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文档简介
家族遗传性胃癌:基因诊断、筛查和临床处理贾淑芹北京大学肿瘤医院
分子诊断中心1家族遗传性胃癌:基因诊断、筛查和临床处理贾淑芹1AutosomalDominantInheritedCancer
Syndromes•Breast
and
Ovarian
Cancer
BRCA1&2ColonCancerand
Polyposis2HNPCCFAPPolyposisCowdensPeutz-JehgersJuvenile
PolyposisMMRAPCMYHPTENSTK11SMAD4BMPR1AOtherGI
CancersGastricPancreasMEN1MEN2/MTCVHLLi-FraumeniCDH1p16MeninRETVHLp53北京大学肿瘤医院(PKUCH)分子诊断中心(MDC)癌症遗传基因筛查101基因panel为癌症患者及其家系成员进行风险评估、遗传咨询和干预AutosomalDominantInherited2333癌症的遗传易感性4• 谁应该做癌症遗传易感性检测?• 若携带与癌症相关的已知基因突变,患癌的风险有多大?• 对于未发病的携带者,我们能做些什么?癌症的遗传易感性4• 谁应该做癌症遗传易感性检测?• 若携带4•遗传弥漫型胃癌(HDGC)•林奇综合征(Lynch)•遗传性乳腺癌卵巢癌综合征(HBOC)•青少年息肉综合征(JPS
)•黑斑息肉综合征(
PJS)90%•家族性腺瘤息肉病(FAP
)•李-佛美尼综合征(LFS)•……家族遗传性胃癌(-)背景5•遗传弥漫型胃癌(HDGC)家族遗传性胃癌(-)背景55家族性胃癌的遗传风险6Chun&Ford,CancerJ.
2012SyndromeGeneFrequencyGC
riskHDGCCDH11-3%>56-70%Lynch
syndromeMMR1/4406-13%HBOCBRCA1&21/40-1/4002.5-5%Juvenile
PolyposisSMAD4,BMPR1A1/16-100,00021%Peutz-JegherSTK111/25-250,00030%FAPAPC1/10-100,0002-4%Li-FraumeniP531/50003-5%家族性胃癌的遗传风险6Chun&Ford,Cancer6遗传性弥漫型胃癌• 1998年,首次发现于新西兰3个毛利家族中,早发的胃癌显示出常染色体显性遗传模式• 连锁分析将基因定位于16q22.1• 在3个家系中都发现E-cadherin
(CDH-1)种系截短突变• 外显率:60岁前,70%的患者均患癌7遗传性弥漫型胃癌• 1998年,首次发现于新西兰3个毛利家族7遗传性弥漫型胃癌
常染色体显性遗传
早发:
14~69y, 平均:
37yLauren分型:
弥散型
不易早期诊断,预后差• CDH1
种系突变为特征8遗传性弥漫型胃癌 常染色体显性遗传88HDGC
诊断标准(IGCLC)2.3confirmedDGCcasesin1stor2nddegreerelativesindependentofageSingle
DGC<40PersonalorfamilyhistoryofDGCandLBC,1
case<50Single
DGC<40PersonalorfamilyhistoryofDGCandLBC,1case<5020101. 2GCcases
in
family,oneconfirmed
DGC<5020151.2GCcasesinfamily,oneconfirmed
DGC19991.2GCcasesinfamily,oneconfirmed
DGC<502.3confirmedDGCcasesin1stor2nddegreerelativesindependentofage9HDGC诊断标准(IGCLC)2.3confirmed92015
版标准解读10• 2例以上胃癌,至少其中一例是弥漫型~30-40%
种系突变• 年龄<40岁的弥漫型胃癌~10%
种系突变• 任何一个家属同时具有弥漫型胃癌和乳腺小叶癌,其中至少一例<50岁• 个人双侧乳腺小叶癌或者多个家族成员乳腺小叶癌,一例<
50岁• 患者同时具有弥漫型胃癌和唇/腭裂• 印戒细胞癌的癌前病变2015版标准解读10• 2例以上胃癌,至少其中一例是弥漫101111CDH1突变的患者印戒细胞癌中E-cadherin表达降低或缺如12CDH1突变的患者印戒细胞癌中E-cadherin表12CDH1
与患癌风险• 终生患癌风险:男性携带者--70%
GC女性携带者---56%
GC女性携带者---42%
乳腺小叶癌(LBC)• 中位发病年龄
毛利族:32
yrs其他:
43yrs13Hansford&Huntsman,JAMAOnc
2015CDH1与患癌风险• 终生患癌风险:13Hansford• 终生患癌风险:男性携带者--67%
GC女性携带者---83%
