NMR信息查找期刊数据库学习课程

1、内 容NMR 原理NMR 论坛NMR 开放管理实验室规定: 门禁/收费NMR 维修NMR 解谱NMR 概况NMR 操作配样基本 2D 操作 (cosy,noesy,hsqc,hmbc)北大 NMR 情况, 搬迁正确的解谱步骤有特色谱图介绍NMR 结构: 磁体/探头/气路/console/电脑检测: 基本 H/C 操作谱图处理: 谱仪软件NMR 应用NMR 谱仪厂家进阶操作: 杂核/ 变温 /特殊 2D /T1/ 其它硬件/ 软件管理员提供服务: 标准匀场/标准锁场/标准谱图/参数参数含义各种经验: 探头/ 旋转/ 气路/ 液氮液氦/ 调谐/ 打印NMR 在化学中的应用数据库. 谱图比较/预测灵

2、敏度/分辨率, 卫星峰/旋转边带液体核磁/固体核磁NMR 相关期刊谱图信息基本知识仪器信息网 / 中国核磁论坛第1页/共31页第一页，编辑于星期六：十点 三十五分。北大图书馆. 英文电子期刊 (化学化工类)电子期刊第2页/共31页第二页，编辑于星期六：十点 三十五分。北大图书馆. 英文电子期刊 (化学化工类)第3页/共31页第三页，编辑于星期六：十点 三十五分。纷色字期刊为专业 NMR 期刊第4页/共31页第四页，编辑于星期六：十点 三十五分。北大图书馆. 中文电子期刊 (化学化工类)第5页/共31页第五页，编辑于星期六：十点 三十五分。粉色字期刊为报导 NMR 较集中期刊第6页/共31页第六

3、页，编辑于星期六：十点 三十五分。NMR 图书/ 文献信息- 有详细条目 165 页第7页/共31页第七页，编辑于星期六：十点 三十五分。第8页/共31页第八页，编辑于星期六：十点 三十五分。第9页/共31页第九页，编辑于星期六：十点 三十五分。NMR 重要 Web Site网 络 重 要 N M R s i t e第10页/共31页第十页，编辑于星期六：十点 三十五分。光谱/波谱数据库(1). 核磁共振波谱数据库http:/1. 建于 1982 年, 隶属于长春应化所的应用化学数据库中, 国内一个比较大型的 NMR 数据库.2. 化合物类型: 天然产物, 金属有机化合物, 毒物等.3. 检索

4、: 化合物名, 分子式, 化学位移, 多重性, 实验条件, 相关文献.4. 可用于化合物结构的自动解析.http:/ 中科院上海有机所的 红外光谱数据库(3). 日本 AIST 有机物光谱数据库 (含 NMR)0. 链接使用还算方便, 已经用过多次查询 NMR, IR 已知谱1. National Institute of Advanced Industrial Science and Technologey2. 内容含有 NMR (1H, 13C), ESR, IR, Raman, Mass 等3. 界面朴实, 简单易用, 许多入口: 名字, 分子式, 分子量, CA 登记号http:/ww

5、(9). 英国皇家学会的 Mass Spectrometry Bulletin质谱文献库, 1980 年来文献 8 万条自索引词获得质谱图http:/(7). CambridgeSoft 公司的 CS ChemFinder1. 报导 75000 多个化合物的基本物性: mp, bp, d, 溶解度, 光谱图 (IR, UV, Mass)2. 检索法: 化合物名称, 分子量, CA 登记号, 结构等 3. 检索某化合物物性, 同时提供链接到其他网站, 便获得该化合物的相关性质./online/dbss/specinfoss.htm(10). S

6、pecinfo数据库1. 一个实用的光谱数据库, 收集660多万个光谱数据2. 全世界最大, 最完整的光谱数据库; 搜索功能多http:/(11). Spectra Online提供许多有机物的红外和拉曼谱图, 但并非免费http:/nmrshiftdb.cubic.uni-koeln.de/nmrshiftdb(2). NMRShiftDB(5). 生物大分子核磁共振数据库BioMegResBank1. 美国Wisconsin-Madison大学生物化学学院制作2. 搜集几十年来全球各实验室研究生物大分子(多肽, 蛋白质, 核酸)的NMR数据3.

