预防医学]15 第十五章常用医学统计软件简介.ppt

1、第十五章 常用医学统计软件简介,预防医学,第一节 EpiData 3.02软件简介,一、EpiData的基础知识,EpiData由三种基本文件组成： QES文件 （调查表文件），它的作用是定义调查表（问卷）的结构。 REC文件 （数据文件），它包括数据以及已经定义好的编码。 CHK文件 （数据录入核查文件），数据输入字段的有效性规则。 字段：每个字段就是我们临床观察表中的一个小项目。 它包括：1.字段的名称； 2.字段的文本描述； 3.字段的数据变量。,二、EpiData运行界面介绍,运行EpiData.exe会出现程序运行界面（图15-1） 图15-1 EpiData3.02软件主界面,二、

2、EpiData运行界面介绍,第一行：EpiData菜单栏 1.文件；2.数据核对；3.数据输入/输出；4.其他功能； 5.工具； 6.窗口设置； 7.帮助。 第二行：EpiData工作过程工具栏 1.建立调查表文件；2.生成数据文件； 3.添加核对命令；4.数据录入； 5.其他功能；6.数据输出。 第三行：EpiData常用的几个快捷工具按钮,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-2 需要建立数据库的原调查表示意图,1.打开原始的调查表（见图15-2）。,（一）建立调查表文件 点击“建立调查表文件”按钮，选择“建立新调查表文件”。,图15-3 选择字段类型,2.根据原始表格在Epi

3、Data输入相关内容。在“姓名”之后，点击“选择字段类型”按钮，在选项卡片之中选择“文本”，设置为文本，长度8个字节（注意一个汉字的长度需要2个字节），点击“插入”按钮（图15-3）。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-4 产生qes调查表,3.依此类推将其他观察指标进行输入并保存（图15-4）。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-5 输入数据库电子表,4.点击数据表预览按钮（图15-5）。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-6 脑血管病人血脂调查表.REC,（二）建立数据文件 建立.REC文件。点击“生成数据文件”按钮，选择“生成数据文件”，

4、生成 “脑血管病人血脂调查表.REC”文件（图15-6）。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-7 自动提醒自动保存数据库对话框,点击“输入数据”按钮，打开“脑血管病人血脂调查表.REC”文件，将数据输入表格，录入完整后，软件会自动提醒进行保存（图15-7），确认保存之后就可以输入下一张表格的数据了。,（三）数据录入,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-8 输出的文本类型数据库,点击“数据输出”按钮，选择“脑血管病人血脂调查表.REC”文件。,（四）数据输出,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-9 输出的Excel数据库,三、使用EpiData建立临床

5、数据录入表,Epidata提供了对字段的进一步设置功能。点击工作过程工具条中“添加核对命令”按钮，仍旧选择“脑血管病人血脂调查表.REC”这个数据文件，同样会出现我们作好的电子表格，这时软件也会自动生成同名的.CHK文件，同时会有一个数据核对窗口（如图15-10）。,（五）优化数据表,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-10 数据核对数据库窗口,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-11 逻辑值设置窗口,1.Rang，Legal：是定义一个字段的数字范围及合理数。 例如，我们对“年龄”字段进行设置，输入“50-85”（ 图15-11)。,三、使用EpiData建立临床

6、数据录入表,Jump：跳转命令。 Must enter：如果当前字段必须输入数据，则需要使用这个规则，选择Yes。Epidata的默认选择为No。 Repeat：如果在编辑表中Repeat选择项中选择“Yes”则前一个记录中的该字段值将自动出现在下一个记录的该字段中。 Value label：是将一组具有解释数值意义的文本与数值结合。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,图15-13 编辑数据标签窗口,例如，我们对“职业”这个 字段进行设置(图15-13）。,图15-14 选择数值窗口,当录入职业时，按F9键，这时会 弹出一张转换表，如下（图15-14）。,三、使用EpiData建立临床

7、数据录入表,图15-15 数据核查结果,为了保证数据录入的可靠性，我们可以让两个人分别输入同样的一 组调查表数据，Epidata提供了对两个相同数据文件的检查功能。,三、使用EpiData建立临床数据录入表,（六）如何核查数据文件,第二节 SPSS10.01社会医学统计软件包,一、SPSS10.01主要的功能窗口,SPSS10.01主要有3大窗口：,数据编辑窗口（Data Editor） 结果输出窗口（Viewer） 语句编辑窗口（Syntax Editor）,一、SPSS10.01主要的功能窗口,图15-16 SPSS主界面窗口,整个数据编辑窗口分为标题栏、菜单栏、工具栏、编辑栏、内容区和

