HBV基因分型的检测方法及临床意义

1、HBV基因分型检测方法及其意义杭州博赛基因诊断技术有限公司 HBV的基因型和分布根据全基因核苷酸序列异源性或者基因区核苷酸序列异源性，将不同病毒株分为不同的基因型，迄今为止，可以分为个基因型，即、和型。 2. A 型：西欧,北欧、北美洲及非洲地区; B 型和C 型：亚洲,澳大利亚; D 型：中东、北非和南欧; E 型：非洲撒哈拉沙漠地带; F 型：美国; G 型：法国和美国; H 型：尼加拉瓜、墨西哥,及美国加里弗尼亚地区。HBV的基因型和分布17.281.4533212.284.70%20%40%60%80%100%中国 (上海）台湾日本其他基因型HBV基因型CHBV基因型B亚洲部分地区的基

2、因型分布国内部分地区基因型分布100%80%60%40%20% 沈阳 北京 广州 上海HBV基因型的临床意义近年来研究发现, HBV基因型具有如下意义HBV标志物清除病毒致病性乙型肝炎的病程及转归药物敏感性与HBV血清型比较,HBV 基因型具有更加重要的意义。HBV基因型和的清除的关系临床资料显示，的清除可能与基因型有关。与基因型相比，基因型有更高的阳性率，分别为与。基因型的自发性清除要比C基因型早年，并且在 清除后，肝脏生物化学指标持续正常。HBV标志物清除 HBeAg累积清除率Journal of Medical Virology 70:350354 (2003)HBV标志物清除*Amon

3、g patients with single genotype B or C, those with HBsAg seroclearance had a higher proportion of genotype B and lower proportion of genotype C when compared to controls; odds ratio 3.41; (95% CI, 1.26-9.28); P = .014.No. of PatientsPatients With HBsAg Seroclearance (n = 30)Patients Without HBsAg Se

4、roclearance (n = 50)Single genotype*A (%)1 (3.3)2 (4)B (%)16 (53.3%)15 (30%)C (%)10 (33.3%)32 (64%)D (%)2 (6.7)-Mixed genotypesA + D (%)1 (3.3)-B + C (%)-1 (2)HBV基因型与HBsAg转阴 的关系Hepatology. 2004 Jun;39(6):1694-701. HBV标志物清除HBV 基因型与病毒致制病性的关系日本学者Shiina分析了1 744 例HBsAg 阳性者的基因型与肝功能异常的关系后发现,与B 基因型相比,C 基因型的

5、肝功能异常更为常见。 C 基因型引起的临床表现及组织学损伤更严重。 HBV基因型与肝硬化的关系病毒致病性 KAO等在进一步对67 例无症状HBV携带,103 例慢性肝炎,32 例肝硬化,20 例肝细胞癌患者进行基因分型研究中发现,各组均以B/ C 型为主,C基因型所占比例按上述顺序逐渐增大,而B 基因型的比例逐渐减小;与B 基因型比较,C 基因型在肝硬化及50 岁以上的肝细胞癌患者中比例较高,而B 基因型与50 岁以下,特别是35 岁以下的肝细胞癌患者有关。HBV基因型和肝细胞癌的关系病毒致病性HBV基因型与抗病毒药物敏感性的关系 不同基因型HBV 感染对干扰素治疗的反应有差别 Kao 对58

6、 例慢性乙型肝炎患者给予干扰素治疗48周,B 基因型和C 基因型的完全应答率(血清ALT 恢复正常,HBeAg 消除,HBV DNA 转阴) 分别为41和15 ,说明干扰素对B基因型治疗效果较好。Kao JH, et al. J Hepatol 2000;33:9981002.核苷类药物疗效与HBV基因型的关系。Intervirology 2003;46:373376注：最近文献倾向于没有两者没有差异，但是基因型B除外。检测基因分型的常见方法 基因测序法 PCR-RFLP ELISA 生物芯片 实时荧光PCR法核酸序列测定法检测HBV基因分型方法首先采用末端终止法，获得待检样本的核酸序列，通常按照国际惯例选择HBV S区基因进行扩增，获得HBV S区的序列，然后将该序列与国际基因库中HBV 各个基因型的标准序列进行比对，建立亲缘树，分析待检HBV与何种基因型的遗传距离最近，即判断为该种基因型。HBV亲缘树分析B基因型C基因型B、C混合型荧光PCR检测特点：1.准确性好:与核酸序列测定分型比较，两者结果吻合率100%。2.有效防污染: PCR反应和分析在完全闭管条件下进行，同时采用了d-UTP-UNG系统，有效防范PCR产物污染，提高检测结果的可靠性。3.操作简单、耗时短、结果判断直观明确 :试剂在荧光PCR检测