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文档简介
1、。NCBI 序列提交方法NCBI 提交序列有两大类方式,一个是批量提交一个是单个序列提交。下面说的就是单个序列提交方式, 这是最新的提交方式 ,由于 NCBI 更新很快,也许过段时间又不一样了,主要是按钮位置可能会变。首先要注册一个自己的NCBI 账号:点击此处注册然后登陆账号:在已登陆状态下点击Submit:点击图中标记处选择GengBank:。1。点击 GO:选择: Banklt :。2。建议认真阅读填写要求等:点击Sign in to use Banklt点击 New Sub, 下面是你提交的记录,即使你提交过程中中断了,也可以Continue!。3。以下是具体提交过程:一 . 填写基本
2、信息二1.图中 1 是作者名字,可以添加作者名, First 和 Last Name ,填了就可以,其他可以不填。2. 图中 2 是填是否出版,有三个选项:未出版,正在出版,已经出版。需要注意的是,如果选则未出版, 需要在 Title 中注明,否则无法提交 。3. 可以添加作者,然后 Continue 即可。4。三. 这是选择是用生么测序方法后的的序列1. 现在我们用的一次只能测一条序列的都是 Sanger 测序,下面的 454 等都代表仪器型号,是我们现在说的高通量测序,简单的书不同型号灵敏度不同。2. 这是选择你测序是一个反应还是几个反应,就是你这条序列是一个测序结果就出来了,还是几个测序
3、结果拼在一起得到的结果,一代测序一个反应最可信的测序范围是 50-750bp, 根据实际选择,然后继续。四填写序列信息:1. 选择什么时候公布你的序列信息, 你可以选怎立刻, 也可以选择在以后的某一时间, 如果你选择了时间, 那么即使你已经上传序列, 有了序列号,在时间未到的时候你也是找不到的。2. 选择你的序列是不是 16SrRNA基因是细菌上编码 rRNA相对应的 DNA序列 , 可能有一个专门的库,所以一般选择 NO3. 选择你的序列类型, 1. 我选了 cDNA , 然后选择是什么类型:是线性,我们一般的都是线状的,还是环状一般想线粒体,叶绿体或者各种质粒都是现状的。5。4. 然后填写
4、你上传了多少个序列,黏贴序列, 注意序列一定要是FASTA格式。 你也可以选择上传文档,这个自己学。然后继续两次继续。五填写你上传序列所属物种。然后即使继续。6。六选择你要你的序列式原始序列,就是你自己测序的序列,还是为已有序列做注释。然后继续。七序列信息1. 填写你基因所属细胞器2. 填写你对基因的注释,可以添加选项,根据自己实际情况添加。3. 最下面可以添加你的 PCR引物,然后继续,会让你检查,你检查后继续即可。7。八信息补充1. 填加序列信息,可以上传文件,也可以选项填写,建议用选项。2. 选择你的信息,可以添加,然后继续在上图中选择添加选项,会让你填写模板是正链还是负链,如果是部分序列,是哪一端,产物是指你把序列通过 BlastP 比对后的到的序列号( qualifiers )和相似度 (Value), 然后 Accept 。跳转后然后继续。8。九最后会让你最终检查你的信息和再次确认你有没有要求,如果没有问题,就Finish 。我是随便找的序列,不能提交的所以没法显
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