全国细菌耐药监测网上传数据标准-V2

1、全国细菌耐药监测网信息系统此文档最后修改于 2014年4月14日全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所 有成员单位的耐药监测数据，系统具备完善的数据筛选和容错处理功能， 系统所支持上传的数据文件格式为 WHONET 5.6软件所导出的通用数据 文件格式，但后缀必需为“ .dbf”。除此以外，系统还支持Excel表格，包 括Excel2003以下版本生成的*.xls以及Excel20072010所生成的*.xlsx。一、科室代码设置监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能，登记 注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上，该映射 关系可随着本院的科室变

2、化随时进行调整增加、删除、修改，调整之 后不影响曾经上传过的文件，仅影响在调整时间点后上传的数据。而各 医院临床科室对应上报数据文件中的 WARD字段保存的值，可以是本院 临床科室名称也可以是本院的临床科室代码，取决于各院在WHONET中是如何管理的，或者是如何从LIS系统导出的。完成医院科室设置后，在 上传本院数据时，系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准 的科室分类进行映射，并将映射结果直接写入DEPARTMENTS,不影响WARD字段中上传的原始值，也就是说，DEPARTMEN号段实际上可以不填写，甚至是整列都不存在。其实，更好的做法是在上报的数据文 件中直接将DEPARTMEN

3、存段设置成系统内置的标准科室代码3位字 符。学习文档仅供参考二、数据文件各字段要求1、来源 ORIGIN非必填字段，最长1个字符。假设填写，则其必须为“ h”，假设不 填写，数据上传后系统会自动补充，假设填写值不为“ h”，系统将自动 替换成“h”。2、国家 COUNTRY_A非必填字段，最长3个字符。假设填写，则其必须为“ CHN,假设 未填写，数据上传后系统会自动补充。3、医院 INSTITUT非必填字段，为卫生部统一分配的标准代码，标准 6字符，前两位 为国家标准省级代码如北京为11,福建为35等，后4位为各省编码 从0001开始，例如福建省立医院为350001,假设未填写，数据上传 后

4、系统自动补充已注册的医院标准代码，假设填写则必须与本院的代码 一致，否则系统会自动替换为正确代码，在数据上传时此字段不建议填 值。4、实验室 LABORATORY非必填字段，最长3个字符。系统不再将此作为医院标识，无具体 格式要求，只要不超长，系统均可接受。5、病历号 PATIENT_ID对于门诊病历不要求必须填写，对于住院病历要求必须填写，并且 填写总量至少占住院病历数据量的95%,否则会导致整个数据文件系统无法接收，该字段最长16个字符。学习文档仅供参考6、姓氏 LAST_NAME名字 FIRST_NAME FULL_NAME系统原则上要求FULL_NAME必填，如果未填写系统可根据 LA

5、ST_NAM序口 FIRST_NAM由动才|算FULL_NAME勺值。因止匕请根据本院 实际情况填写如上三个字段中的任意一个字段即可，如果考虑到本院病 人隐私问题，可将病人加密，只要不超长，系统依然可以正常接收。以 上三个字段的长度要求分别为： LAST_NAME30字、FIRST_NAME20 字、FULL_NAME50 字。7、性别SEX此字段要求必填，最长1个字，WHONE箧求只能填写“f”或者“m”， 系统提供了相关的容错处理机制，允许填写“男”和“女”，系统会自动 将“男”替换成“ m”，将“女”替换成“ f”。8、年龄字段 AGE此字段要求必填，最长3个字符。1不带任何后缀的13位

6、整数或者2位数字+y后缀，代表年龄 是按岁计算。22位数字+ d即代表年龄按天计算。32位数字+ w即代表年龄按周计算。42位数字+ m即代表年龄按月计算。5空值或其它字符，系统会认为是非法值，需补充修改后才能上 报。9、年龄类另U PAT_TYPE非必填字段，系统会根据年龄 AGE自动生成，即使是数据中已经填学习文档仅供参考 写了该值系统也会强制替换，因此，该字段可以不填，假设要填写，长度必须为3位字符，且要符合系统的计算规则，具体计算规则如下：1）当AGE后缀为“d”代表“天”时：28d,生成“ ped”代表“儿童”；2）当AGE后缀为“w”代表“周”时：4w,生成“ ped”代表“儿童”

7、；3）当AGE后缀为“ m”代表“月”时：A. 0m,系统无法识别，需修正后才能上报；=1m,生成“ ped”代表“儿童”；4）当AGE为纯数字，代表“岁”时：0或者0y,系统无法识别，需修正后才能上报；=1或者=1y并且=14或者=15或者=15y并且=65或者65或者65y,生成“ ger”代表“老年”。10、科室送检科室WARD为必填项，最大长度为15字，中英文不限，此字段所填写的值应该 对应为本院科室维护模块中所录入的信息，可以是本院科室代码也可以 是本院科室名称，而填写的值不在本院科室列表中时，系统会认为该值 为非法值，需要修改之后再上传。11、科室类另U WARD_TYPE学习文档

