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文档简介
1、按照国家自然科学基金委员会的分类,生命科学包括:1. 微生物2. 植物学3. 生态学4. 林学5. 生物化学与分子生物学6. 遗传学7. 细胞生物学与发育生物学8. 免疫学9. 神经科学与心理学10. 生物物理学与生物医学工程11. 农学12. 畜牧兽医与水产学13. 动物学14. 生理学与病理学15. 预防医学与卫生学16. 临床医学基础学科17. 药物学与药理学18. 中医学与中药学 第1章 蛋白质的结构与功能一、蛋白质的分子组成1、组成蛋白质的元素:主要元素有:C、H、O、N和 S各种蛋白质的含N量很接近,平均为162、组成单位:L-氨基酸 有20种编码的氨基酸熟悉20种氨基酸的中文名称
2、及简写符号3、等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。pH=pI pH < pI < pH 兼性(中性)离子 阳离子 阴离子4、蛋白质的紫外吸收最大峰值为280nm肽:氨基酸通过肽键连接形成.多肽链:是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。多肽链有两端: N 末端 C 末端 氨基端 羧基端6、氨基酸在蛋白质分子中以肽键相连7. 谷胱甘肽(GSH) -生物活性肽二、蛋白质的分子结构1、 Pr的一级结构:指在蛋白质分子从N-端至C-端的氨基酸排列顺序。主要的化学键:肽键,有些Pr还包括二硫
3、键。2、Pr的二级结构:多肽链主链骨架原子的相对空间位置。主要的化学键:氢键 。形成二级结构的基础:肽单元常见的蛋白质二级结构: a-螺旋; b-折叠;b-转角无规卷曲3、 Pr的三级结构 :整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。主要的化学键:疏水键、离子键(盐键)、氢键和 Van der Waals力(范德华力)等 其中最主要的是疏水作用(或疏水键)结构域:大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域 4、蛋白质的四级结构:蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用亚基之间的结合
4、主要是:氢键和离子键三、蛋白质结构与功能的关系1、蛋白质一级结构是高级结构与功能的基础2、蛋白质的功能依赖特定空间结构三级结构或四级结构的蛋白质才具有生物学功能。三、蛋白质结构与功能的关系1、蛋白质一级结构是高级结构与功能的基础2、蛋白质的功能依赖特定空间结构四、蛋白质的理化性质1、蛋白质具有两性电离的性质-等电点 2、蛋白质具有胶体性质.胶体稳定的因素:颗粒表面电荷;水化膜.3、蛋白质的变性:概念:在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。变性的本质: 破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。变性的
5、结果:理化性质改变和生物活性的丧失。如:溶解度降低、黏度增加、结晶能力消失、生物活性的丧失、易被蛋白酶水解等。导致变性的因素:如高温、高压、强酸、强碱、有机溶剂、重金属离子、生物碱试剂及辐射等因素。临床应用举例: 临床医学上,变性因素常被应用来消毒及灭菌。 防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂(如疫苗等)的必要条件4、蛋白质的复性若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性。5、蛋白质的沉淀、凝固核酸的结构与功能一、核酸的化学组成及其一级结构1、基本组成单位:核苷酸(碱基、戊糖、磷酸)2、连接方式:3,5-磷酸二酯键3、方向:5¢ 3
6、162;4、一级结构:指核苷酸的排列顺序5、分类:核糖核酸(RNA)脱氧核糖核酸(DNA)二、DNA的空间结构与功能1、二级结构:双螺旋结构模型要点:反向平行、右手螺旋; 脱氧核糖和磷酸在外侧碱基内侧; 碱基配对原则 AT CG碱基间距0.34nm,螺旋一圈10对碱基,螺距3.4nm 。DNA双螺旋结构的具有多样性稳定因素:碱基堆积力;互补碱基对的氢键作用力2、DNA的高级结构:超螺旋结构原核生物DNA为环状超螺旋结构真核生物DNA为高度有序和高度致密的结构DNA(约150bp缠绕区和60bp的连接区) +组蛋白(由H2A/H2B/H3/H4组成八聚体)核小体三次折叠染色质三、RNA的结构与功
7、能1、信使RNA( mRNA )开始转录成hnRNA加工后为成熟的mRNA结构特点:密码子:每3个碱基为一个密码子帽子结构:7-甲基鸟苷三磷酸多聚A尾:多个腺苷酸连接而成功能:mRNA依照自身的碱基顺序指导蛋白质氨基酸顺序的合成,即为蛋白质的生物合成提供模板。2、转运RNA(tRNA) 结构:含有多种稀有碱基;tRNA的二级结构三叶草形;三级结构为倒“L”型;3¢-末端有共同的三个核苷酸(CCA);柄端携带活化的氨基酸;反密码子环上有反密码子功能:是蛋白质合成过程中氨基酸的载体,将氨基酸运输到mRNA相应的位置上3、核糖体RNA(rRNA)rRNA占总RNA的80以上。rRNA与不同