GC女性携带者---60%
乳腺小叶癌(LBC)• 18-40ys
携带者建议行预防性全胃切除术14CDH1与患癌风险(2016NCCN,
V1)• 终生患癌风险:男性携带者--67%GC14CDH1HDGC中CDH1种系突变的地域差异15• 低风险区(北美、加拿大、英国)---50%• 中风险区(德国)---25%• 高风险区(葡萄牙,意大利)
---22%• 散发性胃癌高发区(中、日、韩)
~10%HDGC中CDH1种系突变的地域差异15• 低风险区(北美、HDGC中CDH1的突变定位16HDGC中CDH1的突变定位16临床处理遗传学检测和咨询
(E-cadherinorCDH1)• 年龄<25岁或早于先证者10年,每6-12个月做一次胃镜检查,盲取活检30块• 乳腺X光
/乳腺核磁• 预防性全胃切除vanderPost,etal.Journalof
medicalgenetics,
2015.17临床处理遗传学检测和咨询(E-cadherinorCD家族遗传性胃癌(二)我们的研究18家族遗传性胃癌(二)我们的研究18Materialand
Methods19Samples:103
HDGC1500sporadic
GC3097normalcontrolMethods:16exonsPCR+
sequencing~~GC:sitesequencing~~Familiesand
controls:MLPA~~HDGCMaterialandMethods19Samples:VariablesTotalNo.ofpatients(N=1603)Age,
years≦3561>35and
<651051≧65491SexMale1145Female458Lauren
classificationIntestinal517Diffuse864GCfamilial
aggregationPositive182Negative1421HDGC(2010
criteria)82HDGC(2015
criteria)9220Results(1)Table1.Patient
informationVariablesTotalNo.ofpatientsc.1018A>G,p.T340A,7
casesc.865G>A p.A289T,1
casec.1273G>C,p.V425L,1case2.CDH1germline
mutationc.1888C>G,
p.L630V,34casesc.2165-1G>A,
1case21c.1018A>G,p.T340A,7casesc.865c.1298A>Gp.D433G,1
casec.2206G>Ap.V736M,
1casec.1103C>GTp.T368S,1
casec.1174G>Ap.V392I,
1casec.1581A>Cp.R527S,
1case22c.1298A>Gp.D433G,1casec.22061case,exon14
deletion3.CDH1rearrangementin
HDGCNormalE14delE14DELNormal23E14del1case,exon14deletion3.CDH1V736MR527SL630VA289TT340AT368SV392IV425LD433G/N4. SitesofCDH1germline
mutations---------------------------------------------------------------------------------------------Missense
mutation2165-1
G>AE14delRearrangement---------------------------------------------------------------------------------------------Splicesite
mutation24V736MR527SL630VA289T4. Siteso5.CDH1L630Vand
GC
25CDH1L630VmutationinGC
andnormal
controlstotalmutation
no.ratePNormal
control3097571.84%GC1591342.14%0.484HDGC(2010)8244.88%0.071HDGC(2015)9144.40%0.0955.CDH1L630VandGC 25CDH1L256.SummaryExonSitesTypePolymorphismFunctional prediction CasesMutationrateMutation
rateinHDGC in
HDGCMutationReferencep.T340Amissense--benign71/82
=0.0121/92
=0.01106253rsnumber MAF PloyPhen SIFT(2010) (2015) ratein
