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文档简介
1、乙肝患者MBL EXON I 54位基因频率检测 作者:赵铁军 杨翠军 刘 芳 贾天军 张林西 安芳 【摘要】
2、; 目的:检测健康人及慢性乙肝患者MBL基因Exon I 54位密码子点突变的情况。方法:对MBL 54位密码子基因突变采用PCRRLFP检测法。结果:检测64例健康汉族人54位密码子的点突变情况,野生型(GGC/GGC)为44例,占68.8%;突变杂合型(GGC/GAC)为19例,占29.6%,突变纯合子型(GAC/GAC)为1例,占1.6%,基因频率分别为GGC为0.836;GAC为0.164。检测54例乙肝患者,野生型为21例,占38.89%;突变杂合型为32例,占59.26%,突变纯合子型为1例,占1.85%,基因频率分别为GGC为0.6852;GAC为0.3148,健康人及慢性乙肝患
3、者MBL基因54位密码子点突变有显著性差异,2=10.681 P=0.005(按基因型统计);2=6.258 P=0.012(按基因统计)。结论:乙肝患者组较健康对照组MBL基因Exon I 54位密码子点突变频率显著升高,提示该项指标在乙肝发生机理中的作用应进一步研究。 【关键词】 甘露糖结合凝集素;聚合酶链反应;肝炎病毒/乙型;基因型 【ABSTRACT】 Objective:To analyze the genotypes of MBL Exon I 54 in the healthy and patients with HBV
4、 infection.Methods:The situations of PCRRFLP method was used to describe and detect genotypes of MBL Exon I 54.Results:The situations of genotypes of MBL Exon I 54 in 64 healthy cases were that 44 people(68.8%)were wildtype,19 people(29.6%)were heterozygous(wildtype and mutant)1 people was mutant oc
5、cupying 1.6%,the genotypes of GGC and GAC were 0.836 and 0.164 respectively.The situations of genotypes of MBL in 54 HBV infections were that 21 people(38.89%),32 people(59.26%)were heterozygous(wildtype and mutant),1 peoplewas mutant(1.85%),the genotype of GGC and GAC were 0.6852 and 0.3148.t
6、here was statistical significance between HBV infections and healthy(2=10.681,P=0.005(genotype),2=6.258 P=0.012(gene).Conclusion:The results show that MBL genotypes influence recovery from hepatitis B virus infection and need to study deeply. 【KEY WORDS】 Mannosebinding lectin
7、s;PCR;Hepatitis virus B;Genotype 乙型肝炎是由乙型肝炎病毒(HBV)引起的肝脏炎性损害,本病在我国广泛流行,人群感染率高,是当前危害人类健康最严重的传染病之一。甘露糖结合凝集素(mannosebinding lectins,MBL)是一种由肝脏合成和分泌的急性时相蛋白,是Ca2+依赖性凝集素中胶凝素成员之一,广泛存在于肝脏及血液中。近年来研究表明MBL在机体免疫防御及监视中起重要作用,临床某些反复严重感染病症与血清中MBL水平低下及MBL基因突变有关14,以往的群体研究已发现MBL存在3种结构基因的变异型D、B、C,其突变位点
8、均位于外显子1 ,分别为52(CGTTGT),54(GGCGAC)及57(GGAGAA)位密码子,并导致氨基酸的改变,影响了亚单位的空间结构和寡聚体的形成,从而形成无功能的蛋白。这样的蛋白大约95%被降解,所以具有变异型MBL的个体,其血清MBL水平低下,导致调理功能缺陷5。本实验的目的在于检测乙肝患者与健康对照者MBL基因Exon I 54位密码子点突变情况,研究根据MBL基因序列设计引物,测定健康汉族人及慢性乙肝患者MBL 基因Exon1 54位密码子点突变的情况,旨在通过分析这些因素的变化及相关性,为其辅助诊断和治疗提供依据。 1 材料与方
9、法 1.1 实验材料 主要设备 低温高速离心机(德国,Hearus);梯度PCR仪(德国,Eppendorf);凝胶图像分析系统(珠海,黑马);电泳仪(北京,六一),低温冰柜(美国,Thermo) 主要试剂 TaqDNA聚合酶(5U/L,PGK),10×Buffer(随酶增送),dNTP(Promega),丙烯酰胺(Sigma),甲叉双丙烯酰胺(Sigma),红细胞裂解液,DNA提取液,TE缓冲液,电泳缓冲液,PCR Marker(10060
10、0bp,广州东盛科技有限公司) 1.2 实验方法 1.2.1 标本的收集 自2005.122006.9月,收集来自张家口市中心血站经检验符合献血标准的健康献血员共64人的血液标本,女30人,平均年龄37.12±7.98岁;男34人,平均年龄37.57±8.37岁。慢性乙肝标本来自河北北方学院附属第一医院,经检验符合临床诊断标准,共54人,女26人,平均年龄38.68±8.70岁;男28人,平均年龄36.91±9.38岁。收集静脉血标本用EDTANa
