翻译及其后加工

1、4主要成分 1) 核糖体 2) mRNAs 3) tRNAs 4) 氨酰-tRNA合成酶 (aaRS) 5) 起始因子、延伸因子和终止释放因子4翻译的一般性质4翻译的详细机制4翻译后加工4分拣和定向核糖体的主要功能定位核糖体的主要功能定位4A部位氨酰tRNA结合部位，也称为受体部位；4P部位肽酰tRNA结合部位；4E部位空载tRNA临时结合的部位；4肽酰转移酶）活性部位催化肽键形成的部位；4mRNA结合部位；4多肽链离开通道正在延伸的多肽链离开核糖体的通道；4一些可溶性蛋白质因子（起始因子、延伸因子和终止因子）的结合部位。核糖体的分类与组成核糖体的分类与组成 核糖体的三维结构模型和主要的功能部

2、位核糖体的三维结构模型和主要的功能部位原核细胞核糖体的各种功能部位原核细胞核糖体的各种功能部位原核细胞核糖体的各种功能部位原核细胞核糖体的各种功能部位真核细胞多聚核糖体的结构真核细胞多聚核糖体的结构原核生物多顺反子原核生物多顺反子mRNA和真核生物单顺反子和真核生物单顺反子mRNA的翻译的翻译 4二级结构与三级结构4同工受体tRNA-携带同种氨基酸的不同4tRNA个性- “第一套遗传密码”4某些特殊的tRNAs 1) 起始tRNA: tRNAf Met 和 tRNAiMet 2) 校正tRNA 3) tmRNA常见的常见的tRNA的个性（大肠杆菌）的个性（大肠杆菌）tRNA个性丙氨酸丝氨酸缬氨

3、酸谷氨酰胺苯丙氨酸异亮氨酸蛋氨酸受体茎中的G3:U70碱基对受体茎中G1:C72、G2:C71、A3:U70碱基对,D茎中的C11:G24碱基对反密码子反密码子,特别是其中的U反密码子,D环中的G20, 3端的A73U35反密码子几种几种tRNA的个性的个性一种完全是人工合成的保留有G3:U70微螺旋仍然能携带Ala大肠杆菌起始大肠杆菌起始tRNA的结构的结构氨酰氨酰-tRNA合成酶（合成酶（aaRS）两步反应机制：两步反应机制： 1) ATP + 氨基酸氨基酸 (AA) - AA-AMP + PPi 2) tRNA + AMP-AA - AA-tRNA + AMP 分类分类 1) 第一类第一

4、类 aaRS 2) 第二类第二类II aaRS校对机制校对机制- 在装载氨基酸水平的质量控制在装载氨基酸水平的质量控制 1) aaRS是对氨基酸是对氨基酸“身份身份”进行检查唯一的场所进行检查唯一的场所 2) 核糖体不在乎哪一种氨基酸与核糖体不在乎哪一种氨基酸与tRNA相连相连 3) 实载的实载的tRNA被修饰后仍然能起作用被修饰后仍然能起作用 4) 装载前和装载后编辑装载前和装载后编辑 5) 双筛机制双筛机制两类氨酰两类氨酰-tRNA合成酶的催化机理合成酶的催化机理4第一类aaRS一般是单体酶，含有一个平行-折叠核心和由两段同源的氨基酸一致序列HIGH和KMSKS组成的Rossman折叠，该

5、结构模体参与ATP的结合和酶的催化。此类 aaRS识别的tRNA个性通常包括反密码子环内的核苷酸残基和受体茎，一般在受体茎小沟一侧与tRNA结合，紧握反密码子环，将tRNA接受氨基酸的一端置于活性中心，最后总是先将氨基酸转移到tRNA 3-端腺苷酸的2-OH上，然后再通过转酯反应转移到3-OH 。由此类酶催化的氨基酸有Arg、Cys、Gln、Glu、Ile、Leu、Met、Trp、Tyr和Val。4第二类aaRS通常为寡聚酶，并没有上述一致序列，但具有另外的保守序列，由它们形成三种首尾相连的同源结构基序，其中第一种参与二聚体的形成，另一种是 “签名”模体，由7段反平行的折叠、3段相邻的-螺旋和

