生物信息学复习资料全

欢迎下载内容仅供参考一、名词解释(31个)信息科学。狭义：应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。二级数据库实验数据和理论分析的根底上针对特定的应用目标而建立的。序列的功能区域，也可用于研究一组蛋白质之间的进化关系。是研究物种进化和系统分类的一种方法，其常用一种类似树称为系统发育树。是进化保守的并且在其他物种中具有直系同源性。指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。〔来自百度〕FASTADNA苷酸或氨基酸字符串。开放阅读框〔ORF〕：密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。〔来自百度〕域，折叠得较为严密，各行其功能，称为结构域。位并进展罚分，以控制空位插入的合理性cDNAcDNA3’5GeneOntology协会：HMM隐马尔可夫模型：将核苷酸序列看成一个随机序列，DNAMarkov的归类整理和注释DNA质的同一氨基酸位置的一样的氨基酸成员,可用百分比表示。占的比例。是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTXTblastx：是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的Tblastx：是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的6条可能的蛋白序列产生36种比对阵列。〔来自百度〕KEGG：者把基因与表达信息作为一个整体网络进展研究。ChIP-Seq：ChIPDNA分子生物网络：PPI号转导和遗传网络的角度研究这种相关性。高通量测序：一次性对几百万到十亿条DNA的分析，所以又被称为深度测序。拟。NCBInr：GT-AGEntrez二、选择题〔30个〕mRNAAA.dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGSA.NDB数据库、C.GenBankD.SWISS-PROTPIRA.B.mRNAC.D据库以下哪一项不属于启动子研究围？〔〕A.CpG岛预测、BC.糖基化修饰、D.甲基化检测HTGS的含义是〔C〕。A.表达序列标签、B.序列标签位点、C序列、D.人工合成序列STS的含义是〔〕。A.表达序列标签、B.序列标签位点、C列、D.人工合成序列HGPCA.B.C.组计划、D.水稻基因组计划8、以下中属于一级蛋白质结构数据库的是：〔〕A.EMBL、B.DDBJ、C.PDB、D.SWISS-PROT9．BLAST教案所程序中，哪个方法是不存在的？〔〕A.BLASTP、B.BLASTN、C.BLASTX、D.BLASTQ10A.基因进化、B.基因数目、C.基因重复序列、D.基因组复制11、以下哪个选项不是微阵列实验设计的容？〔〕A.贝叶斯网络法、B.对照组的选择、C.重复样本的使用、D.随机化原那么12、构建序列进化树的一般步骤不包括.〔〕A.建立DNA文库、B.建立数据模型、C.建立取代模型、D.建立进化树13GenbankWebA.BankIt、B.Sequin、C.VersionD.Matrix14A.PIR、B.Uniprot、C.SWISS-PROT、D.OMIM15A.Genbank、B.GenPept、C.EMBL、D.DDBJ16NCBINCBIA.Retrieve、B.SRS、C.Entrez、D.PIR17、EntrezA.500B.1000C.5000D.1000018A.nnpredictB.PredictProteinC.SingalDD.SingalP19、Bioinformatics的含义是〔〕。A. 生物信息学、B. 基因组学、C. 白质组学、D. 表观遗传学20、目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是〔〕。A.卡方检验、B.相关分析、C. 聚类分析、D. 正态性分布检验21NCBIA.UniGeneB.UniProC.UniRef、D. URF22根本局部比对搜素工具〔A. MegaB. ClustalWC. BLASTD. GCG23、根据研究发现，人类基因组中真正编码蛋白质的区域仅占DNA序列的〔〕。A.1-2%、B.3-5%、C.5-10%、D.10-20%24、被誉为“生物信息学之父〞的科学家是〔〕。A.Dulbecco、B.Sanger、吴瑞、D.25、多序列比对工具是〔〕。A. BLAST、B. ClustalW、C. Mega、D. GCG26B.C.D.色线条表示27、HTGS的含义是〔〕。A.表达序列标签、B.序列标签位点、C.高通量基因组序列、D.人工合成序列28、accessionnumberA.登录号、B.算法、C.比对、D.类推29EMBLnetA.Query、B.SRS、C.PDB、D.PIR30、数据挖掘的四个步骤不包括以下哪个.〔〕A.数据选择、B.数据转换、C.数据记录、D.结果分析三、是非题〔16个〕1、生物学就是实验科学，所有的研究结论从实验中来，于实验中得到验证。2、比拟是科学研究中最常见的方法，在生物信息学研究中，比对是最常用和最经典的研究手段。3、两个蛋白质序列相似性超过30%就是同源蛋白。4、蛋白质序列相似性指一级序列中氨基酸残基一样。5、蛋白质序列相似性指氨基酸残基具有相似特性.侧链基团大小电荷性、疏水性等一样。6、核酸序列相似性指序列中一样碱基所占的比例。7DNA38DNA69、相似性是指一种很直接的数量关系，无需实验验证。、相似性是指一种很直接的数量关系，也需实验验证。、不同种属间的同源序列称为直向同源序列。、不同种属间的同源序列称为共生同源序列。13、所谓局部比对，即分析两个序列是否有局部序列的相似。14、所谓整体比对，即找出两个序列全长的最优比对结果。15、PSI-BLASTBLAST16、PHI-BLASTBLAST四、问答题〔15个〕1、生物信息学的开展经历了哪几个阶段2、序列的相似性与同源性有什么区别与联系？3、BLASTblastn、blastp、blastx、tblastntblastx什么？4、生物信息学的主要研究领域。5、初级数据库、二级数据库的概念，说出几个数据并说明包含什么数据。6、简述高通量测序的应用围7、简述系统发生分析步骤8、说出至少一种蛋白质结构数据库和一种可视化工具。9、Entrez集成于哪个数据库平台？主要功能是什么？在应用中可以访问哪些子数据库〔请列举5个以上〕？10、试述SWISS-PROT中的数据来源11、分子生物网络可以分成哪几类？简单介绍。12、常用的蛋白质互作数据库有哪些？13、试述蛋白质三维结构预测的三类方法14、国际上权威的核酸序列数据库有那些？15、生物分子数据类型