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文档简介
1、第二节糖基转移酶及其应用糖基转移酶及其应用主要内容主要内容l糖转移酶简介 l糖基转移酶在合成中的应用 Glycosyltransferases 应用activated sugar phosphates 作为糖供体,合成 glycosidic linkage ,糖受体通常为 nucleophilic group, usually an alcohol. 生成的糖苷可以为 O-, N-, S-, or C-glycoside 糖转移酶简介糖转移酶简介功能:催化糖苷键的合成(功能:催化糖苷键的合成( O-, N-, S-, or C-glycoside )供体:活化的糖磷酸供体:活化的糖磷酸受体:亲
2、核基团(蛋白、脂、核酸、糖、小分子),通常为受体:亲核基团(蛋白、脂、核酸、糖、小分子),通常为-OHNon-Leloir donors:Leloir donors:糖供体底物糖供体底物糖基转移酶糖基转移酶根据根据糖供体糖供体中是否含有中是否含有核苷酸核苷酸分为分为两类两类。Leloir:阿根廷生物化学家,研究核苷酸代谢,1970,诺贝尔化学奖l 分为94 家族 (distinct sequence-based families) (CAZy server, http:/rs-mrs.fr/CAZY)l 人类拥有约 270多种糖基转移酶序列,属于 33个家族。l Alpha-1,4-葡萄糖转移
3、酶;beta-1,4-半乳糖转移酶;2,3-唾液酸转移酶糖基转移酶分类糖基转移酶分类根据氨基酸序列相似性进行分类:根据氨基酸序列相似性进行分类:根据蛋白结构相似性进行分类:根据蛋白结构相似性进行分类:根据糖供体和糖苷键连接方式进行分类:根据糖供体和糖苷键连接方式进行分类:l GT-A,GT-B,其他类型Rossmann-type domains (for nucleotide binding)NDP-binding domain generally contains a conserved DXD amino acid motifGT-A fold: SpsA from Bacillus su
4、btilusGT-B fold: beta-glucosyltransferase from bacteriophage T4Leloir GTsTransglycosylase from Staphylococcus aureusOligosaccharyltransferase STT3 from Pyrococcus furiosiusNon-Leloir GTs催化机理催化机理 Glycosyltransferases catalyze the transfer of glycosyl groups to a nucleophilic acceptor with either rete
5、ntion or inversion of configuration at the anomeric centre. This allows the classification of glycosyltransferases as either retaining or inverting enzymes. 鎓 催化机理催化机理Inverting: SN2 nucleophilic attack at the C1 atomRetaining: double displacement mechanism 糖基转移酶辅因子糖基转移酶辅因子l Many, but not all, glycos
6、yltransferases utilize divalent metal ion cofactors such as Mn2+ and Mg2+. mainly in glycosyltransferases that are diphosphonucleoside-dependent. l metal ion is coordinated to an oxygen of each of the two phosphate groups, as well as to side-chain carboxylates derived from the protein. 糖基转移酶抑制剂糖基转移酶
7、抑制剂 直接抑制糖基转移酶活性直接抑制糖基转移酶活性底物类似物;过渡态类似物alpha-2,6-唾液酸转移酶抑制剂Beta-1,4-半乳糖转移酶抑制剂 阻断糖供体的合成阻断糖供体的合成N-Glycan 合成过程中,首先要合成:dolichol-pp-N-acetylglucosamineUDP-GlcANc + dolichol-p - dolichol-pp-GlcNAcN-acetylglucosamine phosphorotransferase糖基转移酶在合成中的应用糖基转移酶在合成中的应用 寡糖的酶法合成寡糖的酶法合成 具有生物活性含糖天然产物的酶法合成具有生物活性含糖天然产物的酶法