6、一种不多见的负责结合核苷酸的折叠组成，由它和第三种结构基序一起组成了酶活性中心的核心部分。这些酶结合tRNA分子的另一面（受体茎大沟一侧），识别的个性不包括反密码子环，最后总是将氨基酸转移到tRNA3-端腺苷酸的3-OH上（苯丙氨酰-tRNA除外）。由此类酶催化的氨基酸有Ala、Asn、Gly、Asp、His、Lys、Phe、Pro、Ser和Thr。4装载前编辑 1) 有时aaRS激活错误的氨基酸 2) 正确的tRNA与酶的结合诱导aa-AMP的水解，而不是装载 3) aa-AMP被转移到酶的编辑中心而水解4装载后编辑 1) 有时 aaRS 激活错误的氨基酸，并将其转移到tRNA上 2) 错误

7、的aa-tRNA在被释放之前被转移到酶的编辑中心水解 4双筛机制 1) 难以建立完美的活性中心 2) 活性中心和编辑中心层层把关，排除错误的氨基酸使用双筛机制的实例使用双筛机制的实例-IleRS4一筛：酶活性中心优先结合正确的同源氨基酸，体积比同源氨基酸大的因为无法进入活性中心首先被排除；4二筛：酶的编辑中心对错误的非同源氨基酸进行编辑，大小合适小的误载的氨酰-AMP 或氨酰-tRNA在校对中心被水解“出局”。4以 IleRS为例，如果Val进入它的活性中心，并发生了第一步反应，生成Val-AMP，但Val-AMP 会被送入编辑中心进行编辑，水解误载的Val。由于aaRS具有内在的校对机制，因

8、此在细胞内形成误载的氨酰-tRNA的可能性非常低。氨酰氨酰-tRNA合成酶的双筛机制合成酶的双筛机制实验实验 (1962)tRNACys-ACA反密码子反密码子 (识别编码识别编码Cys的的UGU 密码子密码子)无细胞抽取物,氨基酸,aaRS Cys-tRNACys-ACA蛋白质含蛋白质含有有CysRNA模板UGUGUGUGUG.使用金属镍催化剂，去除巯基Ala-tRNACys-ACARNA模板UGUGUGUGUG.蛋白质含蛋白质含有有Ala4蛋白质合成的每一步都需要一些特殊的可溶性的蛋白质因子的参与，包括起始因子（IF）、延伸因子（EF）、释放因子（RF）和核糖体循环因子（RRF），它们分别

9、参与肽链合成的起始、延伸、肽链释放和核糖体循环。其中的某些蛋白质因子为小分子G蛋白， 原核生物参与翻译的起始因子、延伸因子和终止因子的结构与功能原核生物参与翻译的起始因子、延伸因子和终止因子的结构与功能 真核生物参与翻译的起始因子、延伸因子和终止因子的结构与功能真核生物参与翻译的起始因子、延伸因子和终止因子的结构与功能 4mRNA、tRNA和核糖体起相同的作用4翻译的极性：阅读mRNA的方向都是从5-端3-端，多肽链生长的方向总是从N-端C-端。4三联体密码 4正确的氨基酸的参入取决于mRNA上的密码子与tRNA上的反密码子之间的相互作用，与tRNA所携带的氨基酸无关 4密码子与反密码子的相互