8、仅供参考为非必填项，最大长度为3个字。如果不填写，系统不进行校验， 如果填写，则必须与 WHONET内置的代码要求一致，见附表1。12、专业类另U DEPARTMENT为100%5填项，最大长度为3个英文字符，此字段所填写的值，必 须为系统所规定的标准专业类别代码， 见附表2。未在该附表中的值为非 法值，无法通过系统校验。系统提供了容错处理，可直接通过 WARD字 段自动推算此列的值。因此，此字段其实可以不填写。13、标本类型英文代码SPEC_TYPE本字段为必填项，最低校验通过率为 100%要求100%必填，不能 为空白，否则将导致整个文件校验失败，系统拒绝接收！系统只接受 WHONET准【

9、标本字典】中的英文代码，见附表 3。意外情况：如果本字段所填写值，与从【SPEC_COD今段所推算出 来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收， 必须改正之后才可以重新上传，且不仅仅是影响单列通过率的问题！例如：痰标本的英文代码为“ sp，数字代码应该对应为“ 3”，如果 填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收， 必须改正之后才可以重新上传！14、数字代码SPEC_CODE本字段为必填项，最低校验通过率为 100%要求100%必填，不能 空，否则将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！校验规则如下：系统只接WHONET准【标本字典】中的数字代码

10、，具体请参照或者学习文档仅供参考下载全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准文档中的附表3:SPEC_TYPESPEC_CODE照字典中的【SPEC_COlD。除此以外的值，均为非法值，如果有一项填写错误，将导致整个文 件校验失败，并且被系统拒绝接收！意外情况：如果本字段所填写值，与从【SPEC_TYPE字段所推算出来的值不匹 配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正 之后才可以重新上传！例如：痰标本的英文代码为“ sp，数字代码应该对应为“ 3”，如果 填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收， 必须改正之后才可以重新上传！容错处理：如果本字段未填写

11、值，则系统会自动从【SPEC_TYPE字段推算出本 列的值，并且会给出警告提示，这不影响通过率，但这会影响高质量数 据占比。15、关于标本字段的其它规则如果标本代码确实没有在系统所给出的字典库中列中，可以将SPEC_TY遁写为“ ot”将SPEC_CODE写为“89”，代表“其它”。如果 出现了 SPEC_TYPE SPEC_COD两者都填写了值，但两值并不匹配的情 况，例如：痰标本的英文代码为“ sp，数字代码应该对应为“ 3”，如果 填写了其它数字代码，系统会给出提示，要求修正不匹配的数据后再次 上传。超出附表3内的标本类型系统视为非法值，需修正后才能上报学习文档仅供参考 数据。另夕卜，当

12、标本类型为质控标本即SPEC_TY哨qc并且SPEC_CODE 为75或者SPEC_TY峭 ex并且SPEC_CODE 99时系统会忽略这些数 据，并给出提示并自动忽略该条数据。14、标本编号SPEC_NUM段100%5填字段，最大长度30字。15、检验结果细菌ORGANISM100%5填字段，标准3位英文字符代码，此代码为 WHONET 5.6标 准细菌代码；注意！系统仅接收革兰阳性菌与革兰阴性菌，见附表4，不接受真菌，支原体，厌氧菌和分枝杆菌等。当发现在附表4所规定的标准代码外的数据时，系统会给出提示并自动忽略该条数据。16、细菌类另U ORG_TYPE系统仅接受革兰阳性菌“ +”和革兰阴

13、Ti菌代码“-”，最大允许1字 符，此字段可不填写。当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段的值推导出来，当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不 匹配的时候，会自动将其替换成合法值。17、 B-内酰胺酶 BETA_LACT非必填字段，1字符，且值仅能为、”或“-，假设填写为“n”、“ne”、 “neg”、“negative”或者中文全角“一”，系统会自动将其修正为半角英 文“-，假设填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“ 十 ”， 系统会自动将其修正为半角英文“ +”。18、超广谱（3 -内酰胺酶ESBL规则同上学习文档仅供参考19、耐甲氧西林

14、葡萄球菌检测试验 MRSA_SCRN规则同上。20、诱导型克林霉素耐药试验INDUC_CLI规则同上。21、霍奇试验HODGE非必需字段，规则同上。22、碳青酶烯酶CARBAPENEM规则同上。23、送检日期标本日期SPEC_DATE本字段为必填项，最低校验通过率为 100%!系统只接收特定的日期格式，例如 2014年11月5日可以有如的表示方式：20141105长度必须为8位2014 11 05 或者 2014 11 52014-11-05 或者 2014-11-52014/11/05 或者 2014/11/52014年11月05日或者2014年11月5日Nov 05 2014,其中Nov为

