生物化学第七版考研考点及其分布三

生物化学第七版考研考点及其分布三第三篇DNA、RNA、蛋白质的生物合成这三章考点分散，第十三章考研涉及的比较少（可能是资料不全的原因，这部分是考博考点高频区），第十四章考过至少20次，集中在第二节（P352-356）第十章DNA生物合成1复制replication概念2DNA复制的基本规律：半保留复制，双向复制，半不连续复制3origin复制起点、genome基因组、replicon复制子、leadingstrand领头链、laggingstrand随从链4原核生物DNA聚合酶分三种类型，其中DNA聚合酶I比较重要，其功能是什么，木瓜蛋白酶酶切可分成两部分，Klenow片段，5P244“科学之家”的阅读材料里，Kornberg家族父子三人各自的贡献（2013简答）6mismatchrepair错配修复7DNA复制保真性（highfidelity）至少依赖三种机制：遵守严格的碱基配对规律；聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能；复制出错时有即时校读功能8DNAtopoisomeraseDNA拓扑异构酶9原核与真核DNA生物合成过程10冈崎片段11卫星DNAsatelliteDNA，中心体centrosome，端粒telomere12端粒酶telomerase概念、功能、爬行模型P25613reversetranscription逆转录，reversetranscriptase逆转录酶概念及作用、整合integration、ribozyme核酶、cDNAcomplementaryDNA、14噬菌体DNA滚环复制和线粒体DNA的D环复制再加上病毒的逆转录复制及简要说明各自过程（简答）P25815AmestestAmes试验P26116引起突变的分子类型17DNA损伤修复类型及修复过程（P263，考过7次以上）光修复酶photolyase（存在于植物中，人没有）、调节子regulon、SOS修复第十一章RNA生物合成（21-23补充自王镜岩生化，这些是RNA考点的高频区）1transcription转录2转录与复制相似之处：都是酶促核苷酸聚合；都以DNA为模板；都需依赖DNA的聚合酶；聚合过程都形成磷酸二酯键；都从5端向3端延伸；都遵从碱基配对规律区别：模板不同；原料不同；酶不同；产物不同；配对不同3结构基因structuralgene、转录不对称性4DNA两条链编码链=有意义链=正链=Crick链=与mRNA序列一致（T变U）模板链=反义链=负链=Waston链=编码mRNA模板（4次以上）编码链codingstrand5promoter启动子6大肠杆菌只有一种RNA聚合酶全酶为α2ββ·δ核心酶α2ββ·利福平或利福霉素专一性结合RNA聚合酶的β亚基，抑制蛋白合成7RNA聚合酶保护法8Pribnow盒、转录泡transcriptionbubble、多聚核糖体polysome、发卡hairpin9原、真核RNA合成比较10真核生物三种RNA聚合酶，各自特点（2次简单，2次以上的客观题）11α-鹅膏覃碱敏感性、羧基末端结构域carboxyl-terminaldomainDTD12启动子核心序列、顺式作用元件cis-actingelement、增强子enhancerHognest盒、管家基因housekeepinggene、GC盒和CAAT盒13转录因子transcriptionfactors分为：通用转录因子和特异性转录因子14中介子mediator、上游因子upstreamfactor、转录起始复合物pre-initiationcomplexPIC、可诱导因子induciblefactor、15II型基因中四类转录因子P27816P279拼版理论17真核mRNA加工：加帽、加尾、剪接的过程（加帽加尾没考过，剪接高频）断裂基因splitgene、外显子exon、内含子intron、18内含子功能（P284）与非编码序列是两个概念19mRAN剪接mRNAsplicing、剪接体spliceomsome、选择性剪接alternativesplicing、RNA编辑RNAediting20tRNA前体的加工21RNA拼接的四种方式类型I自我拼接、类型II自我拼接、hnRNA拼接、tRNA酶促拼接，这四类均属于顺式拼接（cis-splicing），即都在同一初级转录产物上发生的剪接，还有一种mRNA反式拼接（trans-splicing）：在剪接过程中，两条不同（或相同）的hnRNA分子间发生了剪接，将来自两个hnRNA分子上的外显子连接在一起，目前主要在锥虫和线虫中发现22由于存在拼接（splicing）、编辑（editing）和再编码（recoding），断裂基因（splitgene/interruptedgene）可以产生多种蛋白，即同源蛋白（同源体isoform）mRNA编辑、mRNA剪接、剪切cleavage、再编码recoding概念的区别：剪切cleavage：剪去某些内含子，然后在上游外显子3端直接进行多聚腺苷化，不进行相邻外显子之间的链接反应。