7糖的分解代谢3

1、7.3 柠檬酸循环柠檬酸循环（三羧酸循环）（三羧酸循环）细胞呼吸细胞呼吸一、丙酮酸氧化为乙酰一、丙酮酸氧化为乙酰coa丙酮酸脱氢酶复合物丙酮酸脱氢酶复合物（pdc）（）（e1+e2+e3）丙酮酸丙酮酸乙酰乙酰coa硫辛酸硫辛酸丙酮酸丙酮酸 + coa + nad+ 乙酰乙酰coa + co2 + nadh + h+ 丙酮酸氧化丙酮酸氧化tpp(tpp(焦磷酸硫胺素焦磷酸硫胺素) )硫辛酸硫辛酸辅酶辅酶a a（coacoa）nadnad+ +( (烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸) )fadfad（黄素腺嘌呤二核苷酸）（黄素腺嘌呤二核苷酸）五种辅酶五种辅酶丙酮酸脱氢酶复合物丙酮酸脱氢酶复

2、合物三种酶三种酶丙酮酸脱氢酶（丙酮酸脱氢酶（e1e1）二氢硫辛酰转乙酰基酶（二氢硫辛酰转乙酰基酶（e2e2）二氢硫辛酰脱氢酶（二氢硫辛酰脱氢酶（e3e3）噻唑环噻唑环与与e e1 1结合，使丙酮酸结合，使丙酮酸脱羧脱羧，产生，产生羟乙基羟乙基-tpp-tpp羟乙基羟乙基丙酮酸脱羧酶丙酮酸脱羧酶丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶- -酮戊二酸脱氢酶酮戊二酸脱氢酶转酮醇酶转酮醇酶乙酰乳酸合成酶乙酰乳酸合成酶乙醇发酵乙醇发酵乙酰乙酰coa的合成的合成tca光合作用光合作用c c的固定的固定缬氨酸、亮氨酸缬氨酸、亮氨酸的生物合成的生物合成coenzyme a (coa)酶酶e e2 2的底物，从硫辛酰胺上接受的

3、底物，从硫辛酰胺上接受乙酰基乙酰基泛酸泛酸2-2-巯基乙胺巯基乙胺 硫辛酰胺是硫辛酸硫辛酰胺是硫辛酸与酶蛋白的一个与酶蛋白的一个lyslys残基的残基的- -氨基氨基共价共价连接连接硫辛酸硫辛酸还原性还原性二氢硫辛酰胺二氢硫辛酰胺-e-e2 2乙酰型乙酰型乙酰乙酰- -二氢硫辛酰胺二氢硫辛酰胺-e-e2 2(c) e2 consists of three types of domains linked by short polypeptide linkers: a catalytic acyltransferase domain; a binding domain, involved in t

4、he binding of e2 to e1 and e3; and one or more (depending on the species) lipoyl domains.二氢硫辛酰转乙酰基酶二氢硫辛酰转乙酰基酶丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶二氢硫辛酰脱氢酶二氢硫辛酰脱氢酶细菌丙酮酸脱氢酶系的结构细菌丙酮酸脱氢酶系的结构e1 丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶e2 二氢硫辛酰转乙酰基酶二氢硫辛酰转乙酰基酶e3 二氢硫辛酰脱氢酶二氢硫辛酰脱氢酶丙酮酸脱氢酶系丙酮酸脱氢酶系乙酰乙酰- -二氢二氢硫辛酰胺硫辛酰胺丙酮酸丙酮酸羟乙基羟乙基-tpp-tpp乙酰乙酰coacoa硫辛硫辛酰胺酰胺二氢硫辛二氢硫辛酰脱氢

