量减少。可用于分流和不分流方式。节省载气启动的时间应选在样品进入色谱柱后。分流出口流量(mL/min)200-175-150-100-75-50-25--2-1012345678910预运行时间节省载气流量进样节省载气启动时间设在2.5分钟。运行结束节省载气流量正常流量不分流进样柱初始温度尽可能低一些，最好低于溶剂的沸点10-20度。溶剂要与柱子固定相匹配。衬管尺寸尽量小（0.25-1ml),使样品在衬管内尽量少稀释。最好使用直通式衬管,对于比较脏的样品,要加经硅烷化处理的玻璃毛并注意经常更换根据样品(溶剂沸点,待测组分沸点,浓度等)优化开启分流阀的时间,一般在30-80秒之间,多用0.75分钟，可以保证95%以上的样品进入柱子.溶剂效应ASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSAAAAAAAAAAAAAAA=被分析物S=溶剂SolventBPTempDichloromethane4010-30Chloroform6125-50CarbonDisulfide4610-35DiethylEther3510-25Pentane3610-25Hexane6940-60Iso-Octane9970-90溶剂与固定相须谐调.不分流进样总流量4mL/min隔垫吹扫3mL/min分流出口流量0mL/min柱流量1mL/minColumnFlow1mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/min进样SplitVentFlow0mL/minTotalFlow4mL/minSyringeNeedleSample样品进入柱子-结束SplitVentFlow0mL/minTotalFlow4mL/min=SolventVaporColumnFlow1mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/min=AnalyteVaporVentFlow3mL/minTotalFlow50mL/minColumnFlow1mL/minSplitVentFlow46mL/minVentFlow3mL/minTotalFlow50mL/minPurge阀打开–不分流结束=Solvent=Analyte=Solvent=Analyte超载ColumnFlow1mL/minSplitVentFlow(Septum)PurgeColumnFlow1mL/minSplitVentFlow(Septum)PurgeVentFlow3mL/minTotalFlow1mL/minSplitVentFlow0mL/min(Septum)PurgeVentFlow3mL/minTotalFlow4mL/min=SolventVapor=AnalyteVapor30psi(3.4ml/min)柱头压10psi(1.1ml/min)衡流方式70C10C/min22.6psi(1.1ml/min)280CTimeColumn:30m,0.25mm,0.25umCarrier:HeliumDetector:MSPulsedSplitlessInjection冷柱上进样冷柱上进样是将样品直接注入处于室温或更低温度下的色谱柱内，再逐步升高温度使样品各组分依次汽化。优点消除进样口对样品的歧视效应。避免热分解容易利用溶剂效应准确度与精密度均高于分流/不分流进样缺点进样体积小操作复杂，对初始温度、溶剂种类、进样速度等要求较严格易污染毛细管

适用于热不稳定化合物及痕量分析冷柱头进样注射器针柱子固定相样品其它进样口程序升温汽化进样口 使用PTV进样口大体积进样(LVI)，用于较晚流出组分 或不净样品的痕量分析 在冷的进样口进行大体积进样，然后进样口采用温度 阶程进样升温。

进样口使用“无隔垫顶盖”挥发进样口 从一个外加设备如顶空，吹扫捕集或毒性气体进样器引 入气体样品。其它进样口（续）程序升温汽化进样（PTV）程序升温汽化进样（PTV）是将液体或气体样品注射于低温的进样口衬管内，再按程序升高进样口的温度。优点：无注射器头的样品歧视不需要特殊注射器抑制了分流歧视可除去溶剂和低沸点组分，实现样品浓缩可低温捕集气体样品，便于同阀进样或顶空进样技术结合有多种操作模式，分流、不分流及溶剂消除模式重线性接近于冷柱头进样

CO2或液氮冷却

无隔垫，不会造成隔垫污染无隔垫吹扫，不损失样品多次进样后无泄漏最优化的端口体积，适合于毛细管柱HPPTVwithSeptumlessHeadAssembly

SeptumlessSamplingHeadGCColumnVentVentGCDetectorStep1:注样Step2:

予柱升温，使溶剂与样品分离

Step4:

目标化合物结束残留物从分流出口流出

Step3:溶剂分离结束，目标化合物进入柱子.

