文摘索引型数据库检索与利用课件

1、李春英北京大学医学图书馆2017年9月文摘索引 型数据库检索与利用第2讲内容提要PubMed实习BIOSIS PreviewsPubMed练习1.检索有关“禽流感预防控制方面”的文献2.检索微量元素缺乏与皮肤病关系的文献（限英文综述）3.利巴韦林（ribavirin）治疗SARS方面的综述文献4.眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blindness)的文献（比较基本检索和主题词检索的结果）5.北京大学韩济生教授发表的英文文献6.CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献1.检索过程和步骤2022/8/74（1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之

2、间的相互关系如下：预防控制禽流感事物与特征的关系2022/8/75（2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。（3）编制检索策略。 Influenza in Birds / prevention and control （禽流感 / 预防控制） 其中 主题词为： Influenza in Birds（禽流感） 副主题词为： prevention and control （预防控制）2.检索过程和步骤2022/8/76（1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：皮肤病微量元素缺乏因果关系 此外，课题还要求只要英文综述文献。综述英文+20

3、22/8/77（2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。此外， PubMed数据库提供有检索结果滤镜（Result Filters），可对检索结果按照不同分面进行显示，其中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。2022/8/772022/8/78（3）编制检索策略 Trace Elements / deficiency （痕量元素 / 缺乏） Skin Diseases / etiology （皮肤疾病 / 病因学） 其中 主题词为： Trace Elements 、 Skin Diseases 副主题词为： deficiency 、 etiologyP

4、ubMed检索小结1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题2.Search Details描述检索过程3.*关闭自动转换匹配功能4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果BIOSIS Previews数据库BIOSIS Previews主要内容数据库概况数据库特色检索技巧和方法检索结果处理检索实习概况出版单位： 美国生物科学信息服务社(BIOSIS, 现已隶属于Clarivate Analytics) 组成：Biological Abstracts与Biological Abstracts/RRM (Reports, Review, Me

5、etings)整合收录范围：来自90多个国家生命科学领域的6000多种期刊、1500多个国际会议及与生命科学相关的21000多条美国专利信息BIOSIS Previews 学科范围传统生物学如：分子生物学、植物学、生态与环境科学、微生物学、医学、药理学、动物学交叉学科如：农业、生物化学、生物医学、生物技术、实验医学、临床医学、兽医学、遗传学、营养学、药物学、公共卫生相关领域如：仪器、实验方法等BIOSIS Previews文献类型期刊图书专利综述会议 关联性索引和生物学分类BIOSIS Previews特色BIOSIS Previews关联性索引关联性索引 (Relational Indexi

6、ng)在文献标引过程中采用独有的标引方法，其特色在于能够标引出每一个检索字段和控制字汇之间的关联性。这个标引系统使研究人员能快速而准确地找到数据。关联的原则研究主题 (major concepts或者 concept codes)被研究的生物体（1）生物自然分类系统中上位分类名（Super Taxa）（2）生物分类注释（Taxa Notes）（3）生物系统代码（Biosystematic Codes）（4）生物体结构（Organism,Part& Structures)被研究生物体的所在地（Geopolitical Location)用什么方法做研究（Mothods & Equipment)R

7、elational Indexing 关联性标引例如：Coronavirus 冠状病毒的关联性标引词冠状病毒Coronavirus上位分类名Positive Sense ssRNA Viruses生物体分类代码Coronaviridae 03613描述词pathogen; strain-TOR2在BIOSIS Previews全记录中有关Coronavirus的标引生物学分类采用自然主题分类法，按照生物界的自然分类系统分类。全部生物体按照类、门、纲、目、科、属、种的顺序排列。大类分为微生物、植物、古生物、动物，每大类分为四级类目（门、纲、目、科）使用任一生物体的科以上类目，都可以查出与该生物相