8、的蛋白质结合组成了核糖体的大、小亚基。功能:核蛋白体是蛋白质合成的场所四、核酸的理化性质1、核酸在波长 260nm 处有强烈的吸收2、DNA变性:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程,本质是双链间氢键的断裂。解链温度(Tm):解链过程中,紫外吸光度的变化达到最大变化值的一半时所对应的温度。G+C 含量越高,解链温度就越高。理化性质变化如: OD260增高 粘度下降生物活性丧失 增色效应3、复性 定义(1)当变性因素去除后,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。(2)热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火(annealing) 。(3)减色
9、效应:DNA复性时,其溶液OD260降低。第3章 酶酶是由活细胞产生的,对特异底物具有高效催化作用的蛋白质。又称生物催化剂。一、 酶的分子结构与功能1.全酶 蛋白质部分:酶蛋白-决定反应的特异辅助因子:小分子有机化合物 ,金属离子。-决定反应的种类与性质(辅酶或辅基)2.酶的活性中心:指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。活性中心内的必需基团:结合基团:与底物相结合 催化基团:催化底物转变成产物 活性中心外的必需基团:位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需.二 酶的工作原理1、酶促反应的特点 :
10、高效性 特异性 可调节性酶促反应的特异性:绝对特异性;相对特异性;立体异构特异性2、酶的作用原理:降低活化能 诱导契合假说三、酶促反应动力学1、底物浓度对反应速率的影响Km值等于酶促反应速率为最大反应速率一半时的底物浓度,单位是mol/LKm是酶的特征性常数之一,只与酶的结构、底物和反应环境(如,温度、pH、离子强度)有关,与酶的浓度无关。Vmax:是酶完全被底物饱和时的反应速率,与酶浓度成正比。2、底物足够时酶浓度对反应速率的影响呈直线关系3、温度对反应速率的影响具有双重性4、pH通过改变酶和底物分子解离状态影响反应速率5、抑制剂对酶促反应速率的影响1)不可逆性抑制主要以共价与酶活性中心的必
11、需基团相结合,使酶失活如:有机磷化合物 ®¾ 羟基酶 重金属离子及砷化合物 ®¾ 巯基酶2)可逆性抑制作用:抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。三种可逆性抑制剂作用的特点的比较(1)竞争性抑制剂:抑制剂结构与底物结构相似,共同竞争酶活性中心。抑制作用大小与抑制剂和底物的相对浓度有关。Km升高,Vm不变。(2)非竞争性抑制剂:抑制剂结构与底物结构不相似或完全不同。它只与活性中心以外的必需基团结合,使E和ES都下降。该抑制作用的强弱只与抑制剂的浓度有关。Km不变,Vm下降。(3)反竞争性抑
12、制剂:抑制剂并不与酶直接结合,而是与ES复合物结合成ESI,使酶失去催化活性。结合的ESI则不能分解成产物,Km下降,Vm下降。磺胺类药物的抑菌机制与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶(1)细菌在生长繁殖过程中,必需从宿主体内摄取对氨基苯甲酸,在其他因素的参与下由二氢叶酸合成酶催化生成二氢叶酸,再在二氢叶酸催化下生成四氢叶酸,参与核酸的合成,细菌才可以生长繁殖。(2) 磺胺药的基本结构与对氨基苯甲酸相似,能竞争性地与二氢叶酸合成酶结合,从而影响细菌的二氢叶酸合成 ,抑制细菌的生长繁殖。(3) 由于这是一种竞争性抑制作用,故在治疗中需维持磺胺药在体液中的高浓度才能有好的效果。因而首次用量需加倍,同时
13、要1日服用4次,以维持血中的高浓度。磺胺类药物的抑菌机制与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶四、酶活性的调节1、调节对象:关键酶调节方式:酶活性的调节(快速调节);酶含量的调节(缓慢调节)2、酶原的激活:酶原在一定条件下,水解掉一个或几个短肽,形成或暴露出活性中心,转化为有活性酶的过程。酶原激活最主要的意义是避免酶对细胞进行自身消化损伤3、 酶的变构调节变构调节:一些代谢物可与某些酶分子活性中心外的某部分可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催化活性 , 此种调节方式称变构调节。4.同工酶 (isoenzyme)是指催化相同的化学反应,而酶蛋白的分子结构理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。第四章
