绪论(研究生20131209)课件

1、2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1邱君瑞Email:qjunruiTel:81870306医学信息检索2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 2课程内容和安排1) 绪论和原理2) 中文数据库3) PubMed数据库4) 课题检索、全文获取 5) Embase、BP数据库6) 科学引文索引(SCI) 7) 网络检索 8) Elsevier等英文全文数据库 9)文献管理软件10) 课题检索实习 地 点：军事医学楼第25教室 教 员: 邱君瑞、彭骏、徐维、王侠2022/10/1

2、Dept. Medical Information Science, SMMU 3考核: 课题检索报告+考勤报告要求: 自拟课题，规定要求和格式递交时间：2014.1.17 周五 （下午15:00-16:30）递交地点：图书馆1320房间 (电话：81870306)2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 4绪论和原理一、文献信息资源二、信息检索概述三、检索方式（途径）四、检索技术和方法2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 5一、文献信息资源2022/10/1Dept. Medi

3、cal Information Science, SMMU 71. 图书联合国教科文组织规定：50页以上的正式印刷品为图书。高校学生利用最多的资源之一。主题突出，内容系统，论述全面深入，知识成熟稳定。出版周期长，不能及时、迅速地反映最新科研成果。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 81. 图书图书类型：专著、教科书、工具书、图册、读物和文集等。著录样例：1.柳建营，刘小明青年心理健康教程北京：北京工业大学出版社，20022.Norman IJ，Redfern SJ，editors Mental health care for eld

4、erly people New York：Churchill Livingstone；1996 EBSCO西文电子书数据库EBSCO西文电子书数据库2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 122. 期刊有固定名称、统一开本、有编号或年月标志、定期或不定期连续出版；期刊内容不如图书系统完整，但出版周期短、更新快、内容新、易检索；学术期刊能及时连续地反映学科领域的发展动态和研究成果，参考价值大。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 142. 期刊核心期刊是指那些发表某学科或某领域论

5、文较多、使用率（被引率）较高、学术影响较大的期刊。中文核心期刊要目总览，北大图书馆编辑出版，92年开始出版。08年版收录医药卫生类期刊251种。中国科技论文统计源期刊，中国科技信息研究所出版。09年版共收录期刊1800多种。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 152. 期刊SCI期刊 SCI（科学引文索引）是美国科学情报研究所出版的世界著名的期刊文献检索工具。它收录全世界出版的各学科的核心期刊8000余种。通过其严格的选刊标准和评估程序来挑选刊源，使得SCI收录的文献能够全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果。SCI目前已成为衡

6、量国内大学、科研机构和科学工作者学术水平的最重要的甚至是唯一尺度。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 172011年影响因子前10的医学期刊 1 Cancer Journal for Clinicians 101.780 2 New England Journal of Medicine 53.298 3 Annual Review of Immunology 52.761 4 Nature Reviews Molecular Cell Biology 39.123 5 Lancet 38.278 6 Nature Reviews

7、Genetics 38.075 7 Nature Reviews Cancer 37.545 8 Nature 36.280 9 Nature Genetics 35.535 10 Annual Review of Biochemistry 34.317 16 Cell 32.403 18 Science 31.201 20 JAMA 30.026 2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 19SCI中国期刊2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 202022/10/1Dept.

8、Medical Information Science, SMMU 21自建的期刊全文传递平台2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 222022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 24查找中外文核心期刊查找期刊影响因子2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 253. 会议文献是指在各种会议上宣读、交流的论文、报告及其它有关文献；会议文献具有水平高、针对性强、发表快(与最新成果的间隔时间短) ，反映科学技术的发展趋势,不少论文

9、常常在正式发表前先提交学术会议交流。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 272022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 284. 学位论文高等院校、科研机构的毕业生和研究生，为获得相应学位所提交的学术论文，如学士、硕士、博士论文等；非正式出版的文献，论文选题和研究比较专深，学术参考价值较大。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 292022/10/1Dept. Medical Information Science, S

