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文档简介
1、化学生物学专业硕士研究生课程教学大纲课程名称:化学生物学导论课程编号:0703202X01总学时数:80学分:4开课学期:1考试方式:笔试课程说明:化学生物学的研究领域涉及生命科学、化学和医学的多个分支学科。传统 的天然产物化学、有机化学、无机化学、分析化学、生物化学、物理化学、药物 化学、结构化学、波谱学和计算机化学等学科构成化学生物学的化学根底 , 同时 借鉴分子生物学、分子免疫学以及基因工程、蛋白质工程和生物医学工程等学科 的原理、方法及技术。它以研究生命及其调控为目标 , 在分子水平上探索生命现 象的本质和维护生命功能 , 即通过研究生物活性分子的结构、功能和作用 , 进而 利用化学的
2、理论 、方法、手段和策略来解决和探索生命及生物医学问题 ; 同时, 也 借助生物学原理、方法和技术解决化学问题。化学生物学与生理学、细胞学、遗 传学、生物化学、分子生物学和生物医学等有着广泛的联系与交叉。教学内容、要求及学时分配:第一章 绪论 学时 21.1 化学生物学的任务与作用1.2 化学生物学的开展简史1.3 化学生物学与其他相关学科的关系1.4 当今化学生物学研究的重要方面1. 化学遗传学2. 调控过程中分子间相互作用与分子识别的根底研究3. 分子进化及其系统工程的研究1.5 生物技术1 生物技术开展简况2. 生物技术开展的几个重要方面3. 生学信息学4. 基因药物与基因疫苗5. 转基
3、因动物和转基因植物6. 生物技术与化学工业本章要求: 了解化学生物学的开展简史, 化学生物学的研究领域涉, 化学生物学 的任务与作用,化学生物学与其他相关学科的关系以及当今化学生物学研究的重 要方面。第二章 蛋白质 学时 82.1 蛋白质的组成1. 蛋白质的元素组成2. 蛋白质的根本单位 氨基酸3. 氨基酸的性质2.2 多肽1. 多肽的结构2. 肽键3. 多肽的性质4. 天然存在的重要多肽5. 多肽的化学合成2.3 蛋白质的结构1. 蛋白质的一级结构2. 蛋白质的二级结构3. 蛋白质的三级结构4. 蛋白质的四级结构2.4 蛋白质的分类1. 依据蛋白质的组成分类2. 依据蛋白质的外形分类3. 依
4、据蛋白质的功能分类本章要求 了解蛋白质的根本组成以及在生命体内发生重要作用, 了解氨基酸的 光学火星以及理解和两性性质; 熟悉多肽的结构特点及多肽的性质; 掌握多肽的 化学合成并以及在肽键合成时氨基酸的常用的保护方法; 熟悉蛋白质的结构及分 类特点。第三章 酶 学时 83.1 酶是生物催化剂1. 酶的概念2. 酶催化作用特性3.2 酶的分类、组成、结构特点和作用机制1. 酶的分类2. 酶的组成和结构特点3. 酶的催化作用特性4. 与酶的催化特性有关的因素3.3 酶的非蛋白组分 辅酶和金属离子1. 辅酶的结构特点与功能的关系:2. 辅酶在酶促反响中的特点:3. 酶分子中的金属离子3.4. 酶的催
5、化作用机制1. 催化作用2. 催化机制类3.5. 酶的作用与生物化学分子的设计1. 酶的结构及其作用机制是设计生物活性分子的根底2. 具有抗B 内酰胺水解酶的青霉素3. 治疗帕金森氏的B -酪氨酸酶4. 具有抗癌和抗病毒作用的核苷磷酸化酶5. 具有抗癌活性的生物复原烷基化剂6. 降高血压新药 血管紧张肽转换酶抑制剂3.6. 抗体酶和杂化酶1. 抗体酶及其制备2. 杂化酶3.7. 酶模型1. 环糊精酶模型2. 杯芳烃酶模型3. 冠状化合物酶模型4. 环蕃酶模型5. 卟啉酶模型本章要求 了解酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子, 了解酶催化作 用的特点, 以及各类酶的催化作用; 掌握熟悉每促
