单细胞基因测序市场分析

1、1QIAGEN Your Partner in Translational Medicine单细胞基因测序市场分析第1页什么叫单细胞基因测序（Single Cell Sequencing）？一句话说，就是单个细胞水平上对基因组进行测序。，Nature杂志把年度技术授予了单细胞基因测序（Single Cell Sequencing）,认为该技术将改变生物界和医学界许多领域。第2页单细胞基因组、转录组分析单细胞测序经过对单个细胞进行基因组扩增和测序处理了用组织样本无法取得不一样单个细胞异质性信息、样本量太少无法进行常规测序难题研究解析单个细胞行为、机制、与机体关系等提供了新方向为早期检测、诊疗疾病

2、及疾病个体化治疗提供指导。第3页基因组及转录组分析中常碰到难题：第4页全基因组和全转录组分析难题：第5页Title, Location, Date6单细胞测序应用领域单细胞全基因组测序：1、体外受精胚胎测序：在把胚胎植回母体之前，先取一个细胞进行测序，确认基因正常后再植回，以保障胚胎是正常。2、CTC细胞测序：经过对血液中肿瘤细胞测序，找到突变位点，针对性能进行靶向药品治疗。3、肿瘤亚细胞群测序：肿瘤发生、发展中，细胞不停发生新突变，形成许多亚细胞群，单细胞测序能够对这些亚细胞群进行分别测序，并找到对应治疗方案。4、免疫测序：免疫细胞在反抗原发生识别后，免疫细胞基因组发生重排，并产生反抗原特异

3、抗体。对免疫细胞测序，能够找出特异基因结构。第6页Title, Location, Date7单细胞测序应用领域单细胞转录组测序：1、在全基因组范围内挖掘基因调整网络，尤其适合用于存在高度异质性肿瘤细胞、干细胞及胚胎发育早期细胞群体。2、发觉亚细胞成份基因表示谱，比如对在神经元轴突或树突部分特异表示基因转录组分析。第7页一、单细胞测序行业 BCC Research一项分析汇报指出，全球单细胞分析（Single-cell Analysis）市场达5.4亿美金，预测将从年6.3亿美金增加到2016亿美金，复合增加率达21%。依据GENReports汇报，关于单细胞分析文章发表在过去几年也有着暴发性

4、增加。图2：单细胞分析文章发表数量第8页9二、单细胞基因测序基本流程：单细胞分离-基因组扩增-测序和分析单细胞测序，主要经过以下步骤：单细胞分离DNA/RNA提取和扩增（全基因组扩增和全转录组扩增）测序以及后续分析和应用第9页2.1单细胞捕捉和分离单细胞测序第一步是单细胞分离和提取，当前方法主要有：流式细胞术激光捕捉显微切割技术微流控技术Daniel A. Haber, et al CANCER DISCOVERY JUNE 第10页Title, Location, Date11单细胞操作仪器Fluidigm C1单细胞操作毛细管显微操作单细胞10X Genomics Illumina与Bio

5、-Rad公布Singel-Cell Sequencing SolutionQIAscout武汉友芝友-CTC捕捉仪强生-Cell Reserch第11页Title, Location, Date12C1 单细胞自动制备系统1个小时内即可分离96个单细胞Biomarker HD系统30分钟内可进行9216个qPCR反应PBMC单细胞转录组测序结果示例10X Genomics 第12页Title, Location, Date13 Illumina Bio-Rad Single-Cell Sequencing Solution QIAscout 武汉友芝友-CTC捕捉仪 CellSearch第13

6、页2.2全基因组扩增 （Whole Genome Amplification. WGA）/全转录组扩增 （Whole Transcriptome Amplification，WTA）单细胞测序难点在于扩增。全基因组扩增主要方法：简并寡核苷酸引物PCR扩增（DOP-PCR）多重置换扩增（MDA）当前最好方法和基于屡次退火和成环扩增循环（MALBAC）亿康基因第14页常见WGA方法比较第15页转录组扩增主要方法：Clontech企业Smart方法,一个优异单细胞全长RNA-seq：起始RNA只有约10pgEpiCentre企业TargerAmp方法第16页TargetAmp法测单细胞全RNASMA

7、RT法测单细胞全长全RNA第17页Title, Location, Date18单细胞测序国内相关企业（科研）企业名称开展类型华大基因单细胞DNA测序、单细胞RNA测序诺禾致源单细胞DNA测序、单细胞RNA测序贝瑞和康单细胞DNA测序、单细胞RNA测序安诺优达单细胞DNA测序、单细胞RNA测序、单细胞G&T测序、单细胞甲基化测序、单细胞Hi-C测序美吉生物单细胞RNA测序广州锐博单细胞DNA测序、单细胞RNA测序百迈客单细胞RNA测序杭州壹基因单细胞DNA测序、单细胞RNA测序第18页Title, Location, Date19单细胞测序相关报价类型单价备注单细胞全基因组测序1.2万元/样本

8、，90Gb/样本从单细胞（含裂解液）到数据分析单细胞外显子组测序6000元/样本，10Gb/样本单细胞mRNA测序5000元/样本，8Gb/样本单细胞lncRNA测序7000元/样本，10Gb/样本第19页单细胞测序对样本要求Title, Location, Date20类型样本要求单细胞全基因组测序1)细胞分离：由合作方完成单细胞分离；2)由企业寄出样品保留液（MALBAC裂解液；MDAPBS缓冲液）；3)样品需求量：1-1000个新鲜细胞，样本体积尽可能不超出1-2l。单细胞转录组测序1）细胞分离：由合作方完成单细胞分离；2）样品类型：活体新鲜完整细胞；不适于经固定、染色等处理样本；3）样

9、品体积：在显微镜或其它设备辅助下分离，得到单细胞样本体积以不高于0.5l为宜；4）送样量：提议重复单细胞样本个数大于5个。第20页目标客户群QIAGEN Your Partner in Translational Medicine21单位研究方向预估课题经费肺科医院肿瘤科肺癌CTC小RNA检测5万中山医院肝外科肝癌CTC外显子组测序，CTC 转录组测序30万中山医院肝研所肝癌CTC转录组测序10万瑞金医院肠癌CTC转录组测序10万中科院生化细胞所生殖细胞全外显子组测序和转录组测序（已做）300万中科院神经所神经细胞转录组测序（已做）30万复旦大学脑科学研究院神经细胞转录组测序（已做）10万以上海市场为例第21页目标客户群QIAGEN Your Partner in Translational Medicine22以上海为例主要集中单位： 中山医院肝研所、仁济医院干细胞中心、同济大学生科院（干细胞）、上海市肿瘤研究所、中科院生化细胞所、肺科医院肿瘤科、中科院神经所、复旦大学脑科学研究院等主要集中领域： 肿瘤（肺癌、肝癌、肠癌、乳腺癌等）、干细胞、神经科