溶剂被分析物基质SAM分流不分流高分流流量Pre-column恒温Pre-column程序升温Pre-column程序升温烘烤GCColumnGCDetectorGCColumnGCDetectorGCColumnGCDetectorSplit/SplitlessConfigurationAPEXProSepPrecolumnSeparationInlet手动进样应注意的问题注射速度快取样准确，重现避免样品间互相干扰选用合适的注射器，用10ul进样器进样量不要小于1ul。减少注射针尖歧视：每次进样速度尽量一致，玻璃毛放在衬管中间偏下位置，即针尖到达的位置。取样后可用滤纸拭去针尖外面的残留样品，但要注意不要吸去针内样品第五章

色谱柱(占应用的90%)“相似相溶"或同极性相互作用通过样品在固定相中的分配或不同溶解度实现分离组分基于不同的极性而分离(偶极力的作用)通常例如： 醇类是极性化合物 聚乙二醇(Carbowax)是极性固定相气液色谱(GLC)柱效: 色谱柱形成尖锐峰的能力分离度: 色谱柱将两个峰彼此分开的能力选择性: 色谱柱确认两个峰化学与/或物理性质差别的能力优差优差柱分离指标分析物时间进样不保留组分tmtR'tR我们希望知道组分保留在固定相中的真实时间。将n与柱长相比：或每米塔板数(N)=nL每块理论塔板高度(HETP)=nL因此，柱效越高，“N”值越大，“HETP”值越小n=5.545tR'Wh2tR-tm=tR'tR'tR'计算柱效Rt'=调整保留时间n=有效理论塔板数Wh=半峰宽柱长(cm)不保留组分的保留时间(sec)线速度=估算不保留组分的保留时间如果溶剂是流出的第一个组分，就使用它的保留时间。也可从打火机中取5cc丁烷气，使用丁烷峰的保留时间。GC/MS用空气的保留时间使用如下公式来估算柱长：Length=

dk其中d=柱卷成的圈的直径k=柱圈圈数

=3.14使用下面的公式，可利用线速度计算流量

流量(ml/min)=r2

m60其中r=柱半径cmm=平均线速度cm/sec60=从sec到min的转换因子测量线速度和流量HETPC传质阻力项A涡流项分子扩散项m(optm)}}B{HETP=A++CmBm柱效受载气线速度和流量影响。曲线的最低点代表最小板高HETP(或最大每米理论塔板数)也就是最好的柱效。毛细管柱中不存在“A”项。柱效与载气线速度HETP与线速度形成的曲线叫做范德姆特曲线。曲线最低点的线速度值即为可获得最好柱效的最佳线速度值。使用内径更小的柱子。GC/MS要用o.25mm以下的柱子。减小固定相百分组成或固定相液膜厚度。减小进样量。选用更长的柱子。使用程序升温改善后流出组分峰形。@ 好的进样技术可以保障高柱效。进样应该紧凑快速， 以免峰展宽。如何提高柱效时间(Min.)45E52.0E53.0E54.0E55.0E56.0E5响应值RT=4.41RT=4.59RT=5.10分离度是柱将两个相邻峰分开能力的反映。通过两个欲分离相邻峰的分开程度来测算分离度。一般我们选择两个最难分开的峰，如果它们被成功分开，那么其它的也就解决了。1.18(RT-RT)21(W+W)12R=R=1.5认为可以实现基线分离

W1=化合物1的半峰宽

W2=化合物2的半峰宽分离度1.欲分离样品2.柱内径3.固定相4.柱长5.膜厚或填充剂%量A. 柱容量B. 保留能力C. 惰性D. 柱效E. 流失柱选择方面的考虑先试手边的柱子向同事咨询查询已发表的相似应用如果难以确定，先用一个非极性柱，如HP1或HP5这只是一些好的开端，而操作者必须自行优化条件。柱选择恒温程序升温在整个分析过程中，色谱炉温保持恒定。用初始时间设定运行结束时间。升温速率设为“0”。后流出的峰展宽。