GC-2affect7 c.865G>A
missense - - possibly proteinp.A289T damaging1---- 1/734=0.0014 0function8 c.1018A>G deleteriou 6/1591=0.0s8 c.1103C>GTp.T368Smissensers367868307NAbenigntolerated1---- 1/734=0.00 0149c.1298A>Gp.D433Gmissensers376097289NApossiblyaffectdamaging
proteinfunction1----1/734=0.00140p.V392Imissensers1418640440.0008benigntolerated1----01401406/92=0.06102119 c.1174G>A 1/734=0.0affect9 c.1273G>C
missense - - possibly proteinp.V425L damaging1---- 1/734=0.00function11 c.1581A>Cp.R527S missense - - benign tolerated1---- 1/734=0.0 0014affect12 c.1888C>G probablyp.L630V missense rs2276331 G=0.0012 damaging protein364/82=0.04334/1568=0.functionaffect14 c.2206G>A probably
protein 1 -- -- 1/734=0.00p.V736M missense - - damaging 14
0function14c.2165-1G>Aspliceprobablydamagingaffectproteinfunction11/82=0.141/92=0.111/734=0.0014014E14delrearrangementaffectproteinfunctionaffectproteinfunction11/82=0.141/92=0.11--0266.SummaryExonSitesTypePolymorp26Results(2)CellfunctionstudyforCDH1
L630V27Results(2)27aminoacid
127154708 731
777882EGFR
activationExtracellular
domainJuxtamemberane
domainSrckinase
activationP38
activationL630V28aminoacid 127154708 73177788BFigure1Confirmationofwild-typeormutantCDH1(L630V)FLAGfusionproteinexpressingingastriccancercelllineandCHOcellline(ANCI-N87celllineBCHOcell
line).AFLAGβ-actin(NCI-N87cell
line)FLAGβ-actin(CHOcell
line)29BFigure1Confirmationofwild1.FunctionofL630VinNCI-N87
cell1.1TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vontheproliferationin
NCI-N87cell
line.OD
Value
(490nm)00.60.70.824h48h72h96hMockWTL630V0.50.40.30.20.130Figure2CDH1hadnosignificantdifferenceontheproliferationofNCI-N87gastriccancer
cells,Hours1.FunctionofL630VinNCI-N80%20%40%MockWTL630V24h36h
**
** 31Percentage
of
motile
cells1.2TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vonthemigrationin
NCI-N87cell
line.Figure3CDH1mutantL630VpromotedthemigrationofNCI-N87gastriccancercellsthroughwoundhealing
assay.A0%20%40%MockWTL630V24h36h *2.1TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vontheproliferationin
CHOcell
line.2.FunctionofL630VinCHOcell
line00.80.60.40.211.21.41.624h48h72h96hMockWTL630V32OD