15、英文的11月简写Nov-05-2014,其中Nov为英文的11月简写Nov/052014,其中Nov为英文的11月简写05 Nov 2014,其中Nov为英文的11月简写05-Nov-2014,其中Nov为英文的11月简写学习文档仅供参考05Nov/2014,其中Nov为英文的11月简写 2014 05 Nov,其中Nov为英文的11月简写 2014-05-Nov,其中Nov为英文的11月简写 2014/05Nov,其中Nov为英文的11月简写2014 Nov 05,其中Nov为英文的11月简写 2014-Nov-05,其中Nov为英文的11月简写 2014/Nov/05,其中Nov为英文的1

16、1月简写 错误的日期格式举例：2014115中间没有任何分隔符，并且长度不为8位，系统将无法识别。英文月份的简写请参照下表:月份英文代码月份英文代码1Jan7Jul2Feb8Aug3Mar9Sep4Apr10Oct5May11Nov6Jun12Dec24、报告日期数据录入日期 DATE_DATA学习文档仅供参考 为非必填字段，规则同上。25、抗生素所有抗生素代码采用 Whonet 5.6标准代码。抗生素代码见附表5 纸片法K-b法：填写结果只能为6至80之间的整数，否则视为填写错误，系统会将 该值忽略，这会影响该列的通过率。对应的字段名应为：抗生素英文代 码+ “_ND” +抗生素含量，例如：

17、AMK_ND3a AMX_ND2S切记：不能 为S、I、R、不能有小数、不能带任何符号.容等。MIC 法：对于除高浓度庆大霉素和高浓度链霉素以外的MIC法字段，系统要求只能为小数或者1、2、4、8、16、32、64、128、256、512,不在这些数 字范围内的，均为非法值。可以有前导【、=】符号。合法情况举例： 等于纯整数数字或者小数数字：4、4.0;大于或者大于等于上述两类数 字：4、=4、4.0、=4.0;小于或者小于等于上述两类数字：4、=4、4.0、=4.0;对应的字段名应为：抗生素英文代码+ “_NM”；例如：AMK_NM、AMX_NM;切记：不能为S I、R不能为非2的平方数如

18、6、7、99、100 等等。MIC法特殊字段-【GEH_NM1高浓度庆大霉素的填写规则： 以下特殊规则将直接替代普通 MIC法的校验规则，具体如下： 1、仅允许出现如下值：250, 256, 500, 512, 513, 1000, 1024, 1025,学习文档仅供参考不在这些数字范围内的，均为非法值，影响通过率2、可以有前导【、=】符号3、如果填写了【SYN-S,系统将自动替换为【=500】4、如果填写了【SYN-R,则将自动替换为【=1000MIC法特殊字段-【STH_NMfl,高浓度链霉素的填写规则： 以下特殊规则直接替代普通 MIC法的校验规则，具体如下： 1、仅允许出现如下值：50

19、0, 512, 1000, 1024, 2000, 2048, 2049, 不在这些数字范围内的，均视为非法值2、可以有前导【、=】符号3、如果填写了【SYN-S,系统将自动替换为【=1000】4、如果填写了【SYN-R则将自动替换为【=2000MIC法特殊字段-【SXT_NMI复方新诺明的填写规则：该结果上传后系统自动将数据为 320的字符替换为16, 160替换 为8, 80替换4, 40替换为2, 20替换为1, 10替换为0.5,其余字 符保持原始数据。A.系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符，具体如下：a）全角“三”或将替换为半角“ =”b）全角“三”、“w”将替换为半角“

20、 =c）全角“”将替换为半角“ ”d）全角将替换为半角“ ”学习文档仅供参考e）全角“=”将替换为半角“二”f）全角与“。”将替换为半角在数据中假设出现未在附表5中的其它抗生素字段，系统会自动忽略 该字段的数据，不予保存。本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为 CLSI M100-S23上传数据如 果有未到达该折点标准的数据，系统会将该组数据中的未到达CLSIM100-S23标准的抗生素结果忽略。如某一抗生素，CLSI M100-S2折点为 S:=iq测定名果为=8,这样的数据系统无法判断是敏感 还是中介，系统在统计的时候会自动将该组数据中的这个抗生素结果给 忽略掉，不予统计。2014新版细菌耐药