10、MMU 305. 科技报告科技报告是科技人员从事某一专题研究所取得的成果和进展的实际记录。特点是反映新技术、新学科较快，内容专深，数据可靠，保密性强，具有独创性。美国四大科技报告： PB报告(出版局)、AD报告(国防部)、NASA报告(航空和宇航局)和DOE报告(能源部)。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 31美国国家技术情报社（NTIS） / 以收录美国政府立项研究及开发的项目报告为主，少量收录西欧、日本及世界各国（包括中国）的科学研究报告。专业内容覆盖科学技术各个领域。2022/10/1Dept. Medical Inform

11、ation Science, SMMU 336. 专利文献专利（Patent）是受专利法保护的技术发明，并独占其制造、使用和销售的权利。专利文献是实行专利的国家、地区及国际专利组织在审批专利过程中产生的官方文件及出版物，包括专利说明书、专利权利要求书、专利公报等。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 346. 专利文献著录样例： Miklos，H. Method for the treatment and prevention of asphaltene-paraffin-vax precipitates in oil-wells，w

12、ellheads and pipelines by the use of biocolloid suspensions. EP1552106；WO2004031536 (A1) ；CA2501359 (A1) ；AU20032743892022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 35专利数据库2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 367. 标准文献标准文献：记录标准及其相关文献的信息，包括技术标准、生产组织标准、管理标准等标准文件、标准化书刊、目录等出版物以及与标准化工作有关的文献

13、信息。标准文献信息不仅直接应用于生产、管理、贸易，也是科学研究的重要技术依据。ISO 15189：医学实验室国际通行标准2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 37标准数据库2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 38文献信息资源分类图书连续出版物（期刊、报纸等）学位论文专利文献标准文献会议文献政府出版物等。报道及时内容丰富连续出版检索方便2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 39二、信息检索概述2022/10/1Dep

14、t. Medical Information Science, SMMU 40什么是信息检索？使用特定的检索指令，从信息数据库中检索出所需要的信息，并由终端设备显示或打印出来的过程和方法。将大量的原始信息进行加工，再按一定格式输入计算机存储起来，形成可供检索的信息数据库。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 41检索系统的物理组成1、计算机硬件2、软件 系统软件 应用软件（如检索软件，其功能的强弱 直接影响检索效果）3、网络4、数据库在计算机存储设备上按一定方式存储的相互关联的数据集合。2022/10/1Dept. Medical I

15、nformation Science, SMMU 42检索数据库类型文献数据库：文摘型和全文型 (期刊、图书、会议论文、学位论文等） 数值(数据)数据库事实数据库图像数据库视频数据库多媒体数据库2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 43(期刊)文献数据库的构成1)记录(Record) 数据库的基本单元，一个数据库由若干条记录构成。每条记录相当于一篇文献。2)字段(Field) 文献记录的基本单元。一条记录有若干个字段,包括文献的篇名、作者、刊名、出版时间、分类号、文摘、主题词等字段。2022/10/1Dept. Medical Inf

16、ormation Science, SMMU 44文献记录格式2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 45文献数据库:文摘型2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 46文献数据库:文摘型2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 47文献数据库:文摘型2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 48文献数据库:全文型2022/10/1Dept. Medical Inform

17、ation Science, SMMU 49文献数据库:全文型2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 50文献数据库:全文型2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 512022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 52 Genbank数据库有关aids病的基因碱基对序列数值数据库2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 53小结 信息检索概述数据库类型多；期刊文献数据库是重

18、要的信息源；文摘型数据库；全文型数据库；记录和字段。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 54三、检索方式（途径）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 55检索方式1.浏览/导航分类导航、期刊导航等2.自由词检索3.主题词检索2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 561. 分类导航基于分类语言的检索；分类语言是以学科体系为基础，用号码作为标识，按分类编排的检索语言。中国图书馆图书分类法(简称：中图法) 北京图书馆、中