14、糖代谢一 糖的分解代谢(一)、糖的无氧氧化 在不需氧情况下,葡萄糖生成乳酸(lactate)的过程称之为糖的无氧氧化,又称为糖酵解。其反应部位在胞浆。1、反应部位:胞浆2、代谢终产物:乳酸3、产能的方式和数量 方式:底物水平磷酸化净生成ATP数量:从G开始 2×2-2= 2ATP 从Gn开始 2×2-1= 3ATP糖酵解的代谢途径E1: 己糖激酶 E2: 6-磷酸果糖激酶-1 E3: 丙酮酸激酶 1、产能的方式和数量糖酵解反应的意义(1) 产能方式为底物水平磷酸化,是某些细胞在供氧正常时的重要供能途径,如红细胞。也是机体在缺氧情况下获取能量的有效方式。(2)净生成ATP数量
15、:从G开始2×2-2= 2ATP 从Gn开始 2×2-1= 3ATP2、红细胞中存在2,3-BPG支路。2,3-BPG与Hb结合,可降低Hb与氧的亲和力,促进氧的释放,以满足组织细胞对氧的需要。3、某些组织细胞如视网膜、睾丸、白细胞、瘤细胞等即使在有氧条件下,仍以糖酵解为主要供能方式,此种现象称为反巴斯德效应。(二)、糖的有氧氧化 糖的有氧氧化指在机体氧供充足时,葡萄糖彻底氧化成H2O和CO2,并释放出能量的过程。是机体主要供能方式。在胞液及线粒体分四个阶段进行。 第一阶段:丙酮酸生成 胞液 第二阶段:丙酮酸的氧化脱羧 第三阶段:三羧酸循环 线粒体 第四阶段:氧化磷酸化 反
16、应过程 1.丙酮酸的生成 (同无氧氧化) 2.丙酮酸的氧化脱羧 丙酮酸进入线粒体,氧化脱羧为乙酰CoA (1)总反应式: 丙酮酸 乙酰CoA NAD+ , HSCoA CO2 , NADH + H+ 丙酮酸氧化脱氢酶系丙酮酸氧化脱氢酶系的组成酶 辅 酶E1:丙酮酸脱氢酶 TPPE2:二氢硫辛酰胺转乙酰酶 硫辛酸HSCoAE3:二氢硫辛酰胺脱氢酶 FAD, NAD+泛酸在体内活性形式:辅酶A(CoA) 酰基载体蛋白(ACP)3.三羧酸循环(1)三羧酸循环因循环中的第一个中间产物是含三个羧基的柠檬酸,故也称为柠檬酸循环 。由于Krebs正式提出了三羧酸循环的学说,故此循环又称为Krebs循环。所有
17、的反应均在线粒体中进行。 (2)反应过程(3)三羧酸循环的要点整个循环反应为不可逆反应。一次循环,消耗一分子乙酰CoA。经四次脱氢,二次脱羧,一次底物水平磷酸化。生成1分子FADH2,3分子NADH+H+,2分子 CO2, 1分子GTP。关键酶有:柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶复合体。三羧酸循环的中间产物,如草酰乙酸看似在循环中不消耗,其实不然,可转变成其他物质,故需不断补充。(二)有氧氧化的意义 1.是三大营养物质氧化分解的共同途径和联系的枢纽。2.为其他物质代谢提供小分子前体;为呼吸链提供H+ 和 e。3.有氧氧化是机体产能最主要的途径。它不仅产能效率高,而且由于产生的能量逐
18、步分次释放,所以能量的利用率也高。4.氧、糖供应充足时,绝大部分的组织细胞表现出有氧氧化抑制无氧氧化的现象,称为巴斯德效应(Pastuer effect) 。(三)、磷酸戊糖途径磷酸戊糖途径是指由葡萄糖生成磷酸戊糖及NADPH+H+ ,前者再进一步转变成3-磷酸甘油醛和6-磷酸果糖的反应过程。磷酸戊糖途径又称磷酸戊糖旁路代谢。1、反应过程1).细胞定位:胞液2).反应过程可分为二个阶段 第一阶段:氧化反应。第二阶段:非氧化基团转移反应。总反应式 (1)磷酸戊糖生成 生成磷酸戊糖,NADPH+H+ 及CO2。关键酶:6-磷酸葡萄糖脱氢酶。磷酸核糖是一个非常重要的中间产物。(二)磷酸戊糖途径的意义
19、及调节 1.生成的5-磷酸核糖是核酸合成的重要原料。2. NADPH+H+ 是GSH还原酶的辅酶,具有保护细胞膜和清除自由基的作用。6-磷酸葡萄糖脱氢酶缺陷者,不能维持GSH的还原状态,故红细胞膜易破裂而发生急性溶血。3. NADPH作为供氢体,是加单氧酶体系的组成成分,参与激素、药物、毒物的生物转化过程。 4. 6-磷酸葡萄糖脱氢酶受NADPH/NADP+比值的调节。二、糖原的合成与分解糖原储存:肌糖原,250 400g,氧化供能。 肝糖原,70 100g,维持血糖。 糖原的结构特点:葡萄糖残基以-1,4-糖苷键形成长链,以-1,6-糖苷键连接形成分枝(一)、糖原合成1、合成部位 组织定位:
20、主要在肝、肌肉 细胞定位 胞浆2、糖原合成过程 葡萄糖供体为 UDPG 关键酶:糖原合酶 消耗2个高能磷酸键(二)、糖原分解在几个酶的共同作用下,最终产物中的85为1-磷酸葡萄糖,15为游离葡萄糖。关键酶:磷酸化酶 糖 异 生(一)、什么是糖异生 1、糖异生 是指从非糖化合物转变为葡萄糖或糖原的过程。2、部位 主要在肝、肾细胞的胞浆及线粒体。 3、原料 主要有乳酸、甘油、生糖氨基酸。生糖氨基酸-酮酸 甘油-磷酸甘油 磷酸二羟丙酮 乳酸丙酮酸(二)、糖异生途径(一)反应过程 糖异生与糖酵解途径共有可逆反应,3个由关键酶催化的不可逆反应,由另外的反应和酶代替。葡萄糖-6-磷酸酶 1. 6-磷酸葡萄