8、合成 生物制药生物制药-糖蛋白药物生产策略糖蛋白药物生产策略 生物制药生物制药-糖疫苗生产策略糖疫苗生产策略OAcOAcOOAcOAcOOAcOAcOOAcOAcOHOOAcOAcOOAcOAcOOAcN3OOAcOOAcOAcOOAcOAcOOAcN3OBnOBnOBnOOBnOOHOOHOHOOHOHOOHNHAcOHOHOHOOH2679N33 steps6 stepsglycosylation4 stepsChemical Synthesis of a-Gal规模小,过程复杂,立体选择性难规模小,过程复杂,立体选择性难OOHHOHOHOO P O PONNHOOOOHHOHOHOOOH
9、HONHAcOOROOHHOHOHOOOHHOOOHOOHHONHAcOOROOOO-O-HO P O PONNHOOOOOO-O-OHHOOHHOGal1,4GlcNAc-R, acceptor-Gal epitopeUDPUDP-Gal Donor1,3-galactosyltransferaseMn2+Reaction Catalyzed by 1,3-Galactosyltransferase碳水化合物的合成碳水化合物的合成 Organic Synthesis Biosynthetic process Derivative synthesis Versatile Not very fl
10、exible Process Expensive and multistep Economic and short Environment problem Chemical waste Environment-friendly Carbohydrate polymer synthesis Not applicable Practical approach 体内糖供体合成途径体内糖供体合成途径 Glc, GlcNAc & ManSugar-6-pSugar-1-pSugar-NDPkinaseMutasepyrophorylase Gal, GalNAc & FucSugar-1
11、-pSugar-NDPkinasepyrophorylase Neu5AcNeu5AcCMP-Neu5AcpyrophorylaseCTP 糖供体相互转化: GalE: UDP-Gal UDP-Glu GalNAcE: UDP-GalNAc UDP-GlcNAc UGD(UDP-Glc dehydrogenase): UDP-Glc UDP-GlcA UDP-GlcA decarboxylase: UDP-GlcA UDP-Xyl糖基转移酶介导的寡糖合成糖基转移酶介导的寡糖合成 PhosphorylasesGlucosyltransferasesFructosyltransferasesCyc
12、lodextrin glucanotransferasesMany微生物中的糖供体微生物中的糖供体天然糖苷化合物中的糖一般为 C2, C3, C4 and/or C6 脱氧糖,而且大部分为6-deoxyhexoses family (Rhamnose)原核生物糖转移酶具有糖供体糖供体的广泛性 6-deoxyhexoses 一般通过 TDP-sugars进行底物活化(TDP-Rhamnose)优点优点: * 区域、立体选择性* 大量生产不足不足: * 糖基转移酶在大量表达方面存在困难 糖供体比较昂贵糖供体比较昂贵. 副产物抑制消除副产物抑制(碱性磷酸酶)消除副产物抑制(碱性磷酸酶)原位产生糖供体
13、原位产生糖供体 .针对以上不足解决策略针对以上不足解决策略糖基转移酶在工业应用中优势与弱点糖基转移酶在工业应用中优势与弱点可作为LgtC底物 碱性磷酸酶酶法再生糖供体策略酶法再生糖供体策略 UDP-sugar (A) and CMP-sugar (B)糖供体的合成糖供体的合成糖供体的合成糖供体的合成糖供体的合成糖供体的合成糖基转移酶在糖基转移酶在寡糖合成中的应用寡糖合成中的应用(一)(一)具有生物活性寡糖的酶法合成具有生物活性寡糖的酶法合成(for details visit: )OHOOHHOHOOHOOHOHOOOOHHONHACOHOOHOHOOOO
14、HHOHOResearch on Carbohydrates in Human Immunity in Wangs LaboratoryOHOOHHOHOOHOOHOOOOOHHONHACOHOOHOHOOOOHHOHOBlood type B antigenType B bloodType A bloodAnti-B antibody Barrier in blood transfusion Barrier in organ transplantation Cause of hyperacute rejection in animal to human xenotransplantation
15、 Human natural immunity against pathogens, tumors, etc.Non-primate mammals(pig, mouse, dog etc.)New world monkeyHumanApeOld world monkeyAnti-Gal antibody(the most abundant natural Ab)1-2% total IgG, 3-8% total IgM -Gal epitopeabundant, 1 million/cellHuman - HumanHuman - AnimalOHOOHOHOHOOHHOHOOHOOHOH
