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文档简介
现代实验技术概述研究思路
整体(动物模型、ELISA)
组织、细胞(组织、细胞培养)
分子(RNA、DNA、Protein)
基因(基因克隆)整体研究动物模型自发性动物模型(SpontaneousAnimalModels)是指实验动物未经任何有意识的人工处置,在自然情况下所发生的疾病。这类模型在遗传病、代谢病、免疫缺陷病、内分泌疾病和肿瘤等方面的应用正日益增多。诱发性或实验性动物模型(ExperimentalAnimalModels)是指研究者通过使用物理的、化学的和生物的致病因素作用于动物,造成动物组织、器官或全身一定的损害,出现某些类似人类疾病时的功能、代谢或毒使动物患相应的传染病,又如用化学致癌剂、放射线、致癌病毒诱发动物的肿瘤等。是药物筛选研究工作所首选。
ELISAELISA可用于测定抗原,也可用于测定抗体。三个必要的试剂:(1)固相的抗菌素原或抗体,即“免疫吸附剂”(immunosorbent);(2)酶标记的抗原或抗体,称为“结合物”(conjugate)(3)酶反应的底物。ELISA双抗体夹心法测抗原
双抗原夹心法测抗体
组织、细胞培养培养:将取得的组织、细胞接入培养瓶或培养板中的过程称为培养。
理论上讲各种动物和人体内的所有组织都可以用于培养,实际上幼体组织(尤其是胚胎组织)比成年个体的组织容易培养,分化程度低的组织比分化高的容易培养,肿瘤组织比正常组织容易培养。组织、细胞培养组织块培养:直接将组织块接入培养器皿底部,几个小时后组织块可贴牢在底部,再加入培养基。细胞培养:一般应在接入培养器皿之前进行细胞计数,按要求以一定的量(以每毫升细胞数表示)接入培养器皿并直接加入培养基。细胞进入培养器皿后,立即放入培养箱中,使细胞尽早进入生长状态。CO2培养箱
分子水平研究
转录
翻译
DNA
RNA
Protein
逆转录
中心法则核酸制备步骤破碎细胞提取纯化总RNA的提取
RNA的提取目前阶段主要可采用两种途径:1)提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来;2)直接在酸性条件下抽提,酸性下DNA与蛋白质进入有机相而RNA留在水相关键的是抑制RNA酶活性
TRIZOL法
TRIZOL试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。氯仿离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。异丙醇沉淀还原水样层中的RNA。在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。
完整RNA的提取和纯化,是进行RNA方面的研究工作,如Nothern杂交、mRNA分离、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及体外翻译等的前提DNA的提取从各种材料中提取DNA方法不同,分离提取的难易程度也不同。对于低等生物如从病毒中提取DNA比较容易,多数病毒DNA分子量较小,提取时易保持其结构完整性。从细菌及高等动植物中提取DNA难度大一些。细菌DNA分子量较大,一般达2×10道尔顿。因此易被机械张力剪断。细菌DNA,除核DNA外,还有质粒DNA等。蛋白质提取基本步骤:清洗组织/细胞(缓冲盐液)裂解细胞(裂解液)离心去除膜组分等获得可溶性蛋白质纯化(离心、层析、电泳等)电泳概念:带电物质在电场中向相反电极移动的现象称为电泳(electrophoresis)。原理:在一定pH条件下,每一种分子都具有特定的电荷(种类和数量)、大小和形状,在一定时间内它们在相同电场中泳动速度不同,各自集中到特定的位置上而形成紧密的泳动带。当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidiumbromide,EB)染色,在紫外光下至少可以检出1-10ng的DNA条带,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置。此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA条带,用于以后的克隆操作。琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。
琼脂糖凝胶分离DNA片度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA片段。其分辨率比聚丙烯酰胺凝胶低,但制备容易,分离范围广,尤其适于分离大片段DNA。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。
聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的一种电泳方法。
聚丙烯酰胺凝胶具有机械强度好,有弹性,透明,化学性质稳定,对pH和温度变化小,没有吸附和电渗作用小的特点。用于核酸和蛋白质的分离、纯化及检测。聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高。
聚丙烯酰胺凝胶电泳按原理和操作形式的不同,主要有不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶等电聚焦电泳,双向电泳等类型。水平板式电泳槽垂直板式电泳槽反转录聚合酶链式反应(Reversetranscription-Polymerasechainreaction)
抽提RNA总RNARTcDNAPCRDNAAnalysis:QuantificationorcDNAcloneRT-PCRPCR-聚合酶链式反应体外高效、快速、特异地扩增目的基因或DNA片段。原理:类似于DNA的体内复制在试管中的DNA的体外合成。用于基因分离克隆,序列分析,基因表达调控,基因多态性研究等许多方面。◆◆◆引物1引物2模板PCR原理示意图目的基因增加2n20~30循环94℃变性5’3’3’5’变性94℃引物退火45-65℃延伸72℃PCR过程示意图模板PCR反应产物积累规律示意图平台期产物量时间(循环数)PCR反应五要素引物(primer)酶(TaqDNApolymerase)dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)模板(template)Mg2+(magnesium)实时荧光定量PCR常规PCR:借助电泳对扩增反应的终产物进行半定量及定性分析实时荧光定量PCR技术:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,最终精确的对起始模板的定量分析淬灭基团R荧光定量PCR示意图模板DNADNA探针RQQ报告基团WesternBlotting§印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。§1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNA-RNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。§而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法。WesternBlotting蛋白质分离:十二烷基磺酸钠―聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)蛋白质转印:蛋白质转移到硝酸纤维素膜(NC)上,称为一个印迹(blot)固相免疫测定(ECL):一抗、酶标二抗、底物NorthernBlottingRNA片段经电泳后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜上,然后用探针杂交。被检对象为RNA,探针为DNA或RNA。应用:检测某一组织或细胞中已知的特异mRNA的表达水平。比较不同组织或细胞的同一基因的表达情况。提取RNA琼脂糖凝胶变性电泳碱变性、转移到NC膜与DNA或RNA探针杂交放射自显影Northern印迹杂交NorthernBlottingRNA分离:琼脂糖凝胶变性电泳(去除RNA
中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离)RNA转印:RNA转移到硝酸纤维素滤膜上探针杂交X光片进行放射自显影
pancreaskidneyskeletalliverlungplacentabrainheartGEFmRNANorthernblottinghybridization基因克隆
基因克隆(分子克隆molecularcloning)应用酶学的方法,在体外将目的基因与载体DNA结合成一具有自我复制能力的DNA分子(复制子、重组体),继而通过转化或转染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子拷贝,或其表达产物。基因克隆示意图基本步骤提取目的基因:人工基因合成法(RT-PCR)目的基因与载体结合:限制性内切酶、DNA连接酶将目的基因导入受体细胞:转化目的基因的检测和表达:无表达产物无表达产物有表达产物无表达产物载体(Vector):是指运载外源DNA有效进入受体细胞内的工具。
限制性核酸内切酶:切割DNADNA连接酶:生成3’-5’磷酸二酯键原核载体:质粒(pBR322,pUC…)、噬菌
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