21、监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能， 能将上传的不合格数据自动修正或删除，处理为合格的数据文件，同时 具备一定的学习功能，用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错 误，不断改良，提高数据质量，同时可将修正后数据用于本机构细菌耐 药监测统计分析。学习文档仅供参考附表1:WARD_TYPE 字典代码含义out门诊病人in住院病人inx住院病人非-ICDicu重症监护病房int过度监护病房eme急诊nur家庭护理com社区hos其它医院lab实验室abaAbattoir屠宰场vetVeterinary clinic兽医诊所farFarm农场fieField 野外stoStore/Market

22、商店/超市resRestaurant 饭店zooZoo动物园mix混合unk未知不明来源oth其他学习文档仅供参考附表2:系统内置标准科室分类字典代码名称代码名称neu神经内科obg妇产科car心内科ped儿科res呼吸内科pes小儿外科dis消化内科neo新生儿科end内分泌内科oph眼科hem血液内科oto耳鼻咽喉科nep肾脏内科sto口腔科ger老年病内科der皮肤性病科rhe风湿免疫科inf感染疾病科med（大）内科chi中医科oim其它内科rad放射治疗科sur外科onc肿瘤科ort骨科eme急诊科urs泌尿外科out门诊科ces胸外科icu重症医学科cas心脏外科rcu呼吸监护室b

23、us整形烧伤外科ccu心脏监护室nes神经外科ecu急诊监护室vas介入血管外科reh康复医学科ots其它外科oth其它学习文档仅供参考附表3:SPEC_TYP囱 SPEC_CODE寸照字典名称SPEC_CODE 数字代码SPEC_IYPE 英文代码名称SPEC_CODE 数字代码SPEC_IYPE 英文代码鼻腔拭子1no水96wa咽拭了2th食物97fo淡3sp/、明怀不98un支气管分泌物4br质控99qc耳鄢标本5ea头友100hr眼分泌物6ey指甲101nl口腔拭子7mo鼻口因拭子102np皮肤拭子8sk足拭子103ft天中拭手9jt尸检标本104au导尿胃尿10uc异物105-7b-

24、尿液11ur脂粪106mc皿液12bl子宫内避孕器107iu脑脊液13sf刖段尿108fv肺穿刺液14lu脐部拭子109us腹水15ab隔离标本110is胄液16ga腹部脓肿111ad排泄物17dr烧伤标本112bs液体18fl永久导管113cp胆汁19bi角膜标本114cr伤口拭子21wd脓胸115ee外科手术伤口拭子22sw胸膜脓肿116ep脓肿23as硬膜下脓肿117es脓液24ps人工心脏瓣膜118hp羊水25am小支气管肺泡灌洗液119mb气管插管26tr起博器120pm窦道拭子27si胰腺标本121pn棉签28sb心包积液122pd吸气管29at导管尖端123cs无菌体液30fn人

25、工骨124pb器官31og人工分流管125sh宫颈拭子32cx人工血管126pv脐带标本33um保护性导管刷127pc阴道拭子34va扁桃体穿刺液128tn活检组织35bx褥疮溃疡129ud组织36ti非导管尿130uz脑部组织37bn肾穿刺尿131uo心脏标本38he未知来源尿132uu心脏瓣膜39hv扁桃体脓肿133pt肝脏穿刺液40li牙龈脓肿134de粪便41st肛周脓肿135ac直肠拭子42re皮肤脓肿136ak肌肉标本43mu阑尾137ap手部拭子44ha外周导管138ch手臂拭子45ar培养基140cm腋窝拭子46ax前庭大腺囊肿141cb结膜拭子47co引流液142dn中耳拭子

26、48em心内膜143ec外耳拭子49eo附睾标本144ed瘦管50fi会厌拭子145eg生殖器拭子51gn食管拭子146eh男性外生殖器拭子52gm输卵管147fa女性外生殖器拭子53gf疝148fu胎盘组织54pl胆囊标本149gb乳房穿刺液55bt雕关节标本150hi乳汁56mi雕关节液151hf学习文档仅供参考精放5/sm昆里152it尿道拭了58ue关节胫枳液153jf清清中段尿59cv膝盖拭子154kn分泌物60se膝关节液155kf骨组织61bo喉拭子156lx骨髓62bm唇拭手15/IP支气管肺泡灌洗液63ba恶露158lo胸水64Pf卵巢组织159ov卜呼吸道标本65rl阴茎拭

27、子160pe上砰吸道标本66ru阴茎分泌物161pg气营抽出液67ta会阴拭子162Pi外部溃疡标本68ux血浆163pa内部溃疡标本69ui前列腺组织164po筛选标本70sc前列腺液165pu筛选MRS怫本71mr直肠子宫馅凹穿剌液166rc筛选VRE标本72vr检测寄生虫用透明胶带167tp科研标本73rs血清168sr实验室标本74la分流液169su外部质控75ex脾组织170sl呼吸道标本76rp抗酸染色痰171sa溃疡标本77ul诱导痰172in膀胱尿78ub吞线试验检测寄生虫173sg肾脏尿79uk睾丸穿刺液174te耻骨弓上穿刺尿80ua牙齿175to肾脏标本81ki蠕虫17