10、识别遵守摆动规则4在核糖体上同源tRNA的识别是诱导契合的过程 兔网质红细胞兔网质红细胞3H-Leu在不同的时段完成标记在不同的时段完成标记纯化全长的多肽纯化全长的多肽降低温度以降低翻译的速率降低温度以降低翻译的速率使用胰蛋白酶消化，分使用胰蛋白酶消化，分离肽段，用放射线对肽离肽段，用放射线对肽端位置作图端位置作图在保温60分钟后分离出的珠蛋白几乎所有的Leu残基都是带放射性的。而在保温仅几分钟后分离到的珠蛋白，其带放射性的Leu则集中在肽链的C-端 。 4Marshall Nirenberg和Heinrich Matthaei 建立了大肠杆菌无细胞翻译系统无细胞抽取物无细胞抽取物核糖体核糖体

11、各种各种tRNA氨基酸氨基酸aaRSATP, GTP+ mRNA = 蛋白质蛋白质他们使用多聚核苷酸磷酸化酶得到同聚物他们使用多聚核苷酸磷酸化酶得到同聚物破译第一个遗传密码破译第一个遗传密码即: nNDPs (NMP)n + nPi 在在1961年，年，Matthaei发现，当将发现，当将Poly U加到大加到大肠杆菌无细胞翻译系统中以后，一种仅由苯丙氨肠杆菌无细胞翻译系统中以后，一种仅由苯丙氨酸组成的多肽即多聚苯丙氨酸被合成了，这就意酸组成的多肽即多聚苯丙氨酸被合成了，这就意味着他们成功破译出第一个密码子即味着他们成功破译出第一个密码子即UUU的密的密码子。码子。破译其余的遗传密码破译其余的

12、遗传密码 4在1964年，由Nirenberg发明的核糖体结合技术使得遗传密码最终完全得以破译。4核糖体结合技术是建立在两个基本的事实上：一是人工合成的三聚核苷酸可以作为模板；二是在无GTP时，三聚核苷酸可以促进同源的氨酰-tRNA结合在核糖体上，而不生成蛋白质。这样，利用由核糖体和三聚核苷酸及其同源的氨酰-tRNA形成的三元复合物能被硝酸纤维素滤膜吸附的性质，可将结合的氨酰-tRNA与其它没有结合的氨酰-tRNA分开。通过分析结合在硝酸纤维素滤膜上的氨酰-tRNA上氨基酸的性质和原来的三聚核苷酸序列可以弄清某种氨基酸的密码子。如使用GGG作为模板，则放射性标记的甘氨酰-tRNA能够结合到核糖

13、体上，这样就破译出甘氨酸的密码子是GGG。同样利用其它已知序列的三聚核苷酸作为模板可以破译出更多的遗传密码。综合以上的结果，Nirenberg最终完全破译出20种氨基酸所有的三联体密码。19AAs + 14C-Pro + aaRSs使用NC滤膜过滤放射性在滤出液放射性在滤出液19AAs + 14C-Phe + aaRSs使用NC滤膜过滤放射线留在滤膜上放射线留在滤膜上遗传密码的主要性质遗传密码的主要性质4 简并与兼职4密码子的选定不是随机的4通用和例外4不重叠4无标点4同一种氨基酸的不同密码子使用的频率不尽相同线粒体内遗传密码的例外线粒体内遗传密码的例外生物来源密码子UGAAUAAGA，AGG

14、CUNCCG标准遗传密码脊椎动物果蝇啤酒酵母圆酵母裂殖酵母线状真菌锥体虫高等植物终止TrpTrpTrpTrpTrpTrpTrp终止IleMetMetMetMetIleIleIleIleArg终止SerArgArgArgArgArgArgLeuLeuLeuThrThrLeuLeuLeuLeuArgArgArgArg无ArgArgArgTrp4摆动规则由Crick于1966年提出，用来解释一种tRNA反密码子如何能够识别一种氨基酸的几个同义密码子以及某些含有稀有碱基（如次黄嘌呤）的反密码子是怎样识别由正常碱基构成的密码子的现象。该规则的内容是：密码子在与反密码子之间进行碱基配对的时候，前两对碱基严