16、OOOOHHONHACOHOOHOHOOOOHHOHOThe specificity of glycosyltransferases determine the sugar sequenceOHOOHHOHOOHOOHOOOOOHHONHACOHOOHOHOOOOHHOHOBlood type B antigenOHOOHOH -Gal antigenOOHOHHOOOOOHHONHACOHOOHOHOOOOHHOHOOHOOHOHOOHOHHOHOOOOHHONHACOHOOHOHOOOOHHOHOhuman 1,3GalTpig 1,3GalTAnti-Gal productionmill
17、ion years ago 5-15 20-30 30-40 60-70 70-80120-130mammals -gal epitopesynthesishumansapesmonkeysOld WorldNew WorldmonkeysprosimiansmarsupialsnonprimateplacentalmammalsInactivation of 1,3 GTBiomedical use of -Galu soluble -Gal antagonist to anti-Galu -Gal conjugates in immunotherapy against bacteria,
18、virus, and cancer cells.人工合成的必要性人工合成的必要性OOHHOHOHOO P O PONNHOOOOHHOHOHOOOHHOOHOOROOHHOHOHOOOHHOOOHOOHHOOHOOROOOO-O-HO P O PONNHOOOOOO-O-OHHOOHHOReaction Catalyzed by 1,3-GalactosyltransferaseGal1,4Glc-R, acceptor-Gal epitopeUDPUDP-Gal Donor1,3-galactosyltransferaseMn2+1,3GalT 催化合成 -Gal Epitopes 及其衍生
19、物HOOOHHOHOOUDPHOOOHHOHOOUDPOHOOHHOOOOHHOR1R2HOOHOOHHOHOOHOOHOHOOOOHHOR1R2UDP-Gal4-epimeraseUDP 1,3GalTR1R2OHOHOHOHNHAcN3SPhOAllylabcdNHAcOHeNH2OHfUDP-Gal100mg/$416 UDP-Glc5g/$529.5EC Fang J, Chen X, Wang PG, et al.: J. Org. Chem. 1999, 64, 4089-4094. OOHOHOHOOOHOHHON3OHOOOHNHAcHOOOHOHOHOOOHOH
20、HON3OOOOHNHAcHOOOH OHOHOOOHOHOHHOOOHOHOHOOOHOHHON3OOOOHNHAcHOOOH OHOHHOHOOOHHOHOOUDPHOOOHHOHOOPO3=OPO3H-COOHOCOOH2PiUTPUDP-Gal4-epimeraseUDP1,4 galactosyltransferase1,3 galactosyltransferasePPiUDP-GlcUDP-GlcPyrophospho-rylasePyruvateKinaseInorganicPyrophos-phatase通过原位再生合成 a-Gal 五糖Fang J, Li J, Chen
21、X, Wang PG, et al: J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6635-6638.其他生物活性寡糖的合成(应用)其他生物活性寡糖的合成(应用)In Human milkOOHOHOOHOOHOHOOHOHHOOOHOOOHOHOHOOH1,4GalTlgtC gene(a) globotriose Gb3OHOHOAcHNOHOOHOHOOHOOHOHOOHOHOHOOHOOH1,3GalNAcTlgtD gene(b) globotetrose Gb4OHOOHOOHOOHOHOOHOHHOOHOAcHNOH(c) LNT-21,3GlcNAcTlgtA g
22、eneOHOOHOOHOOHOHOOHOHOOHOAcHNOH(d) LNnT: Lacto-N-neotetraose1,4GalTlgtB geneHOOHOHOOHOHOOHOOHOOHOHOOHOHOHOAcHNOH2,3transialidase(e) LSTDOHOAcHNHOOHHOHO2COH(Without the B subunits, the A subunit has no way of attaching to or entering the cell, and thus no way to exert its toxic effect.)Stx is an AB5
23、subunit toxin. The pentamer of (small) B subunits binding to its receptor glycosphingolipid(GSL), globotriaosyl ceramide(Gb3) in glomerular endothelial cell membranes, initiates A subunit-mediated cell death leading to HUS(hemolytic uremic syndrome ), but induction of inflammatory pathways is also k