Value
(490nm)Figure4CDH1hadnosignificantdifferenceontheproliferationofCHOcancer
cells,Hours2.1TheinfluenceofCDH1andMockWT2.2TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vonthemigrationin
CHOcell
line.0h 12h 24hFigure5CDH1mutantL630VpromotedthemigrationofCHOcancercells
throughwoundhealing
assay.Percentage
of
motile
cells20%L630V0%40%60%MockWTL630V80%12h24h**33MockWT2.2TheinfluenceofCDHDISCUSSIONCDH1anditsmutantL630Vhadno
significantinfluence
on cancercellproliferation
.CDH1mutantL630Vpromotedthemigration
ofgastriccancer
cells.34DISCUSSION34结 论• 中国人GC中CDH1种系突变以错义突变为主,突变频率为3.14%(50/1591)• HDGC中CDH1突变频率为8.53%(or
9.78%)• CDH1
T340A很可能是HDGC的致病突变• CDH1 L630V在我国正常人群和GC、HDGC人群中突变频率均无显著差异35结 论35结 论36• 90%以上的HDGC
无CDH1种系突变,CDH1种系突变可能不是我国HDGC的主要遗传易感基因。• 本研究为国内家族遗传性胃癌的预防性切除术积累数据,提供理论及实践的基础。结 论36• 90%以上的HDGC无CDH1种系突变,CD家族遗传性胃癌(三)案例分析37家族遗传性胃癌(三)案例分析3735号家系
CDH1T340A:carrier:gastriccancerLungcancerEsophegeal
cancerBreastcancerTestedCancerSomaticmutation
T340A61y3834y40y35号家系CDH1T340A:carrier61y38335号家属,34y,男性,CDH1
T340A3935号家属,34y,男性,CDH1T340A39688号家系
CDH1L630V40GC:gastric
cancerIGC:intestinal
GCEndC:endometrial
cancer688号家系CDH1L630V40GC:gastric688-241688-241688-442688-442688-843688-843688-944688-944688-1445688-1445建议流
程46• 详细地家系咨询,患者知情同意,遗传学检测• 家系随访
“肿瘤易感基因panel”检测及复检• 通知18-40y,无症状致病突变携带者在遗传门诊咨询• 建议进行胃镜检测及取24-30块活检、病检• 根据结果进一步遗传门诊治疗或随访建议建议流程46• 详细地家系咨询,患者知情同意,遗传学检4747家族遗传性胃癌:基因诊断、筛查和临床处理贾淑芹北京大学肿瘤医院
分子诊断中心1家族遗传性胃癌:基因诊断、筛查和临床处理贾淑芹48AutosomalDominantInheritedCancer
Syndromes•Breast
and
Ovarian
Cancer
BRCA1&2ColonCancerand
Polyposis49HNPCCFAPPolyposisCowdensPeutz-JehgersJuvenile
PolyposisMMRAPCMYHPTENSTK11SMAD4BMPR1AOtherGI
CancersGastricPancreasMEN1MEN2/MTCVHLLi-FraumeniCDH1p16MeninRETVHLp53北京大学肿瘤医院(PKUCH)分子诊断中心(MDC)癌症遗传基因筛查101基因panel为癌症患者及其家系成员进行风险评估、遗传咨询和干预AutosomalDominantInherited4950350癌症的遗传易感性51• 谁应该做癌症遗传易感性检测?• 若携带与癌症相关的已知基因突变,患癌的风险有多大?• 对于未发病的携带者,我们能做些什么?癌症的遗传易感性4• 谁应该做癌症遗传易感性检测?• 若携带51•遗传弥漫型胃癌(HDGC)•林奇综合征(Lynch)•遗传性乳腺癌卵巢癌综合征(HBOC)•青少年息肉综合征(JPS
)•黑斑息肉综合征(
PJS)90%•家族性腺瘤息肉病(FAP
)•李-佛美尼综合征(LFS)•……家族遗传性胃癌(-)背景52•遗传弥漫型胃癌(HDGC)家族遗传性胃癌(-)背景552家族性胃癌的遗传风险53Chun&Ford,CancerJ.