21、糖水解为葡萄糖 果糖双磷酸酶 2. 1,6-双磷酸果糖 转变为 6-磷酸果糖 3. 丙酮酸转变成磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)丙酮酸羧化为草酰乙酸,再脱羧生成PEP的过程称丙酮酸羧化支路。(三)、糖异生的意义维持血糖浓度恒定 ;调节酸碱平衡;协助氨基酸代谢;乳酸循环(Cori 循环)五 血糖及其调节血糖是血液中单糖的总称,临床称血中葡萄糖为血糖。 正常成人血糖浓度 为3.896.11mmol/L (一)、血糖来源和去路(二)、血糖水平的调节主要调节:降低血糖:胰岛素;升高血糖(胰高血糖素,糖皮质激素,肾上腺素)糖尿病人代谢时会 出现多方面的代谢紊乱。第5章 脂类代谢脂类是指脂肪和类脂的总称为脂类。
22、 血浆中所含脂类统称为血脂,包括:甘油三酯、磷脂、胆固醇及其酯以及游离脂肪酸。必需脂肪酸亚油酸、亚麻酸、花生四烯酸等多不饱和脂肪酸是人体不可缺乏的营养素,不能自身合成,需从食物摄取,故称必需脂肪酸。一、甘油三酯的分解代谢 (一)脂肪动员1.定义:储存的脂肪,被脂肪酶逐步水解为FFA及甘油,并释放入血以供其他组织氧化利用的过程。2.关键酶:激素敏感性甘油三酯脂肪酶(HSL) 3.脂解激素;能促进脂肪动员的激素,如胰高血糖素、去甲肾上腺素、ACTH 等。4.抗脂解激素:可抑制脂肪动员,如胰岛素、前列腺素E2等。(二)脂肪酸的氧化1.脂肪酸氧化的反应部位 除脑组织外,大多数组织均可进行,其中肝、肌肉
23、最活跃。2.亚细胞定位 胞液、线粒体。3.脂肪酸氧化的反应过程第一阶段:脂肪酸的活化成脂酰CoA(胞液)第二阶段:脂酰CoA经肉碱转运进入线粒体第三阶段: -氧化过程:脱氢、加水、再脱氢、硫解第四阶段:乙酰CoA的彻底氧化4、脂酸氧化是体内能量的重要来源-以16碳软脂酸的氧化为例活化:消耗2个高能磷酸键 -氧化:每轮循环四个重复步骤:脱氢(FADH2)、加水、再脱氢(NADH)、硫解5、 甘油3-磷酸甘油磷酸二羟糖酵解(三)酮体的生成和利用酮体是乙酰乙酸、-羟丁酸 、丙酮三者的总称。血浆水平:0.030.5mmol/L(0.35mg/dl代谢定位:生成:肝细胞线粒体。原料:乙酰CoA。利用:肝
24、外组织(心、肾、脑、骨骼肌等)线粒体。酮体生成的关键酶: HMGCoA合酶1. 酮体的生成 乙酰乙酰CoA硫解酶;HMGCoA合酶;HMGCoA裂解酶;-羟丁酸脱氢酶2. 酮体的利用 琥珀酰CoA转硫酶(心、肾、脑及骨骼肌的线粒体)乙酰乙酰CoA硫激酶(肾、心和脑的线粒体)乙酰乙酰CoA硫解酶(心、肾、脑及骨骼肌线粒体)二、甘油三酯的合成代谢(一)脂肪酸的合成1. 合成部位 肝(主要)、脂肪等组织的胞液中。2. 合成原料乙酰CoA、ATP、HCO3、NADPH、Mn2+ (1)乙酰CoA的主要来源Glc(主要)乙酰CoA氨基酸乙酰CoA全部在线粒体内产生,通过柠檬酸-丙酮酸循环 出线粒体。(2
25、)NADPH的来源 主要来源是磷酸戊糖途径,胞液中异柠檬酸脱氢酶及苹果酸酶催化的反应亦可提供。 3. 脂肪酸合成过程(1) 脂肪酸合成酶系乙酰CoA羧化酶 (acetyl CoA carboxylase)是脂肪酸合成的限速酶,存在于胞液中,其辅基是生物素,Mn2+是其激活剂。催化丙二酰CoA的合成。脂肪酸合酶复合体,该酶是由两个亚基组成的二聚体,每个亚基都含有多个功能结构域和一个酰基载体蛋白(acyl carrier protein,ACP)。脂肪酸合成的各步反应均在ACP辅基上进行。 二、 胆固醇的合成(一)合成部位1.组织定位:除成年动物脑组织及成熟红细胞外,几乎全身各组织均可合成,以肝、
26、小肠为主。2.细胞定位:胞液、光面内质网 (二)合成原料四、胆固醇的转化五、血浆脂蛋白代谢1、概念:血脂与血浆中的蛋白质结合,以脂蛋白 形式而运输,其中的Pr称为载脂蛋白。2、血浆脂蛋白的分类超速离心法:CM、VLDL、LDL、HDL乳糜微粒(CM):转运外源性甘油三酯极低密度脂蛋白:转运外源性甘油三酯低密度脂蛋白:转运胆固醇到肝外高密度脂蛋白:转运肝外胆固醇入肝VLDL的合成以肝为主,小肠亦可合成少量。第六章 生物氧化物质在生物体内进行氧化称生物氧化,主要指糖、脂肪、蛋白质等在体内分解时逐步释放能量,最终生成CO2 和 H2O的过程。呼吸链:代谢物脱下的成对氢原子(2H)通过多种酶和辅酶所催
27、化的连锁反应逐步传递,最终与氧结合生成水,这一系列酶和辅酶称为呼吸链又称电子传递链。一、呼吸链成分的排列顺序1. NADH氧化呼吸链NADH 复合体Q 复合体Cyt c 复合体O2P/O 比值=2.52. 琥珀酸氧化呼吸链 琥珀酸 复合体 Q 复合体Cyt c 复合体O2P/O 比值=1.53.两条呼吸链的排列顺序NADH氧化呼吸链 FADH2氧化呼吸链二、氧化磷酸化(一)氧化磷酸化 是指在呼吸链电子传递过程中偶联ADP磷酸化,生成ATP,又称为偶联磷酸化。 (二)P/O 比值氧化磷酸化过程中,每消耗1摩尔无机磷原子数与所消耗的氧原子摩尔数之比即P/O比值。 (三)底物水平磷酸化是底物分子内部