19、国科技信息研究所，19742022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 57中图法五个基本部类马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论；哲学、宗教；社会科学；自然科学；综合性图书2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 58R1 预防医学R2 中国医学R3 基础医学R4 临床医学R5 内科学R6 外科学R71 妇产科学 R9 药学R31 医用一般科学R32 人体形态学R33 人体生理学 R36 病理学2022/10/1中图法的学科等级体系R 医药、卫生 R3 基础医学 R31 医用一

20、般科学 R32 人体形态学 R322 人体解剖学 R322.1 心脏血管系 R33 人体生理学 R34 医学生物化学与分子生物学2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 60中图法的作用组织图书馆藏书（分类排架）检索系统的使用2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 61 1. 分类导航（SinoMed）中图法分类体系2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 621. 分类导航（维普）中图法分类体系2022/10/1Dept.

21、Medical Information Science, SMMU 631. 分类导航（同方)专辑分类导航2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 64 1. 分类导航2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 65小结 分类导航中图法分类体系按学科分类逐级浏览；了解某学科信息；不适合专题检索。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 66例:查找“窦房结动脉解剖”4万多篇2022/10/1Dept. Medical Inform

22、ation Science, SMMU 672.自由词检索什么是自由词（文本词）检索？2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 682.自由词检索什么是自由词（文本词）检索？计算机程序对记录(文献)中的每一个词进行扫描并自动标引形成自由词索引。用户输入任一检索词，如果记录(文献)中出现了该检索词，则认为该记录(文献)是用户所需的，将之输出。 文献记录：浅谈军校医学生素质教育 全球社会医学模式的改变,使得我国医学教育必须立足于培养全面发展的高素质医学人才。而军事医学的特殊战略地位更决定了军事医学教育务必摈弃传统保守的观念,实施全面的素质教育

23、,为国防军事医学培养合格人才。 自由词索引：保守模式传统培养发展全面改变全球观念人才国防教育素质教育军事医学医学模式军校医学生.自动标引2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 70自由词检索特点：词形匹配il-182022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 71自由词检索特点：全记录扫描 pancreatitis2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 72自由词检索缺陷:遗漏文献IL18，Interleukin-182022/

24、10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 73自由词检索缺陷:遗漏文献Liver carcinoma, hepatic cancer2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 74自由词检索缺陷:误检文献2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 75小结 自由词检索自由词检索特点：简单，使用方便；最常用的检索方法；通常检率效率较低；须考虑检索词的各种变体、同义词和近义词，以及使用各种辅助检索方法。2022/10/1Dept. Medical

25、 Information Science, SMMU 76 3. 主题词检索基于主题词表的检索主题词是经人工规范化处理的最能表达文章主题概念的语词。所谓规范化处理，就是在文献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控制和规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。 主题词 关键词 Neoplasms neoplasm、tumors、tumor、cancer2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 773.主题词检索医学主题词表(MeSH) 美国国立医学图书馆,1960MeSH的组成 字顺表(2万多个医学词汇) 树状结构

26、表（分类表,16大类) 副主题词表（80多个副主题词）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 78MeSH字顺表2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 79MeSH树状结构(Tree structures)2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 80MeSH副主题词表(Subheadings) Abnormalities、Administration & Dosage、Adverse Effects、Analysis、An

27、atomy & Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、Diagnosis、Diagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.2022/10/1Dept. Medical Information Science

28、, SMMU 81MeSH副主题词表(Subheadings)副主题词是对主题词的进一步限制，用来检索更为专指的文献，即主题词某一方面的内容（如治疗、诊断等）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 82MeSH的主要特点规范性组配性语义性2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 83MeSH的规范性同义规范 对各种同义词进行规范，使得每一个事物只能用一个语词来表达。词义规范 对多义词、同型异义词的规范。使得一个语词只能表达一个事物。例: 胃肿瘤的MeSH词：Stomach Neop