15、格遵守标准的碱基配对规则，第三对碱基则具有一定的自由度。但并非任何碱基之间都可以配对，当反密码子第一位碱基是A或C者，只能识别一种密码子；第一位碱基是G或U者，则能识别两种密码子；第一位碱基是I者，则能识别三种密码子。4摆动规则的意义在于使得在翻译的过程中，tRNA和mRNA更容易分离。摆动规则摆动规则反密码子第一个碱基密码子第三个碱基ACGUIUGC、UA、GA、C、U在核糖体上同源在核糖体上同源tRNA的的识别是诱导契合的过程识别是诱导契合的过程4以原核细胞为例，在A部位上同源tRNA与mRNA的结合诱导A1492和A1493 从16SrRNA螺旋44的内部环中被挤出来，同时还造成通用保守

16、的G530从原来的顺式构象编成反式构象。在新的构象之中，A1493和A1492分别与密码子/反密码子的前两个碱基对螺旋相互作用，而G530 同时与反密码子的第二个位置和密码子的第三个位置相互作用。这些构象诱导变化的结果是密码子/反密码子的前两个碱校对受到核糖体的检查，以区分正确的Watson-Crick碱基对和错配的碱基对，而“摇摆”位置似乎能够容忍摆动规则允许的碱基对。44步骤反应： （1）氨基酸的活化 （2）起始 （3）延伸 （4）终止和释放4原核生物的翻译4真核生物的翻译4细胞器的翻译系统 （一）氨基酸的活化（1）fMet-tRNAfMet的形成（2） Sec-tRNASec的形成（3）

17、其他氨酰-tRNA的形成（二）起始阶段（1）起始密码子的识别（2）起始复合物的形成 （三）延伸阶段 在起始复合物形成以后，翻译即进入延伸阶段，延伸阶段所发生的主要事件是进位、转肽和移位且不断的循环。（四）多肽链合成的终止与释放MetATP/ Mg 2+ +tRNAm MettRNAf MetMet-tRNAmMetMet-tRNAfMetfMet-tRNAfMetN10-甲酰基四氢叶酸甲酰基四氢叶酸转甲酰基酶转甲酰基酶AMP/Mg2+ PPi相同的相同的aaRSAMP/Mg2+PPitRNASec + ATP + SerSer RSSer- tRNASecHSe- + ATPSePSec-tR

18、NASec4原核翻译系统起始密码子的识别主要是依赖于mRNA 5-端的SD序列与16S rRNA3-端的反SD序列之间的互补配对。SD序列位于起始密码子上游约7个碱基的区域，由4个5个碱基组成，富含嘌呤碱基，它是由John Shine和Lynn Dalgarno在1974年，通过比较多种原核细胞蛋白质mRNA的5-端核苷酸序列之后总结出来的。在16S rRNA 3-端有一段富含嘧啶碱基的序列，可以和SD序列互补配对，因而被称为反SD序列。许多实验证明，正是SD序列与反SD序列的互补关系，才使得位于mRNA 的SD序列下游的第一个AUG用作起始密码子。 SD序列和反序列和反SD序列序列起始复合物

19、的形成起始复合物的形成4起始复合物的形成与起始密码子的识别紧密联系在一起，起始阶段的总反应式可写成： 30S + 50S + mRNA + fMet- tRNAfMet +IF1 + IF2 + IF3 + GTP 70SmRNAfMet- tRNAfMet + GDP + Pi + IF1 + IF2 + IF34在形成的三元复合物中，起始密码子正好处于P部位，而fMet- tRNAfMet通过密码子与反密码子的互补作用定位于P部位，A部位是空着的，mRNA像一根细线一样，通过小亚基上弯曲的通道，将作为模板进行翻译。无活性的无活性的 70S核糖体核糖体SD 序列序列30S 起始复合物起始复合