2012SyndromeGeneFrequencyGC
riskHDGCCDH11-3%>56-70%Lynch
syndromeMMR1/4406-13%HBOCBRCA1&21/40-1/4002.5-5%Juvenile
PolyposisSMAD4,BMPR1A1/16-100,00021%Peutz-JegherSTK111/25-250,00030%FAPAPC1/10-100,0002-4%Li-FraumeniP531/50003-5%家族性胃癌的遗传风险6Chun&Ford,Cancer53遗传性弥漫型胃癌• 1998年,首次发现于新西兰3个毛利家族中,早发的胃癌显示出常染色体显性遗传模式• 连锁分析将基因定位于16q22.1• 在3个家系中都发现E-cadherin
(CDH-1)种系截短突变• 外显率:60岁前,70%的患者均患癌54遗传性弥漫型胃癌• 1998年,首次发现于新西兰3个毛利家族54遗传性弥漫型胃癌
常染色体显性遗传
早发:
14~69y, 平均:
37yLauren分型:
弥散型
不易早期诊断,预后差• CDH1
种系突变为特征55遗传性弥漫型胃癌 常染色体显性遗传855HDGC
诊断标准(IGCLC)2.3confirmedDGCcasesin1stor2nddegreerelativesindependentofageSingle
DGC<40PersonalorfamilyhistoryofDGCandLBC,1
case<50Single
DGC<40PersonalorfamilyhistoryofDGCandLBC,1case<5020101. 2GCcases
in
family,oneconfirmed
DGC<5020151.2GCcasesinfamily,oneconfirmed
DGC19991.2GCcasesinfamily,oneconfirmed
DGC<502.3confirmedDGCcasesin1stor2nddegreerelativesindependentofage56HDGC诊断标准(IGCLC)2.3confirmed562015
版标准解读57• 2例以上胃癌,至少其中一例是弥漫型~30-40%
种系突变• 年龄<40岁的弥漫型胃癌~10%
种系突变• 任何一个家属同时具有弥漫型胃癌和乳腺小叶癌,其中至少一例<50岁• 个人双侧乳腺小叶癌或者多个家族成员乳腺小叶癌,一例<
50岁• 患者同时具有弥漫型胃癌和唇/腭裂• 印戒细胞癌的癌前病变2015版标准解读10• 2例以上胃癌,至少其中一例是弥漫575811CDH1突变的患者印戒细胞癌中E-cadherin表达降低或缺如59CDH1突变的患者印戒细胞癌中E-cadherin表12CDH1
与患癌风险• 终生患癌风险:男性携带者--70%
GC女性携带者---56%
GC女性携带者---42%
乳腺小叶癌(LBC)• 中位发病年龄
毛利族:32
yrs其他:
43yrs60Hansford&Huntsman,JAMAOnc
2015CDH1与患癌风险• 终生患癌风险:13Hansford• 终生患癌风险:男性携带者--67%
GC女性携带者---83%
GC女性携带者---60%
乳腺小叶癌(LBC)• 18-40ys
携带者建议行预防性全胃切除术61CDH1与患癌风险(2016NCCN,
V1)• 终生患癌风险:男性携带者--67%GC14CDH1HDGC中CDH1种系突变的地域差异62• 低风险区(北美、加拿大、英国)---50%• 中风险区(德国)---25%• 高风险区(葡萄牙,意大利)
---22%• 散发性胃癌高发区(中、日、韩)
~10%HDGC中CDH1种系突变的地域差异15• 低风险区(北美、HDGC中CDH1的突变定位63HDGC中CDH1的突变定位16临床处理遗传学检测和咨询
(E-cadherinorCDH1)• 年龄<25岁或早于先证者10年,每6-12个月做一次胃镜检查,盲取活检30块• 乳腺X光
/乳腺核磁• 预防性全胃切除vanderPost,etal.Journalof
medicalgenetics,
2015.64临床处理遗传学检测和咨询(E-cadherinorCD家族遗传性胃癌(二)我们的研究65家族遗传性胃癌(二)我们的研究18Materialand
Methods66Samples:103
HDGC1500sporadic
GC3097normalcontrolMethods:16exonsPCR+
sequencing~~GC:sitesequencing~~Familiesand
controls:MLPA~~HDGCMaterialandMethods19Samples:VariablesTotalNo.ofpatients(N=1603)Age,
years≦3561>35and
<651051≧65491SexMale1145Female458Lauren
classificationIntestinal517Diffuse864GCfamilial
aggregationPositive182Negative1421HDGC(2010
criteria)82HDGC(2015
criteria)9267Results(1)Table1.Patient
informationVariablesTotalNo.ofpatientsc.1018A>G,p.T340A,7
casesc.865G>A p.A289T,1
casec.1273G>C,p.V425L,1case2.CDH1germline
mutationc.1888C>G,
p.L630V,34casesc.2165-1G>A,
1case68c.1018A>G,p.T340A,7casesc.865c.1298A>Gp.D433G,1
casec.2206G>Ap.V736M,
1casec.1103C>GTp.T368S,1
casec.1174G>Ap.V392I,
1casec.1581A>Cp.R527S,
1case69c.1298A>Gp.D433G,1casec.22061case,exon14
deletion3.CDH1rearrangementin
HDGCNormalE14delE14DELNormal70E14del1case,exon14deletion3.CDH1V736MR527SL630VA289TT340AT368SV392IV425LD433G/N4. SitesofCDH1germline