29、lasms2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 84MeSH的组配性多数主题都需要用两个或多个主题词组配起来进行描述。例如：肝素治疗哮喘的研究 肝素/治疗应用 哮喘/药物治疗2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 85MeSH的语义性主题词之间存在含义上的关系，如同义、等级和相关关系。用一定方法来揭示这种语义关系。 例： Cancer see Neoplasms Family Planning see related Contraception 2022/10/1Dept. M

30、edical Information Science, SMMU 86MeSH的标引和检索MeSH应用 PubMed（Medline） 中国生物医学文献数据库(CBM/SinoMed) 医学搜索引擎标引人员根据文章的内容，给出多个MeSH词，以确切描述一篇文章内容的重点。检索人员根据检索需求，选择相关MeSH词进行检索。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 87MeSH的标引和检索根据MeSH的语法规则，把文献内容或检索需求用MeSH词表中的词汇进行表达。实质：主题词、副主题词的选择和组配组配： 1.主题词和主题词之间(布尔算符) 2

31、.主题词和副主题词之间 “副主题词的范围注释及适用规则”，每个副主题词有特定的含义和使用范围，分别与有关的主题词组配。（见实习题集附录）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 88/ Abnormalities（畸形） 与器官主题词组配，表明因先天性缺陷引致 器官形态学的改变。 例1. 肝发育不全 肝/畸形例2. 髂动脉异常 髂动脉/畸形 2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 89/ pathology（病理学） 用于疾病状态的器官、组织和细胞的结构。 例1.肝肿瘤的病理学 肝

32、肿瘤/病理学 例2.风湿性心内膜炎时轻微的心瓣膜纤维变性风湿性心脏病/病理学 心内膜炎/病理学 心瓣膜/病理学2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 90/Diet Therapy(膳食疗法)与疾病主题词组配，表明疾病时进行膳食和营养的调理，但维生素和矿物质的补充则用“药物疗法”。例1：合理膳食预防儿童少年肥胖症 肥胖症/膳食疗法； 肥胖症/预防和控制2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU /Drug Therapy (药物疗法)与疾病主题词组配。表明通过投给药品、化学品或抗生素

33、（维生素和矿物质补充）治疗疾病。 例1：利多卡因治疗眩晕症的疗效研究 眩晕/药物疗法；利多卡因/治疗应用 例2：儿童中耳炎的抗生素治疗 中耳炎/药物疗法；抗生素类/治疗应用 2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 92/Radiotherapy(放射疗法)与疾病主题词组配，表明用电离或非电离辐射治疗疾病；也包括放射性同位素疗法。 例1：氩激光光凝治疗视网膜静脉周围炎 视网膜炎/放射疗法；氩/ ；激光/ 例2：同位素32磷治疗小儿血管瘤 血管瘤/放射疗法；磷放射性同位素/ 2022/10/1Dept. Medical Informatio

34、n Science, SMMU 93/Surgery (外科学)用以表明对器官、部位或组织进行外科手术以治疗疾病，包括激光切除组织，但不包括移植术（应标“移植”）。 例1：耻骨后保留尿道前列腺切除术 尿道/外科学；耻骨/外科学； 前列腺切除术/方法 例2：准分子激光治疗近视眼疗效观察 近视/外科学；激光/治疗应用； 角膜切除术，光折射，准分子激光/2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 94 /Transplantation（移植）与器官、组织或细胞主题词组配，表明器官、组织、细胞在同一个体中由一个部位移植于另一部位，或在同种或异种不同

35、个体间的移植。 例1：完全性动脉移植治疗冠心病 动脉/移植；冠状动脉疾病/外科学 例2：亲属供脾移植治疗血友病 脾/移植；血友病/外科学 例3：肝移植患者护理体会 肝移植/护理2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 95/ Therapy（治疗）与疾病主题词组配，表明对疾病的治疗。但不包括药物疗法（应标“药物疗法”）、膳食疗法（应标“膳食疗法”）、放射疗法（应标“放射疗法”）和外科学（应标“外科学”）。 例1：老年尿毒症患者两种透析方法的比较 尿毒症/治疗；透析/. 例2：肝癌的基因治疗 肝肿瘤/治疗；基因疗法/ 2022/10/1De