20、物70S起始复合物起始复合物GDP + Pi4每添加一个氨基酸需要三步反应进位、转肽和移位 4三步反应循环多次，循环的次数取决于mRNA上的密码子的数目 4原核生物和真核生物在延伸循环上非常相似 4快：15-20个氨基酸/秒 4精确：每参入10 000氨基酸出现1个错误 进位进位转肽转肽移位移位Repeat4进位是指正确的氨酰-tRNA进入A部位，它是在EF-TuGTP的帮助下完成的，尽管在没有EF-Tu的存在下，氨酰-tRNA也能进入A部位，但是效率极低。进位的具体过程是：首先EF-TuGTP和fMet-tRNAfMet以外的氨酰-tRNA形成三元复合物，随后三元复合物进入A部位；氨酰-tR

21、NA的结合导致小亚基的构象发生变化，致使16S rRNA上一段高度保守的碱基与密码子/反密码子复合物前两个碱基对上的小沟能够紧密地发生作用，有利于确保正确的tRNA的结合。如果上述相互作用没有能够稳定特定的核糖体构象，进入A部位的错误氨酰-tRNA 在肽键形成之前被释放。4核糖体上的一个结构域充当EF-Tu的GAP，该功能依赖于密码子/反密码子的相互识别而使得进入的氨酰-tRNA相对于大亚基处于一个正确的位置。一旦正确的氨酰-tRNA进入A部位不久，EF-Tu所具有的GTP酶活性被激活，与它结合的GTP水解成GDP和Pi。当GTP水解以后，EF-Tu的构象发生较大的变化，这种构象的变化促进了E

22、F-Tu的释放。而EF-Tu的释放引起氨酰-tRNA在核糖体上的重新排布，以便于肽键的形成，为进入转肽反应创造条件。释放出来的EF-TuGDP在EF-Ts的催化下，由细胞液的GTP取代GDP而重新转变成为有活性的EF-TuGTP。由此可见，EF-Ts的功能是作为GEF，催化与EF-Tu上的GDP与细胞液的GTP进行交换，重新激活EF-Tu。一旦EF-Tu与GTP结合，它的构象即发生变化，从而导致EF-Ts的解离。多肽链延伸过程中的进位和移位反多肽链延伸过程中的进位和移位反 转肽转肽4当正确的氨酰-tRNA进入A部位以后，紧接着就发生转肽反应，由转肽酶催化与A部位结合的氨酰-tRNA上的氨基N亲

23、核进攻与P部位结合的tRNA上的肽酰基或氨酰基而形成肽键。第一个肽键在甲酰甲硫氨酸和第二个氨基酸之间形成。4转肽反应牵涉到由23S rRNA上1个高度保守的腺苷酸参与的酸碱催化。该腺苷酸的周围并没有发现蛋白质。目前已有充分的证据表明大肠杆菌的肽酰转移酶由50S亚基上的23S rRNA承担。4转肽酶活性中心的腺苷酸嘌呤环的一个N通过抽取氨酰-tRNA的氨基N上的质子而促进转肽反应。A2451在所有的已知23S rRNA中是绝对保守的，它处于特殊的微环境中，致使其pKa从7.6下降到4，能够作为广义的酸碱催化剂发挥作用，被抽取的质子在氨酰-tRNA上的酯键被切开后，供给P部位上tRNA上的羟基。蛋

24、白质合成过程中的转肽反应蛋白质合成过程中的转肽反应4还没有发现一种蛋白质单独或者和其它蛋白质一起催化肽键的形成；4小亚基的16S rRNA特殊的区域在A部位和P部位与反密码子区域相作用。相反，大亚基的23S rRNA与肽酰-tRNA的CCA末端相作用，从而使之位于转肽酶合适的位置；4红霉素和氯霉素抑制转肽酶的活性，但某些23S rRNA序列发生突变的菌株对这两种抗生素具有抗性；4核糖体的三维结构显示转肽酶的活性中心由RNA组成，最近的蛋白质离活性中心有2nm，这样的距离太远，不可能参与催化；4人工筛选到的核酶能催化肽键的形成4碎片反应23S rRNA催化的转肽反应催化的转肽反应23S rRNA

