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文档简介
1、生物化学第1页/共42页第十四章 RNA的合成:转录和加工 DNA的转录 转录后加工 逆转录第2页/共42页DNA的转录 转录transcription:指遗传信息从DNA转移到RNA的过程,即以DNA为模板,由依赖DNA的RNA聚合酶催化RNA合成的过程。第3页/共42页 参与转录的各因素:1. 依赖DNA的RNA聚合酶:作用特点:(1)以4种核糖核苷三磷酸作为底物,反应需要Mg2的参与(2)需要适当的DNA作为模板(3)合成的RNA链方向也为53(4)反应无需引物,直接以DNA为模板合成新的RNA链(5)RNA聚合酶无校对功能第4页/共42页依赖DNA的RNA聚合酶催化的转录是不对称的:在
2、体内转录过程中,DNA双链中只有一条链或者某个区段作为模板进行转录。参与转录的DNA链被称为模板链(反义链),而另一条链则被称为编码链(正义链)。RNA含有与编码链几乎完全相同的碱基序列,除了以U代替T以外。第5页/共42页 RNA聚合酶:含有2 亚基,其中2 构成核心酶,负责转录过程中RNA链的延伸。起始亚基,为转录起始所必需功能未知第6页/共42页 RNA聚合酶的三维构像图第7页/共42页2. 转录单位:RNA链的合成是从模板特定的部位起始的,经过链的延伸终止于特定的模板部位。一般将从转录起始点到转录终止点的整个区域称为转录单位。参与转录的各因素:第8页/共42页参与转录的各因素:3. 启
3、动子结构:启动子是指RNA聚合酶识别、结合并由此启动转录的一段DNA序列,位于转录起点的5端上游区,启动子本身一般是不被转录的。E. Coli 中的两个启动子序列:-10序列(Pribnow框):TATAAT-35序列(识别序列):TTGACA第9页/共42页E. Coli 中不同基因的启动子序列-10序列(Pribnow框)-35序列(识别序列)-35序列(识别序列)第10页/共42页转录的起始第11页/共42页 原核生物转录的过程:1. 模板的识别和转录泡的形成: 亚基第12页/共42页转录泡结构RNA聚合酶模板链非模板链第13页/共42页 原核生物转录的过程: 2. 转录的起始: RNA
4、聚合酶到达转录起始点,开始催化核苷三磷酸按照模板链上的碱基顺序合成RNA。此时亚基从全酶上脱离下来,解离后的亚基再与另一个核心酶组成全酶开始下一轮转录。 3. RNA链的延伸:转录泡延着模板链3 5方向不断移动,转录泡内RNA链的5端方向1012个核苷酸始终与模板链形成杂合体。 4. 转录的终止:当RNA聚合酶达到终止子时,RNA转录将终止第14页/共42页转录的进行第15页/共42页终止子:具有终止功能的特定的DNA序列,为RNA聚合酶提供终止转录信号的DNA序列。(1)不依赖于因子的终止子:含有一个或多个富含GC的回文对称序列;含有一个多聚的A或T序列在回文序列后。AGCCCGCCTAAT
5、GGCGGGCTTCGGGCGGATTACCGCCCGAAGCCCGCCUAAUGGCGGGCU第16页/共42页转录的终止第17页/共42页不依赖于因子的转录终止第18页/共42页(2)依赖于因子的终止子:这类终止子必须在因子存在下转录才发生终止。这类终止子的回文结构中不含GC富集区,回文结构后也无寡聚U。因子:一种相对分子量约为45kD的蛋白质因子,起协助终止的作用。第19页/共42页依赖于因子的转录终止第20页/共42页真核生物的转录:真核生物含有三种RNA聚合酶,根据它们对于-鹅膏蕈碱 敏感度的不同,分为RNA聚合酶、。真核生物的RNA聚合酶不能直接识别启动子起始转录,必须在其他的转录
6、因子的帮助下开始转录。真核生物DNA含有复杂的转录调控结构第21页/共42页真核生物三种RNA聚合酶的比较第22页/共42页转录后加工 在体内,尤其是真核生物体内,由DNA直接转录合成的RNA大多数要经过一系列的后加工才能生成成熟的RNA的过程,称为转录后加工。第23页/共42页 原核生物体内的RNA后加工:原核生物的mRNA通常一经转录即进行翻译,大多不进行转录后加工。但tRNA和rRNA都要在转录后经过一系列加工才能成为有功能的分子。第24页/共42页原核生物中rRNA前体的加工:E. Coli 中rRNA 有7个转录单位,每个转录单位由16s rRNA、23s rRNA、5s rRNA以
7、及一个或几个tRNA基因组成。第25页/共42页 真核生物体内RNA的转录后加工:真核生物体内的tRNA和rRNA和原核生物有些类似,但真核生物的mRNA前体必须经过复杂的加工过程。第26页/共42页1. 真核生物中rRNA前体的加工:哺乳动物的rRNA 前体约为45S,在细胞核中加工最后形成18S、28S和5.8S rRNA.第27页/共42页2. 真核生物中tRNA前体的加工:通过核酸内切酶和外切酶去除5及3端的附加序列;在3端加上CCA序列;核苷的修饰第28页/共42页3. 真核生物中mRNA前体的加工:在细胞核内,mRNA的初始转录物被加工为分子大小不等的中间产物,称为核不均一RNA
8、(hnRNA)。 hnRNA在转变为成熟的mRNA的过程中,需经以下的进一步加工:(1) 5端加“帽”:真核生物mRNA 5端“帽”结构5,5-三磷酸键7-甲基鸟苷第29页/共42页真核生物mRNA 5端“帽”结构第30页/共42页真核生物mRNA 5端加“帽”过程鸟苷酰转移酶磷酸水解酶鸟嘌呤-7-甲基转移酶2-O-甲基转移酶第31页/共42页(2) 3端加polyA 尾:AAUAAA:最主要的polyA信号Poly A聚合酶内切酶第32页/共42页(3) 内含子的剪切:大多数真核基因是断裂基因,其转录产物中同时含有内含子(插入序列)和外显子(编码序列)。在mRNA的后加工过程中,将通过拼接(splicing)去除内含子,使外显子成为连续序列。第33页/共42页真核生物的mRNA剪切外显子内含子第34页/共42页初级转录物中间体剪接的RNA内含子外显子真核生物的mRNA剪切模式(1)第35页/共42页2,5-磷酸二酯键真核生物的mRNA剪切模式(2)第36页/共42页相同的转录产物,不同的剪接方式,最终可生成不同的蛋白质降钙素甲状腺脑降钙素基因相关肽 第37页/共42页真核生物mRNA剪切举例卵清蛋白第38页/共42页逆转录 逆转录:是指以RNA为模板合成DNA的过程。,催化逆转录反应的酶称为逆转录酶,也称为RNA指导的DNA
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