24、ey. Gb3 is heterogenous in its lipid structure and membrane organization, such that different Gb3 formats are differentially recognized by Stx family members, particularly Stx2, which is more frequently associated with clinical disease. 血型相关抗原酶法合成血型相关抗原酶法合成Fluorescently labeled sLex conj sLex在转移性结肠癌
25、高表达转移性结肠癌高表达二价肿瘤抗二价肿瘤抗原酶法合成原酶法合成(用于检测肿瘤位置)(用于检测肿瘤位置)糖基转移酶应用乳腺癌、前列腺癌上高表达Globo-HP-凝集素凝集素 配体配体防治黑色素瘤防治黑色素瘤l 寡糖的合成常常需要多种糖基转移酶寡糖的合成常常需要多种糖基转移酶l 为了增加产量还有用其他一些酶为了增加产量还有用其他一些酶l 分步合成费时费力分步合成费时费力?一锅多酶法一锅多酶法- Super beads - Super bugJ. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5869-5870一锅多酶法合成透明质酸 (hyaluronic acid)E1, hyaluron
26、ic acid synthase; E2, UDP-Glc dehydrogenase; E3, UDP-Glc pyrophosphorylase; E4, UDP-GlcNAc pyrophosphorylase; E5, pyruvate kinase; E6, lactate dehydrogenase; E7, inorganic pyrophosphatase OHOHOHOOHOOHOHOOROHOHOOHOOOOHOOROHOHOHOAcHNHOOHHOHO2CCO2HOHOAcHNHOOHHOOCMPPPiPEPE3HOOHOOHOHOHE4E5HOOHOOHOHOPHOOH
27、OOHOGDPOHGDPPyruvateGTPHOOHOOHOPOHOGDPOOHHOCH3OHNADPH/NADHNADP/NADGlcAGlcE1E2E6E7E8OOHHOCH3OHOHOHOHOOOOHOOROHOHOOHHOCH3OHCMPSialyl Lewis X antigenLewis X antigensialyl Lewis X 酶法大量合成酶法大量合成E1: 1,3-fucosyltransferase;E2: pyruvate kinase;E3: GDP-mannose pyrophosphorylaseE4: GDP-4-keto-5-deoxymannose 3,
28、5-epimerase/GDP-4-keto-6-galactose reductase; E5: glucose dehydrogenase; E6: hexokinase; E7: phosphomannomutase; E8: a2,3-sialyltransferase激酶激酶歧化酶歧化酶SuperbeadGalUGalTGalKPyKFRecombinant E. coli stratins overexpressingGalK, GalT, GalU or PykF1) Fermentation2) Lysis3) Add to Ni2+ resinChen X, Fang J,
29、Wang PG, et al.: J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2081-2082.Beads with:GalKGalTGalUPykFPeristaltic pumpfor circulationReservoir with: 1,3GalTLacOBn 9.6 mMATP 0.96 mMPEP 19.2 mMUDP 0.96 mMGlc-1-P 0.96 mMGal 12 mM MgCl2 10 mMMnCl2 10 mMKCl 100 mM HEPES 100 mM pH 7.5Liu Z, Zhang J, Chen X, Wang PG: ChemBio
30、Chem 2002, 3, 348-355.Production of UDP-Gal with Superbeads. Superbead 用于寡糖合成OHOOHOHOOOOHHONHAcOHOHOOHHOHOOHOOHOHOOHOOHHOHOOMeOOOHHOHOOHOOHOHOOHOOHHOOBnOOOHHOHOOHOOHHOHOOOOHHONHAcOHOOOHHOHOOHOOHHOHOOBnOOOHHOHOOHOOHOHOOOOHHONHAcOOHOOHHOHOOHOOHHOOOOHHOOHN3OHOOHOHOOHOOHHOHOOBnOOOHHOHO1,3GalT85%(a72%)83