当组分有较宽的沸点范围(>100°C)时使用。减少分析时间并使峰变窄。增加柱流失，引起基线漂移。可设多阶程序升温。

HP6890可设“快速变化速率”至120°C/min。柱温操作色谱柱类型载气条件色谱炉条件进样参数检测器参数样品信息

应用举例说明：

固定相商品名称固定相化学名称可替代的固定相溶剂最低温度和最高温度应用举例消耗品手册提供的信息:第六章样品采集技术讨论主题:SCAN采集方式的适用性各种数据采集参数对数据的影响Scan采集原理Time->Abundance4.765.775.886.436.807.074.505.005.506.006.507.007.50020000004000000600000080000001e+0071.2e+007TIC:DRUGDEMO.D总离子色谱MASSTIMEMS采集参数质量范围e.g.35-350A/D'se.g.N=2or4samplesper0.1amuScanhighlow,0.1amustepsSignalaveragingwith2determinationsper0.1amudatapointMASSTIME质量峰检测影响扫描时间的因素:平均每0.1amu

增加数据点的数目(samplingrate)

扫描质量范围

离子检测的真实数目

(scanthreshold)每个色谱峰通过5-10次扫描可以很好地定性!每个色谱峰通过10-20次扫描可以很好地定量!MASSTIME程序时间回扫时间扫描时间扫描循环时间数字式扫描过程1E22E23E24E25E26E27E28E29E21E31E3ABUNDANCE150.0151.0152.0153.0154.0155.0M/Z1.1E3阈值321451234532145STORES:154.10,1137用五个邻近的数据点平滑确定中心质量(质量峰最大).质量中心的水平应超过质量阈值数据文件同时储存质量和丰度阈值阈值过高82182M/Z相对强度M/Z相对强度82303182阈值设置适当阈值对质谱图质量的影响本章将学到如何输入GC参数如何输入

MS(scan)参数如何输入

MS(SIM)如何输入如何设置系统监控数据采集设置

method

是为仪器和计算机设定的采集和处理数据的一个完整指示数据采集采集方式调谐文件MS质谱应用参数GC质谱应用参数进样口参数Methods在\HPCHEM\n\Methods子目录下由“.m”扩展名识别.数据文件在\HPCHEM\n\DATA子目录下由“.d”扩展名识别.n

表示仪器编号什么是方法?仪器控制所有的仪器控制界面都可以从这一界面看到当前的方法和序列可以在标题栏看到数据分析界面用快照功能处理正在采集的数据用于定性和定量分析选择方法的某部分进行编辑方法/编辑完整方法编辑方法填入关于方法的说明选择acquisitions和analysis方法信息进样方式选择样品来源(GCorother)选择进样方式(manual,ALS,orvalve)如果是手动manual,选择进样口的位置选择“UseMS”如果用质谱采集数据；如果用GC检测器就不选自动进样器进样体积及洗针次数按Configure...设定进样针体积按More...设定取样位置等黏度：最后一次泵起至进样的时间有效值0--7样品深度：0.00表示针尖与标准瓶底距离3.6mm有效值-2——30.0进样前注射器在进样口停留时间,有效值0.00-1.00进样后注射器在进样口停留时间,有效值0.00-1.00进针速度注射器控制（More)阀进样必须先配置阀(如果安装了)用RunTime对话框，控制阀的运行事件分流模式选择"Split"输入所有的设置不分流模式选择"Splitless"输入所以的设置脉冲不分流模式选择"PulsedSplitless"输入所有设置脉冲分流模式选择"PulsedSplit"输入所有设置流量模式色谱柱流量和压力都可以随时间程序变化色谱柱设定流量模式，连接方式等参数安装柱子输入柱子编号，点击OK在目录中添加新柱子

