肠道定植和血流感染肠杆菌科细菌的流行病学分析

1、肠道定植和血流感染肠杆菌科细菌的流行病学分析目的：了解养老院居住者肠道定植产超广谱B-内酰胺酶(Extended-spectrum B -lactamase,ESBLs)肠杆菌科细菌的发生率和耐药性,并 从居住者个人、医护人员和养老院机构三个层面确定定植危险因素 ; 了解瑞金医 院 2021 年住院患者血培养别离病原体种类和耐药性, 在此根底上对 2021-2021年该院别离的引起血流感染 (Bloodstream infections,BSI) 大肠埃希菌的耐药 性和分子流行病学特征进行分析 , 进而为临床合理使用抗菌药物、防控医院获得 性血流感染和耐药菌的播散提供科学依据。方法:1)以VI

2、TEK2Compact全自动微生物分析系统鉴定细菌作为参考方法 , 建立联合应用科玛嘉定位显色培养基、吲 哚试验、鸟氨酸脱羧酶试验、 赖氨酸脱羧酶试验鉴定常见氧化酶阴性革兰阴性杆 菌的方法并进行评估 ;2) 收集上海市 7 家养老机构居住者的肛拭标本和临床病历 资料, 对别离出的肠杆菌科细菌菌株采用上述方法进行鉴定 , 纸片扩散法进行药 敏试验,聚合酶链式反响(Polymerase chain reaction,PCR)扩增编码ESBLs和碳 青霉烯酶的基因 , 应用统计学软件从居住者个人、医护人员、机构水平三个层面 对所有可能的变量进行分析并确定产ESBLs菌株定植的危险因素；3)收集瑞金医

3、院 2021年 1 月 1 日-12 月 31 日住院患者送检所有血培养标本的菌株信息和患者 信息以分析阳性检出率、病原体分布、科室分布、患者特征和耐药性 ；4) 收集瑞 金医院 2021 年 6月-2021 年 6 月引起血流感染最常见的大肠埃希菌菌株 , 纸片扩 散法进行药敏试验 ,pcr 扩增编码 esbls 和碳青霉烯酶的基因、系统发生群基因 和多位点序列分型 (multi-locussequencetyping,mlst) 基因 , 并采用软件 eburst 对序列型 (sequencetype,st) 进行分析以探究菌株间的同源性。结果:1) 采用本次研究所建立的以显色培养基联合简

4、单生化反响的鉴定方案 对8个属 10个种共 318株菌的鉴定结果说明 ,与 vitek2compact 全自动微生物分 析系统鉴定结果相比 , 这 10 个菌种鉴定的特异性均大于 90%,灵敏度为 75%100%; 一致性分析说明除弗劳地枸橼酸杆菌的 kappa 值为 0.5947 外, 其余均大于 0.85;mcnemar 检验 p 值均大于 0.05; 该鉴定法本钱只有参考方法的 10%;2)390 位养老院居住者共别离到457株肠杆菌科细菌,其中183(46.92%)株产esbls;大 肠埃希菌 (365,79.87%) 、奇异变形杆菌 (40,8.75%) 和肺炎克雷伯杆菌 (24,5

5、.25%) 是最常见的菌种；ctx-m是最常见的B -内酰胺酶(198,99.00%),其中 ctx-m-14(84,42.00%) 的比例最高;两株产碳青霉烯酶的肺炎克雷伯杆菌别离自 同一家养老院 , 均携带 blakpc-2 且均为 st11; 别离菌对碳青霉烯类、 tzp,ak,fos,cl 和 tgc 的耐药率低 ; 侵入性医疗操作 (or=3.112,95%ci1.725-5.615,p=0.000) 、喹诺酮使用史 (or=1.808,95%ci1.047-3.121,p=0.034) 和每周洗澡次数 (or=1.959,95%ci1.163-3.302,p=0.012) 是肠道定

6、植产 esbls 肠杆菌科细菌的独 立相关变量;3)2021 年瑞金医院 5546例住院患者送检血培养标本 16428份,血培 养阳性者384例，阳性率为6.92%;检出病原体398株，其中革兰阴性(g-)菌272 株(68.34%),革兰阳性(g+)菌94株(23.62%),真菌32株(8.04%);6180岁患者阳 性率(8.26%)最高,送检阳性率居前 5位的科室分别是灼伤整形科、 中医科、心外 监护病区、移植病区和创伤外科；g+球菌对va、tec、Izd保持高敏感率，发现1 株耐万古霉素屎肠球菌 ;g- 杆菌中肠杆菌科细菌对 ak 和碳青霉烯类药物敏感率 高, 肠杆菌科细菌、鲍曼不动杆

7、菌、铜绿假单胞菌对碳青霉烯类药物的耐药率分 别为 7.51%、 70.97%、 35.90%;4)2021 年6月至 2021年6月共连续收集到引起血流感染大肠埃希菌128株,其中80株产esbls,未发现产碳青霉烯酶菌株；别离株 对ak,tzp和碳青霉烯类抗生素保持高敏感率；ctx-m-14(40/80)是最常见的B -内酰胺酶,其次是ctx-m-55(17/80)和ctx-m-15(14/80);b2 群是最常见的系统发 生群，但是在产esbls菌株中d群的比例最高；共检测到49个序列型，分为6个非 重复的进化组或克隆复合物以及 33个单体, 其中 st131(17/128) 是最常见的序

8、列 型, 其次是 st69(12/128) 和 st648(10/128) 。结论:1) 显色培养基联合简单生化试 验可快速经济有效地鉴定数种常见氧化酶阴性革兰阴性杆菌 ;2) 养老院居住者每 周的洗澡次数、侵入性医疗操作史和喹诺酮类抗生素使用史是产ESBLs肠杆菌科细菌肠道定植的独立相关变量 , 抗生素的合理使用、遵循无菌操作和护理原那么、 注意养老院居住者的个人卫生是控制耐药菌在养老机构播散的重要措施 ;3) 瑞金 医院血流感染病原体以G-菌为主,老年患者血培养阳性率咼，引起血流感染大肠 埃希菌的同源性低,不存在产ESBLs菌株的院内克隆传播；4)养老院居住者肠道 产ESBLs肠杆菌科细菌的定植率和瑞金医院血流感染产ESBLs大肠埃希菌的发