28、6wo子宫拭子82ut胸部伤口拭子177wt十二指肠液83du腹部拭子178an纵膈拭子84me血管179bv囊液85bu头部拭子181hd囊肿穿刺液86cy唾液腺穿刺液182sv淋巴结穿刺液87In腿部拭子183lg腺体穿刺液88gi颈部拭子184nk其它89ot神经185nv导管91ca盆腔积液186lv透析液92di筛选艰难梭菌187cd环境标本93en腹股沟拭子188gr假体94pr腹股沟三角区拭子189ig中央导管95cc脐带导管190cu学习文档仅供参考附表4:细菌字典代码中文名称saj毗邻颗粒链菌(Abiotrophia adiacens)+saj毗邻颗粒链菌(Streptoco

29、ccus adjacens)+lbo博兹曼杆国(Fluoribacter bozemanii)-lbo博兹曼杆国(Legionella bozemanii)-bsaA群 3 -溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group A)+grdSalmonella Group D (D1, D2, D3)-greSalmonella Group E (E1-E2-E3)-grgSalmonella Group G (O:13) (G1-G2)-leg军团菌属(Legionella sp.)-ggiSalmonella Group G1 (0:13,22)-gg2Salmon

30、ella Group G2 (0:13,23)-bhm霍氏鲍特菌(Bordetella holmesii)-bhmCDC NO-2-haf哈夫尼业菌属(Hafnia sp.)-grcSalmonella Group C (C1-C4, C2-C3)-grbSalmonella Group B (0:4)-sunSalmonella sp., unnamed-sun未命名沙门菌(Salmonella unnamed)-spc变形斑沙雷菌(Serratia proteamaculans)-spcSerratia proteamaculans ss. proteamaculans (-scn凝固酶阴

31、性葡萄球菌 (Staphylococcus, coagulase negative)+ral罗尔斯顿菌属(Ralstonia sp.)-buk伯克霍尔德菌属(Burkholderia sp.)-gc1Salmonella Group C1 (0:7)-lma麦凯克伦埃特洛克菌 (Legionella maceachernii)-lma麦凯克伦埃特洛克菌 (Tatlockia maceachernii)-lmc麦克达德埃特洛克菌 (Legionella micdadei)-lmc麦克达德埃特洛克菌 (Tatlockia micdadei)-tal埃特洛克菌属(Tatlockia sp.)-apl

32、胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae)-apl胸膜肺炎放线杆菌(Haemophilus pleuropneumoniae)-acb放线杆菌属(Actinobacillus sp.)-clr红嘴鸥弯曲菌(Campylobacter lari)-clr海鸟弯曲菌(Campylobacter laridis)-cap一氧化碳嗜纤维菌属 (Capnocytophaga sp.)-capCDC DF-1-chb金黄杆菌属(Chryseobacterium sp.)-sid广口引喋萨顿菌(Kingella indologenes)-学习文档仅供参考sid广口引喋

33、萨顿菌(Suttonella indologenes)-sut萨顿菌属(Suttonella sp.)-eet肠/It 大肠 WB_国(Escherichia coli, enterotoxigenic (ETEC)-eei肠侵袭型大肠埃希国(Escherichia coli, enteroinvasive (EIEC)-ppm假鼻疽伯克霍尔德菌 (Burkholderia pseudomallei)-ppm类鼻疽伯克霍尔德菌 (Pseudomonas pseudomallei)-ste窄食单胞菌属(Stenotrophomonas sp.)-ef4CDC EF-4-ef4类巴斯德菌(Past

34、eurella-like (CDC EF-4)-e4aCDC EF-4a-e4bCDC EF-4b-oen酒球菌属(Oenococcus sp.)+dei异常球菌属(Deinococcus sp.)+cam弯曲菌属(Campylobacter sp.)-chm色杆菌属(Chromobacterium sp.)-cor棒杆菌属(Corynebacterium sp.)+ha-嗜血杆菌属(Haemophilus sp.)-meb甲基杆菌属(Methylobacterium sp.)-mic微球菌属(Micrococcus sp.)+och苍白杆菌属(Ochrobactrum sp.)-oanCDC

35、 Vd-1-oanCDC Vd-2-oan人苍白杆国(Ochrobactrum anthropi)-ps-假单胞菌属(Pseudomonas sp.)-se-沙雷菌属(Serratia sp.)-shi志贺菌属(Shigella sp.)-snd志贺菌,非痢疾(Shigella, non-dysenteriae)-sta葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)+sdo道恩链球菌(Streptococcus downei)+str链球菌属(Streptococcus sp.)+br-布皙菌属(Brucella sp.)-157大肠菌 O157:H7(Escherichia coli O