剪切RNA的5种方式：普通方式外显子滑动、外显子延长、内含子保留、选择性外显子mRNAeditingmRNA编辑：指在mRNA水平上改变遗传信息的过程，即mRNA分子中由于核苷酸的缺失、插入或置换使基因转录物序列与基因编码序列不互补，使翻译出的蛋白氨基酸序列与不同于基因序列中编码信息的现象。mRNA编辑的方向是从3端向5端进行，与其他的相反mRNA编辑的意义：可消除移码突变的危害；增加基因产物多样性，转录出多种同源蛋白；与生物分化发育有关，是基因重要调控方式；可使基因产物获得新结构和功能，利于生物进化；可能与学习和记忆有关mRNAsplicingmRNA剪接：除去初级转录产物中的内含子，把外显子连接为成熟的mRNA称为剪接RNA剪接的意义：生物机体进化中形成，是进化的结果；是基因表达调控重要环节；主要存在于真核生物，原核生物中极少见但并非没有；内含子与外显子是相对的，有些内含子也能编码产生蛋白或功能RNAmRNArecodingmRNA再编码：mRNA改变原来的编码信息，以不同的方式进行翻译这种mRNA编码和读码方式的改变成为mRAN再编码。23RNA的生物功能多样性表现：在遗传信息翻译中起着决定多用；有重要的催化功能和其他持家功能；RNA转录后加工和修饰依赖于各类小RNA和其他蛋白复合物；对基因表达和细胞功能具有重要调节作用；RNA在生物进化中其重要作用第十二章蛋白质生物合成1蛋白生物合成三个过程：氨基酸活化；肽链合成；肽链形成后修饰2mRNA、tRNA在蛋白合成中的作用，原、真中的异同（简答、论述各一次）3codon密码子、openreadingframe开放阅读框、起始密码子AUG，终止密码子UAA、UGA、UAG，密码子五个特点：方向性，连续性，简并性（degenerate），通用性，摆动性（wobble）框移突变frameshifmutation、nonsensemutation无义突变4核糖体结构与功能，注意哪些部分有催化功能P295（至少4次，考过简答或论述）5原、真核蛋白合成过程以及区别，区别见P306页图各种酶、起始复合物（initiationcomplex）、SD序列（Shine-Dalgarnosequence）KozakconsensussequenceKozak共有序列（3次）、多肽延长的循环过程：进位、成肽、转位，具体过程与能量消耗起始蛋白因子：真核的eIF-2与原核的EF-G功能类似延长因子和释放因子原、真核也有类似的P3046蛋白质翻译后修饰（09-12年至少4次，其中论述题1次）主要为三大要点：多肽链折叠为天然构象的蛋白；蛋白质一级结构修饰主要是肽键水解和化学修饰；蛋白空间结构修饰包括亚基聚合和辅基连接——这三大要点又可各自独立称为简答题P308-3127翻译后修饰posttranslationalmodification、蛋白的靶向输送proteintargeting、分子伴侣molecularchaperon、伴侣蛋白（伴侣素）chaperonin蛋白质二硫键异构酶、肽-脯氨酰顺反异构酶8蛋白质靶向运输机理信号序列signalsequence、信号肽signalpeptide、核定位序列nuclearlocalizationsequence，NLS、信号肽识别颗粒signalrecognitionparticleSRP、内质网滞留信号序列endoplasmicreticulumretentionsignal（KDEL）、导肽（线粒体基质蛋白前体N-端保守的长度为20-35个氨基酸的信号序列，富含SerThr及碱性氨基酸）9antibiotic抗生素考过氯霉素（结合原核的50S亚基）链霉素（结合原核的30S亚基）利福平（原核RNA聚合酶的β亚基）作用10干扰素interferonIFN及其作用机制P319第十三章基因表达调控1基因表达geneexpression时序调节temporalregulation生命体在生长、发育等各个阶段中，按照一定的时间顺序对相关基因进行调控表达的模式。2可诱导基因induciblegene、可阻遏基因repressiblegene、诱导induction、阻遏repression、阻遏蛋白repressor、3协调调节coordinateregulation4DNA重排rearrngement指为适应特定需要，将一个基因从远离启动子的地方移到距启动子很近的地方从而启动转录的方式。DNAamplificationDNA扩增：为一特异蛋白质编码的基因的拷贝数选择性地增加而其他基因并未按比例增加的过程。分解代谢物基因激活蛋白catabolitegeneactivatorproteinCAP：或称cyclicAMPreceprorproteinCRP环腺苷酸受体蛋白,能与cAMP结合而活化，作用于启动子区域，促进转录，也含有螺旋-转角-螺旋（HTH）的基序。5操纵子operon、乳糖操纵子lacoperon乳糖操纵子的两个调节机制P3291阻遏蛋白负性调节：a没有乳糖存在时，调节基因（阻遏基因）表达阻遏蛋白；阻遏蛋白结合到操纵基因上，封闭结构基因，不表达酶。