从目录中选择柱子在目录中增加柱子从目录中删除柱子从目录中选择柱子在目录中增加柱子从目录中删除柱子更换柱子(添加新柱子于目录中)使用其他厂家柱子柱安装

选择欲安装的柱子从目录中删除柱子校正柱长步骤1首先用1微升空气进样，记录其保留时间。点击change/calibrate步骤2输入空气峰的真实保留时间步骤3步骤4步骤5输入炉温设定值炉温输入GC检测器温度设定值(如果有GC检测器)检测器保存GC检测器数据(如果有GC检测器)监控温度监视流量或压力信号输入辅助部件（MS接口）温度输入辅助部件压力辅助部件运行期间可自动运行25个时间表运行时间表为方法定义压力单位锁住HP6890键盘GC检测器柱补偿(如果有GC检测器)选项从仪器控制面板监视信号时观察GC检测器保留时间（如果有GC检测器）GC实时绘图选择用于MS采集的调谐文件MS调谐文件更改EM电压溶剂延迟采集方式编辑采集参数离子源与四极杆温度编辑时间事件表MS采集参数（SCAN）MS采集参数（续）扫描范围阈值与采样点数MS采集参数（时间和扫描范围）MS扫描参数（阈值和取样率）为每一组定义阈值和取样率MS扫描参数（绘图）定义要绘图的量和范围激活由MSSIM/Scan参数面板的“实时绘图”控制的区域定时事件检测器on/off时间程序倍增电压随时间变化程序阀时间程序用于监视MS源压力,阀和MS温度范围.MS监控适用于远距离控制监控警告器采集数据选择Method/Run点击样品瓶图标选择

Method/Run样品瓶标识采集数据样品总量稀释倍数讨论主题:选择离子检测（SIM）与扫描的区别SIM采集参数如何影响数据SIM方式如何进行数据采集选择离子检测的原则SIM是什么?只监视所选择信息的质荷比它如何做?控制质量分析器，仅仅对感兴趣的质量进行分析为什么做?提高灵敏度改善峰形改善精确度应用痕量分析复杂基质常规定量选择离子检测SIM数据采集DwelltimeSIMmass1SIMmass2SIM循环时间四极杆电压(amu)TIMESIMmass3空中时间扫描数据采集扫描时间扫描循环时间空中时间四极杆电压(amu)TIMESIM与SCAN比较选择:离子/组数目每个离子驻留时间以便获得良好的数据采集所需的循环/峰数目目标:每个峰通过15-25次循环每个离子驻留时间相同运用时间规划(SIMGroups)使采集/循环离子数目最少设置SIM采集该SIM质谱图是9-羧基THC的离子以0.1amu增加量.选择最大丰度的质量数做SIM采集动态质量校正9-CarboxyTHCTMSDerivativeMasstochargeratioin0.1amuincrements020406080100.........573.0\\\488.3\473.3371.2NormalizedAbundance\371.0\473.0\488.0动态质量校正在左图的三种可能性中选择最大丰度质量,不会导致来源于调谐与调谐之间不正确比率的错误负峰选择精确质量和整数质量对照如果自动调谐质量轴为-0.1amu离子比率将如何？左图为精确质量，右图为整数质量二者化合物相同但测定结果不同9-羧基THCTMS衍生物峰比率可以监视30离子/组,50组/采集使用最小数目的离子/组

以获得最大灵敏度和精度选择最有特征的离子高质量丰度化合物特有的可以选择化合物的特征离子以达到分类目的选择SIM离子RF电压DC电压扫描线选择153151152高--维持质量峰宽为0.6amu低(默认值)

--质量峰宽增大到0.9amu选择“LOW”可增加灵敏度低分辨方式不适合于质量差别<3amu的化合物测定(如：同位素标记内标)低或高质量分辨质谱SIM方式选择SIM采集方式编辑SIM参数SIM方式（参数）添加或删除组添加，修改或删除每组标记输入新方法名称保存方法

SIM/Scan同步采集一次进样，同时采集SIM和Scan的数据:SIM数据用于目标化合物的定量Scan数据用于未知化合物的谱库检索SIMandScan的数据保存在相同的数据文件夹中（data.ms和datasim.ms)可以使用AutoSIM的指令自动将全扫描的方法转换为SIM的方法SIM组和离子会被自动选择不需要手动建立第七章

定性分析本章将学到:数据分析主菜单的特征数据浏览工具熟练处理数据的性能积分参数利用反检索(PBM)进行定性分析自动谱库检索及报告参数恢复如何自建库定性分析数据分析窗口调用数据放大缩小图获得质谱图背景扣除峰纯度谱库检索导航键快速浏览文件夹可关闭，提供给多的界面空间数据分析中鼠标的功能及按相对丰度显示质谱图数据分析界面的鼠标右键功能可以通过点击工具栏快捷键，切换是否启动右键功能右键在导航界面，总离子流图和质谱图的内容不同本底扣除用于设置化学工作站积分参数用于保存当前化学工作站

