非小细胞肺癌基因检测培训课件

1、人类基因组计划和国际癌症基因组计划个体化医疗的奠基石于1990年在美国正式启动的人类基因组计划，要把人体内约10万个基因的密码全部解开，同时绘制出人类基因的谱图。2006年多国联合启动的国际癌症基因组计划，是人类基因组计划后的又一重大科学研究。揭示更多地与癌症相关的突变类型，获得50种肿瘤的特定分子异常谱型，探寻DNA变异与肿瘤发生发展的机理。人类基因组计划和国际癌症基因组计划个体化医疗的奠基石于1肿瘤治疗存在的核心问题盲目治疗过度治疗个体化治疗肿瘤治疗存在的核心问题盲目治疗个体化治疗肺癌的传统分类观点小细胞肺癌 (SCLC)非小细胞肺癌 (NSCLC)腺癌鳞癌大细胞癌腺癌鳞癌大细胞小细胞肺癌

2、的传统分类观点小细胞肺癌 (SCLC)腺癌鳞癌大细胞小细肺腺癌的分子亚型KRASEGFRHER2BRAFALK fusionPIK3CAMEK1ROS fusionPDGFR amp肺腺癌的分子分类腺癌鳞癌大细胞小细胞肺癌的传统分类肺腺癌的分子亚型KRASEGFRHER2BRAFALK fuEGFR基因突变检测在临床应用的意义IPASS: 根据突变状态的疗效分析048121620Time from randomisation (months)0.00.20.40.60.81.0Gefitinib EGFR M+ (n=132)Gefitinib EGFR M- (n=91)Carboplati

3、n / paclitaxel EGFR M+ (n=129)Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85)Gefitinib EGFR M+ (n=132)Gefitinib EGFR M- (n=91)Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129)Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85)无进展生存率 对象有效率不加选择的中国患者30根据临床特征选择优势人群50根据EGFR敏感基因选择+耐药基因选择70-80%80-95% Mok, Wu,Thomprast et al. NEJM, 200

4、90.4EGFR基因突变检测在临床应用的意义IPASS: 根据突变状检测EGFR突变的重要性医学指南全球三大肿瘤突变会指南均强调检测EGFR突变的重要性检测EGFR突变的重要性医学指南EGFR突变检测的应用很好预测TKI药物对NSCLC患者的疗效HRM血浆突变检测EGFR突变检测的应用很好预测TKI药物对NSCLC患者的疗EML4-ALK融合基因ALK 最早是在间变性大细胞淋巴瘤（ ALCL)的一个亚型中被发现的，因此定名为间变性淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）。靶向药：XALKORI 胶囊（克唑替尼），辉瑞公司。NCCN与ESMO推荐ALK阳性NSC

5、LC的一线治疗首选克唑替尼。总体突变率：11.4%腺癌突变率：16.1%鳞癌突变率：0.7%优势人群：轻微/从未吸烟；与EGFR突变人群相比，ALK融合人群年龄更轻；腺癌；EGFR/KRAS野生型；病理学特（含印戒细胞的黏液型或实性腺癌中，ALK融合基因的发生率高于其他类型的肺腺癌(462VS. 8.0）EML4-ALK融合基因ALK 最早是在间变性大细胞淋巴瘤（EML4-ALK融合检测的意义无进展生存期的概率 (%)1008060402000510152025时间(月) 克唑替尼(n=173)化疗(n=174)事件, n (%)100 (58)127 (73)中位数, 个月7.73.0HR

6、(95% CI)0.49 (0.37 - 0.64)P 0.0001Shaw et al., ESMO 2012; Abstract LBA1_PRN Engl J Med 2013;368:2385-94EML4-ALK融合检测的意义无进展生存期的概率 (%)10靶向药物检测项目汇总药物基因癌种样本判断标准重要程度吉非替尼/厄洛替尼/埃克替尼EGFR非小细胞肺癌组织标本、血浆、体液标本突变敏感必检KRAS突变耐药推荐克唑替尼EML4-ALK组织标本融合敏感必检ROS1组织标本融合敏感推荐靶向药物检测项目汇总药物基因癌种样本判断标准重要程度吉非替尼铂类药物与ERCC1 mRNA 表达Lord

