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文档简介
1、案例色盲的遗传学模型研究随机调查1000人,按性别和是否色盲将这1000人分类。分类结果如下:男性正常、女 性正常、男性色盲和女性色盲各有442、514、38、6人。按遗传学的理论,有如下结论:性别决定于两个染色体,女性是XX,男性是XY,人群中女性和男性,也就是有 XX和XY染色体的人所占的比例都是1/2;染色体X与非色盲遗传因子A,或与色盲遗传因子a成对出现,而染色体Y不可 能与A,或与a成对出现。A和a与X成对出现的概率分别为P和q , P + q = 1;遗传因子有显性和隐性之分,非色盲遗传因子A是显性因子,色盲遗传因子a是 隐性因子。因而,对男性来说,(XA)Y的情况没有色盲,其概率
2、为P/2 ; (Xa)Y的情况有色盲,其概 率为q;2。对女性来说,(XA)(XA)、(XA)(Xa)和(Xa)(XA)三种情况都没有色盲,它们的概 率之和为P2.;2 + pq ; (Xa)(Xa)的情况有色盲,其概率为q*2。即男性正常、女性正常、 男性色盲和女性色盲这四类人所占的比例分别为P/2、p*2+ pq、q2和q2,;2,其中p 未知,q =1p。将男性正常、女性正常、男性色盲和女性色盲这四类人分别记为,a4,并记类A. 所占的比例为Pj(i = 1,,4)。则P1 = P/2,p2 = p2 .2 + pq,p3 = q/2,p4 = q2 , 2.这些Pt都依赖一个未知参数P
3、。若上述模型是对的,试求类4所占比例Pj(i = 1,,4)的极大似然估计(相当于求p的 极大似然估计)解:参数似然函数为q )38 ()6J)514 z + pqJ Ix p956(2 - p)514(1-p)50从而有对数似然方程a ln L( p) 956 51450 八=0dpp2 p 1 p即1520p2 3482p +1912 = 0。据此求得p的极大似然估计p - 0.91,从而得p.的极大似然估计 P. = Pi(P),i = 1,4。它们分别为 0.455、0.49595、0.045 和 0.00405。(由此得各类的期望频数的估计值np., i = 1, ,4。它们分别为4
4、55、495.95、45和4.05)使用Excel软件,由数值迭代算法求得参数p的极大似然估计,使得似然函数,或使得 对数似然函数达到极大值。如何设定P的初始值是数值迭代算法能否正确求解的关键。对 本例来说,可通过以下一些途径设定P的初始值。由于(XA)Y是男性没有色盲,所以没有 色盲的男性只有A,没有a。由于在随机调查1000人中没有色盲的男性有442人,所以A 与X成对出现的概率p不可能小于0.442。其次由于在没有色盲的人中才有A,色盲的人中 没有A,并由于在随机调查1000人中有442 + 514 = 956人没有色盲,所以A与X成对出现 的概率p不可能大于0.956。故由调查数据知,
5、p的初始值应设定在0.442与0.956之间。 另外,由于男性没有色盲的概率为p 2,在随机调查1000人中男性没有色盲有442人,所 以p的初始值应设定在0.442x2 = 0.884附近。类似地,由男性色盲、女性没有色盲和女性 色盲的概率,以及在随机调查的人中男性色盲、女性没有色盲和女性色盲各有多少人,也可 以推得p的初始值应设定在什么值附近。本例,我们取p的初始值为0.85。下面介绍利用统计软件Excel求参数的极大似然估计的方法。建立Excel工作表格:将p的初始值0.85输入到例如A1单元格;将目标函数,即对数似然函数 “ =956*ln(。1) + 514*ln(2 一。1) +
6、50*ln(1 一。1) ” 输入到例如 A3单元格;p满足约束条件:0 p 1,为此将0和1分别输入到例如B1和C1单元格;按下面的步骤求参数的极大似然估计:1.选择Tools(X具)下拉菜单;.选择Solver Parameters(规划求解)选项;.在Solver Parameters(规划求解参数)对话框中:在Set Target Cell(设置目标单元格)栏中键入A3;在Equal to(等于)栏中选择Max(最大值);在By Changing Cells(可变单元格)栏中键入A 1;在Subject to the Constraints(约束)栏中选择Add(添加)选项:.在Add Constraint(添加约束)对话框中:在Cell Reference(单元格引用位置)栏中键入A1;在Constraint (约束)栏中键入B1;在 =下拉菜单,选择=;再一次选择Add(添加);5 .在Add Constraint(添加约束)对话框中:在Cell Reference(单元格引用位置)栏中键入A1;在Constraint (约束)栏中键入C1;在 =
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