6、反映的速度极受控因素; 建立 抗体酶及杂化酶的概念并对目前新型酶模型有一定的了解, 通过一些酶合成的医 药实例了解酶的作用与生物化学分子的设计过程。第四章 核酸 学时 104.1 核酸和生命遗传的化学本质1. 遗传物质是什么?2. 遗传信息是如何传递的?3. 遗传信息与蛋白质的氨基酸顺序有什么关系?4.2核酸DNA和RNA的结构1. 核酸的根本单位2 多聚核苷酸3. DNA 的结构4.3 嘌呤碱基和嘧啶碱基的性质和重要反响1. 碱基环的芳香性和互变异构2. 碱基的碱性3. 嘌呤和嘧啶碱基的化学反响4.4 核酸的性质1. 核酸的离解性质2. 核酸的水解4.5 核酸碱基顺序分析中的化学反响1. M
7、axam-Gilbert 碱基顺序分析法2 . San ge碱基顺序分析法3. RNA 的碱基顺序分析法4.6 核苷酸1. ATP和 GTP guanosine triphosphase2. cAMP 和 cGMP4.7 多聚核苷酸的生物合成1. DNA的生物合成2. RNA 的生物合成4.8 多聚核苷酸的化学合成1. 保护基2. 磷酸酯键的形成3. DNA 的固相合成法4.9 核酸和蛋白质的合成1. 氨基酸的活化2. 蛋白质的合成4.10 核酸化学中的几种新技术1. DNA重组技术和基因工程2. PCR技术3. 基因定点突变技术4. 定向分子进化4.11肽核酸PNA化学1. 药物开发中的 P
8、NA 技术2. PNA 作为抗菌剂3. PNA 在癌症基因治疗中的应用4. PNA 药物的前景 本章要求 : 认识核酸对生命延续、生物物种遗传、生长发育、细胞份哈等方面 所起的重要作用;了解核酸的根本组成和特征以及核酸的性质;对核酸的水解、 核酸的变性、复性与杂交有初步的认识;了解核酸的催化性质, 、反映类型及催 化剂制;认识脱氧核酶的意义和作用。第五章 聚糖 学时 85.1 糖类物质的多样性5.2 多糖的结构及其主要类型1. 同聚多糖2. 糖胺聚糖和蛋白聚糖3. 细菌多糖5.3 糖蛋白1. 糖蛋白的结构2. 糖蛋白中糖链局部的功能5.4 糖酯的结构与功能1. 鞘糖纸的结构2. 甘油糖酯的合成
9、5.5 糖蛋白的生物合成1. 糖链合成的特点2. N-糖链的合成3. 0-糖链的合成4. 蛋白糖基化和去糖基化的化学调控本章要求 :认识研究聚糖物质对生命活动本质的重要性;了解糖种类的多样性 及衍生物的多样性 熟悉糖蛋白的根本结构及糖链局部的功能;了解糖酯的结构 和功能、糖蛋白的合成过程中一些根本的操作要点。第六章 相互作用与分子识别 学时 66.1 生物分子之间的分子识别1. 分子识别的物理根底2. 分子识别过程的动力学3. 分子识别的特性性6.2 分子识别的化学根底1. 共价键结合2. 非共价键的相互作用6.3 分子识别中的立体化学因素1. 几何异构2. 光学异构3. 构象异构6.4 超分
