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文档简介
1、商业数据分析20161124线性降维线性降维21PCAPrincipal Component Analysis主成分分析法线性降维2PCA主成分分析(PCA)的方法可以解决数据降维和解相关性的问题。PCA的思想是:将p维的样本线性映射到k维空间上(kXc2、计算Xc的协方差矩阵S:3、计算协方差矩阵S的特征向量和特征值;求每个特征值lj求aj构成的特征向量线性降维4、将特征值从大到小排列,选取前k个大的特征值对应的特征向量,也就是选出这p个特征中最重要的k个特征对应的特征向量。5、将Xc映射到第4步计算出来的特征向量上,即Xc乘以这个特征向量,得到新的数据集Z。这个新的数据集Z就是我们通过PC
2、A处理原始数据后的结果啦!那么问题来了?2K是多少?线性降维画个图,告诉你k是多少2理论上来讲,选的前K个特征值的总和,应该至少在全部特征值总和的70%以上,才能在降维的同时,保证数据没有丢失过多的有用信息。线性降维碎石图(scree plot)2刚才已经把特征值从大到小排列了, 假设有a个特征值,那么横轴就是从1到a递增,纵轴就是特征值的数值,如下图,就可以看到特征值刚开始变化很陡峭,之后慢慢就平坦了,用数学语言来讲,就是斜率逐渐减小。这张图的“拐点”位置对应的横坐标,就是我们要取的k。线性降维拐点为什么叫碎石图呢?就好像小石头从山顶上滚下来,刚开始很陡,小石头连滚带爬的往下滑,后来就到了平
3、地,大家都挨在了一起,而K的值就是:山脚下进入平地的那个点的值。P.s P.s 具体具体K K的选择还是要看实际应的选择还是要看实际应用的情况,如果是为了画图,那么用的情况,如果是为了画图,那么直接选择直接选择K=2K=2或者或者K=3K=3就可以了。就可以了。MATLAB实例(Example 2.2)2 我们对酵母细胞周期数据集(yeast.mat)进行主成分分析。对酵母细胞,我们针对384个基因在17个时间点进行验测获得数据。即:384个样本,17个特征。 下面打开matlab我们进行PCA实战!线性降维PCA的总结2u假设我们想要将原本p维的特征映射到k(kXc2、计算Xc的协方差矩阵S
4、;3、计算协方差矩阵S的特征向量和特征值;4、将特征值从大到小排列,选取前k个大的特征值对应的特征向量;5、将Xc映射到第4步计算出来的特征向量上。线性降维Singular Value Decomposition奇异值分解SVD什么鬼2线性降维任何一个矩阵都可以表达为:这就叫做把矩阵X进行奇异值分解。假设X是np的矩阵,那么U是一个nn 的矩阵,而D是一个np对角矩阵(对角线上才会有非零元素),而V是一个pp的矩阵。而U和V各自的列向量都是单位正交向量。因此X UDVTXTX = VDTUTUDVT = VDTDVTVT XTXV=DTDSVD什么鬼2线性降维因此,SVD分解后得到的V就是XT
5、X的特征向量,而DTD对角上的元素就是XTX的特征值。 XTX = VDTUTUDVT = VDTDVTVT XTXV=DTDSVD是什么2线性降维任何一个矩阵都可以表达为:这就叫做把矩阵X进行奇异值分解。X UDVT新的PCA步骤:1、每列中心化:XXc2、把Xc进行奇异值分解,得到U、D、V3、将U、D、V都从大到小排列,选取前k个大的Uk、Dk、Vk ;4、计算XkUkDkVKT;小问题:这样得到的Xk和直接把X投影都k个特征向量上是一样的吗?MATLAB实例LSI2 为了说明SVD的方法,我们来看一个信息检索的例子,称为潜在语义索引(或LSI)。 信息检索(IR)的许多应用程序依赖于词
6、汇的搭配,用户输入了几个词语在一些文档中进行检索。然后用户用来检索的词可能是各种各样的,甚至是不准确的。所以,有时候检索结果不尽人意。潜在语义索引使用SVD的方法来求解输入检索词和文档的相关性,使得检索结果更为准确。线性降维MATLAB实例(Example 2.3)2 我们使用数据集lsiex.mat进行实验,这里有一些文档,里面包含一个书名的列表,然后还有个术语集包含一些词汇。我们把他们变成一个矩阵,每一列是一个文件,每一行是一个术语在这个文件中出现的次数。 然后将用户的搜索输入变成一个向量,包含对应术语的为1,不包含的为0。 下面打开matlab我们进行PCA实战!线性降维作业课后作业2.8题 2.9题课本作业分别写在不同的文件,压缩为zip文件。在11月29日00:00前发送至助教邮箱。作业课后作业2.8 Apply PCA to the following data sets. What value of d would you get using the scree plot for choosing the number of dimensions? a. Other gene expression data sets. b. oronsay data. c. sparrow data. 2.9 Repeat Example
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