积分参数用于加载，修复，保存化学工作站积分

参数化学工作站积分参数

积分事件表：面积加和开启/关闭

积分事件表：基线划至所有峰谷开启/关闭

积分事件表：基线后置、维持开启/关闭BaselineBack&Baselinehold基线后置BaselineBack基线维持Baselinehold

积分事件表：积分器与负峰检测开启/关闭积分器关闭/开启负峰检测开启/关闭

积分事件表：切线撇去开启/关闭用于设置RTE积分参数用于保存当前RTE积分参数用于加载，修复，保存RTE积分参数RTE积分参数峰起点与终点丰度差与峰高相比基线位置。分离相邻两峰的最少扫描次数基线落下或切线峰位置（顶点或峰重心最小峰面积最多峰数目RTE积分文件扩展名为.P提取离子色谱SIM/Scan同步数据可以选择要调用的数据通常都是同时显示。如图所示ScanSIM不纯纯峰纯度

PBM库检索运用所包含的压缩谱图质谱图浓缩谱图(15-26个最重要的峰)压缩谱图:当U+A值最大时，质谱图包含15-26质量(“最重要的峰").定义

由检索目录决定.0-100%分组唯一性和丰度的函数唯一性:丰度:意义:PBM库检索的概念选择所要检索的谱库库检索选择谱库谱库检索选择"Spectrum/SelectLibrary...”点击"OK"设定检索策略谱库检索选择"Spectrum/EditStrategy..."设定适合的参数PBM检索结果PBM检索结果文本文件检索统计表将检索报告作为方法的一部分自动谱库检索选择"Method/EditMethod..."选择"LibSearchReport"设定期望的报告风格及打印目的地自动谱库检索摘要报告参数检索参数反相检索结果选用分子结构数据库步骤在molstruc处双击左键在molstruc.sdb处双击左键点击OK建立自建库添加和编辑信息

将用户当前数据文件中的一张质谱图放入自建库建立用户自己的结构库

建立用户自己的结构库（续）建立用户自己的结构库（续）建立用户自己的结构库（续）自动化工具:DOSCAN信噪比测定信噪比测定(续)NIST检索标准谱局部放大命中者丰度表未知谱比较标准谱化合物名字检索正向（标准库的峰与未知谱对照）反向（未知谱的峰与标准库对照）纯度M：主库；R：重建库；U：自建库从tools菜单下选择MassSpectrumInterpreter进入谱图解析谱图解析以最大峰高百分比设定一阈值，高于该值的峰被解析同位素计算通过化合物名称、CAS号、分子式等信息检索AMDIS进入路径：dataanalysis/spectrum/AMDIS总离子流单一色谱峰及提取离子保留时间峰形、纯度、信噪比、特征峰等质谱图(包括自然图和重叠性）编写及运行宏程序数据采集采集方式调谐文件GC参数MS参数注射器参数定性数据分析数据库检索策略报告选项为自动检索报告选择报告格式方法流程eMethods用于在不同仪器间转移方法可以通过光盘，USB设备或电子邮件转移方法包含方法中的所有参数。例如：定量表和宏可以保留时间锁定输出一个压缩文件。扩展名为

.emeth包含数据输入后的方法的硬件配置信息输入是将文件解压成标准方法文件解压的方法是可以被修改的第八章定量基础BBBBB=基线BVBV=峰谷点BPBP=基线渗透BHHH=水平基线(基线漂移）各种积分事件校正（定量） 校正即是利用某个峰的峰高或峰面积来确定其对应组分的浓度或含量 当检测器灵敏度针对不同的组分而变化；及检测器对同一组分不同含量响应值发生变化时须做校正校正方法*面积百分比法AREA%*峰高百分比法HEIGHT%

归一化法NORM%

外标法ESTD

内标法ISTD*不是校正方法面积百分比法AREA% AREA(pk)AREA%= x100%AREA(pk) 假定检测器响应都相同所有组分都流出所有组分都被检测到优点

缺点无需做校正 以上所有的假定简单、快速的定量过程 需测量所有的组分进样量不要求严格 所有的面积都必须准确校正因子绝对响应时间RF=含量/面积校正检测器响应与组分的含量及其它组分的存在无关含量 100 100200面积 3000 2500 4000归一化法(NORM) RF(pk)xAREA(pk) NORM%= x100%[RF(pk)xAREA(pk)] 假定所有组分都流出所有组分都被检测到优点