7、 对一些数据给出了分析, 指出用户从中可得到的信息http:/ Sadtler光谱数据库1. Sadtler公司提供的光谱数据库2. 收录红外, 近红外, 拉曼, 核磁, 质谱, 紫外及未数码化的气相色谱图3. 红外谱图库最为全面, 但并非免费34/default.htmhttp:/riodb.ibase.aist.go.jp/ssnmr/index_eng.html(4). 日本 Solic state NMR databasehttp:/riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/cre_index.cgi提供许多有机物

8、的NMR谱图, 检索方式多样网 络 数 据 库第11页/共31页第十一页，编辑于星期六：十点 三十五分。第12页/共31页第十二页，编辑于星期六：十点 三十五分。日本 SDBS 查 Me3NH HCl 的 NMR 日本 S D B S第13页/共31页第十三页，编辑于星期六：十点 三十五分。第14页/共31页第十四页，编辑于星期六：十点 三十五分。1. Searches entire CAS databases2. substances from 1907 3. text from 1907, some pre-19004. reactions from 1940, some back to

9、19075. current catalogues6. Medline 1953-章 6. SciFinder Scholar6-1. 概况使用情况:1. 至 2004 年, 900 大学/研究机构使用2. 北大于 2004.12 考虑购买, 开始进行试用3. 北大于 2005.12 正式购买, 每次最多 5 人在线检索美国: 44%, 欧洲 26%, 日本 9%, 加拿大 4%, 澳纽 4%, 其它 13 % 1. 目前查找化学信息最强有力的检索工具.2. SciFinder: 创建于 1995 年, 含多种 CAS 的数据库, 服务对象包括工商界与政府部门3. SciFinder Scho

10、lar: 1998 年引进, 为 SciFinder 的精简版, 设定服务对象为大学/研究机构4. SciFinder Scholar 的售价比 SciFinder 便宜甚巨, 97% 折扣 (服务学术界)5. SciFinder Scholar 的 CAplus 数据库已比 CA on CD 丰富内容1. Reference Databases (文献数据库) . CAplus MEDLINE2. Structure Database (结构数据库) . REGISTRY3. Reaction Database (反应数据库) . CASREACT4. Commercial Sources

11、Database (商业来源数据库) . CHEMCATS5. Regulatory Database (管制数据库) . CHEMLIST检索范围:数据库:topic search Y Ychemical name N Ymolecular formula Y Ystructures N Yreactions N Nsince 1977 1907CA on CDCAplusCA 网络查找SciFinder第15页/共31页第十五页，编辑于星期六：十点 三十五分。6-2. SciFinder 数据库CAplus1. The most current and comprehensive bibl

12、iographic chemistry database.2. 收录 1907 年以来的资料, 比印刷版还齐全3. 报导 cited references: 1997 年起.CASREACT1. 报导 1907 年来超过 900 万化学反应:, 包括: 有机合成, 有机金属, 生物催化反应2. 文献涵盖: 各种期刊和专利, 包括最新的反应改进3. 检索类型: 反应, 反应物, 产物, 试剂. REGISTRY1. 2004 年底资料, CA 登记号已经超过 7700 万号 含 2700 万有机与无机化合物, 5700 个 sequence2. 报导的 substance 包括: 目前每天增加

13、7 万个每秒 20 个 substancesOrganic, Organometallics, Inorganic, Elements, Metals, Isotopes, Alloys, Nuclear Particles, Minerals, Proteins and Nucleic Acids, Coordination compounds, Polymers, Nonstructurable materialsCHEMCATS1. Regulatory information from 19 Government Regulatory lists around the world2.

