基因组DNA的提取与分离鉴定课后研讨题_第1页
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文档简介

1、基因组DNA的提取与别离鉴定课后研讨题1、动植物DNA提取的方法主要有哪些?并说明各方法的原理。答:.浓盐法利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者别离,常用的方法是用1M氯纳提取化 钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时 蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95与乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.也可用0. 15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以IMNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯 仿一一异醇法除去蛋白.两种方法比拟,后种方法使核酸降解可能少一些.以稀盐酸溶液提取DNA时,加入适量去污剂,如SDS

2、可有助蛋白质与DNA的别离。在提取 过程中为抑制组织中的DNase对DNA的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离 子的烙合剂.通常用.15MNaCL, 0. 015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.阴离子去污剂法:用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中 DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以 常用阴离子去污剂提取DNA.苯酚抽提法:苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了 DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子外表又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶

3、于酚相,而DMA 溶于水相。离心分层后取出水层,屡次重复操作,再合并含DNA的水相,利用核酸不溶于 醇的性质,用乙醇沉淀DNA。此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。 此法的特点是使提取的DNA保持天然状态.水抽提法:利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中, 使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2. 6M,加入2倍 体积95%乙醉,立即用搅拌法搅出.然后分别用66%,80%和95%乙醉以及丙铜洗涤,最后在空 气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法 加

4、以改良,在提取过程中加入SDS.2、苯酚、氯仿和异戊醇在基因组DNA的提取中各有什么作用?答:苯酚:使蛋白质变性,同时抑制了 DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由 于蛋白与DNA联结键己断,蛋白分子外表又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子 溶于酚相,而DNA溶于水相。氯仿:氯仿的作用有多个方面,一是作为有机溶剂变性蛋白,使其沉淀并通过离心除 去,同时也通过变性作用抑制RNase活性;二是RNA提取试剂中通常含有苯酚,苯酚微溶于 水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,如果不除去会损伤核酸,需要通过氯仿把水相里参与的 苯酚抽提掉;三是作为溶剂抽提样品中的一些脂溶性杂质(比方油脂、脂溶性色素

5、等),起 到一定除杂作用异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低外表张力,从而减 少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相 及下层有机溶剂相维持稳定。3、无水乙醇沉淀DNA的原理是什么?答:用无水乙醇沉淀DMA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是可以任意比 和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反响,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。DNA 溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA 失水而易于聚合。4、结合本人实验操作的体会,试述在提取过程中应如何防止大分子DNA的降解和断裂?

6、答:(1)控制好温度,保持温度在适宜范围内,因为短时高温主要是造成DNA的变性,也就 是DNA双链解链成为单链,但在温度下降后会恢复为双链形式。DNA在溶液尤其是水的稀溶 液中,会发生自然的降解作用。降解作用速率和温度关系不大,但是反复的冻融会加速DNA 的断裂和降解。(2)操作过程必须全程温和进行,假设剧烈震荡,转移DNA的抢头没有剪去尖部,扩宽管口, 吸取过程产生汽泡,用了反复吸打的的方法助溶DNA沉淀都可能导致DNA断裂。(3)为防止DNase的降解作用,器具尽可能灭菌,加EDTA。PH最好是在8. 05、DNA含量的测定方法有哪些?并说明各方法的原理。6、如何判断所提取样品DNA (RNA)的纯度?7、总结DNA琼脂糖凝胶电泳实验操作的关键环节和考前须知。8、DNA琼脂糖凝胶电泳

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