8、状态栏。SPSS程序很大，命令和功能也很多，我们主要介绍菜单栏上 的10个菜单命令。（见图15-16）,（一）SPSS数据编辑窗口,一、SPSS10.01主要的功能窗口,SPSS输出窗口是用于展示SPSS的统计分析结果。其菜单命令与数据编辑窗口相似，只是减少了几个菜单项，而另加了一个Insert菜单项，在图形编辑窗口中，可以作图形转换,可存为.spo为后缀的文件。,（二） SPSS输出窗口,一、SPSS10.01主要的功能窗口,在语句编辑窗口，SPSS过程以命令语句形式出现。该窗口还可以编辑对话框操作不能实现的特殊过程的命令语句。窗口中所有的命令语句最终形成一个命令语句文件，可存为.sps为后

9、缀的文件。,（三） SPSS语句编辑窗口,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.统计描述： Analyze Descriptive Statistics Frequencies Descriptives Explore Analyze Compare Means Means 这里只简单介绍Frequencies过程和Descriptives过程。,（一）数值变量资料的统计分析,图15-17 描述统计量结果,1）结果如下：,（1）频数分析（Frequencies）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-18 直方图,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,2）对资料进行分组：Trans

10、form Recode Into same Variables 3）对已分组资料进行频数分析步骤： 输入各组组中值x和频数f；对变量值进行加权，进行Weight cases过程；进行Frequency过程，此步同原始数据资料的操作。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Descriptives对话框（图15-19） Options对话框（图15-20）,（2）描述统计（Descriptives）,图15-21 描述性统计量显示,结果如下：显示描述统计量（见图15-21）。,（2）描述统计（Descriptives）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,

11、Analyze Compare Means One-samples T Test Independent-samples T Test Paired-samples T Test One-way ANOVA Analyze General Linear Model Univariate,2.统计推断,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例：有83例患者的血小板资料，问患者的血小板与正常人的平均值150(109/L)有无统计学意义，同时估计患者血小板的可信区间。 步骤： 1）Analyze Compare Means One-samples T Test，打开对话框； 2）把变量血小板转到右边

12、的“Test Variables”栏中（见图15-22、15-23）；,（1）单样本t检验（One-Samples T Test）,2.统计推断,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,t检验对话框（图15-22） Options对话框（图15-23）,图15-24 单样本t检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有一个189例患者的临床资料，问不同性别之间的收缩压(bp1)、舒张压(bp2)分别是否相同？ 步骤： 1）Analyze Compare Means Independent-samples T Test；把变量bp1、bp2转到 “T

13、est Variables”栏中； 2）把变量sex转到 “Grouping Variable”栏中，激活“Define Groups”对话框，定义两组的两个值，然后单击ok按钮,返回；（见图15-27 ）,2.统计推断 (2)成组设计两样本t检验（Independent-samples T Test）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-27 两独立样本t检验对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-28 两独立样本t检验描述性统计量,3）检验；单击“OK”按钮即可。结果如下：,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-29 两独立样本t检验结果,二、主要统计方法的

14、软件实现及结果解释,结果显示：收缩压和舒张压的方差齐性检验的F值分别为0.092和1.118，说明方差齐，收缩压P=0.0150.05，不同性别间差异有显著性；但不同性别的舒张压差异无显著性，P=0.0570.05。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有20名患者，按性别和年龄配成10对，随机分到两组，一组服用新药，另一组服用安慰剂，然后观察某实验指标，问新药和安慰剂的疗效有无差别？,2.统计推断 （3）配对t检验（Paired-samples T Test）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-30 配对比较t检验,分析步骤如下： Analyze Compare Means

15、 Paired-samples T Test，打开对话框； 从左侧同时选中两个成对变量，转到 “Paired Variables”栏中； t检验对话框结果类似单样本t检验，P=0.1580.05，尚不能说明新药和安慰剂的疗效不同。结果见图15-30。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有一个189例患者的临床资料，问不同意识程度之间的收缩压(bp1)、舒张压(bp2)分别是否相同？ 分析步骤如下： Analyze Compare Means One-way ANOVA，打开对话框； 把变量bp1、bp2转到 “Dependent List”栏；,2.统计推断 （4）单因素方差分析（On

