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文档简介
1、关于实验植物提取及检测第一张,PPT共三十页,创作于2022年6月植物基因组 DNA的提取琼脂糖凝胶电泳检测第二张,PPT共三十页,创作于2022年6月一 、实验目的 学习提取和纯化高等植物总DNA的方法,理解其原理。第三张,PPT共三十页,创作于2022年6月脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA) 与蛋白质结合在一起以核蛋白(DNP)的形式存在。在制备核酸时通常破坏细胞壁及细胞膜来使核蛋白释放出来。植物总DNA包括细胞核DNA和细胞核外DNA,前者存在于细胞核内,后者存在于细胞质中有半自主性复制活性的细胞器内,例如线粒体DNA(mtDNA)和叶绿体DNA(ctDNA)。二、实验原理第四张
2、,PPT共三十页,创作于2022年6月第五张,PPT共三十页,创作于2022年6月细胞破碎 抽提去蛋白质 沉淀核酸基本过程第六张,PPT共三十页,创作于2022年6月 机械方法: 超声波处理法、研磨法、匀浆法; 化学试剂法:用SDS处理细胞; 酶解法: 加入溶菌酶或蜗牛酶,破坏细胞壁。 细胞破碎 第七张,PPT共三十页,创作于2022年6月SDS法 SDS是有效的阴离子去垢剂, 细胞中DNA与蛋白质之间 常借静电引力或配位键结合, SDS能够破坏这种价键。CTAB法 CTAB是一种阳离子去垢剂,它可以溶解膜与脂膜,使细胞中的DNA-蛋白质复合物释放出来,并使蛋白质变性,使DNA与蛋白质分离。D
3、NA提取第八张,PPT共三十页,创作于2022年6月蛋白质 常用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)或氯仿:异戊醇(24:1)抽提。RNA 常选用RNase消化 ,或是用LiCl来消除大分子的RNA。酚类物质 提取液中加少量巯基乙醇,选取幼嫩的材料。DNA纯化(去杂质)第九张,PPT共三十页,创作于2022年6月实验材料植物叶片(去叶脉)试剂 2CTAB抽提液(CTAB、Tris-HCL、EDTA、Nacl)TE 缓冲液(pH=8.0) 氯仿:异戊醇(24:1)巯基乙醇异丙醇70%乙醇 三、材料与试剂第十张,PPT共三十页,创作于2022年6月离心机 水浴锅研钵 微量移液器仪器用具第十一张,P
4、PT共三十页,创作于2022年6月移液器量程的选择第十二张,PPT共三十页,创作于2022年6月1取 2g 清洗凉干的植物幼嫩叶片于研钵中,加 入液氮,迅速研磨。将2CTAB抽提液与2ml巯基乙醇在提取前混合后于65水浴中加热30分钟。2将 0.5mL 研磨液转入 1.5mL 离心管中,加入1ml CTAB提取液,置于65水浴中保温 30min,其间颠倒混匀23次。破碎细胞3. 加入等体积氯仿:异戊醇(24:1)混合液,充分颠倒混匀20分钟,防止成团。8000r/min,离心 5min,取上清。抽提去蛋白4将上清液移入新的1.5mL离心管内,加 等体积异丙醇(预冷)。颠倒混匀,可见 DNA 絮
5、状沉淀。沉淀核酸58000r/min,离心 1min,倒掉上清液,将离心管倒置干燥。 将沉淀回溶于无菌水或 TE 缓冲液待测。四、操作步骤第十三张,PPT共三十页,创作于2022年6月1)选取新鲜材料,研磨迅速彻底,研磨好的材料应与 CTAB 抽提液充分混匀;2)若提取产物有颜色,可能是材料中含有较多的多酚类物质,添加巯基乙醇(25),尽可能选取幼嫩的材料;3)收集 CTAB 与核酸形成的复合物时不要离心过度,否则沉淀再溶解难;4)为了获得具有生物活性的天然核酸,在分离制备过程中必须采用温和的条件,避免过酸过碱、剧烈地搅拌,防止热变性,同时还要避免核酸降解酶类的降解。五、注意事项第十四张,PP
6、T共三十页,创作于2022年6月六、作业 为了获得高质量的植物总DNA,在分离提取过程中应注意那些问题?第十五张,PPT共三十页,创作于2022年6月琼脂糖凝胶电泳检测DNA一、实验目的 学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术。第十六张,PPT共三十页,创作于2022年6月DNA分子在高于等电点的PH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。在一定电场强度下,DNA分子的迁移速度与相对分子质量的对数成反比。二、实验原理第十七张,PPT共三十页,创作于2022年6月琼脂糖是一种线性多糖聚合物。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35600.612
7、00.70.8100.90.571.20.961.50.2312.00.12第十八张,PPT共三十页,创作于2022年6月三、实验仪器和试剂仪器电泳仪电泳槽灌胶模具等第十九张,PPT共三十页,创作于2022年6月Tris-硼酸(TBE) Tris-乙酸(TAE) Tris-磷酸(TPE)常用电泳缓冲液 第二十张,PPT共三十页,创作于2022年6月电泳指示剂溴酚兰在碱性液体中呈紫兰色,一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成上样缓冲液。 作用:增加样品比重,以确保DNA均匀沉入加样孔内。形成肉眼可见的指示带,预测核酸电泳的速度和位置。使样品呈色,使加样操作更方便。上样缓冲液第二十一张,PPT共三十页
8、,创作于2022年6月溴化乙锭(EB) 是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光。其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可粗略估计样品DNA浓度。琼脂糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般5ng。 EB是致癌物质,切勿用手接触,更不要污染环境。GoldViewTM: 是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,采用琼脂糖电泳检测DNA时,GoldViewTM与核酸结合后能产生很强的荧光信号,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,而单链DNA呈红色荧光。GoldView不仅能染DNA,也可用于染RNA。
9、核酸染色剂第二十二张,PPT共三十页,创作于2022年6月DNA分子量标准第二十三张,PPT共三十页,创作于2022年6月不同种类DNA Marker第二十四张,PPT共三十页,创作于2022年6月1.凝胶制备 制备1%琼脂糖凝胶。称取0.8g琼脂糖加入 80mL 1TAE,加热至琼脂糖全部熔化,冷却至50-60 时,加入 EB或GoldViewTM 10ul。缓慢倒入胶板,待胶凝固后拔出梳子。2.加样 取15l DNA样液与 2l 上样 buffeer 混匀,用微量移液器小心加入样品槽。3.电泳 接通电源,切记靠近加样孔的一端为负,电压为15V/cm(长度以两个电极之间的距离计算),待溴酚兰移动到一定位置,停止电泳。4.观察拍照四、操作步骤第二十五张,
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