7、RVN et al, Clin Cancer Res, 2002, 8:2286-91背景 ERCC1（Excision Repair Cross Complement Group 1）是核酸外切修复家族中重要成员，参与DNA链的切割和损伤识别。ERCC1的表达量直接影响DNA修复的生理过程，DNA修复是铂类化疗耐药性产生的主要机制之一。铂类药物与ERCC1 mRNA 表达Lord RVN et 吉西他滨与RRM1 mRNA 表达背景 吉西他滨是脱氧胞嘧啶核苷同系物，属细胞周期特异性抗代谢类化疗药，主要作用于DNA合成期（S期）的肿瘤细胞，同时也阻断细胞增殖由G1向S期过渡的进程。临床研究显示

8、低RRM1 mRNA水平的肺癌患者对吉西他滨敏感性相对较高，药物疗效较好，中位生存期延长。而且，专家建议RRM1高表达的患者应避免使用吉西他滨。Rafael Rosell1. Oncogene (2003) 22, 35483553吉西他滨与RRM1 mRNA 表达背景 吉西他滨是脱氧胞嘧啶抗微管类药物与TUBB3 mRNA 表达背景 抗微管类化疗药是作用于细胞微管，通过影响纺锤体形成，从而抑制细胞有丝分裂的一类广谱化疗药。在多种临床研究中，TUBB3 mRNA表达水平与抗微管类化疗的疗效密切相关。低TUBB3表达水平的肿瘤患者接受紫杉醇类或长春碱类化疗的效果较好，中位生存期较长。反之，TUB

9、B3高表达的患者的抗微管类化疗疗效较差。 Rafael Rosell1. Oncogene (2003) 22, 35483553抗微管类药物与TUBB3 mRNA 表达背景 抗微管类化疗药氟类药物与TYMS mRNA 表达背景 TYMS基因编码的胸苷酸合成酶（TS）是嘧啶核苷酸合成的限速酶，是肿瘤生长的重要因子。5-FU的代谢物5-FdUMP与TS结合，阻碍TS的正常功能，从而抑制DNA合成。临床研究表明，低TYMS mRNA水平的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好，中位生存期较长。反之，TYMS高表达的患者对氟类疗效较差。研究也发现培美曲赛的疗效与TYMS mRNA表达水平呈负相关。By Yo

10、shinori Shirota, Journal of Clinical Oncology, 2001,19: 4298-4304氟类药物与TYMS mRNA 表达背景 TYMS基因编码的胸化疗药物检测项目（ mRNA 表达）类型药物基因样本评价mRNA 表达卡铂、顺铂奥沙利铂 ERCC1 石蜡切片新鲜组织低表达敏感抗微管药物 TUBB3低表达敏感吉西他滨RRM1 低表达敏感氟尿嘧啶培美曲赛TYMS低表达敏感化疗药物检测项目（ mRNA 表达）类型药物基因样本评价mR样本要求石蜡包埋肿瘤组织块 一般组织块不小于555（mm），组织包于蜡块正中央，处理完可归还蜡块（推荐）。送检保存：常温保存、运

11、输。新鲜肿瘤组织块 要求提供50mg左右的样本，取癌组织的中心位置组织块，55mm（绿豆大）以上，以PBS或生理盐水清洗干净，15分钟内放入RNAlater保存液或液氮中保存。送检保存：常温保存、运输，取样后24小时内送检。全血标本 使用枸橼酸钠（1：9）或EDTA-Na2抗凝的采血管，血液样本2ml以上。禁忌：切勿使用肝素抗凝剂；切勿反复冻融。送检保存：4冰箱保存，切不可置于-20中（血细胞在融解的时候易发生溶血）；当天送检，冰上运输。样本要求石蜡包埋肿瘤组织块案例分析姓名：王女士年龄：46诊断：非小细胞肺癌样品种类：穿刺组织检测项目：EGFR突变检测；EML4-ALK基因融合检测；ERCC1表达量；TYMS表达量；RRM1表达量；TUBB3表达量检测项目 检测