25、催化的转肽反应催化的转肽反应4经历了转肽反应以后，P部位的tRNA已经成为空载的tRNA），空载的tRNA随后进入E部位，与此同时，移位反应发生了，在A部位上形成的肽酰-tRNA同与其结合的mRNA一起移动到P部位，这为肽链延伸的下一轮循环做好了准备。注意在移位反应中，肽酰-tRNA上的反密码子与密码子的相互作用已不再是决定氨基酸特异性的因素，但是它对于维持移位反应的准确性（只移位一个密码子）以保持正确的阅读框架是至关重要的。4移位反应需要EF-G的帮助，EF-G也是一种小分子G蛋白，其大小、形状以及电荷分布与和氨酰-tRNA结合的EF-Tu相似。EF-GGTP在A部位的附近与核糖体结合，推动

26、移位反应的进行。EF-G-GTP的结合可能将带有新生肽链的tRNA从A部位“推”到P部位，与此同时，空载的tRNA则从P部位转移到E部位。既然tRNA与mRNA通过密码子/反密码子的碱基配对结合在一起，mRNA也就随之发生移位。移位反应被认为是自发的，因为空载tRNA 对E部位的亲和力要比对P部位高，而肽酰-tRNA对P部位的亲和力要比对A部位的亲和力高。但是，在移位过程中，GTP并不发生水解，只是在移位完成以后，核糖体再次充当EF-G的GAP，导致EF-G水解与其结合的GTP成为GDP和Pi。一旦GTP被水解，EF-G立刻与核糖体解离。EF-G的解离是下一轮肽链的延伸反应所必需的，这是因为E

27、F-G和EF-Tu与核糖体的结合位点部分重叠。在EF-G-GDP从核糖体上释放出来以后，其分子本身的一个结构域似乎作为自己的GEF以再生出EF-G-GTP。Phe-tRNA-EF-Tu EF-G EF-G与苯丙氨酰与苯丙氨酰 -tRNA EF-Tu复合物在三维结构上的相似之处复合物在三维结构上的相似之处 翻译过程中的分子模拟翻译过程中的分子模拟 EF-Tu和和EF-G各自与核糖体结合的相互排斥各自与核糖体结合的相互排斥 4随着肽链的不断延伸，位于mRNA上的终止密码子最终进入A部位，由于没有相应的氨酰-tRNA的结合，RF1或RF2便识别并结合上去，RF3又是一种小分子G蛋白，它与GTP形成的

28、复合物RF3GTP促进RF1和RF2的作用。一旦释放因子结合到A部位，核糖体上的肽酰转移酶的活性就会发生改变，它催化肽酰基转移给水分子，导致肽酰-tRNA的水解，肽链因此被释放出来。随后空载的tRNA离开核糖体，释放因子因为RF3的GTP酶活性将结合的GTP水解而得以释放。最后，在RRF的帮助下，核糖体与mRNA解离，解离的核糖体进入下一轮翻译。原核细胞多肽链合成的终止与释放原核细胞多肽链合成的终止与释放4细菌mRNA一般很快水解，其半寿期较短，因此，mRNA有很大的可能性丢掉了它的3-端。如果这种情况真的发生了，后果很可能非常严重。不妨设想，假定一个mRNA分子因此丢失了它的终止密码子（基因

29、突变也可以导致一个mRNA丧失终止密码子），那么将没有终止信号促进核糖体的解离。任何与这种有缺陷的mRNA结合的核糖体当翻译到断裂的末端，将裹足不前，难以解离。4E. coli和其它细菌已发展了一套专门的机制处理这些无终止密码子的有缺陷的mRNA，这种机制为反式翻译。反式翻译不同于一般的顺式翻译，它将两个mRNA翻译成一条融合的肽链，其中有一个mRNA分子无终止密码子，另一个mRNA分子是tmRNA。 tmRNA(10Sa RNA)的结构的结构使用使用tmRNA 的反式翻译的反式翻译4核糖体的沉降系数为80S，比原核系统大；4mRNA模板的结构差别很大，通常是单顺反子，有帽子和尾巴，但没有SD