28、能量重新分布,生成高能键,使ADP磷酸化生成ATP的过程。(四)氧化磷酸化偶联部位(五) 氧化磷酸化的偶联机理-化学渗透假说三、氧化磷酸化系统及抑制剂的影响 四、线粒体内膜的物质转运胞浆中NADH的氧化胞浆中NADH必须经一定转运机制进入线粒体,再经呼吸链进行氧化磷酸化。转运机制:-磷酸甘油穿梭(NADHFADH2)主要存在于脑和骨骼肌苹果酸-天冬氨酸穿梭(NADHNADH )主要存在于肝和心肌五、高能化合物的储存和利用磷酸肌酸作为肌肉和脑组织中能量的一种储存形式。第 7 章 氨 基 酸 代 谢一、氨基酸的一般代谢1.营养必需氨基酸:指体内需要而又不能自身合成,必须由食物供给的氨基酸,共有8种
29、:Thr、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Lys、Met 2.脱氨基作用:指aa脱去-氨基生成相应-酮酸的过程。包括: 转氨基作用 辅酶是磷酸吡哆醛 氧化脱氨基作用 催化酶:L-谷氨酸脱氢酶 氨基酸氧化酶作用 主要在肌肉组织进行 嘌呤核苷酸循环 主要在肌肉组织进行转氨酶的种类多,专一性强,分布广,主要存在于细胞内,血清中的活性很低。肝细胞中活性最强丙氨酸转氨酶(ALT):心肌细胞中活性最强即谷丙转氨酶(GPT)天冬氨酸转氨酶(AST)即谷草转氨酶(GOT)血清转氨酶活性,临床上可作为疾病诊断和预后的指标之一。氨基酸脱氨基的主要方式:联合脱氨基作用二、氨的代谢1、血氨的来源氨基酸脱氨基作
30、用产生的氨是血氨主要来源, 胺类的分解也可以产生氨肠道细菌腐败作用产生氨肾小管上皮细胞分泌的氨主要来自谷氨酰胺2、血氨的转运通过丙氨酸-葡萄糖循环氨从肌肉运往肝谷氨酰胺的运氨作用3、氨在肝合成尿素是氨的主要去路去路:在肝内合成尿素,这是最主要的去路。合成非必需氨基酸及其他含氮化合物。合成谷氨酰胺。生成部位:主要是在肝细胞的线粒体及胞液中进行反应过程:原料:2 分子氨,一个来自于游离氨, 另一个来自天冬氨酸。过程:通过鸟氨酸循环,也叫尿素循环。耗能:3 个ATP,4 个高能磷酸键。关键酶:氨基甲酰磷酸合成酶, CPS-精氨酸代琥珀酸合成酶鸟氨酸循环:氨酸代琥珀酸合成酶4、尿素合成障碍可引起高血氨
31、症与氨中毒血氨浓度升高称高血氨症,常见于肝功能严重损伤或尿素合成相关酶的遗传缺陷。高血氨症时可引起脑功能障碍,称氨中毒一碳单位:某些氨基酸在分解代谢过程中产生的含有一个碳原子的基团,称为一碳单位的种类:甲基(-CH3 )、甲烯基(-CH2- )、甲炔基(-CH= )、甲酰基( -CHO)、亚胺甲基 ( -CH=NH )一碳单位四氢叶酸:一碳单位的运载体参与一碳单位代谢SAM(S腺苷甲硫氨酸):甲基的直接供体其他个别氨基酸代谢的产物氨基酸的特殊代谢及其产物L-组氨酸胺;色氨酸-羟色胺;L-谷氨酸-氨基丁酸;L-半胱氨酸磺酸SAM为体内甲基的直接供体活性硫酸根:3´-磷酸腺苷-5
32、0;-磷酸硫酸(PAPS)苯丙氨酸的代谢(1) 苯丙酮酸尿症(PKU) 苯丙氨酸羟化酶缺陷时,苯丙氨酸不能转变为酪氨酸,生成苯丙酮酸、苯乙酸等从尿排出的一种遗传代谢病。(2)人体缺乏酪氨酸酶,黑色素合成障碍,皮肤、毛发等发白,称为白化病(albinism)。(3)体内尿黑酸氧化酶先天缺陷时,尿黑酸分解受阻,可出现尿黑酸症,表现为骨及组织有广泛的黑色物沉积。第八章 核苷酸代谢一、嘌呤核苷酸的合成与分解代谢从头合成和补救合成两种途径(一)嘌呤核苷酸的合成代谢从头合成途径1、合成原料:磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO22、哺乳动物合成部位:主要在肝脏3、在磷酸核糖上逐步合成;4、最先合成IMP,再转
33、化成AMP和GMP5、脱氧核糖核苷酸的生成在在核苷二磷酸水平上进行NDP核糖核苷酸还原酶,Mg2+dNDP(二)、嘌呤核苷酸的分解代谢嘌呤碱的最终代谢产物是尿酸嘌呤核苷酸的抗代谢物嘌呤核苷酸的抗代谢物是一些嘌呤、氨基酸或叶酸等的类似物。氨蝶呤氨甲蝶呤等氮杂丝氨酸等6-巯基嘌呤6-巯基鸟嘌呤8-氮杂鸟嘌呤等叶酸类似物氨基酸类似物嘌呤类似物二、嘧啶核苷酸的合成与分解代谢(一)嘧啶核苷酸的从头合成1、合成部位:主要是肝细胞胞液2、合成原料:谷氨酰胺、CO2和天冬氨酸3、最先合成UMP,再生成CTP、dTMP(二)、嘧啶核苷酸的分解代谢的终产物被彻底氧化分解dTMP或TMP的生成脱氧核苷酸还原酶脱氧胸
34、苷一磷酸dTMP第十章 DNA的生物合成一、复制的基本规律1、半保留复制: DNA合成时,以亲代DNA解开的两股单链为模板,按碱基配对规律,合成子代DNA的过程。子代DNA,一股单链来源于亲代,另一股单链为新合成。子代和亲代的DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制意义:按半保留复制方式,子代DNA与亲代DNA的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性2、DNA复制从起始点向两个方向延伸形成双向复制3、 DNA复制为半不连续复制领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。顺解链方向生成的子链,复制为连续进行,称为领头链另一股链复制方向与解链方向相反,不
