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文档简介
WB过程中的常见问题及处理方法WB的简介WB即蛋白质印迹法(WesternBlot)。它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。
基本原理通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色,分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中的表达情况的信息。三、WB的影响因素步骤较多,任何一步都可能影响结果1、电泳分离蛋白蛋白抽提;蛋白定量;样品制备变性;上样量;电泳(电压、电流的大小,胶浓度、制胶)3、封闭封闭液的选择;封闭条件优化;……5、抗体孵育抗体及稀释液选择;抗体稀释倍数优化;抗体孵育时间;……四、注意事项1.蛋白样品的提取尽可能新鲜组织或蛋白避免反复冻融对于有些蛋白,加去磷酸化的(NaF)尽量去除核酸,多糖,脂类等干扰分子(通过加入核酸酶或采取不同提取策略)
选择合适的裂解液准确定量(BSA标准蛋白)
2、制胶根据不同的蛋白大小,选择不同的浓度制胶。制胶的时候一定要注意玻璃板一定要干净,不能有残留的胶。玻璃板底部放平,尽量不能漏胶灌胶的时候,不能太快,容易产生旋窝水或异丙醇压的时候,不能太久
3、转膜a泡膜:转膜之前将海绵、胶、膜都用预冷的转移液浸泡20min;
凝胶若是没在预冷的转膜buffer中浸泡,就会在转膜过程中出现凝胶皱缩,导致出现转移条带变形bPVDF膜具有疏水性,需用甲醇浸泡,活化g夹好膜和凝胶后,确定在凝胶/膜和滤纸之间没有气泡存在,否则会导致转膜不完全h保证膜和滤纸的大小和凝胶完全一样,过大和过小都会影响转膜效率i一定要注意膜的保湿,避免膜的干燥,否则极易产生较高的背景4、封闭a脱脂奶粉不能与生物素化或伴刀豆蛋白标记的抗体一起使用,因为脱脂奶粉含有糖蛋白和生物素b如果封闭剂中含磷酸酶,用磷酸化特异性抗体分析磷酸化蛋白受到影响,因为磷酸酶与印记膜上的磷酸化蛋白接触可使之去磷酸化c检测磷酸化抗体时,不能使用酪蛋白/脱脂奶粉作为封闭剂五、常见问题及解决电泳中的问题︶条带呈笑脸状——凝胶不均匀冷却,中间冷却不好;——电泳系统温度偏高︵条带呈皱眉状
可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全纹理(纵向条纹)样品中含有不溶性颗粒条带偏斜电极不平衡或者加样位置偏斜条带两边扩散加样量过多4、二抗非特异性结合或与封闭剂交叉反应——设置二抗对照(不加一抗),降低二抗浓度5、洗膜不充分——增加洗涤次数,增加洗膜次数没有阳性条带或很弱1、一抗、二抗等不匹配订购试剂时认真选取一抗与组织种属,一抗与二抗或/和底物与酶系统之间相匹配的抗体及底物。可通过设置内参可以验证二级测系统的有效性更换更好的一抗二抗2、一抗或/和二抗浓度低增加抗体浓度;长孵育时间;3、封闭剂与一抗或二抗有交叉反应封闭时使用温和的去污剂,如TWEEN20更换封闭剂(常用的脱脂奶、BSA、血清或明胶)4、样本中无靶蛋白或靶蛋白含量过设置阳性对照,如果阳性对照有结果,但标本没有则可能是标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。后者可增加标本上样量至少每孔20-30ug蛋白,样本制备时使用蛋白酶抑制剂,或分级提取目5、转膜不充分,或洗膜过度使用丽春红S检测转膜效果,PVDF膜需浸透,需正确的转膜操作,勿过度洗膜6、曝光时间过短
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