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文档简介

1、蛋白灰度分析 蛋白灰度分析软件 蛋白灰度分析软件有：Image-Pro Plus，Quantity One，Image J 等 （1）Image-Pro Plus 综合性能最好，操作简便结果可靠！因为它有 强大的IOD 算法，能准确反应蛋白灰度但需要靠魔棒或轨迹法选 取目的蛋白区域，有一定的主观性主观性，不过蛋白灰度测定本身就是半 定量分析-测量值本身就没有一定标准，不同软件测量值不同， 即使相同软件重复测量数值也不一定相同，因此只要测定数值能反 应目的蛋白变化趋势，测量值相对偏差不大即可 （2 2） Quantity Quantity One One ：有泳道-轨迹测定法， 等高线/手绘选取

2、目的区域测定法等方法 .泳道-轨迹测定法：先剔除一系列背景，再选择泳道（lane）， 然后分析条带（band）,最后使用高斯建模得出灰度分析值 （Gauss Model trace）特点：感觉比较科学，重复性好，但十分 繁琐，而且有时不能正确反应灰度。 .等高线-手绘选取目的区域测定法：通过等高线或手绘选取目 的蛋白区域，最简便，但重复性不太好。 （3）Image J 最坑爹，它用魔棒选取区域 测定灰度，可是有时很难选中所需区域， 而且方法繁琐，不推荐！ Image-Pro Plus Image-Pro Plus 分析蛋白灰度教程 说明：目的蛋白的灰度=目的蛋白IOD 值/ 相应内参IOD 值

3、 1. 使用Photoshop 剪切出目的区域（只含western bolt 条带，如 图），保存为TIFF 格式文件。 2. Image-Pro Plus 2. Image-Pro Plus 打开文件，剔除背景： （1） 放大镜放大目的区域 （2 2） Measure-calibration-intensity-options-image,Measure-calibration-intensity-options-image,选 择背景最大value value 值-ok-ok-system-close-ok-ok-system-close （3 3）Measure-count/size-m

4、easure-select measurementsMeasure-count/size-measure-select measurements，选择IOD IOD 为测量值， 调整结果显示方式：Options-label style Options-label style 改为mesurementmesurement，选择IOD IOD 为显示值。 （4）接下来有2 种方法选择目的蛋白区域（即找出AOI， area of interest, IPP 核心元件）：魔棒和手绘轨迹法。 （5）count/size-edit-convert AOI to object-得出 IOD 值 （6）若测下一条带，则点NEW AOI 按钮，再按以上方

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