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文档简介

1、he=imread('02.png');%读入图像imshow(he),title('H&Eimage');text(size(he,2),size(he,1)+15,.'ImagecourtesyofAlanPartin,JohnsHopkinsUniversity',.'FontSize',7,'HorizontalAlignment','right');cform=makecform('srgb2lab');%色彩空间转换lab_he=applycform(he,cfo

2、rm);ab=double(lab_he(:,:,2:3);%数据类型转换nrows=size(ab,1);%求矩阵尺寸ncols=size(ab,2);%求矩阵尺寸ab=reshape(ab,nrows*ncols,2);%矩阵形状变换nColors=3;%重复聚类3次,以避免局部最小值cluster_idxcluster_center=kmeans(ab,nColors,'distance','sqEuclidean',.'Replicates',3);pixel_labels=reshape(cluster_idx,nrows,ncols)

3、;%矩阵形状改变imshow(pixel_labels,);%显示图像title('imagelabeledbyclusterindex');%设置图像标题segmented_images=cell(1,3);%细胞型数组rgb_label=repmat(pixel_labels,113);%矩阵平铺fork=1:nColorscolor=he;color(rgb_label=k)=0;segmented_imagesk=color;endimshow(segmented_images1),%显示处理后的图像title('objectsincluster1');

4、%设置图像标题imshow(segmented_images2),%显示处理后的图像title('objectsincluster2');%设置图像标题imshow(segmented_images3),%显示处理后的图像title('objectsincluster3');%设置图像标题mean_cluster_value=mean(cluster_center,2);tmp,idx=sort(mean_cluster_value);blue_cluster_num=idx(1);L=lab_he(:,:,1);blue_idx=find(pixel_labels=blue_cluster_num);L_blue=L(blue_idx);is_light_blue=im2bw(L_blue,graythresh(L_blue);%图像黑白转换nuclei_labels=repmat(uint8(0),nrowsncols);%矩阵平铺nuclei_labels(blue_idx(is_light_blue=false)=1;nuclei_labels=repmat(nuclei_labels,113);%矩阵平铺blue_nuclei=he;显示处理后的图像blue

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