31、%69%92%95%1,4GalT1,4GalT86%76%1,3GalT + 1,4GalTa Gram scale synthesis, others are 100 mg scales从多菌种发酵到从多菌种发酵到Super bugUMPUDPUTPGlobotioseUDPUDP-GalOrotic AcidUTPPPi2PiGlc-1-PUDP-GlcUDP-GalGal-1-PGalactose (100 g/L)GalKGalTGalUGlucoseFructoseC. ammoniagenes DN510E. coli NM522/pNT25/pNT32Globotriose(G
32、al1,4Lac)188 g/L, 36 hr.LgtCE. coli NM522/pGT5PpaLactose (100 g/L)Kyowa Hakkos technology for large-scale production of UDP-Gal and globotriose utilizing metabolically engineered bacterial cells OOHOHOOHOOHOHOOHOHOHOHOHOOHglobotriose Gb3Ppa: pyrophosphataseGalU: glucose-1-phosphate uridylyltransfera
33、seGalT: galactose-1-phosphate uridylyltransferaseGalK: galactokinaseLgtC: 1,4-galactosyltransferaseCMP-NeuAc regeneration system by bacterial coupling Using this approach, sugar nucleotides including UDP-Gal,CMP-Neu5Ac, UDP-GlcNAc and GDP-Fuc have been successfully produced on a large scale.Superbug
34、 technologies for the synthesis of -GalBacteriaNutrientsStartingMaterialsBio-synthetic pathway engineeringa-Gal分析合成途径分析合成途径ATPADPGalK : galactokinaseGalUT: galactose-1-phosphate uridylytransferaseGalU : glucose-1-phosphate uridylyltransferasePykF: pyruvate kinase1,3GalT: 1,3-galactosyltransferase1,3
35、GalT Gal1,3LacL actoseUDP-Gal UDPPEPPyruvateGal-1-PGlc-1-PUDP-GlcUTPPykFGalUGalKGalUTGalactosePPi克隆表达验证相关酶克隆表达验证相关酶 Clone and express individual enzymes in the biosynthetic pathway of -Gal (克隆相关酶) Construction an artificial biosynthetic gene cluster and transfer into E. coli host cell.(构建基因簇并转化) Lar
36、ge scale production of -Gal oligosaccharides using fermented and permeated cells. (发酵生产) EnzymeAmount (U/L) 1,3GalTGalKGalTGalUPykF 6025100100501 U = 1 mol / min, 37oCpLDR20-KTUFgalK + galT1,3GalTgalUpykFT7 terminatorl l PRpLDR20-KTUFAmprEcoR VSac IISal IXba ICla I 9 kbl cI - repressorpMB1rbcrbcrbcr
37、bc构建多基因表达质粒构建多基因表达质粒检验多基因表达效果检验多基因表达效果66,20031,00021,50045,000LysateMIBMPure14,50097,400PykFGalKGalTGalU1,3GalTSuperbug 整个生产过程 Whole Cell ReactionAnalyzed by TLC, HPLCRt,20-36h Stop by inserting in boiling waterCentrifugationGel filtration P21H NMR, 13C NMR Analysis Culture NM522/pLDR20-KTUF Centrif
38、ugationOverexpressionResuspended inTris-HCl BufferE . coli N M 522pL D R 20-K T U F -G al7.2 g Gal1.1 g ATP8.4 g Lac3.6 g GlcTotal volume: 1 L 0.3 g UDP-Glc7.2 gChen X, Liu Z, Zhang W, Fang J, Andreana P, Wang PG: ChemBioChem. 2002, 3, 47-53.大规模发酵产量大规模发酵产量Superbug-11,3GalTGal1,3Gal1,4GlcGal1,4GlcUDP