缺点简单、快速的定量过程 所有组分峰都要流出进样量不要求严格 需测量所有的组分 必须校正所有的峰

外标法（ESTD） 含量＝面积(pk)xRF(pk) 优点 校正检测器的响应 只对欲分析的组分峰做校正 无需所有峰都能被检测到 缺点 进样量必须准确 仪器必须有良好的稳定性 需定期做再校正外标法校正过程首先准备一个混合标样，其中感兴趣组分的浓度须准确知道运行标准样品建立校正表运行待测样品并使用校正表分析它需要时进行再校正单级校正对每一峰只做一次校正单级校正中做了如下假设： 响应因子不会因为某峰对应物质的含量 变化而发生变化 响应曲线须通过原点含量响应值(A或H)含量响应值A或HA(istd)或H(istd)多级校正对每一峰需做至少两次校正可以补偿检测器对不同含量的样品组分而给出 非线性响应。响应曲线可以不通过原点定量分析多级校正过程首先准备一个混合标样，其浓度应高于欲分析物 的浓度将浓标样等梯度稀释，其中最低浓度低于待测物的浓度运行每一级稀释好的标样在每一级上进行校正运行待测样品并使用校正表分析它需要时进行再校正线性拟合（最小二乘法）含量响应值(A或H)点到点校正曲线含量响应值(A或H)非线性拟合含量响应值(A或H)含量响应值(A或H)含量响应值(A或H)含量响应值(A或H)内标法（ISTD）

RF(pk)面积(pk)含量＝ RF(ISTD)面积(ISTD)优点进样量不严格要求.内标的加入消除了由于进样量、仪器不稳定等因素带来的系统误差。只对欲分析的组分峰做校正缺点必须加一个组分进到样品，易增加面积测量误差。*内标含量=*内标含量面积(pk)面积(ISTD)RF’选择内标物的标准样品中不存在化学性质与样品相似与样品有相同的浓度范围不会与样品发生反应在感兴趣组分附近流出*可得到分离良好的、干净利落的峰色谱性质稳定可迅速容易得到定量方法总结 优点 缺点AREA% 无需校正 检测器的响应必须一致 进样量不严格要求 所有组分峰都须流出 所有组分峰都须被检测到 所有面积都须准确NORM% 进样量不严格要求 所有组分峰都须流出 所有组分峰都须测定 必须校正所有的峰ESTD 校正检测器的响应 进样量必须准确 只对感兴趣峰做校正 仪器需有很好稳定性 无需所有峰都流出 无需所有峰都被检测到

ISTD 进样量不严格要求 必须在所有样品中加入 只对感兴趣峰做校正 一个组分 校正检测器的响应 样品和标样的准备工作 更加复杂本章将学到:如何设置并调试定量数据如何编辑定量结果如何产生定量报告定量数据分析步骤3:查找限定离子步骤2:保留时间窗口内查找目标离子步骤1:在信号窗口内查找峰积分化学工作站定量概念分析标准物分析未知物建立标准曲线由曲线计算含量ResponseAmountStd1UnknownUnknownamtUnknownresponseStd2定量过程连同校正表下载方法文件.下载第一个标准数据文件选择