8、关的文献。生物分类代码/名称是一个五位的代码，代表种级别以上的分类组。点击list连接可以看到生物系统学代码。如检索冠状病毒主要概念主要概念是涉及生命和生物科学领域的相关词汇BIOSIS Previews有168个主要概念词可通过主要概念的列表找到所需概念词汇。列表中分为两种格式：字顺列表和按照概念的层级排列可以输入要查找的学科分类的部分字符，点击查找在选中的学科分类前点击添加后，选择确定,系统会自动跳转到检索界面中主概念检索字段的检索框里主要概念索引辅助工具例检索传染性疾病患者护理的文献输入检索词选择主要概念字段概念代码学科编码是一个五位数的编码，代表生命科学中的广泛的学科领域，每一个编码对

9、应着一个学科名称。点击相应的连接可以看到学科编码和相应的名称。学科编码与名称用于标引自1993目前年的BIOSIS的纪录。共计571个五位的学科编码代表了生命科学的大类。检索代码和名称结果相同。概念代码辅助检索找到后，点击学科名词前的添加按钮，返回到检索界面的检索框中可以浏览要查找的学科分类代码可以输入学科名称或代码查找所学的学科词汇例如检索艾滋病患者心理行为的文献检索技巧1布尔逻辑运算符通常使用的运算符有AND、OR、NOT。不区分大小写如在标题字段输入asthma drug therapy（系统默认转换为asthma AND drug AND therapy进行检索）可以检索出标题同时含有

10、哮喘、药物和治疗的文献但在“出版物名称”或“来源出版物”字段中却不能使用逻辑运算符检索技巧2.位置运算符NEAR/x：连接的检索词之间相隔指定数量的单词记录。用数字取代“ x”可指定将检索词分开的最大单词数。NEAR=NEAR/15。SAME：连接的两个检索词在同一句子内，前后顺序没有要求。在“地址”检索中，使用SAME将检索限制为出现在“全记录”同一地址中的检索词。NEAR可以用在多数字段中，但不要在“出版年”字段中使用。SAME只能用在“地址”字段中，不能用在其他字段中。检索技巧3. 通配符通配符可以用在开头、中间和结尾。但是特殊字符和出版年不得使用通配符。通配符的使用规则会随着字段的不同

11、而不尽相同。“*”，代表0到多个字母，例如输入gene*，可检索出gene、genetics和generation。“$”，代表0到1个字母，例如输入disease$，可检索出disease和diseases。“？”，代表1个字符，例如输入colo?r，可检索出color和colour。多个运算符的先后次序：SAMENOTANDOR括号可以改变优先运算顺序，并最优先运行，一个检索提问中最多可使用50个运算符号检索方法基本检索高级检索基本检索界面检索框中输入检索词或短语，选择检索字段的检索方法如果检索内容多，可添加多个检索框例如查找板蓝根治疗应用的文献板蓝根拉丁学名Isatis tinctori

12、a生物学分类如下：界 植物界门 种子植物门Spermatophyta亚门 被子植物门Angiospermae纲 双子叶植物纲Dicotyledones亚纲 原始花被亚纲 Archichlamydeae目 罂粟目Rhoeadales科 十字花科Cruciferae属 菘蓝属Isatis种 板蓝根Isatis tinctoria板蓝根治疗应用板蓝根治疗应用高级检索例如检索维生素C与维生素E对中华鳖生长发育与免疫的影响方面的文献分析内容：维生素C、维生素E、中华鳖中华鳖拉丁文Trionyx Sinensis生物学分类如下 Animalia(动物界) Chordata（脊索动物门） vertebrata（脊椎动物亚门） reptilia(爬行纲) testudinata(龟鳖目) chelonia(海龟科) 维生素C与维生素E对中华鳖生长发育与免疫的影响文献检索结果处理结果分析结果显示结果保存与打印检索结果分析功能多层次的限定与精确的检索发现某研究领域的隐含的发展趋势把握学科领域的最新动态了解某特定课题在不同学科的分布情况获取某学科领域的核心研究人员的信息检索结果分析方法8个字段的深入分析：著者出版年研究机构来源期刊学科领域国家与地区 文献类型文献语种例如分析艾滋病疫苗的相关研究文献专利权人分析发表论文最多的作者涉及的研究领域发表文献的主要类