39、-GalUDPPEPPyruvateGal-1-PGlc-1-PUDP-GlcUTPPykFGalUGalKGalTGalactoseLactoseGlycolyticpathwayGlucoseATPADPGlucosePyruvatePykFPEPGlycolytic pathwayPPiNM522添加三种三种原料:glucose, galactose, lactosePnPn-11,3GalTGal1,3Gal1,4GlcGal1,4GlcUDP-GalUDPGal-1-PGlc-1-PUDP-GlcUTPGalUPpKGalTGalactoseLactoseGalactoseNM522
40、PnPnPn-1PpKPnPPiPpK: polyphosphate kinaseSuperbug-2添加三种三种原料:多聚磷酸, galactose, lactoseHOOOHHOHOOUDPHOOOHHOHOOUDPOHOOHHOOOOHHOHOHOOHOOHHOHOOHOOHOHOOOOHHOHOOROR1,3GalTUDPSucroseFructose(energy source)SusAGalESucroseLacORE. coliChen X, Zhang J, Kowal P, Andreana P, Wang PG: J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8
41、866-8867.SusA: sucrose synthaseGalE: UDP-Gal 4-epimerase添加两种两种原料:sucrose, lactoseSuperbug-3每次进步只有一每次进步只有一点点,积累多了点点,积累多了才会实现自己的才会实现自己的目标。目标。二二具有生物活性的含糖天然产物及其酶法合成具有生物活性的含糖天然产物及其酶法合成含糖天然产物含糖天然产物含糖天然产物含糖天然产物诺加霉素阿克拉霉素(安乐霉素);蒽环类抗癌药,它能嵌入癌细胞的DNA上,抑制核酸的合成,特别是RNA的合成,为周期非特异性药物,在G1晚期和S晚期阻断细胞周期。daunorubicin n. 微
42、道诺霉素;红比霉素;正定霉素;柔毛霉素(用作抗肿瘤药)含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成The glycosyltransferase UrdGT2 establishes both C and O glycosidic bonds 天然抗生素竹桃霉素天然抗生素竹桃霉素(landomycin)抗菌性与红霉素类似抗菌性与红霉素类似含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成含糖天然产物酶法合成OOHOHOObaicaleinOHOHOHOHOOOOHOOOHOHluteolin 7-glucosideOHOHOHOOHOOOHOHHO
43、OHOHOOHOOHOOHOHOHOOHquercetagetin-7-arabinosyl-galactosideOOOOHHOOHOHOMeOHOHHOquercetrinOOOHOHOOHOHOMeHOOOHOHOHOHOOHrutin 抗菌黄酮苷化合物抗菌黄酮苷化合物 OOHHOOOHOHOquercetin-3-galactosideOHOHOHOOHOOHHOOOHOHOHOmyricetin-3-O-galactosideOHOHOHOOHOOHHOOOHOHOHOmyricetin-3-O-glucosideOOHHOOHOH抗肿瘤黄酮苷化合物抗肿瘤黄酮苷化合物 OOHHOOO
44、HOkaempferol 3-o-glucosideOOHHOOHOHOOHOOOHOOHOH3CHOOHHOHOOHOapigenin 7-O-rutinosideOOHHOOOHOHOHOmyricetin-3-galactosideOHOHOHOOHOOHHOOOHOHOHOOHOHOHOmyricetin-3-arabinosideOOHHOOOHOHOquercetin 3-galactosideOHOHOHOOHOOHHOOOHOHOquercetin 3-xylosideOOHHOOHOHHOO+OHOHOcyanidin 3-galactosideOHOHOHOOH降血脂黄酮苷
45、化合物降血脂黄酮苷化合物 研究表明,对于某些黄酮药物,糖的存在与否会对药糖的存在与否会对药效影响很大效影响很大。例如: diosmin,gossipyn和rutin对于中枢神经系统有明显的镇静作用,但相应的苷元没有类似作用。桔皮素(tangeratin)是一种非常有效的抗肿瘤细胞增生的药物,体外研究表明包括桔皮素在内的三种黄酮类药物它们的糖苷型比苷元型抗肿瘤活性更高。在对乳腺腺癌细胞抑制研究中,发现柚皮苷、芦丁、芹菜素、山奈酚、白杨素的抑制活性逐渐减弱,含有糖配体的糖苷类物质活性比其他的要高些。 European journal of pharmacology, 2006,539(3): 16