b存在乳糖时，乳糖被β-半乳糖酶催化为半乳糖，半乳糖与阻遏蛋白结合使得阻遏蛋白不能与操纵基因结合，结构基因被活化，相关酶表达。乳糖操纵子的阻遏蛋白含有螺旋-转角-螺旋（HTH）的基序。2CAP的正性调节：a当有葡萄糖存在时，葡萄糖被组成酶（constitutiveenzyme）降解的产物抑制了腺苷酸环化酶活性，活化磷酸二酯酶，使cAMP浓度下降，CAP含量随之下降。乳糖操纵子转录受抑制；b反之，无葡萄糖时，CAP含量促进乳糖操纵子转录。3协同调节：当阻遏蛋白封闭转录时，CAP对该系统不能发挥作用。若无CAP存在，即使没有阻遏蛋白与操纵子序列结合，操纵子仍无转录活性Crabtreeeffect克勒勃屈利效应，又称葡萄糖效应：单纯乳糖存在时，细菌利用乳糖作碳源；若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时，细菌首先利用葡萄糖而不利用乳糖的现象称为葡萄糖现象。6色氨酸操纵子调节，衰减attenuation机制1阻遏物-操纵基因调节：trp操纵子转录起始的调控是通过阻遏蛋白实现的。调节基因产生阻遏蛋白结合于trp操纵基因特异序列，阻止转录起始。但阻遏蛋白的DNA结合活性受Trp调控，Trp起着一个效应分子的作用。a在有高浓度Trp存在时，阻遏蛋白-色氨酸复合物形成一个同源二聚体，并且与色氨酸操纵子紧密结合，因此可以阻止转录。阻遏蛋白-色氨酸复合物与基因特异位点结合的能力很强，因此细胞内阻遏蛋白数量仅有20～30分子已可充分发挥作用。b当Trp水平低时，阻遏蛋白以一种非活性形式存在，不能结合DNA。在这样的条件下，trp操纵子被RNA聚合酶转录，同时Trp生物合成途径被激活。2弱化作用（attenuation）trp操纵子转录终止的调控是通过弱化作用实现的。在色氨酸操纵子的前导区编码的mRNA前导序列（leadersequence）有4个区，且有相邻的两个色氨酸密码子。a当Trp浓度很低时，负载有Trp的Trp-tRNATrp也就少，这样翻译通过两个相邻色氨酸密码子的速度就会很慢，核糖体停留在mRNA前导序列1区，转录得以完成；b高浓度的Trp使负载有Trp的Trp-tRNATrp增加，翻译通过两个相邻色氨酸密码子的速度就会很快，核糖体到达在mRNA前导序列2区，使3-4区自我配对形成茎环结构，转录终止。形成茎环结构的3-4区即衰减子（attenuator）序列。衰减子attenuator指原核生物操纵子上游中能显著减弱甚至终止转录作用的一段核苷酸序列，该区域能形成不同的二级结构，利用原核微生物转录与翻译的偶联机制对转录进行调节。7真核基因组结构特点P332（2010）单顺反子monocistron、反向重复序列invertrepeat、卫星DNAsatelliteDNA、8转录激活状态染色质的变化（至少5次）活性染色质activechromatin、CpG岛、基因组印记genomicimprinting印记控制区imprintingcontrolregionICR、组蛋白修饰histonemodification其中DNA碱基的甲基化修饰变化考过简答，组蛋白变化为2013最后的论述题9增强子enhancer沉默子silencer锌指zincfingerP33810运铁蛋白受体tansferrinreceptorTfR、铁反应元件ironresponseelementIRE、ALA合酶P340-34111小分子RNA对基因表达的调节（考研2010论述题）P341-343尤其是P343的比较图第十四章基因重组与基因工程1整合integration、化学裂解法与双脱氧测序法2基因重组包括同源重组homologousrecombination、特异位点重组sitespecificrecombination、转座重组transpositionalrecombination以及三个概念3Holliday模型的关键四步P346（问答）4细菌基因转移与重组的四种方式：接合、转化、转导、细胞融合P347（问答及客观题，其中转化考频极高）5P350页免疫球蛋白的基因重排（考博真题出现过两次论述题）只做了解6关于转座转座子transposon、逆转座子（retrotransponsons）：在基因组内存在着通过DNA转录为RNA后，再经逆转录成为cDNA并插入到基因组的新位点上的因子，被称为逆转座子，逆转座作用的关键酶为逆转录酶和整合酶。自身编码逆转录酶和/或整合酶的非传染性转座因子称为逆转录转座子7P352DNA克隆标题下的三段话包含若干名词解释DNAclone/clone、复制子replicon、嵌合DNADNAchimeras、重组DNArecombinantDNA、基因工程geneticengineering、重组DNA技术recombinantDNAtechnology、转染(transfection)指真核细胞由于外源DNA掺入而获得新的遗传标志的过程。常规转染技术可分为瞬时转染和稳定转染（永久转染）两大类8限制-修饰体系restriction-modificationsystem