36、pt. Medical Information Science, SMMU 96 / Therapeutic Use （治疗应用）与药品生物制品和物理因素主题词组配，表明将其用于预防或治疗疾病，包括兽医用药。 例1：比索洛尔治疗原发性高血压 比索洛尔/治疗应用；高血压/药物疗法例2：维生素E可防止动脉粥样硬化 维生素E/治疗应用； 动脉粥样硬化/预防和控制； 动脉粥样硬化/药物治疗2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 97 /Analogs & Derivatives (类似物和衍生物)与药品及化学物质主题词组配，表明这些物资具有共同

37、的母体分子(官能团)或相似的电子结构，但其他原子或分子不同，即增加了原子或分子或被其他原子或分子所取代 例：万古霉素及其衍生物研究 万古霉素/类似物和衍生物2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 98/ Pharmacology（药理学） 与药品和外源性投给的化学物质主题词组配，表明它们对活组织或有机体的作用，对生理学与生物化学过程的加速或抑制，及其他药理作用机制。 例1：利尿药氢氯噻嗪的药理学 氢氯噻嗪/药理学例2：纳洛酮治疗神经系统疾病的药理学基础 纳洛酮/药理学；神经系统疾病/药物治疗； 纳洛酮/治疗应用 2022/10/1Dep

38、t. Medical Information Science, SMMU 99/Mortality 死亡率与人类和兽医学疾病主题词组配，表明对其死亡率的统计；与技术操作主题词组配，表明因操作所引起的死亡。例1：上海市结核病死亡情况的调查 结核/死亡率；上海例2：肾移植患者死亡原因分析 肾移植/死亡率；死亡原因2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 100CBM数据库实例2022/10/1主题检索流程图文献内容检索需求主题概念主题概念主题语言文献主题词提问主题词检索系统检索结果存贮查找主题分析主题分析标引标引输入检索输出2022/10/1

39、Dept. Medical Information Science, SMMU 102小结 主题词检索基于主题语言的检索;人工标引,昂贵,费时；标引者需要具备一般的医学专业知识和丰富的信息组织知识和经验；检索者需要了解主题词检索的原理，并熟练掌握主题词检索方法；较好的检索效率。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 103主题词还是自由词？自由词检索是当前主流；医学专业检索，主题词作用不可替代； 自由词智能检索是发展趋势；选择使用主题词和自由词。2022/10/1Dept. Medical Information Science, SM

40、MU 104四、检索技术和方法2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1051. 逻辑算符（布尔算符）逻辑“与”表示两个检索词必须同时出现，表示“相交”关系。有“and”，“*”，“并且”，“与”等表达形式。 肾衰竭 and 手术2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 106 1. 逻辑算符（布尔算符）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1071. 逻辑算符（布尔算符）逻辑“或”表示两个检索词至少出现其中一个，表示“并

41、列”关系。有“or”，“+”，“或者”，“或”等表达形式。肾衰 or 肾功能衰竭2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1081. 逻辑算符（布尔算符）2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1091. 逻辑算符（布尔算符）逻辑“非”表示含有前一检索词同时不含有后一检索词，表示“不包含”关系。有“not”，“and not”, “-”， “不包含”，“排除”等表达形式。肾衰竭 not 慢性2022/10/1Dept. Medical Information Science, SM

42、MU 110 1. 逻辑算符（布尔算符）肾衰竭-慢性2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 111布尔算符运算的优先级三者运算的优先级一般如下： NOTANDOR 例：cancer OR carcinoma AND therapy运算优先级的限定： 有时为了让优先级低的逻辑运算先进行，可以使用括号来加以限定。例：(cancer OR carcinoma) AND therapy2022/10/1Dept. Medical Information Science, SMMU 1122. 精确匹配符（短语匹配）严格按输入的词组或短语形式匹配，不能插词，词序不能互换；表达形式：半角的“ ” ，“精确匹配” 选项； 例1:“Renal fail