实习九近交系数与亲缘系数的计算实用教案

1、二、实习(shx)内容 1、近交系数的计算： )1 ()21(121AnnxFF)1 ()21(21ANxFF （1） （2）（3）)21(121nnxF （n1为父亲到祖先(zxin)的代数，n2为母亲到祖先(zxin)的代数，FA为祖先(zxin)的近接系数）。第1页/共13页第一页，共13页。 上列（1）式和（2）式，算法结果完全相同，均可运用。（1）式中的n1+n2，也就等于（2）式中的N；（1）式括号左上方的1，也就等（2）式括号前的。计算时，首先通过系谱，把所给系谱划为箭头( jintu)式系谱，然后通过此系谱找出父、母到祖先的代数，然后代入公式，即可计算。第2页/共13页第二页，

2、共13页。 示例：现在289号公羊的横式系谱(x p)如下，可先将其改制成箭头式系谱(x p)，然后计算135号和181号间的亲缘系数。) 01 ()()(1112112221)289(F289135181904916 从系谱可看出，135号和181号之间，有108号和16号两个共同(gngtng)祖先，其通径路线为：13510818113590164919110816491081811690108135289第3页/共13页第三页，共13页。2、亲缘(qn yun)系数的计算： （1）旁系亲属(pngxqnsh)间的亲缘系数，计算公式为：)1)(1 ()1 ( )21(DSANSDFFFR第

3、4页/共13页第四页，共13页。N=n1+n2，FS为父亲的近接系数(xsh)，FD为母亲的近接系数(xsh)， 如果个体(gt)S、D和A都不是近交个体(gt)，则公式可简化为：)21(NSDR第5页/共13页第五页，共13页。 示例：现在289号公羊的横式系谱如下，可先将其改制成箭头式系谱，然后(rnhu)计算135号和181号间的亲缘系数。16491081811690108135289135289181901084916第6页/共13页第六页，共13页。 从上面系谱(x p)可看出，135号和181号之间，有108号和16号两个共同祖先，其通径路线为： 135108181 1359016

4、49181 代入公式后则得： %25.313125. 00625. 025. 0)(4212)21()181()135(p289135181904910816第7页/共13页第七页，共13页。(2)直系亲缘(qn yun)间的亲缘(qn yun)系数，计算公式为： xANxAFFR11)21(第8页/共13页第八页，共13页。 如果共同祖先A和个体X都不是(b shi)近交所生，则公式可简化成：NxAR)21(第9页/共13页第九页，共13页。 示例：仍用上例系谱，计算289号公与其祖先16号之间的亲缘(qn yun)系数。 从上例系谱可看出，289号与16号之间的亲缘(qn yun)关系，有两条通径路线，每条通径的代数都是3，即： 2891359016 2891814916289135181904910816第10页/共13页第十页，共13页。 另外，289号公羊(n yn)还是近交后代，其近交系数是15.63%，代入公式后则得：%25.23156. 1141156. 0101)21()21(33)16)(289(R 即289号公羊与祖先16号公羊之间的亲缘(qn yun)系数是23.25%。第11页/共13页第十一页，共13