14、报导 235,031 Inventoried/regulated substances 3. 每周更新信息CHEMLISTMEDLINE1. 报导全球最新最完整的商用化学品信息2. 内容包括化学品 800 万种, 供应商 750 家, 目录 850 种2. 信息更新及时1. 报导医学相关的信息, 1953 年迄今2. 含 Bibliographic, Abstract and Indexing Information3. 每周更新 4 次/scifinder/ataglance.html第16页/共31页第十六页，编辑于星期六：十点 三十五分。SciFinder Scho

15、lar 查找范例(1). 查找: 微波辅助无机合成 的文献自家用 PC点选第 2 图标: Research Topic进入 SciFinder Scholar 检索界面(挑出无机合成)Analyze by: Journal Name点选: Analyze all document; Sort by frequency得到: 各种文献报导的次数统计表6-4. (安装: 参考北大图书馆的说明) 得到: 316 数据资料无机化合物磷酸钇 (YPO4) 的论文 框内输入: microwave assisted synthesis(2). 查找: 点击 SciFinder Scholar自家用 PC点选

16、第 1 图标: Chemical Substance or Reaction进入 SciFinder Scholar 检索界面分析法限制: 点选: Language, 再选: English, Chinese点选: Index Term (关键词), 再选: Energy transfer, crystal field得到: 11 papers(安装: 参考北大图书馆的说明) 得到: 800 papers续选 Substance Identifier 图标输入: yttrium phosphate点击 SciFinder Scholar找出无机类的期刊: J. Meter. Res.DONE续

17、选 Molecular Formula 图标输入: YPO4 Search result no hit.第17页/共31页第十七页，编辑于星期六：十点 三十五分。第18页/共31页第十八页，编辑于星期六：十点 三十五分。章 5. 网络检索 Crossfire5-1.概论简介:1. Beilstein 的网络数据检索版, 1994 年 MDL 公司开发2. 和 Gmelin (报导无机/有机金属化合物) 同一网络平台3. 使用软件: Crossfire Commander V7.0; 画图 ISIS/Draw 2.5特点:1. 大量的超链接: 5000万个.2. 提供丰富的信息: 物质, 反应,

18、 引用3. 输出报告可以: html, words, excel4. 可和 Gmelin 联用检索信息5. 没有在线使用人数限制 (相对 SciFinder)i). 链接化合物, 反应, 参考文献ii). 链接到制备信息, 文献全文i). 物质信息: 900 多万种, 含结构和参考文献ii). 反应信息: 1000 多万种, 有利于制备iii). 引文信息: 1980 年来文献的摘要, 80 万条检索:1. 三种检索i). 结构和反应检索: 画出结构查找, ii). 文本检索:iii). 实情检索: 又名数据检索 (easy data search, EDS)Guided Search: 由左

19、上方的 Search Field 开始Advanced Search: 需熟悉各种检索字段以及联用符途径选择:substancesreactionscitations2. 可限定: 基团检测i). 查找类型: structure, reactant, product, reagentii). 产率: 例如 85 % 以上iii). 基团检测: Alk 取代基, C* (可任意基团), 同时限定反应物与产物检索字段:author, patent assignee, journal titlecoden, article title, publication yearCrossFire第19页/共

20、31页第十九页，编辑于星期六：十点 三十五分。5-2.Crossfire 检索范例Q1: 查找某一溶剂, 能满足以下条件: 不能含 Cl, 沸点 120 oC, 且其密度 (density) 和粘度 (viscosity) 为已知者.题解:由 Easy Data Search 着手.方法一: Guide Search: 点击左上角的 Search Field, 填写右边 Query Builder 的检索表格:由路径: Beilstein / Substance Identification / Element CountOperator Field Name Relation Field C

21、ontent List Boiling point (BP) 120proximity Pressure is 760not Element Count is Cl*and Density of Liquid existand Dynamic Viscosity exist方法二: 用 Advanced Search, 检索字段输入:BP120proximityBP.P=760 and DV and DEN not ELC=cl*由 List 可得到字段的简称由路径: Beilstein / Physical Properties / Density of LiquidQ2: 检索发表在 19

22、91 年 Journal of Medicinal Chemistry (J. Med. Chem.) 有关 Cromaskalim 化合物的文献题解:联用 Structure 与 Easy Data Search 1. 用 ISIS Draw 画出化合物的结构图, 点选 as structure2. Search Field 的表格填写:Operator Field Name Relation Field Content List Journal Title start with j med chemproximity Publication Year is 1991Q3: 了解能治疗气喘的吸入式药剂化合物的结构特征, 进一步查询哪些化合物具有和其类似的结构.题解: 1. 先由 Easy Data Search 得到数十个满足要求 (吸入式治疗气喘) 的化合物结构 Effect is antiasthmaproximity Route of Application