46、8-176 A comparison of the structures among these compounds indicates the following elements are essential to the potential acceptors of UGT78D1: 1) the 3-hydroxyl group, 2) the double bond in the ring C, 3) the 4-hydroxyl group .Guangxiang Ren, Lianwen Zhang, Glycoconj J (2012) 29:425432酶(酶(UGT78D1)
47、的底物选择性)的底物选择性l 阿糖胞苷,急性白血病,糖基部分在抑制核酸代谢物与酶的结合抑制核酸代谢物与酶的结合反应中起重要作用,从而增强了其抗肿瘤效应。l 烯二炔类抗肿瘤抗生素通过糖基部分与通过糖基部分与DNA 结合结合,使药物分子嵌入DNA 双螺旋的小沟中(特别是TCCT位点)。 l 蒽环类抗生素,环A 和氨基糖部分在决定药物与氨基糖部分在决定药物与DNA的选择性结合的选择性结合中起关键作用中起关键作用。该类药物与DNA作用形成复合物的稳定性主要决定于药物的糖环与DNA之间的作用。以以DNA为靶点的抗肿瘤药物为靶点的抗肿瘤药物糖配基具有协助药物生物转运和特异性识别并结合协助药物生物转运和特异
48、性识别并结合DNA 的作用的作用。l 含糖天然产物或药物大量存在l 糖分子在药物分子执行其功能时有时具有重要作用l 人工添加糖分子存在一定困难选择合适的药物分子或改造某种功能已知的糖苷药物,设计合成途径选择合适的药物分子或改造某种功能已知的糖苷药物,设计合成途径小结如下:小结如下:三:糖蛋白药物三:糖蛋白药物正在开发的蛋白质正在开发的蛋白质和抗体药物中大约和抗体药物中大约83%是糖蛋白。是糖蛋白。 2000-2005(%) 2005-2010(%)抗体抗体 35 25蛋白蛋白 15 12Small Molecules 8 8Revenue In Billions200020052010预计到预
49、计到 2010年,年,糖蛋白药品市场可糖蛋白药品市场可达达680亿美元亿美元 。国际生物药品市场占有率分析国际生物药品市场占有率分析 蛋白糖基化的作用Protein foldingProtein targeting/traffickingLigand recognition/bindingBiological activityStabilityRegulates protein half-lifeImmunogenicityglycocomponent of glycoproteins美国美国Amgen公司的公司的EPOGEN(EPO, 红细胞生成素)红细胞生成素)和和Aranesp(最新的红
50、细胞生成素):(最新的红细胞生成素):EPOGEN,包含有,包含有165个氨基酸,其序列与天然的内个氨基酸,其序列与天然的内源性红细胞生成素相同,具有相等的生物活性。源性红细胞生成素相同,具有相等的生物活性。Aranesp是第二代红细胞生成蛋白,比是第二代红细胞生成蛋白,比EPOGEN多两多两条条N-糖链,包含了更多的唾液酸,其体内糖链,包含了更多的唾液酸,其体内半衰期比半衰期比EPOGEN长长3倍多倍多,从而显示出更强的生物活性。,从而显示出更强的生物活性。目前糖蛋白表达的缺点和不足非人源化的糖蛋白非人源化的糖蛋白:糖蛋白的快速清除,改变药代动力学性质,补体激活,提高免疫原性和用药安全问题。
51、现有人源化的糖蛋白现有人源化的糖蛋白:生产成本高,细胞容易污染,N-糖基化不足,糖基化程度不同(同一批次和不同批次)。Sethuraman N, Stadheim TA. Challenges in therapeutic glycoprotein production. Curr Opin Biotechnol. 2006. 17(4):341-6. l 掺入非天然氨基酸掺入非天然氨基酸l 特定化学反应引入糖基修饰特定化学反应引入糖基修饰l 细胞表达复杂糖修饰蛋白细胞表达复杂糖修饰蛋白 l 特定酶切(特定酶切(Endo-H)、酶连)、酶连(Endo-A/M)引入均一糖链)引入均一糖链四:糖疫
52、苗四:糖疫苗 病原微生物耐药性逐渐变强,需病原微生物耐药性逐渐变强,需要更安全有效的防治方法要更安全有效的防治方法 多种微生物表面成分可作为疫苗多种微生物表面成分可作为疫苗In principle, various types of cell surface epitopes, characteristic for the invading organism or related to aberrant growth of cells, can be applied to develop vaccines. 糖合成技术的出现为糖疫苗的研究糖合成技术的出现为糖疫苗的研究应用提供了可能应用提供了可
53、能The progress in establishing the structure of carbohydrate immuno-determinants in conjunction with improvements in carbohydrate synthesis has rendered it feasible to develop new generations of carbohydrate-based vaccines.部部分分已已知知糖糖蛋蛋白白抗抗原原糖疫苗结构糖疫苗结构Carrier protein:KLH (key hole Limpet hemocyanin)DT
