2020年基础医学网络信息资源整合及应用论文

1、基础医学网络信息资源整合及应用论文基础医学在医药卫生领域起着举足轻重的作用。多年以来，我 国基础医学研宄在疑难病症的病因、 病理、病程发展等方面取得了卓 有成效的成果。 基础医学研宄离不开信息资源的支持。 目前网络中 积累的基础医学资源主要包括人体生理心理相关数据、 基因序列、 蛋 白质图谱、 可视人体图像等。 欧美一些发达国家医学信息网络化建设 起步较早，资源的网络化服务也比较成熟。像欧洲的 EMB、L 美国的 NCBI日本的DDBJ都建立了多个大型的基因数据库和蛋白质结构数 据库，实现数据的同步交换和更新， 成为基础医学研宄必需的资源获 取平台。我国基础医学资源较为分散，主要存储在不同的科

2、研单位， 多以小型专业数据库的形式为用户提供服务， 有各自的访问路径和查 询接口，服务方式和资源类型都较为单一。如何在这些广泛、类型不 同的资源之间建立联系， 满足用户全面的资源获取需求， 提高资源的 利用率和共享率，是我国基础医学研宄必须面对的一大问题 2 。目 前，解决这一问题的方法是实现基础医学资源整合。1 资源整合的意义1 。 1 为科研工作提供便利 中国医学科学院基础医学研究所，北京协和医学院流行病与 卫生统计学系 中国医学科学院基础医学研究所，北京协和医学院网絡中心 中国医学科学院基础医学研究所，北京协和医学院基础学院 病原生物学系分子寄生虫实验室北京 100005*基金项目：科技

3、部国家 科技基础条件平台科学数据共享工程重大项目。获取能力。基础医学资源整合提高了现有数据资源的利用率， 避免了科研的重复投资 1。2 为政府决策提供支持基础医学资源整合 可以让有关部门对我国基础医学科研现状整体把握， 能够更为科学地 判断基础医学研宄热点，实现科研资金的合理分配，提高科研效率。 通过对整合资源的系统分析，能够提高数据分析的质量 5 ，为我国 政府卫生管理政策的制定和卫生决策的实施提供更为有力的支持。1 。3加强基础医学资源管理目前基础医学数据资源呈现电子化、网络化、分布性、无序性 等特点这给资源有效管理和合理调配带来很大困难。 通过资源整合可 以有效地实现数据资源的统一管理，

4、实现科研成就的传承和利用。2 基础医学资源整合建设近年来，我国政府极为重视科学数据共享，己经将其作为一项 战略选择纳入国家科技基础条件平台建设。 基础医学科学数据共享网 （/。bmi。，以下简称“共享网”）作为国家科技基础条件平台建 设下医药卫生共享项目的子项目， 其主要目的就是实现我国网络环境 下的基础医学资源整合。 通过过去几年的不断建设， 共享网取得长足 的进步和广泛的影响， 使我国基础医学领域的资源整合取得了较为可 观的成效。1 资源整合的实现2 。1。1资源：共享网自xx年正式投入建设并对外公开发布以来，本着“边建设，边服务”的原则，得到全国范围内多家科研单位 和高等院校的支持和响应

5、。 目前共享网共整合了清华大学、 北京大学、 中科院生物物理所、北京华大基因、中国医学科学院、军事医学科学 院等10多家单位的25个数据库资源八根据数据内容的不同，共享网 将整合的 25个数据库分为以下 4类： 1）人群调查及人体数据资源包 括中国人生理常数数据库、 中国人心理状况数据库、 中国数字化可视 人体数据库、中国人群亚健康现状调查数据库及中国妇女和儿童营养 状况数据库、中国人群心血管健康研宄数据库共 6个八（2）分子机制 类数据资源包括非编码RNA数据库、神经突触数据库、人类肿瘤相关 抗原数据库、 人类肝脏蛋白质组表达谱数据库、 人类尿蛋白质数据库 等共 13个数据库。（3）模式生物

6、类数据资源包括动物模型基因组数 据库、基因组多态性图谱数据库、 模式生物基因组数据库和转录因子 数据库4个A（ 4）实验材料数据资源包括实验细胞数据库和遗传工程 小鼠品系基本表型数据库。2 。 1。 2整合技术：共享网采用门户技术（ Portal ）来实现资源整合。门户是一个应用框架，它能将各种应用系统、数据资源集成 到一个信息管理平台上， 并以统一的用户界面提供服务。 利用门户中 的内容管理系统（contentmanagementsystem，CMS将各个数据库整 合到共享平台中， 为用户提供一站式的资源浏览和检索系统， 避免了 信息冗余和查询重复， 提高信息获取效率。 共享网对整合的数据资