11、2抗凝(抗凝比例为101),分离血浆,-80保存,供测定MBL含量,细胞成分用盐酸胍法提取DNA。 1.2.2 染色体DNA的提取 取抗凝血的细胞成分200L,用红细胞裂解液溶解红细胞,离心5000rpm 5min/次,弃上清,2次后,用生理盐水平衡,离心12000rpm 5min,去上清,采用胍盐酸法提取DNA,根据剩余体积依次加入不同体积的的提取液(包括7.5M胍盐酸、20mg/mL 10%十二烷基磺酸钠等),70 水浴10min,振荡混匀,再进行15min,离心收集上清,乙醇沉淀DNA,TE溶解,-20保存,供PCR用。
12、0; 1.2.3 PCR RFLP检测方法的建立 1.2.3.1 引物设计与合成 根据MBL EXON I的DNA序列主要应用引物设计软件primer premier 5设计引物,由金思特科技有限公司合成。 引物F为 5CAT CAA CGG CTT CCC AGG GCA AGA TTG G3; 引物R为5GTC TCC TCA TAT CCC CAG GC3。 1.2.3.2
13、扩增体系及参数设置如下 扩增体系为25L,其中10×buffer 2.5L,dNTP(2.5mmol/L)2L,primer F(50pmol/L) 0.2L,primer R(50pmol/L)0.2L,TaqDNA酶0.2L(5u/L),模板2L 灭菌三蒸水补足总体积。预变性95 5min,变性94 10s、62 30s、72 30s(循环35次),72 10min。
14、; 1.2.3.3 扩增产物用限制性内切酶(Ban I)酶切 酶切体系为20L ,其中:Ban I(10u/L) 0.5L,10×Buffer 2L,DNA扩增产物17.5L,37水浴反应1h,酶切产物用7%的PAG凝胶电泳,银染分析结果。DNA Marker作为参照,凝胶图像分析系统拍照,记录。 1.3 PCRRFLP检测方法的应用 &
15、#160; 用上述建立的方法对所收集64例健康汉族人及54例慢性乙肝患者的Exon I 54 位密码子碱基突变进行分析。 1.4 统计分析 1.4.1 乙肝患者组、健康对照组MBL基因Exon I 54位密码子点突变频率的计算,通过简单数基因的方法得出。 1.4.2 乙肝患者组、健康对照组MBL基因Exon I 54位密码子点突变频率的比较,采用两样本率比较的2检验。 2 结果
16、160; 2.1 电泳分析结果显示酶切标本出现下列三种情况(图1) 2.2 健康汉族人及慢性乙肝患者的Exon I 54 位密码子点突变频率 检测64例健康汉族人54位密码子的点突变情况,野生型(GGC/GGC)为44例,占68.8%;突变杂合型(GGC/GAC)为19例,占29.6%;突变纯合子型(GAC/GAC)为1例,占1.6%。基因频率分别为GGC为0.836;GAC为0.164(见表1)。 检测54例乙肝患者,野生型为21例,占38.89%;
17、突变杂合型为32例,占59.26%;突变纯合子型为1例,占1.85%。基因频率分别为GGC为0.6852;GAC为0.3148(见表2)。表1 64例健康汉族人MBL外显子I 54位密码子点突变情况表2 54例慢性乙肝患者MBL外显子I 54位密码子点突变情况 3 讨论 人类MBL基因位于10q11.2q21,由一个5启动子区域、四个外显子和三个内含子组成,编码产物为MBL,是一种由肝脏产生可溶性的C型凝集素,结构类似于C1q。MBL识别表达于病原体上的甘露聚糖和与其相似的糖基,从而通过
18、调理吞噬作用和/或Lectin途径激活补体而导致其结构破坏,在机体的固有性免疫应答方面发挥重要作用。已经发现在5启动子区域有7个点突变,在Exon I有3个突变位点,编码区域上游突变会改变MBL的血清浓度,有可能使其产物不能够多聚化而进一步激活补体的MBL途径,因为MBL功能的发挥依赖于合适的MBL单体的多聚化水平,而MBL的血清水平和其结构则影响MBL功能的发挥。其中Exon I的52位(ArgCys 命名为等位基因D)、54位(GlyAsp命名为等位基因B)和57位密码子(GlyGlu,等位基因C)突变会干扰MBL多肽进一步组装成功能性多聚体,进而降低血清中功能性MBL的含量。而且研究发现
19、其突变与许多疾病具有一定的相关性。有关MBL的检测方法有许多种,包括PCRRFLP(restricted fragment length polymorphism)限制性片断长度多态性聚合酶链式反应、PCRSSP(sequence specific primer polymerase chain reactions)序列特异性引物聚合酶链式反应 、SDMPCR(site directed mutation)定点突变聚合酶链式反应以及PCRSSOP(sequence specific oligonucleotide probe)序列特异性杂交探针聚合酶链式反应等方法。本文针对54位密码子设计的引物初步建立了检测方法即PCR RFLP,用建立的该方法就北方地区收集的健康汉族人及慢性乙肝患者中的MBL 基因 Exon I 54位密码子的点突变情况进行调查、分析,在所检测到的64例健康汉族人中54位密码子的点突变情况,野生型(GGC/GGC)为44例,占68.8%;突变杂合型(GGC/GAC)为19例,占29.6%;突变纯合子型(GAC/GAC)为1例,占1.6%;基因频率分别为GGC为0.836,GAC为0.164。检测54例乙肝患者,野生型为21例,占38.89%;突变杂合型为32例,占59.26%;突变纯合子型为1例,占1.85%;基因频率分别为GGC为0.6852,GAC为0.3
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