5、酶酰脱氢酶丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶二氢硫辛酰二氢硫辛酰转乙酰基酶转乙酰基酶二氢硫二氢硫辛酰胺辛酰胺丙酮酸脱氢酶复合物催化的反应丙酮酸脱氢酶复合物催化的反应e1e2e3(c) the mechanistic details of the first three steps of the pyruvate dehydrogenase complex reaction. a deeper look steric preferences in nad+-dependent dehydrogenases, the enzymes that require nicotinamide coenzymes a

6、re stereospecific and transfer hydride to either the pro-r or the pro-s positions selectively. the table (facing page) lists the preferences of several dehydrogenases.丙酮酸氧化脱羧反应过程的调控丙酮酸氧化脱羧反应过程的调控p p320320共价调节共价调节别构调节别构调节atpatp抑制抑制e1e1( (丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶) )乙酰乙酰coacoa抑制抑制e2e2( (二氢硫辛酰转乙二氢硫辛酰转乙酰基酶酰基酶) )nadh

7、nadh抑制抑制e3e3( (二氢硫辛酰脱氢酶二氢硫辛酰脱氢酶) )丙酮酸脱丙酮酸脱氢酶激酶氢酶激酶丙酮酸丙酮酸脱氢酶脱氢酶磷酸酶磷酸酶二、柠檬酸循环二、柠檬酸循环（tcatca循环、三羧酸循循环、三羧酸循环、环、krebskrebs循环）循环）柠檬酸柠檬酸-酮戊二酸酮戊二酸草酰乙酸草酰乙酸乙酰乙酰coacoa异柠檬酸异柠檬酸琥珀酰琥珀酰-coa-coa琥珀酸琥珀酸延胡索酸延胡索酸苹果酸苹果酸 柠檬酸循环柠檬酸循环是乙酰基二碳是乙酰基二碳单位进一步氧单位进一步氧化降解产生化降解产生coco2 2和还原型辅酶和还原型辅酶的代谢途径。的代谢途径。c4+c2c6 c6 c6 c6 c5 c4 c4

8、c4 c41. 1. 乙酰辅酶乙酰辅酶a a与草酰乙酸缩合成柠檬酸与草酰乙酸缩合成柠檬酸柠檬酸柠檬酸草酰乙酸草酰乙酸乙酰乙酰coacoa柠檬酸合成酶柠檬酸合成酶限速酶限速酶柠檬酸合成酶单体柠檬酸合成酶单体柠檬酸柠檬酸乙酰乙酰coacoa柠檬酸合成酶结构（二聚体）柠檬酸合成酶结构（二聚体）structure of citrate synthaseopen form of the enzyme aloneclosed form with bound oxaloacetate (yellow) and a stable analog of acetyl- coa(carboxymethyl-coa;

9、 red)柠檬酸合成酶作用机制柠檬酸合成酶作用机制硫酯硫酯烯醇化物烯醇化物酸催化酸催化共轭碱共轭碱柠檬酸合成酶作用机制柠檬酸合成酶作用机制烯醇化物烯醇化物 羰基碳羰基碳草酰草酰乙酸乙酸酸催化酸催化柠檬酸合成酶作用机制柠檬酸合成酶作用机制柠檬酰柠檬酰-coa-coa柠檬酸合成酶作用机制柠檬酸合成酶作用机制硫酯硫酯2. 2. 柠檬酸异构化生成异柠檬酸柠檬酸异构化生成异柠檬酸异柠檬酸异柠檬酸6 6顺乌头酸顺乌头酸4 4柠檬酸柠檬酸9090pro-s armpro-r armrs顺乌头酸酶顺乌头酸酶顺乌头酸酶顺乌头酸酶（含（含4fe4fe4s4s的铁硫蛋白）的铁硫蛋白）异柠檬酸异柠檬酸isocitra