36、157:H7)-d01痢疾志贺国血清 1 型(Shigella dysenteriae serotype 1)-sd1痢疾志贺国 1 型(Shigella dysenteriae Type 1)-d02痢疾志贺国血清 2型(Shigella dysenteriae serotype 2)-d03痢疾志贺国血清 3型(Shigella dysenteriae serotype 3)-d04痢疾志贺国血清 4型(Shigella dysenteriae serotype 4)-d05痢疾志贺国血清 5型(Shigella dysenteriae serotype 5)-d06痢疾志贺国血清 6型(

37、Shigella dysenteriae serotype 6)-d07痢疾志贺困血清 7型(Shigella dysenteriae serotype 7)-d08痢疾志贺国血清 8型(Shigella dysenteriae serotype 8)-d09痢疾志贺国血清 9型(Shigella dysenteriae serotype 9)-d10痢疾志贺困血清 10型(Shigella dysenteriae serotype 10)-学习文档仅供参考d15痢疾志贺国血清 15型(Shigella dysenteriae serotype 15)-f01福氏志贺菌血清 1 型(Shige

38、lla flexneri serotype 1)-f1a福氏志贺菌 1a 血清型(Shigella flexneri serotype 1a)-fib福氏志贺菌 1b 血清型(Shigella flexneri serotype 1b)-f02福氏志贺菌血清 2型(Shigella flexneri serotype 2)-f2a福氏志贺菌 2a 血清型(Shigella flexneri serotype 2a)-f2b福氏志贺菌 2b 血清型(Shigella flexneri serotype 2b)-f03福氏志贺菌血清 3型(Shigella flexneri serotype 3)

39、-f3a福氏志贺菌 3a 血清型(Shigella flexneri serotype 3a)-f3b福氏志贺菌 3b 血清型(Shigella flexneri serotype 3b)-f04福氏志贺菌血清 4型(Shigella flexneri serotype 4)-f4a福氏志贺菌 4a 血清型(Shigella flexneri serotype 4a)-f4b福氏志贺菌 4b 血清型(Shigella flexneri serotype 4b)-f05福氏志贺菌血清 5型(Shigella flexneri serotype 5)-f06福氏志贺菌血清 6型(Shigella

40、flexneri serotype 6)-b01鲍氏志贺菌血清 1 型(Shigella boydii serotype 1)-b02鲍氏志贺菌血清 2型(Shigella boydii serotype 2)-b03鲍氏志贺菌血清 3型(Shigella boydii serotype 3)-b04鲍氏志贺菌血清 4型(Shigella boydii serotype 4)-b05鲍氏志贺菌血清 5型(Shigella boydii serotype 5)-b06鲍氏志贺菌血清 6型(Shigella boydii serotype 6)-b07鲍氏志贺菌血清 7型(Shigella boy

41、dii serotype 7)-b08鲍氏志贺菌血清 8型(Shigella boydii serotype 8)-b09鲍氏志贺菌血清 9型(Shigella boydii serotype 9)-b10鲍氏志贺菌血清 10型(Shigella boydii serotype 10)-b11鲍氏志贺菌血清 11 型(Shigella boydii serotype 11)-b12鲍氏志贺菌血清 12型(Shigella boydii serotype 12)-b13鲍氏志贺菌血清 13型(Shigella boydii serotype 13)-b14鲍氏志贺菌血清 14型(Shigella

42、 boydii serotype 14)-b15鲍氏志贺菌血清 15型(Shigella boydii serotype 15)-fla黄杆菌属(Flavobacterium sp.)-nmo脑膜炎余瑟宙其它血清型(Neisseria meningitidis, other serogroups)-139霍乱弧菌 O139ffll清型(Vibrio cholerae O139)-bsbB 群 3 -溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group B)+noc诺国属(Nocardia sp.)+hku昆兹子创伤球菌(Helcococcus kunzii)+hec创伤球

43、菌(Helcococcus sp.)+4c2CDC IVc-2-sc+凝固酶阳性葡萄球菌 (Staphylococcus, coagulase positive)+pab类牙抱杆国属(Paenibacillus sp.)+mibCDC Coryneform Group A-4+mibCDC Coryneform Group A-5+mib微杆菌属(Microbacterium sp.)+学习文档仅供参考sdy停孚L链球菌(Streptococcus dysgalactiae)+sdy停孚 L 链球菌停孚 L 亚种 (Streptococcus dysgalactiae ss. dysgalac

