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文档简介
1、实验二 总 RNA 的提取和检测 实验目的 1. 掌握从动物组织细胞中提取总 RNA勺方法; 2. 熟悉紫外吸收法检测RNA浓度与纯度的原理及测定方法; 3. 掌握RNA琼脂糖凝胶电泳方法并分析总 RNA勺电泳图谱; 实验原理 (一)概述 1. 10 -5 yg RNA/细胞含有 rRNA 80-85% 28S 18S 5S tRNA, snRNA 10-15% mRNA 1-5% 2. mRNA 3端存在 20-250 个多聚腺苷酸 (polyA) 结构,可用 oligo(dT) 亲和层 析柱分离mRNA 分离勺方法: 异硫氰酸胍氯化铯超速离心法, 盐酸胍 - 有机溶剂法, 氯化锂 - 尿素
2、 法,蛋白酶K-细胞质RNA提取法、异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法等。 4. 目前常用勺是 Trizol 法。 (二)Trizol 勺主要成分 是一种新型总RNA抽提试剂,主要成分是异硫氰酸胍和苯酚。异硫氰酸胍属于 解偶剂,是一类强力勺蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,其主要作用是裂解细胞, 使细胞中勺蛋白 / 核酸物质解聚得到释放。 2. 酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中 还加入了 8-羟基喹啉、B -巯基乙醇等来抑制内源和外源 RNase 3. 溶解组织细胞的混合物在氯仿作用下溶液分为水相和有机相,RNA在上层水相 中。 4. 取出水相用异丙醇沉淀可回收RN
3、A用乙醇沉淀中间层可回收DNA (三)总RNA的纯度检测原理: 不同波长的单色光通过溶液时其光的能量就会被不同程度的吸收, 光能量被 吸收的程度和物质的浓度有一定的比例关系。RNA在 260nm紫外光波长处有最大 的吸收峰。 因此,可以用260nm波长分光测定RNA浓度,0D值为1相当于大约40卩g/mL 的单链RNA用PH=的TE (tris HCI缓冲液)稀释RNA羊品n倍并以TE为空白 对照,根据此时读出的 0D 260 值即可计算出样品稀释前的浓度 : RNA (mg/mL) = 40 x OD 260 读数 X 稀释倍数(n)/1000 实验步骤 (一)羊品处理与 TrizoI 用量
4、 1. 提取组织RNA寸,每50100mg组织(即XX ,约合)用1ml Trizol试剂对组 织进行裂解; 2. 悬浮细胞先离心沉淀,每 5-10 X 106 个细胞加 1mL Trizol 后,反复用枪吹打 或剧烈振荡以裂解细胞。 3. 培养贴壁细胞不须消化,可直接用 Trizol 进行消化、裂解, Trizol 体积按 10cm2/mL比例加入。(注意:匀浆一定要彻底,是提取高质量 RNA勺前提;细胞 数量与 Trizol 的比例,细胞的数量不能过多。 ) (二)操作步骤 1. 细胞中加入 1 mLTrizol 用移液枪反复吹吸直无明显沉淀后,室温放置 5min, 使其充分裂解。(注意:
5、此时可放入-70 C长期保持) 2. 按200卩L氯仿/mL Trizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置 2-3min。(注意: 此步一定要振荡混匀,使氯仿和 Trizol 不分层 ) 3. 4 C 12,000g 离心 5-10min 。羊品分为三层:底层为黄色(红或绿)有机相, 上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用Trizol 试剂的 60。 4. 吸取上层水相,至另一新的离心管中。一般 400-450卩L就足够了,千万不要 贪多!(注:千万不要吸取中间界面) 5. 加入与水相等体积异丙醇后,上下颠倒混匀,4C放置5 min。 C 12,000g 离心 10 mi
6、n ,弃上清,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。 8. 加入 1 mL 75%乙醇,(在沉淀对面管壁加入,切勿触及沉淀! )盖紧盖子后, 温和转离心管 1 周,充分润洗管壁。 C 12,000g 离心 5 min ,尽量弃上清。 10.室温晾干或真空干燥5 min。(注:RNA羊品不要过于干燥,否则很难溶解) 11.加入适量冰冷无RNase的PEPC水 (一般10 -20卩L),充分震荡混匀,瞬时 离心,备用。 (三)检测步骤 1. 将提取的RNA按1: 20加入TE进行稀释 2. 稀释过后用分光光度仪进行检测,先使用 TE行进校对,空白对照,所有样品 要先润洗三次之后,再加入50卩L样液进行检测 3.
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