35、能顺着解链方向连续延长,称为随从链。复制中不连续片段称为岡崎片段二、DNA复制的酶学和拓扑学变化参与DNA复制的物质:底物: dNTP聚合酶: 依赖DNA的DNA聚合酶( DNA-pol;DDDP)模板: 解开成单链的DNA母链;引物: 提供3¢-OH末端使dNTP可以依次聚合;其他的酶和蛋白质因子聚合反应的特点:DNA 新链生成需引物和模板; 新链的延长只可沿5¢ 3¢方向进行 1、DNA聚合酶原核生物的DNA聚合酶分为三型: DNA-pol ;DNA-pol ;DNA-pol 延长子链;常见的真核细胞DNA聚合酶有五种DNA-pol aDNA-pol bDNA
36、-pol gDNA-pol d 延长子链的主要酶DNA-pol e参与DNA合成反应的各种酶DNA聚合酶:催化核苷酸之间聚合核酸外切酶:校读和碱基选择拓扑异构酶:理顺DNA链解螺旋酶DnaA、B、C:作用于氢键,使DNA双链解开成为两条单链。引物酶:由dnaG编码,催化生成RNA引物的酶单链DNA结合蛋白(SSB) :保护单链的完整DNA拓扑异构酶:改变DNA超螺旋状态、理顺DNA链DNA连接酶:连接DNA双链中的单链缺口DNA聚合酶,拓扑酶和连接酶催化3¢,5¢-磷酸二酯键生成的比较 提供核糖3¢-OH提供5¢-P结果DNA聚合酶引物或延长中的新链游离
37、dNTP去PPi(dNTP)n+1连接酶复制中不连续的两条单链不连续连续链拓扑酶切断、整理后的两链改变拓扑状态三、DNA的生物合成过程1、原核生物的DNA生物合成:复制起始DNA解链形成引发体含有解螺旋酶(DnaB蛋白)、DnaC蛋白、引物酶(DnaG蛋白)和DNA复制起始区域的复合结构称为引发体2、真核生物复制的起始与原核基本相似端粒(telomere)指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构。四、DNA损伤与修复突变(Mutation)是指DNA分子中碱基序列的改变,又称为DNA损伤。突变的类型错配缺失 框移插入 重排逆转录概念:含有逆转录酶的RNA病毒是通过逆转录(反转录)过程传递遗传信
38、息的,即以RNA为模板,指导DNA的合成,也称为反转录或逆转录。 逆转录酶:是一种依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),是一多功能酶。第11章 RNA的生物合成是DNA指导的RNA合成,也叫转录RNA指导的RNA合成,也叫RNA复制转录 (transcription) 是生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。参与转录的物质:原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板: DNA酶 : 依赖DNA的RNA聚合酶(RNA-pol)(DDRP)其他蛋白质因子复制和转录的区别 RNA聚合酶(一)原核生物的RNA聚合酶真核生物的RNA聚合酶 一、原核生物转录的模板和酶1、原核生物转录
39、的模板DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链,称为模板链、有意义链相对的另一股单链是编码链、反义链。2、 RNA合成由RNA聚合酶催化3 、RNA聚合酶结合到DNA的启动子上起动转录4.不对称转录(asymmetric transcription):在包含多个基因的DNA分子中,各基因的模板链并不总在同一条链上,在某个基因节段以其中某一条链为模板进行转录,而在另一个基因节段上则以其对应单链为模板,这种选择性称不对称转录。 不对称转录有两方面含义:在DNA分子双链上,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;其二是模板链并非总是在同一单
40、链上。二、原核生物的转录过程1、转录起始需要RNA聚合酶全酶与模板结合,形成闭合转录复合体2、原核生物的转录延长时蛋白质的翻译也同时进行3、原核生物转录终止依赖(Rho )因子的转录终止非依赖( Rho)因子的转录终止:转录产物形成发夹结构三、真核生物的转录过程1、 真核生物有三种DNA依赖性RNA聚合酶2、转录起始需要启动子 、RNA聚合酶和转录因子的参与3、真核生物转录延长过程中没有转录与翻译同步的现象4、真核生物的转录终止和加尾修饰同时进行聚腺苷酸(poly A)尾巴不同物种、不同细胞或不同的基因,转录起始点上游可以有不同的DNA序列,但这些序列都可统称为顺式作用元件能直接、间接辨认和结