44、tiae)+mahMannheimia species-phaMannheimia haemolytica-pha溶血曼海姆菌(Pasteurella haemolytica)-javSalmonella Java-kol口金菌(Kingella oralis)-alc产碱杆菌属(Alcaligenes sp.)-aec气球菌属(Aerococcus sp.)+aer气单胞菌属(Aeromonas sp.)-agr根瘤菌属(Agrobacterium sp.)-aly小链球菌(Alysiella sp.)-arb隐秘杆菌属(Arcanobacterium sp.)+bd-鲍特菌属(Bordet

45、ella sp.)-e26类鲍特菌(Bordetella-like species)-e26CDC EF-26-tsk冢村菌属(Tsukamurella sp.)+cmb鞘杆菌属(Calymmatobacterium sp.)-car心杆菌属(Cardiobacterium sp.)-chr金色单胞菌属(Chryseomonas sp.)-hel螺杆菌属(Helicobacter sp.)-sph鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas sp.)-myrMyroides sp.-plc动球菌属(Planococcus sp.)+com丛毛单胞菌属(Comamonas sp.)-det嗜皮菌属(

46、Dermatophilus sp.)+eik艾 肯国属(Eikenella sp.)-emp稳杆菌属(Empedobacter sp.)-bud布戴约维米国属(Budvicia sp.)-bua布丘菌属(Buttiauxella sp.)-ced四地四菌属(Cedecea sp.)-ci-柠檬酸杆国属(Citrobacter sp.)-edw爱德华菌属(Edwardsiella sp.)-erw欧义菌属(Erwinia sp.)-esc埃希国属(Escherichia sp.)-o26大肠菌 O26(Escherichia coli O26)-111大肠菌 O111(Escherichia c

47、oli O111)-ewi爱义菌属(Ewingella sp.)-gor戈登菌属(Gordona sp.)+sah糖多抱菌属(Saccharopolyspora sp.)+kl-克雷伯菌属(Klebsiella sp.)-klu克吕沃菌属(Kluyvera sp.)-moe米勒菌属(Moellerella sp.)-学习文档仅供参考lem勒米诺菌属(Leminorella sp.)-pr-变形杆菌属(Proteus sp.)-prv普罗威登斯菌属(Providencia sp.)-bcxBurkholderia cepacia complex-gc2Salmonella Group C2 (O

48、:6,8)-ros玫瑰单胞菌属(Roseomonas sp.)-ber伯杰菌属(Bergeyella sp.)-flu安光杆国属(Fluoribacter sp.)-tat塔特姆菌属(Tatumella sp.)-yer耶尔森菌属(Yersinia sp.)-yok科泽菌属(Koserella sp.)-yok预研菌属(Yokenella sp.)-ery丹毒丝菌属(Erysipelothrix sp.)+lit利斯顿菌属(Listonella sp.)-phb发光杆菌属(Photobacterium sp.)-flv黄单胞菌属(Flavimonas sp.)-fra弗郎西斯菌属(Franci

49、sella sp.)-gar加德纳菌属(Gardnerella sp.)+kin金菌属(Kingella sp.)-koc考克菌属(Kocuria sp.)+lat乳球菌属(Lactococcus sp.)+leu明串珠菌属 (Leuconostoc sp.)+lis李斯特菌属(Listeria sp.)+mo-布二汉菌属(Branhamella sp.)-mo-昊拉国属(Moraxella sp.)-ne-余瑟菌属(Neisseria sp.)-nod拟国属(Nocardiopsis sp.)+oli寡源杆菌属(Oligella sp.)-pas巴斯德菌属(Pasteurella sp.)-

50、ple邻单胞菌属(Plesiomonas sp.)-psy嗜冷杆菌属(Psychrobacter sp.)-rhd红酵母属(Rhodococcus sp.)+sim西蒙斯菌属(Simonsiella sp.)-spb鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium sp.)-stp链霉菌属(Streptomyces sp.)+tay泰勒菌属(Taylorella sp.)-vi-弧菌属(Vibrio sp.)-wee威克斯国属(Weeksella sp.)-xan黄单胞菌属(Xanthomonas sp.)-ren肾杆菌属(Renibacterium sp.)+aub金杆菌属(Aureobact

51、erium sp.)+exi微/、杆菌属(Exiguobacterium sp.)+cel纤维单胞菌属(Cellulomonas sp.)+学习文档仅供参考cel厄氏菌属(Oerskovia sp.)+arc弓形菌属(Arcobacter sp.)-cox考克斯体属(Coxiella sp.)-bar巴尔通体属(Bartonella sp.)-ehr埃里希体属(Ehrlichia sp.)-chl衣原体属(Chlamydia sp.)-ori东方体属(Orientia sp.)-aun月尿气球菌(Aerococcus urinae)+Ips假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudom

52、esenteroides)+pai乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)+pdn肩害片球国(Pediococcus damnosus)+pdx糊精片球菌(Pediococcus dextrinicus)+PPV小片球菌(Pediococcus parvulus)+ppo戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)+mapStreptococcus, microaerophilic+cao拥挤棒杆菌(Corynebacterium accolens)+cf1CDC Coryneform Group F-1+cg2CDC Coryneform Group G

53、-2+ci1CDC Coryneform Group I-1+ce3西地四菌 3(Cedecea sp. 3)-ce5西地四菌 5(Cedecea sp. 5)-mmo摩根摩根菌(Morganella morganii)-mmo摩根摩根菌摩根亚种 (Morganella morganii ss. morganii)-msb摩根摩根菌塞氏亚种 (Morganella morganii ss. sibonii)-trb特拉布于斯国属(Trabulsiella sp.)-tguCDC Enteric Group 90-tguTrabulsiella guamensis (CDC Enteric Gr

54、oup 90-atr肠棕气单胞菌(Aeromonas trota)-ply淋巴管巴斯德菌(Pasteurella lymphangitidis)-nfr非发酵革兰阴性杆菌 (Non-fermenting gram negative rods)-spaCDC IIk-1-spa少动鞘氨醇单胞菌(Pseudomonas paucimobilis)-spa少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis)-bba杆状巴尔通体(Bartonella bacilliformis)-ead大肠WB国 (广碱殊异株 )Escherichia coli (alkalescens-dispa

55、r)-vx1非 O1,非 O13哪霍舌L弧菌(Vibrio cholerae non O1, non O139)-vhi霍乱弧菌 O1 群彦岛型(Vibrio cholerae O1 Hikojima)-vin霍乱弧菌 O1 群稻叶型(Vibrio cholerae O1 Inaba)-gc4Salmonella Group C4 (O:7,14)-ge2Salmonella Group E2 (O:3,15)-ge3Salmonella Group E3 (O:3,15,14)-dpi懒惰狡诈颗粒菌(Dolosigranulum pigrum)+dol狡诈颗粒菌(Dolosigranulum

56、 sp.)+学习文档仅供参考cmcCDC Coryneform Group G-1+cmc禾i棒杆国(Corynebacterium macginleyi)+sga沙门菌鸡血清型(Salmonella Gallinarum)-sga沙门菌鸡白痢血清型 (Salmonella Pullorum)-svc鼠伤寒沙门菌哥本哈根变种(Salmonella Typhimurium var. Copenhagen)-mor摩根菌属(Morganella sp.)-g64Salmonella Group 64 (O:64)-sal沙门菌属(Salmonella sp.)-sro沙门菌属(粗糙型)Salmon

57、ella sp. (rough)-sno沙门菌，未分型(Salmonella, nontypable)-sntSalmonella, non-Typhi-xtpSalmonella, non-Typhi/non-Paratyphi-bcs芽胞杆菌属(Bacillus sp.)+chdChlamydophila sp.-abi之养菌属(Abiotrophia sp.)+pdmCDC EF-5-pdm美人鱼发光杆菌美人鱼亚种(Listonella damsela)-pdm美人鱼发光杆菌美人鱼亚种(Photobacterium damsela ss. damsela)-pdm美人鱼发光杆菌美人鱼亚种

58、(Vibrio damsela)-alo差异球菌属(Alloiococcus sp.)+aoi耳炎差异球菌(Alloiococcus otitidis)+sol气味沙雷菌 1(Serratia odorifera 1)-ari亚利桑那菌属(Arizona sp.)-ari亚禾U桑那菌属 (Salmonella enterica ss. arizonae (Subgroup I)-ariSalmonella subgroup 3a-g61Salmonella Group 61 (O:61)-g63Salmonella Group 63 (O:63)-shtSalmonella enterica

59、ss. houtenae (Subgroup I-shtSalmonella subgroup 4-sbg沙门菌乍得血清型(Salmonella bongori)-sbgSalmonella subgroup 5-sdiSalmonella enterica ss. diarizonae (Subgroup-sdiSalmonella subgroup 3b-sslSalmonella enterica ss. salamae (Subgroup II-sslSalmonella subgroup 2-secSalmonella enterica ss. enterica (Subgroup

60、I-secSalmonella subgroup 1-groSalmonella Group O (O:35)-sii肠炎沙门菌印度亚种 (Salmonella enterica ss. indica (Subgoup VI)-siiSalmonella subgroup 6-b16鲍氏志贺菌血清 16型(Shigella boydii serotype 16)-b17鲍氏志贺菌血清 17型(Shigella boydii serotype 17)-b18鲍氏志贺菌血清 18型(Shigella boydii serotype 18)-学习文档仅供参考d11痢疾志贺国血清 11 型(Shige