10、子化学与分子识别1. 环糊精及其衍生物与分子识别2. 杯芳烃与分子识别3. 分子印记聚合物与分子识别本章要求 : 熟悉分子识别机制、各种分子识别模型、分子识别与药物分子的 选择性关系; 掌握分子是别的化学根底以及识别中的立体化学因素; 了解一些典 型的大环化合物的识别作用。第七章 化学物质与蛋白质的相互作用 学时 67.1 化学物质对蛋白质的沉淀作用1. 沉淀作用的类型2. 沉淀剂的类型7.2 化学物质对蛋白质的稳定作用1. 蛋白质不可逆失活的化学因素2. 蛋白质的稳定7.3 化学物质对蛋白质侧链基团的共价修饰作用1. 生物体内蛋白质加合物的形成2. 特定的氨基酸残基侧链基团的修饰3. 亲和性
11、标记7.4 蛋白质光谱探针1. 蛋白质吸收探针2. 蛋白质荧光探针3. 蛋白质光散射探针本章要求 :了解并掌握化学物质与蛋白质的相互作用 第八章 化学物质与酶的相互作用 学时 88.1 酶和酶促有机化学反响1. 酶催化的水解反响2. 酶催化的氧化复原反响3. 酶催化的碳碳键形成反响4. 酶催化的加成反响5. 酶催化的卤化反响和脱卤素反响8.2 有机介质中的酶促有机化学反响1. 有机溶剂中酶的结构与性质2. 酶促反响的有机溶剂体系3. 有机介质中酶催化的各类反响4. 光学活性化合物的制备本章要求 : 熟悉酶和酶促有机化学反响中酶催化的水解反响、氧化复原反响、 碳碳键形成反响、 加成反响以及酶催化
12、的卤化反响和脱卤素反响; 对有机介质 中的酶促有机化学反响的条件如: 有机溶剂中酶的结构与性质、 酶促反响的有机 溶剂体系、 有机介质中酶催化的各类反响、 光学活性化合物的制备等有比拟全面 地了解。第九章 化学物质与核酸的相互作用 学时 89.1 化学物质的致突变作用1. 基因突变的类型2. 化学诱变剂及其作用原理3. 化学诱变的应用4. 化学致癌物质及其作用机理9.2 小分子药物与DNA勺相互作用1. 共价结合2. 非共价结合3. 剪切作用9.3小分子化合物与R NA的相互作用1. RNA药靶的优越性2. 作用于RNA的小分子药物9.4 核酸的小分子探针1 .分光光度法2. 荧光法3. 共振
13、瑞利散射法本章要求: 认识基因突变的类型、 化学诱变剂及其作用原理、 化学诱变的应用及 化学致癌物质及其作用机理;了解小分子药物与DNA的相互作用,包括共价结合、 非共价结合、剪切作用等。熟悉小分子化合物与RNA勺相互作用以及核酸小分子 探针的具体方法。第十章 无机物质与生物分子的相互作用 学时 8 10.1 生物体中的化学元素1. 生物体中化学元素的分类和主要功能2. 金属离子与生物分子配合物10.2 无机物质与酶的相互作用1. 金属离子与酶蛋白作用的方式2. 无机物质对酶的激活作用3. 无机物质对酶的抑制作用4. 金属配合物对酶的抑制作用10.3 无机物质与核酸的相互作用1. 共价配位作用2. 静电作用3. 嵌插作用4. 断裂作用 本章要求 :了解生物体中化学元素的分类和主要功能,金属离子与生物分子配 合物的根本类型和作用; 了解金属离子与酶蛋白作用的方式、 无机物质对酶的激 活作用、无机物质对酶的抑制作用、 金属配合物对酶的抑制作用以及无机物质与 核酸的相互作用。第十一章 生物氧化 学时 811.1 生物能及其存在形式1. 生物能和 ATP2. 生物体系中的高能磷酸酯类化合物11.2 线粒体呼吸1. 线粒体呼吸链的组成2. 氧化复原电势与自由能的变化3. 线粒体呼吸链的电子传递11.3 氧化磷酸化1. ATP 复合体2. ATP 合成反响3. 电子传递反响与 ATP 合
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