10、te铁硫簇铁硫簇iron-sulfur cluster半胱氨酸半胱氨酸cysteines顺乌头酸酶的活性中心顺乌头酸酶的活性中心the active site of aconitase. 铁硫中心的作用是底物结合和催化作用铁硫中心的作用是底物结合和催化作用 顺乌头酸酶是一种含顺乌头酸酶是一种含4fe-4s4fe-4s的铁硫蛋白，的铁硫蛋白，fe-sfe-s聚聚簇与柠檬酸结合，并参与底物的脱水和再水合。簇与柠檬酸结合，并参与底物的脱水和再水合。 铁硫蛋白：铁硫蛋白：与与fe-sfe-s聚簇结合着的蛋白质称为聚簇结合着的蛋白质称为铁硫蛋铁硫蛋白白，或，或非血红素铁蛋白。非血红素铁蛋白。柠檬酸：分子

11、结构对称，反应不对称柠檬酸：分子结构对称，反应不对称citrate: a symmetrical molecule that reacts asymmetrically途径途径2 2实际并不出现实际并不出现- -酮戊二酸酮戊二酸易受影响的键易受影响的键柠檬酸：分子结构对称，柠檬酸：分子结构对称，反应不对称反应不对称citrate: a symmetrical molecule that reacts asymmetrically3. 3. 异柠檬酸氧化脱羧生成异柠檬酸氧化脱羧生成-酮戊二酸酮戊二酸-酮戊二酸酮戊二酸异柠檬酸异柠檬酸异柠檬酸脱氢酶异柠檬酸脱氢酶mg2+、mn2脱去的脱去的coco

12、2 2来自最初的草酰乙酸来自最初的草酰乙酸哺乳动物中也存在依赖哺乳动物中也存在依赖nadpnadp+ +的异柠檬酸脱氢酶的异柠檬酸脱氢酶异柠檬酸异柠檬酸nadp+ ca2+ 异柠檬酸脱氢酶的活性中心异柠檬酸脱氢酶的活性中心the active site of isocitrate dehydrogenasethe active site of isocitrate dehydrogenase4. -4. -酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰coacoa琥珀酰辅酶琥珀酰辅酶a-酮戊二酸酮戊二酸-酮戊二酸脱氢酶系酮戊二酸脱氢酶系脱去的脱去的coco2 2来自最初的草酰乙酸来自最初

13、的草酰乙酸高能硫酯键高能硫酯键5. 5. 琥珀酸的生成琥珀酸的生成琥珀酸琥珀酸琥珀酰琥珀酰coa琥珀酸硫激酶琥珀酸硫激酶(琥珀酰琥珀酰coa合成酶合成酶)底物水平磷酸化底物水平磷酸化核苷二核苷二磷酸激酶磷酸激酶哺乳动物：哺乳动物：gtpgtp植物和细菌：植物和细菌：atpatp磷酸基转移到磷酸基转移到gdpgdp，生成，生成gtpgtpcoacoa被磷酸基取代被磷酸基取代磷酸基转移到酶活磷酸基转移到酶活性部位性部位hishis残基上残基上释放琥珀酸释放琥珀酸琥珀酰琥珀酰coacoa合成酶反应机制合成酶反应机制大肠杆菌琥珀酰大肠杆菌琥珀酰coacoa合成酶合成酶succinyl-coa synt

14、hetasesuccinyl-coa synthetase of of e. colie. coli活性部位包括：活性部位包括： (蓝色蓝色)亚基亚基 (褐色褐色)亚基亚基coenzyme a磷酸磷酸6. 6. 延胡索酸的生成延胡索酸的生成延胡索酸延胡索酸琥珀酸琥珀酸琥珀酸脱氢酶琥珀酸脱氢酶 琥珀酸脱氢酶是琥珀酸脱氢酶是tcatca中唯一的中唯一的线粒体内膜结合蛋线粒体内膜结合蛋白白，也是，也是琥珀酸琥珀酸-coq-coq氧化还原酶氧化还原酶的一部分，没有区的一部分，没有区别琥珀酸相同两端的能力。别琥珀酸相同两端的能力。 fad fad作为该酶的辅作为该酶的辅基，共价结合在酶的一基，共价结合在