mutations---------------------------------------------------------------------------------------------Missense
mutation2165-1
G>AE14delRearrangement---------------------------------------------------------------------------------------------Splicesite
mutation71V736MR527SL630VA289T4. Siteso5.CDH1L630Vand
GC
72CDH1L630VmutationinGC
andnormal
controlstotalmutation
no.ratePNormal
control3097571.84%GC1591342.14%0.484HDGC(2010)8244.88%0.071HDGC(2015)9144.40%0.0955.CDH1L630VandGC 25CDH1L726.SummaryExonSitesTypePolymorphismFunctional prediction CasesMutationrateMutation
rateinHDGC in
HDGCMutationReferencep.T340Amissense--benign71/82
=0.0121/92
=0.01106253rsnumber MAF PloyPhen SIFT(2010) (2015) ratein
GC-2affect7 c.865G>A
missense - - possibly proteinp.A289T damaging1---- 1/734=0.0014 0function8 c.1018A>G deleteriou 6/1591=0.0s8 c.1103C>GTp.T368Smissensers367868307NAbenigntolerated1---- 1/734=0.00 0149c.1298A>Gp.D433Gmissensers376097289NApossiblyaffectdamaging
proteinfunction1----1/734=0.00140p.V392Imissensers1418640440.0008benigntolerated1----01401406/92=0.06102119 c.1174G>A 1/734=0.0affect9 c.1273G>C
missense - - possibly proteinp.V425L damaging1---- 1/734=0.00function11 c.1581A>Cp.R527S missense - - benign tolerated1---- 1/734=0.0 0014affect12 c.1888C>G probablyp.L630V missense rs2276331 G=0.0012 damaging protein364/82=0.04334/1568=0.functionaffect14 c.2206G>A probably
protein 1 -- -- 1/734=0.00p.V736M missense - - damaging 14
0function14c.2165-1G>Aspliceprobablydamagingaffectproteinfunction11/82=0.141/92=0.111/734=0.0014014E14delrearrangementaffectproteinfunctionaffectproteinfunction11/82=0.141/92=0.11--0266.SummaryExonSitesTypePolymorp73Results(2)CellfunctionstudyforCDH1
L630V74Results(2)27aminoacid
127154708 731
777882EGFR
activationExtracellular
domainJuxtamemberane
domainSrckinase
activationP38
activationL630V75aminoacid 127154708 73177788BFigure1Confirmationofwild-typeormutantCDH1(L630V)FLAGfusionproteinexpressingingastriccancercelllineandCHOcellline(ANCI-N87celllineBCHOcell
line).AFLAGβ-actin(NCI-N87cell
line)FLAGβ-actin(CHOcell
line)76BFigure1Confirmationofwild1.FunctionofL630VinNCI-N87
cell1.1TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vontheproliferationin
NCI-N87cell
line.OD
Value
(490nm)00.60.70.824h48h72h96hMockWTL630V0.50.40.30.20.177Figure2CDH1hadnosignificantdifferenceontheproliferationofNCI-N87gastriccancer
cells,Hours1.FunctionofL630VinNCI-N80%20%40%MockWTL630V24h36h
**
** 78Percentage
of
motile
cells1.2TheinfluenceofCDH1anditsmutantL630Vonthemigrationin
NCI-N87cell
line.Figure3CDH1mutantL630VpromotedthemigrationofNCI-N87gastriccancercellsthroughwoundhealing
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