54、 (diphtheria toxoids,CRM197)TT (tetanus Toxoids)antigen protein Glycan (起免疫作用的只是糖链的一部分;oligosaccharides- 有机合成或多糖降解获得)CouplingBifunctional spacer molecules (amino, carboxyl or thiol groups)Glycoconjugate vaccines against bacterial infections 基于细菌荚膜多糖上的片段,如下列病原微生物:基于细菌荚膜多糖上的片段,如下列病原微生物: 研究内容:糖链长度与疫苗功能
55、;糖链数目与免疫功能研究内容:糖链长度与疫苗功能;糖链数目与免疫功能Polysaccharide type-3 related di-,tri-and tetrasaccharride -CRM197 conjugates: S. pneumoniae type 3 infectionoligosaccharide/proteinratios肺炎球菌奈瑟氏脑膜炎球菌流感嗜血杆菌伤寒沙门氏菌痢疾志贺氏菌B型链球菌肺炎杆菌偶联多条糖链更有效偶联多条糖链更有效病原微生物糖疫苗病原微生物糖疫苗 抗寄生虫疫苗制备更复杂抗寄生虫疫苗制备更复杂. . Malaria(Malaria(疟疾疟疾), ), to
56、xoplasmosis toxoplasmosis( 弓形体病)弓形体病) and leishmaniasand leishmanias(利(利什曼虫)什曼虫). Malaria caused by Plasmodiumfalciparum. Malaria caused by Plasmodiumfalciparum(疟原虫)(疟原虫), , 靶点:对应前两者为靶点:对应前两者为glycosylphosphatidylinositol anchors(GPIs)glycosylphosphatidylinositol anchors(GPIs)偶联于偶联于KLH获得疫苗,对疟疾有很好的防治效
57、果。获得疫苗,对疟疾有很好的防治效果。肿瘤糖疫苗肿瘤糖疫苗至今至今FDA只批准了一个预防肝炎病毒的疫苗只批准了一个预防肝炎病毒的疫苗糖相关肿瘤抗原糖相关肿瘤抗原Muc-1NER-2/neuCEAP53STn Globo H糖苷酶及其应用糖苷酶及其应用l Glycoside hydrolases (Glycosidases)l Transglycosylasesl Lyasesl phosphorylases糖链糖链 或或 糖缀合物糖缀合物糖苷键天然水解时,半衰期为470万年;糖苷酶可以提高催化效率10的17次方倍。糖苷键切割相关酶糖苷键切割相关酶糖苷键底物及效率糖苷键底物及效率糖苷酶分类糖苷酶
58、分类l 按水解机理: 保持型&翻转型l 按糖苷键位置: 内切酶内切酶,外切酶(非还原端外切酶非还原端外切酶,还原端外切酶)l 包括近13万条糖苷酶序列,分属130个家族 ( sequence-based families, http:/rs-mrs.fr/CAZY)l 超过30种糖苷酶的晶体结构已经解析l Transglycosidases (transglycosylases): 在寡糖和多糖之间进行糖基化反应 。根据序列进行分类根据序列进行分类(EC 3.2.1.-)某些保持型糖苷酶(唾液酸转移酶),活性中心可以包含一个酪氨酸某些保持型糖苷酶的酶促反应中,有邻基参与过程Myrosi
59、nases (芥子苷酶)Lyases(裂解酶)通过消去反应的机制(eg: a-glucan lyases)Phosphorylase & Transglycosidasesl A-R+H3PO3-A-H2PO3 + RHl “磷解”糖苷键l 产物:sugar-1-P(retention or inversion)l 通常为外切酶(如glycogen phosphorylase))l 经过糖苷-酶过渡态,糖的羟基亲和进攻合成新的糖苷键l “糖解”糖苷酶(环糊精合酶)TransglycosidasesPhosphorylase水解机理水解机理都要经历鎓离子过渡都要经历鎓离子过渡态;而且活性
60、中心包态;而且活性中心包含了两个酸性氨基酸含了两个酸性氨基酸(一般为谷氨酸和天(一般为谷氨酸和天冬氨酸)冬氨酸)Inverting glycosidase: A single displacement mechanismRetaining glycosidase: A double displacement mechanism亲和标记试剂:用于研究特定的活性位点氨基酸残基。2-脱氧-2-氟糖;5-氟糖。机制:通过鎓离子过渡态去稳定化实现。Mechanism-based, time-dependent inhibitors of retaining glycoside hydrolases.糖苷酶研究工具糖苷酶研究工具Tim
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