41、合转录上游区段DNA的蛋白质,现已发现数百种,统称为反式作用因子反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的,则称为转录因子 四、 真核生物RNA的加工主要的修饰方式有剪接、剪切、修饰、添加。1、真核生物mRNA的加工包括首、尾修饰和剪接前体mRNA在5-末端加入“帽”结构前体mRNA在3端特异位点断裂并加上多聚腺苷酸尾mRNA的剪接:除去hnRNA中的内含子,将外显子连接。断裂基因:真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。 外显子:在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RN
42、A的核酸序列。内含子:隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。 2、tRNA的转录后加工切除5前导序列及中部的内含子3端加入CCA-OH作为末端碱基修饰(1)甲基化(2)还原反应 (3)核苷内的转位反应 (4)脱氨反应 3、rRNA的转录后加工第12章蛋白质的生物合成(翻译)蛋白质生物合成也称翻译:是生物细胞以mRNA为模板,按照mRNA分子中核苷酸的排列顺序所组成的密码信息合成蛋白质的过程。 反应过程(1)氨基酸的活化(2)肽链的生物合成(3)肽链形成后的加工和靶向输送蛋白质合成合成的肽链的方向是从N端向C端进行 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子。蛋白质生物合成体系1.基本
43、原料:20种编码氨基酸2. 三种RNA:mRNA(信使RNA) 直接模板rRNA(核糖体RNA) 提供场所tRNA(转运RNA) 转运氨基酸3.主要酶和蛋白质因子:氨基酰-tRNA合成酶、转肽酶、起始因子、延长因子、释放因子等4.能源物质:ATP、GTP5.无机离子:Mg2+、 K+1、mRNA是蛋白质生物合成的直接模板密码子:在mRNA的开放阅读框架区,以每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸(或其他信息),这种三联体形式的核苷酸序列称为密码子。遗传密码的特点:方向性、连续性、简并性、通用性、摆动性2、核蛋白体是蛋白质生物合成的场所3、tRNA是氨基酸的运载工具及蛋白质生物合成的适配器4、
44、蛋白质生物合成需要酶类、蛋白质因子等二、氨基酸活化形成氨基酰-tRNA三、肽链的生物合成过程整个过程可分为 :起始、延长、终止起始的氨基酰-tRNA真核生物: Met-tRNAiMet原核生物: fMet-tRNAffMet肽链延长在核蛋白体上连续循环式进行,又称为核蛋白体循环,包括以下三步: 1. 进位/注册2. 成肽3. 转位翻译后加工:蛋白质合成后,还必须进行后加工,才能表现出生理活性,这些蛋白质的修饰过程称为翻译后加工。蛋白质合成后靶向输送:指蛋白质合成后需定向输送到发挥功能的细胞靶部位的过程。 新生分泌蛋白的N端,可引导其自身转移到细胞靶部位的保守氨基酸序列,称信号序列或信号肽。第十
45、三章 基因表达调控基因:负责编码RNA或一条多肽链的DNA片段,包括编码序列、编码序列外的侧翼序列及插入序列。基因组:一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。基因表达:基因经过转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白质分子的过程。基因表达的特性:时间特异性;空间特异性 ;基因表达的方式:基本表达;诱导和阻遏表达某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达, 通常被称为管家基因。原核生物调节蛋白分为三类:特异因子;阻遏蛋白;激活蛋白;操纵子:是原核生物中几个功能相关的结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协同单位。操纵子的本质是DNA序列。原核细胞操纵子的结构与功能操纵子:调节序列-编码一
46、种阻遏蛋白;启动序列-结合RNA聚合酶,启动转录;操纵序列-阻遏蛋白的结合位点;编码序列-编码功能性蛋白,26个;转录调节因子结构:DNA结合域;转录激活域;蛋白质-蛋白质结合域(二聚化结构域)第十四章基因重组与分子生物学技术 基因重组:DNA片段在细胞内、细胞间,甚至在不同物种之间进行交换,交换后的片段仍然具有复制和表达的功能。基因工程:采用人工方法将不同来源的DNA进行重组,并将重组后的DNA引入宿主细胞中进行增殖或表达的过程。 一、重组DNA技术 1、最主要的工具酶:限制性核酸内切酶2常用的载体有: 质粒、 噬菌体DNA 、动物病毒载体等3、目的基因的获取方法:化学合成法;基因组DNA分