Calibrate/SetUpQuantitation.设置定量数据资料选择Calibrate/SetUpQuantitation...定量数据资料表参考峰窗口：用于内标非参考缝窗口：用于其它化合物相关窗口：允许目标离子与限定离子的保留时间之差默认值+/-：峰起点与终点须在此范围内浓度单位内标浓度是否用RTE积分单击"InsertAbove"输入化合物输入化合物(续)内标指令用于:增加新级别级别再校正删除级别更新校正表10。00010。000再校正分别选择对浓度和保留时间是否再校正分别对浓度和保留时选择再校正的方式（取代或平均）选择再校正的级别选择Recalibrate化合物信息-第1页化合物信息-第2页化合物信息-第3页校正曲线校正曲线自动定量数据库自动定量添加浓度级别创建定量数据库定量报告选项“MultiView”窗口结果演示交叉定量1.选择Method/EditMethod...2.选定"QuantReport"3.选定报告格式和目的地4.保存方法!!自动生成定量报告使用Qedit手动再积分当前数据声明显示在所有报告中!修改数据状态使用下列工具:TraceModeQuantLocateaPeak/LocateallCompoundsEasyID如果peaks/限定离子找不到,检查:1.积分2.数据文件中的质量数3.时间范围4.信号相关窗口如果出现奇怪的校准曲线,检查:1.数量2.积分事件3.响应定量数据库故障排除查找峰/查找所有化合物修正保留时间校正离子比率设置信号萃取窗口EasyID点击Quantitate/TraceModeQuant对痕量样品进行处理，列出所有相关化合物和内标的定量过程详细资料TraceModeQuant当每个化合物的变化相一致时非常有用总校正工具:DOLIST用户配置DOLIST选项工具:DOLIST数据采集采集方法调谐文件GC参数MS参数注射器参数定性分析选择检索检索策略报告选项对自动产生的报告中检索的结果进行检查定量分析积分选择积分参数文件定量资料库报告规格检查自动产生的定量报告方法流程自动编辑SIM方法编辑SIM方法的参数第九章

用户报告和资料库本章将学到:如何建立模板及产生报告如何建立资料库及其更新用户报告和资料库形象的运行时间程序一旦安装,直接建立\hpchem\custrpt添加CustRpt

菜单用户报告模板文件为*.crt用户报告资料库文件为*.crd

用户报告和资料库建立新报告模板编辑用户报告模板指定新报告模板用户报告D.02.00之前的版本D.02.00版从右边表中选择报告内容.从左侧所列的报告选项中选择项目.击Add键.重复至选项添加完毕.击OK.用户报告-完善报告由选择View/Edit或在工具栏中选Edit.选择一个条目，把它拖到任意单元.用NextCmpd

键或输入一个数字，观察其它化合物.当前所显示的是加亮区的值.用户报告-拖放式用户报告-格式设置打印页数控制纸张大小.用户报告-页面设置选择File/Save或File/SaveAs输入文件名并击OK.选择它，为方法建立一个作为报告模板的文件.选择它，在运行方法时打印用户报告将报告与每个文件一起保存或覆盖用户报告-保存模板加载一个定量数据文件.选择Quantitate/PrintReport.打印用户报告-交互式Start用户报告编辑方法模板选择File/MultipleFileSelect...打印用户报告-多文件所选数据文件列于此建立新资料库编辑当前数据库和/或做图将新数据库列入清单资料库D.02.00之前的版本D.02.00版从右表中选择资料库部件从左表所列数据库可能条目中选项.击Add键重复至所需部件和条目添加完毕击OK.完善资料库由选择View/Edit或在工具栏中选Edit.选择一个条目，把它拖到第3行任意单元用NextCmpd

键或输入一个数字，观察其它化合物.当前所显示的是加亮区的值.资料库-拖放式TheReportWizard格式自动生成，但你可以用Format菜单条目使之用户化.加亮的条目是你所要安排的选择一个菜单条目或在工具栏中击一个选项需要时重复.保存模板.资料库-格式TheReportWizard格式自动生成，但你可以用ChartOptions使之用户化..保存资料库.资料库-制图选择File/Save或File/SaveAs输入文件名并击OK.选择它，为方法建立一个作为资料库的文件.选择它，在运行方法时更新资料库资料库-保存资料库加载一个资料库文件.选择Quantitate/UpdateDatabase.更新资料库-交互式Start用户报告.编辑资料库选择File/MultipleFileSelect...Selecteddatafileswillbelistedinthisbox.更新资料库-多文件数据采集采集方法调谐文件GC参数MS参数注射器参数定性分析选择检索检索策略报告选项对自动产生的报告中检索的结果进行检查定量分析积分选择积分参数文件定量资料库报告规格检查自动产生的定量报告用户报告和资料库设计用户报告和/或资料库检查所产生或更新的报告方法流程第十章

