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SubmittingdatatoGEO----芯片数据上传指导/geo/GEO上传指南主题知识讲座第1页GEOarraydepositoptionsandformats----数据上传4种方式OptionFormatKeypointsWebformdepositwebformsInteractivewebforms-useonlyifyouhaveaverysmallnumberofSamplestosubmit.GEOarchivespreadsheets

(e.g.,Excel)Recommendedmethodformostsubmissions.

QuicklydescribeyourstudyusingExcelspreadsheettemplates.SOFTplaintextGoodoptionifyourdataandmetadataarealreadyinadatabase,andyoucangenerateandexportdatainSOFTplaintextformat.MINiMLXMLGoodoptionifyourdataandmetadataarealreadyinadatabase,andyoucangenerateandexportdatainMINiMLXMLformat.GEO上传指南主题知识讲座第2页GEOarchivesubmission上传所需内容Metadataspreadsheet试验设计和各个样本描述信息,以及各步骤protocols内容等Matrixtable标准化,探针合并,弱信号过滤后用于差异分析数据文件Rawdatafiles扫描仪读取未编辑原始文件,如GenePixPro.gpr文件,AgilentFE.txt文件等Platform芯片平台描述,探针注释等信息GEO上传指南主题知识讲座第3页GEOarchivesubmission上传步骤说明1.CreateaGEOaccount,loginGEOandclick“NewSubmission”,starttosubmityourdatafile.GEO上传指南主题知识讲座第4页GEOarchivesubmission上传步骤说明2.Select“GEOarchive”andclick“Submit”.GEO上传指南主题知识讲座第5页SelectThisformat3.Select“GEOarchive”format,uploadyourdata(tarallfilesinonearchive)andclick“Submit”.GEO上传指南主题知识讲座第6页GEO上传数据验证流程SeriesGSE9612SamplesGSM23612PlatformGPL4123数据上传成功后，会为数据暂时分配一个序列号，数据不会公开GEOcurator

开始处理递交数据Contactyou解释并修正数据中他们认为有问题地方5个工作日GEO官方发email确认试验数据序列号(GSExxxx)以及数据公

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