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文档简介

1、聚类分析,5.3 八种系统聚类方法,正如样品之间的距离可以有不同的定义方法一样,类与类之间的距离也有各种定义。例如可以定义类与类之间的距离为两类之间最近样品的距离,或者定义为两类之间最远样品的距离,也可以定义为两类重心之间的距离等等。类与类之间用不同的方法定义距离,就产生了不同的系统聚类方法。本节介绍常用的八种系统聚类方法,即最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法、类平均法、可变类平均法、可变法、离差平方和法。系统聚类分析尽管方法很多,但归类的步骤基本上是一样的,所不同的仅是类与类之间的距离有不同的定义方法,从而得到不同的计算距离的公式。这些公式在形式上不大一样,但最后可将它们统一为一个公

2、式,对上机计算带来很大的方便,详见后。,5.4 系统聚类法的基本性质,5.5 附 注,Q型聚类 R型聚类,标记变量,增强可读性,距离计算方法 类间平均链锁法 类内平均链锁法 最近距离 最远距离 重心法 中间距离 离差平方和,数据标准化处理 默认不处理 R型 Q型,计算样本 距离方法 连续 顺序名义 二值,欧式距离 变量矢量余玄 相关系数 Che距离 Block距离 Min距离 自定义,树形图 冰柱图,纵向,横向,凝聚状态表,类成员构成,仅显示聚成n类时,各类的成员构成,有效样本个数,各样本的距离矩阵,聚类步骤 表示某步聚类分析中那两个样本聚成了一类 两样本或类间距离 参与聚类的是样本还是类 0样本 n是第n步产生的类,聚成3类时,样本的类归属情况表

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