30、序列；4转录和翻译在时空上分离，分别发生在细胞核和细胞质，两者不存在偶联关系；4起始tRNA不进行甲酰化，也不能进行甲酰化；4只能使用AUG为起始密码子，而且识别起始密码子的机制也完全不同；4起始阶段不仅消耗GTP，还消耗ATP；4起始因子的种类和结构更为复杂；4肽链延伸的速度低于原核生物，大概是每秒钟参入2个氨基酸；4只有2种释放因子；4对抑制剂的敏感性不同。真核生物的细胞质翻译真核生物的细胞质翻译系统翻译的详细机制系统翻译的详细机制 4氨基酸的活化此阶段的反应与原核翻译系统没有什么差别，所不同的是起始氨酰-tRNA并不进行甲酰化。4起始与原核系统差别较大4延伸与原核系统非常相似 eEF-1

31、 代替 EF-Tu和EF-Ts eEF-2 代替 EF-G4终止与释放与原核系统相似，但没有RRF真核生物细胞质翻译系统翻译的起始真核生物细胞质翻译系统翻译的起始 4mRNA的准备和检查 4Met-tRNAiMet与核糖体40S小亚基的结合4 43S预起始复合物与mRNA复合物结合通过扫描发现起始密码子4 60S 亚基的结合与起始因子的释放 4由于真核系统的mRNA要经历复杂的后加工，所以翻译系统首先需要对mRNA进行检查，以确保只有加工完好的mRNA才能被用作模板。参与这一步反应的起始因子为eIF4系列，其中eIF4E为帽子结合蛋白，专门与mRNA的5-端的帽子结合，eIF4G是一种接头分子

32、，既能与eIF4E结合，又能与结合在3-端尾巴上的PABP结合，还能结合eIF3，使mRNA的5和3-端在空间上相互靠近成环。4mRNA的环化能很好地解释poly A尾巴为什么能提高翻译的效率：一旦核糖体完成翻译通过polyA成环的mRNA，新释放的核糖体亚基所处的位置恰到好处，非常适合在同一个mRNA分子上重新启动翻译。在哺乳动物中，PABP结合到一种可以与eIF4A结合的mRNA结合蛋白PAIP-1上，加强mRNA的5-端和3-端相互作用，有助于核糖体识别并结合到mRNA的5-端。一些翻译调控因子可以直接结合到mRNA的3-UTR，与其它翻译起始因子或者40S核糖体亚基相互作用，干扰mRN

33、A 5-端和3-端的相互作用，阻止或者减缓mRNA的翻译。真核生物真核生物mRNA成环模型成环模型“扫描模型扫描模型”440S小亚基首先识别帽子结构，然后沿着mRNA“迁移”，这个过程中核糖体可以解开稳定性小于126 kJ的二级结构，但是稳定性更高的发夹结构则可以阻止核糖体的迁移。当核糖体迁移到起始密码子AUG的地方就停止迁移，通常以遇到的第一个AUG为起始密码子，但是AUG本身并不足以阻止迁移，AUG必须在一个适当的环境中才能被有效识别，其中最重要的是-4位和+1位的碱基，在序列NNNPuNNAUGG中的起始密码子可以被有效识别，在AUG之前第3位的嘌呤（A或者G），以及紧跟着AUG的G，都可以影响翻译效率达10倍以上。如果引导序列比较长，在第一个40S亚基离开起始位点之前，另一个40S亚基可以识别mRNA的5-端，从而在引导序列到起始密码子之间结合多个核糖体亚基。真核翻译系统发现起始密码子的扫描机制真核翻译系统发现起始密码子的扫描机制Met-tRNAiMet与核糖体与核糖体40S小亚基的结合小亚基的结合真核生物翻译系统几种变化的扫描模