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文档简介
1、 料推荐用 NTSYSpc 2.10e 制作聚类图(实例讲解)1. 在 EXCEL 表中 先建立一个 0, 1 构成的矩阵:按如下规则输入数据,A1=1 表示有带记为1,B1=38 表示 AFLP/SSR/RFLP有 38 个条带,C1=60表示样本数,D1=0 表示无带记为0。如图 ( 每个列为一个样本的条带情况) :2. 将 EXCEL数据复制粘贴到文本格式,命名保存sz2.txt。3. 打开 ntsys软件的, 将文本文件导入软件中:点 Similarity,选中 Qualitative data, input file栏导入保存的sz2.txt。在Output file栏输入 sz3
2、,点 Compute,会出现一个报告:4. 点 Clustering,选 SAHN, inputfile栏导入 sz3.NTS,Outputtreefile栏输入 sz4,1 料推荐点 Compute,又会出现一个报告:5. 点 Graphics,选 Tree plot, input file栏导入sz4.NTS,点 Compute,就出现一个报告和聚类图:2 料推荐因为默认设置显示样本数是30,需改变设置为60,点聚类图的Options,选 plot options,在Phenogram 中的 OTUs/page 栏改 30 为 60:点 OK, 全部样本的聚类图就出来了:点 File进行图片保存即可。注:F
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