16、e-way ANOVA）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,把变量意识程度转到 “Factor”栏中； 单击“Contrasts”按钮，激活对话框，选择“Polynomial”，单击“Continue”按钮返回； 单击“Post Hoc”按钮，激活对话框，若方差齐时选择Bonferroni两两比较方法，方差不齐时选择Tamhanes T2方法，单击“Continue”按钮返回； 单击“Options”按钮，激活对话框，选择Descriptive和Homogeneity-of-variance选项，单击“Continue”按钮返回； 单击“OK”即可。（具体见图15-31、15-32、15-

17、33）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图 15-31 单因素方差分析对话框 图15-32 Contrasts对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,结果如下：包括各组变量值的描述统计（图15-34）；方差齐性检验（图15-35）； 从方差分析表中可知，不同意识程度之间的收缩压、舒张压相等，P分别为0.922、0.108，均0.05；两两比较表省略。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-34 一般描述性统计量,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-35 方差齐性检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如16只家兔按种属分成4个区组，每个区组中的4只家兔分

18、别在不同室温下（5、10、15、20度）测血糖浓度，问不同室温下家兔的血糖浓度是否相同？ 步骤： Analyze General Linear Model Univariate，打开对话框； 从左侧选中变量“血糖浓度”转到“Dependent Variable”栏中，处理因素选入“Fixed Factor”栏中，区组因素选入“Random Factor”栏中；单击“OK”即可。见图15-36,2.统计推断 （5）随机区组设计的方差分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-36 Univariate对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-37（双因素设计方差分析结果）,结

19、果表明不同室温下家兔的血糖浓度不相同。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.统计描述： Analyze Descriptive Statistics Frequencies Crosstables 频数分析（Frequencies） 可产生频数表，计算构成比；也可以绘出条图或圆图。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例：有一组临床病人的资料，观察性别和意识程度情况。 步骤： （1）Analyze Descriptive Statistics Frequencies，打开对话框； （2）从左侧选中性别和意识程度两变量，转到“Variables”栏中； （3）单

20、击“Charts”按钮，打开对话框，选中Bar Charts或Pie Charts选项，单击“Continue”返回后，单击“OK”即可（见图15-38、图15-39和图15-40）。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-38 Frequencies对话框,（二）分类资料的统计分析,图15-40 Charts对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-39 format 对话框,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-41 分类资料描述统计量,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-4

21、2 分类变量直条图,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,列联表分析（Crosstables）可产生四格表、RC表，计算率或构成比；同时进行2检验。 2检验在SPSS中的过程：,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-43 分类频数表资料数据库结构,在数据编辑窗口中确定行变量、列变量、频数变量（图15-43）；,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,必须指定频数变量，Data Weight Cases，前面已阐述过； Analyze Descriptive Statistics Crosstables，打开对话框，把行变量和列变量分别从

22、左侧转到右侧的Rows和Columns栏中； 单击“Statistics”按钮，激活对话框，根据不同资料、不同的研究目的，在对话框中选入不同的分析指标，然后单击“Continue”返回后，单击“OK”即可。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-44 卡方检验主要对话框,如何在Statistics对话框中选入不同的分析指标（图15-44）：,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,下面结果里2=26.066，P=0.000，表明不同喂养方式的婴儿腹泻发生率不同。具体结果见图15-45,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-45

23、卡方检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Analyze菜单 Nonparametric Tests Two-Independent-Samples Tests Tests for Several Independent Samples Two-Related-Samples Tests Tests for Several Related Samples,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.成组设计两样本均数比较的非参数检验（Two-Independent-Samples Tests） 如比较两种手术方案患者的生存日数间的比较，假设生存日数呈偏态分布。在“Te

24、st type”复选框组中选中最常用的“Mann-Whitney U”复选框（图15-46）。,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-46 成组比较秩和检验对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-47 两组比较秩和检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,2.配对设计两样本均数比较的非参数检验（Two-Related-Samples Tests） 在“Test type”复选框组中选中最常用的“Wilcoxon”复选框，即配对设计两样本均数比较的秩和检验。 结果如下： Wilcoxon Signed Ranks Test（图15-48）结果中P=0

25、.154，说明两种方法相同。,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-48 配对设计秩和检验结果,（三）非参数检验 2.配对设计两样本均数比较的非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,3.成组设计多样本均数比较的非参数检验（Tests for Several Independent Samples）和区组设计多样本均数比较的非参数检验（Tests for Several Related Samples） 它们的基本对话框分别如下，与方差分析中不同的是：它们不提供多重比较。（主要对话框见图15-49、15-50）,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-49 成组设计多样本秩和检验图 15-50 随机区组设计多样本秩和检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图15-51 完全随