7、源 采用 Oracle 数据库进行管理，并用 WindowsServerxx 服务器对外提 供服务。2 。2资源整合管理 资源整合的关键是把好数据质量关。为保证资源质量，共享网 成立了专门的学术委员会， 聘请国内基础医学领域的院士、 专家担任 委员会成员，对申请加入共享网的数据资源从数据量、数据服务、数 据质量、科研成果等多个方面严格审查， 确保每个整合资源的科学性 和实用性。根据基础医学数据量大，数据类型多样的特点，共享网对整合 的数据资源采用元数据方式统一管理。元数据( metadata )是关于数 据的数据，是描述、定位、检索、利用、管理信息资源的结构化信息。 利用元数据对基础医学信息资

8、源进行开发和描述， 统一定义各种数据 资源的基本信息和功能，为用户使用提供方便。3 资源整合中的问题及对策3 。1资源整合中存在的问题3 。1。1数据标准不统一：由于基础医学资源类型多样，数据 编码和组织方式都差别较大， 数据管理没有统一的标准， 为资源整合 带来了很大的麻烦。3 。1。2资源管理不规范：有些基础医学资源涉及到保密性或 安全性等问题， 没有完善的管理办法对其进行合理规划， 并且资源整 合还面临资源所有权、 知识产权及个人隐私等问题， 给资源整合带来 不便。1。3 多数单位配合积极性不高：目前我国科学数据共享相关政策和法律法规尚不完善， 缺乏相应的补偿机制和激励机制， 致使 共享

9、积极性不高， 共享观念淡薄。 一些数据资源被视为个人或单位所 有，使得长期积累的数据资源无法实现更高的科学价值。3 。1。4数据分类和编码紊乱：基础医学研宄己经积累了大量 的科学数据， 但是这些科学数据资源缺乏系统化的归纳、 层次化的标 识和规范化的表达，缺乏统一的、可操作的资源调查、规划、设计与 描述，导致科学数据资源使用效率低。 数据格式的不同导致描述和管 理的差异，给资源整合带来困难。3 。1。5复合型人才匮乏：基础医学资源整合需要具备掌握基 础医学知识、 软件开发技术和资源管理方法的复合型人才。 而目前从 事资源整合工作的人员大多只具备单一领域的知识背景， 难以实现明 确的需求分析和充

10、分的知识交流。34 解决方案3 。2。1做好资源规划工作： 为了促进共享网资源整合有计划、 可持续发展，必须要加强领导和管理，统筹规划基础医学各类 资源的实质性整合， 加速从信息孤岛向实现信息高度共享和网络互联 的模式转换 8 。同时对网络中基础医学资源进行追踪考察，全程管 理，确保基础医学资源整合的远期效果 1 。3 。22制定标准和规范：标准化是实现资源共享的根本要求。没有统一的标准，就不能实现真正意义上的资源共享 9 。在基础医 学资源整合的同时， 要从我国国情出发， 建立一套符合我国资源现状 的、能够与国际接轨的标准规范，指导共享网建设科学高效进行。3 。23制定相应的法规政策：根据我

11、国资源整合面临的实际困 难，国家有关部门应该建立健全资源整合的法律法规， 明确规定科学 数据共享原则，界定数据共享范围。同时建立相应的补偿机制，出台 督促赏罚措施。 只有这样才能使科学数据共享有法可依， 促进科学数 据管理和共享，使其潜在的价值得以充分发挥 5 。3 。24做好数据分类和编码：实现基础医学资源整合要加强数 据分类的研宄，提高医药卫生数据资源的管理和共享程度 7 。3 。25培养多学科交叉的复合型人才：人才建设是保证资源整 合建设长期发展的前提。 因此在资源整合的过程中应该针对基础医学 的专业性需求， 培养一批优秀的跨学科人才， 保证资源整合的技术创 新性和服务全面性。4 小结 基础医学科学数据作为一种科研资源其价值只有广泛传播和使 用才能更大程度地发挥。 通过建立共享网实现资源的实质性优化整合 和广泛性互