47、离从cDNA文库中筛选;合酶链反应二、重组DNA技术操作过程 可形象归纳为 分-分离目的基因;切限制酶切目的基因与载体;接拼接重组体;转转入受体菌;筛筛选重组体;第15章 血液的生物化学血清蛋白电泳图谱:清蛋白 a1球蛋白a2球蛋白b-球蛋白 g球蛋白第十六章 肝脏生物化学 一、肝的生物转化作用1、生物转化的概念:机体对内、外源性的非营养物质进行代谢转变,使其水溶性提高,极性增强,易于通过胆汁或尿液排出体外的过程称为生物转化2、生物转化的对象:非营养物质3、生物转化反应的特点:连续性;多样性;解毒与致毒的双重性4、肝的生物转化包括两相反应第一相反应:氧化、还原、水解反应第二相反应:结合反应氧化
48、反应是最多见的生物转化第一相反应生物转化第二相反应-结合反应结合对象:凡含有羟基、羧基或氨基的药物、毒物或激素等均可发生结合反应。 结合物:葡糖醛酸、硫酸、乙酰基、谷胱甘肽、甲基、甘氨酸等物质或基团。 其中与葡糖醛酸结合是最普遍的二相反应。葡糖醛酸结合是最重要、最普遍的结合反应葡糖醛酸基的直接供体 尿苷二磷酸葡糖醛酸(UDPGA)硫酸结合也是常见的结合反应硫酸供体:3´-磷酸腺苷-5´-磷酸硫酸( PAPS)甲基活性供体:硫腺苷蛋氨酸(SAM)二、胆汁与胆汁酸的代谢胆汁酸按结构分:游离胆汁酸:如胆酸、鹅脱氧胆酸结合胆汁酸:如牛磺胆酸、甘氨胆酸(与牛磺酸、甘氨酸结合)胆汁酸按
49、来源分初级胆汁酸:肝细胞直接合成 次级胆汁酸:肠道细菌作用下(7-羟基脱氧)如:脱氧胆酸及石胆酸初级胆汁酸的生成部位:肝细胞的胞液和微粒体中原料:胆固醇限速酶:胆固醇7-羟化酶次级胆汁酸的生成肠菌部位:小肠下段和大肠过程:次级胆汁酸初级胆汁酸水解、脱羟胆汁酸肠肝循环的概念:胆汁酸随胆汁排入肠腔后,约95%胆汁酸可经门静脉重吸收入肝,在肝内转变为结合胆汁酸,并与肝新合成的胆汁酸一道再次排入肠道,此循环过程称胆汁酸的肠肝循环胆汁酸肠肝循环的生理意义在于可使有限的胆汁酸库)存(约35克)循环利用,以满足机体对胆汁酸的生理需求。三、血红素代谢1、血红素的生物合成合成原料:甘氨酸、琥珀酰辅酶A和Fe2+
50、合成部位:起始和终止阶段在线粒体,而中间阶段在胞液中进行。-氨基-酮戊酸(ALA)ALA合酶是血红素合成的限速酶, 受血红素反馈调节。2、血红素的分解代谢血红素在体内分解代谢的主要产物是胆色素。它包括胆绿素、胆红素、胆素原和胆素等。胆红素的生成:生成部位:肝、脾、骨髓单核-巨噬细胞系统的微粒体与胞液中。胆红素的运输:主要以胆红素-清蛋白复合体的形式进行运输。 在内质网的胆红素尿苷二磷酸葡糖醛酸基转移酶(UGT)催化下,生成葡糖醛酸胆红素(单酯或二酯),故称直接胆红素或结合胆红素。 生理学思考题:第一章 复习思考题一、名词解释 阈强度(阈值)、兴奋性(二者的关系)、内环境二、简答题 &
51、#160; 1.生理功能的调节方式有哪几种?各有何特点? 2.反射弧由哪几部分组成? 3.负反馈有何生理意义?(举例说明) 4.简述细胞在一次兴奋过程中兴奋性的周期性变化。第二章 细胞的基本功能 一、名词解释 静息电位、去极化、超极化、阈电位、兴奋-收缩耦联 二、简答题 1. 细胞膜物质转运方式有哪几种?各主要转运哪类物质?钠泵活动有何生理意义? 2. 载体转运有哪些特点?主动转运和被动转运有何区别? 3. 简述神经纤维静息电位和动作
52、电位的产生机制。4.人为改变细胞外液K+,对RP有何影响? 5.动作电位和局部电位有何区别? 6.简述神经-肌肉接头兴奋传递的过程。 7.影响肌肉收缩的因素有哪些? 8.兴奋-收缩耦联的关键物质和结构基础是什么?第三章 血液 一、名词:血细胞比容二、简答1、血浆渗透压包括哪两种?主要由何物质形成?各有何生理作用?2、简述红细胞悬浮稳定性降低的原因?3、红细胞生成的基本原料和成熟因子是什么?4、简述各类白细胞的主要功能。5、简述ABO血型的抗原、抗体及分型依据。6、简述血小板的功能。7、简述血液凝固的基本过程。8、简述内源性凝血与外源性凝血的区别及血清和血浆的区别。9、草酸钾、柠檬酸钠和肝素的抗
53、凝机制各是什么?10、已知体重,如何计算血量和体液量?11、何谓交叉配血实验?其结果有何意义?第四章 血液循环一、名词解释 心动周期、搏出量、射血分数、心输出量、心指数、自律性、窦性心律、 平均动脉压、微循环二、简答题1.熟悉心动周期中各心腔内压力、容积、瓣膜开闭及血流方向的变化。2.简述第一心音和第二心音产生的机理和意义。3.简述心输出量的影响因素。4.简述心室肌细胞动作电位产生的离子基础。5.窦房结P细胞动作电位有何特点?自律细胞与心室肌细胞动作电位有何区别?6.简述兴奋在正常心脏内传播的途径及特点。7.心肌有哪些生理特性?在一次兴奋过程中,其兴奋性有哪些变化?心脏为何不会发生完全强直收缩?8.简述正常ECG各波的意义。 9.简述动脉血压的形成及影响因素。 10.何谓中心静脉压?其数值受哪些因素影响?11.影响静脉血回流的因素有哪些?12.典型微循环由哪几部分组成?三条血流通路各有何功能?其总闸门和分闸门
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