15、酶的一个个hishis残基上残基上.(fad.(fad的的c-c-8 8酶的酶的n-3)n-3)the fe2s2 cluster of succinate dehydrogenase 7. 7. 苹果酸的生成苹果酸的生成苹果酸苹果酸延胡索酸延胡索酸延胡索酸酶延胡索酸酶（延胡索酸水合酶）（延胡索酸水合酶）延胡索酸酶催化反应可能的两种机制延胡索酸酶催化反应可能的两种机制two possible mechanisms for the fumarasetwo possible mechanisms for the fumarase reaction reaction 碳负离子碳负离子8. 8. 草酰

16、乙酸的再生草酰乙酸的再生苹果酸苹果酸草酰乙酸草酰乙酸苹果酸脱氢酶苹果酸脱氢酶热力学上不利于草酰乙酸的生成热力学上不利于草酰乙酸的生成柠檬酸柠檬酸顺乌头酸顺乌头酸异柠檬酸异柠檬酸-酮戊二酸酮戊二酸琥珀酰琥珀酰-coa-coa琥珀酸琥珀酸延胡索酸延胡索酸苹果酸苹果酸草酰乙酸草酰乙酸乙酰乙酰coacoa苹果酸脱氢酶苹果酸脱氢酶延胡索酸酶延胡索酸酶琥珀酸脱氢酶琥珀酸脱氢酶琥珀酸硫激酶琥珀酸硫激酶-酮戊二酸脱氢酶系酮戊二酸脱氢酶系异柠檬酸脱氢酶异柠檬酸脱氢酶顺乌头酸酶顺乌头酸酶柠檬酸合成酶柠檬酸合成酶顺乌头酸酶顺乌头酸酶三、柠檬酸循环的总结三、柠檬酸循环的总结1、总反应、总反应2、乙酰、乙酰coa碳原子

17、去向碳原子去向tcatca中乙酰中乙酰coacoa中中c c原子的命运原子的命运 羰基碳羰基碳在循环的在循环的第二轮的第第二轮的第3 3、4 4步步分别脱去分别脱去 甲基碳甲基碳在第在第1 1轮随轮随机保留在琥珀酸的中机保留在琥珀酸的中间两个间两个c c上，第上，第2 2轮随轮随机保留在琥珀酸的机保留在琥珀酸的4 4个个c c上，此后每轮循上，此后每轮循环消去环消去5050tcatca中乙酰中乙酰coacoa中中c c原子的命运原子的命运异柠檬酸异柠檬酸-酮戊二酸酮戊二酸柠檬酸柠檬酸琥珀酸琥珀酸琥珀酰琥珀酰-coa-coa延胡索酸延胡索酸苹果酸苹果酸草酰乙酸草酰乙酸乙酰乙酰coacoa3 3、

18、柠檬酸循环中生成的产物（、柠檬酸循环中生成的产物（nadhnadh、fadhfadh2 2、coco2 2、gtp/atpgtp/atp）products of one turn of the citric acid cycle四、柠檬酸循环的生物学意义四、柠檬酸循环的生物学意义1 1、提供能量、提供能量葡萄糖的有氧代谢葡萄糖的有氧代谢the aerobic metabolism of glucosethe aerobic metabolism of glucose糖酵解糖酵解2乙酰乙酰coa2 2、tcatca是绝大多数生物体主要的分解代谢途径是绝大多数生物体主要的分解代谢途径3 3、双向（、双向（合成合成和分解）功能和分解）功能三羧酸循环是糖、脂和蛋白质等物质代谢和转化的枢纽三羧酸循环是糖、脂和蛋白质等物质代谢和转化的枢纽tca在合成代谢中的作用在合成代谢中的作用柠檬酸柠檬酸-酮戊二酸酮戊二酸琥珀酰琥珀酰-coa-coa草酰乙酸草酰乙