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文档简介

1、基因芯片样品的采集、保存和运输基因芯片实验、microRNA芯片实验、PCR芯片实验和实时定量PCR实验的样品准备一、动物组织样品保存与运输(每张芯片需50-100mg组织)1、新鲜组织样品的保存与运输A、使用RNAlater试剂T取新鲜组织(注:生物体死亡后尽快在10分钟内取材),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,所用组织必须切至厚度在 0.5 cm以下(长宽不限),然后放入装有5倍体积RNAlater的离心管(或冻存管)中。T4C孵育过夜,此时样品管需要横置以便组织块充分接触到RNAlater,然后转入-20C中保存。样品在-20C不会冻结, 但是溶液中可能有一些晶体出现,这并不影响后续的

2、RNA抽提。冻存样品也可以反复冻溶,其RNA含量和完整性不受影 响。TRNAlater处理的标本可用常规冰袋4C低温运输(无需使用干冰-70C运输)。B、使用Trizol试剂Trizol试剂可抑制RNA酶活性,破坏细胞膜结构以裂解细胞释放出RNA。T取新鲜组织(注:生物体死亡后1分钟内取材料并保存好),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,每50100 mg组织加1 ml Trizol溶液匀浆裂解组织样品,操作最好在冰上进行。T匀浆的裂解液4C短期保存(1个月),-20度或-70C长期保存。干冰运输,短期(5天以内)冷藏(4C )运输亦可。2、冻存组织的保存与运输生物体死亡后尽快(最好在10分钟内

3、)切取新鲜组织,以PBS或生理盐水清洗干净切为小块,立刻放入液氮中冷冻2-3小 时后可转入-70C冰箱保存或着一直保存在液氮中。冻存组织可放入干冰中直接运输,或者以Trizol 4C下匀浆:冻存的 组织块以液氮研磨后加Trizol或直接加Trizol以电动匀浆器匀浆,匀浆的裂解液干冰运输或短期(5天以内)冷藏(4C) 运输。二、哺乳动物培养细胞样品采集、保存与运输一一使用Trizol试剂(不建议使用RNAlater)1、悬浮细胞t悬浮细胞培养液倒入离心管中,离心沉淀细胞,弃去上清液。T细胞沉淀(1X107个细胞)中加入1 ml的Trizol裂解液。T反复吸打几次后,目视可见细胞层溶解完全。-7

4、0C保存或干冰运输。注:Trizol处理的标本冷藏(4C )运输,短期 (5天以内)亦可。2、贴壁细胞T从培养容器中吸出并弃去培养液。T培养瓶中直接加入Trizol试剂,Trizol用量与细胞贴壁面积有关,约15 cm2细胞贴壁面积加入1 ml Trizol。T反复吸打几次后,目视可见细胞层溶解完全。-70C保存或干冰运输。注:Trizol处理的标本冷藏(4C )运输,短期 (5天以内)亦可。注:1、上海市内细胞样品也可以直接常温运送,运送时在培养瓶中装满培养液并以封口膜封口,然而某些实验条件中包含时间 限制,建议以Trizol处理。2、所使用的1.5 ml冻存管或离心管、枪头等必须高温灭菌,

5、装好样品后管口需要以封口膜封好。3、如需干冰,快递运输所用干冰量至少为8公斤,且运输用泡沫箱需用封箱带密封。植物组织样品准备组织需要量:100mg - 1g,根据植物不同部位的组织决定组织需要量(尽可能量多些,但不必超过1g)保存和运输方法:准确取得所需新鲜组织后,如有必要可用PBS清洗干净,将所用组织切碎,装入冻存管中或者用锡箔包裹好,立即投入液氮中保存。冻存组织可干冰或液氮运输。注:1、所使用的1.5 ml冻存管或离心管、枪头等必须高温灭菌,装好样品后管口需要以封口膜封好。2、快递运输所用干冰量至少为8公斤,且运输用泡沫箱需用封箱带密封。蛋白芯片实验、转录因子芯片实验和免疫印迹实验的样品准

6、备悬浮细胞:T约1X107个细胞,低速离心收集,弃去培养液,加入2 5 ml PBS悬浮细胞,转入小离心管中,低速离心沉淀细胞,弃 去PBS,放入-70 C冰箱保存。干冰运输。贴壁细胞:T约1 X 107个贴壁细胞,胰酶消化后加入PBS悬浮细胞,低速离心收集,弃去液体,加入2 5 ml PBS悬浮细胞,转入 小离心管中,低速离心沉淀细胞,弃去PBS,放入-70C冰箱保存。干冰运输。组织:T采集新鲜组织(注意:生物体死亡后10分钟内取材料并保存好),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,切为小块,放入 液氮或-70 C冰箱中保存,干冰运输。血清和血浆:T采集新鲜血液,分离血清或血浆后放入-20C或-

7、70C冰箱保存。干冰运输。检测蛋白芯片血清约需要100-200U1 的量。注:1、本市内细胞样品也可以直接常温运送,运送时在培养瓶中装满培养液并以封口膜封口,然而某些实验条件中包含时间限 制,建议冻存后运输。2、所使用的1.5 ml冻存管或离心管、枪头等必须高温灭菌,装好样品后管口需要以封口膜封好。3、快递运输所用干冰量至少为8公斤,且运输用泡沫箱需用封箱带密封。ChIP-chip样本采集、保存和运输悬浮细胞:T约1X107个细胞,低速离心收集,弃去培养液,加入2 5 ml PBS悬浮细胞,转入小离心管中,低速离心沉淀细胞,弃 去PBS,放入-70 C冰箱保存。干冰运输。贴壁细胞:T约1 X

8、107个贴壁细胞,胰酶消化后加入PBS悬浮细胞,低速离心收集,弃去液体,加入2 5 ml PBS悬浮细胞,转入 小离心管中,低速离心沉淀细胞,弃去PBS,放入-70C冰箱保存。干冰运输。组织:采集新鲜组织(注意:生物体死亡后10分钟内取材料并保存好),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,切为小块,放入 液氮或-70C冰箱中保存,干冰运输。为获得理想结果,建议根据下述方法处理、保存及运输细胞样品用于ChIP-chip实验:悬浮细胞:取107悬浮细胞低速离心,用10ml培养基将细胞沉淀重悬于50ml离心管中;加入270ul 37%的甲醛(本公司可提供),轻轻混匀,室温孵育10分钟;该步骤最好在通风橱

9、中完成;加入1ml 1.25M的苷氨酸(本公司可提供),轻轻混匀,室温孵育5分钟,中和甲醛;1000Xg离心5分钟,弃上清,用预冷的1XPBS/EDTA洗细胞两遍;1000Xg离心5分钟,弃上清;收集到的样品一80C冻存,干冰运输贴壁细胞:将10cm培养皿中(107细胞)旧的培养基吸掉,添加10ml新鲜培养基;加入270ul 37%的甲醛(本公司可提供),轻轻混匀,室温孵育10分钟;该步骤最好在通风橱中完成;加入1ml 1.25M的苷氨酸(本公司可提供),轻轻混匀,室温孵育5分钟,中和甲醛;将皿中的混合液吸掉,用预冷的1XPBS/EDTA洗细胞两遍,加入1ml含有1Xprotease inhibitor cocktail 的1XPBS,用细胞刮将皿底的细胞刮下,收集到1.5ml离心管中

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