序列在本节将学到:怎样通过样品“序列”自动进行分析如何建立，运行和修改序列如何设置和使用“安全控制”如何设置和使用保留时间锁定序列序列是一个完成下列任务的表:能使每个样品个别运行的整套方法.为文件名赋值.定义样品类型(样品,空白,校正,关键词).什么是序列?D.02.00版之前的界面D.02.00版编辑样品明细表建立序列方法D.02.00增加了更多的右键选项配置序列格式D.02.00增加的版本Sequence/RunSequence...停止或暂停一个序列运行序列各别命名系统为文件名赋值Swapped系统为文件名赋值用户定义命名依据所有文件名由系统自动加扩展名”。D“!!为文件名赋值序列的附加选项（Sequence/more)将另一个序列内容加入本序列为第一个文件命名第一个样品瓶号更改方法模拟序列sequence/run...或sequence/loadeorrunsequence...运行/重处理序列Sequence/Viewsequencelog复查序列输入序列信息序列可以通过LIMS系统引入。例如以CSV的文件格式引入序列可以自动的产生同时保存两种“操作方式"安全控制D.02.00版设定和修改使用者设置用户口令和能力水平安全控制帐号1701ca/da软件输入msd设定和修改使用者设置用户口令和能力水平安全控制帐号(D.02.00版）的界面通过设置"restrictedusers"添加/减少使用方法安全控制方法（左右为不同的版本的界面）Startup状态下色谱加热Standby状态在无测试样品时调用仪器Startup/Standby状态设定所有操作均须通过用户名称和口令!!安全控制操作

第十一章保留时间锁定软件消除改变色谱带来的保留时间变化使保留时间重现性更好不同次进样之间不同系统之间系统间交换方法什么是保留时间锁定？保留时间锁定即为当与某台HP6890Plus系统使用相同的色谱柱时，任何的HP6890Plus系统均可获得与之相匹配的色谱保留时间的能力。保留时间锁定可用于：任何GC检测器

(包括

MSD)任何进样口或进样器类型具有相同固定相和内径的不同长度的毛细管柱保留时间锁定(RTL)对两个不同系统锁定色谱图1416182022242628系统20.013min.系统1保留时间锁定=

被分析物保留时间匹配min.02.557.51012.51517.52022.560m目标50m新仪器对仪器，色谱柱对色谱柱，位置对位置保留时间锁定=结果的重复“60m”X250mm0.25mmHP-5,韩国，汉城(1997年10月)“60m”X250mm0.25mmHP-5,德国，威尔明顿(1997年5月)5次“标准”运行选择锁定峰RTL计算压力曲线确定RTL并保存方法保留时间锁定的步骤(RTL)注意:一旦锁定方法运行,如果你从GC面板或仪器控制改变压力，它会回到锁定值!在Agilent1701DA工作站上怎样做RTL？在五种不同的压力下运行五次，一般标准的做法是用：目标压力-20%目标压力-10%目标压力目标压力+10%目标压力+20%对每一次的运行测定目标化合物的RT将结果输入化学工作站软件，以使之建立RTL校正文件，这个文件将会成为方法的一部分。这个过程对于每一种特定方法只需做一次！

在Agilent1701DA工作站上怎样做RTL？（续）RTL校正-RT对PNIST1624b(硫181nm)的五次运行0501000501000501000501005.65.805010016psi18psi20psi(目标压力)22psi24psi6.584min.5.828min.5.976min.6.147min.(目标时间)6.347min.压力为20psi下的运行6.243min.(期望6.147)5.8020406080100120140160180在instrument栏目下选acquireRTLockcalibrationdata在工作站上完成RTL须预先编辑GC和MS参数并保存方法。RTL文件将保存于该方法中如果用自动进样器，请将样品放在1号位置点击yes,开始不同压力下的5次进样如果用手动进样，选择进样口，然后按工作站提示进样五次进样完成后，进入数据分析窗口在RTLock下选择RestoreNominalChromatogram显示第三次运行的总离子流图拖鼠标右键选择欲锁定的峰点击yes显示保留时间/压力曲线的相关系数，如果正常，点击yes输入被锁定的化合物名称点击yes输入期待的保留时间如果输入的期待时间超过20%，工作站会提示显示为实现期待保留时间所需的压力。点击yes选择该相，会出现下列窗口显示五次运行的结果选择该相会显示RTL报告。如下页所示

RetentionTimeLockingDataReportRetentionLockedMethod:C:\MSDCHEM