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文档简介
兰州大学博士学位论文 1 前 言 原发性肝细胞肝癌(以下简称肝癌)是世界第五大最常见 恶性肿瘤 与第三大致命癌症 1肝癌的发病率在东南亚、中国以及撒哈拉 沙漠 以南非洲最高,而在西方国家相对较低 5。在世界范围内,肝癌的发病率在女性所有恶性肿瘤中位居第七,而死亡率位居第六;在男性所有的恶性肿瘤中,肝癌的发病率位居第五,而死亡率则位居第二 6。 男性发生肝癌的机率较女性高 。 在过去的 二三十年里,肝癌在西方发达国家如澳大利亚的发病率显著增加,预计到 2020 年将翻一倍 7。 据世界卫生组织统 计, 在 2008 年,全世界肝癌新发病例总 人数为748300,死亡总人数为 695900。 肝癌有着明确的危险因素,其中乙肝病毒 (丙肝病毒 (占比率达 80%以上 8在我国,乙型肝炎病毒 是 肝癌发生最主要的独立危险因素。 此外, 在中国由于环境 及食品 污染,药物 滥用问题日益严重,也对各种恶性肿瘤包括 肝癌的发生起有重要作用 。在澳 大利亚 , 主要原因,其感染者进展为肝癌的可能性比非感染者高出 27 倍13。肝癌的预后很差:在没有远处转移的病例, 5 年存活率也只有 28%, 而一旦发生局部或远处转移 时, 5 年存活率降至 3% (因此,我们迫切需要研究肝癌的分子发病机理,以期寻求敏感特异的肝癌标记物和新的治疗靶点,从而提高肝癌的早期诊断率,并开发更为有效的治疗策略与方案。 在全世界范围内,有超过 的慢性 染者。在澳大利亚,大约有291,000 个 染者,其中 75%为 活动期感染。若无有效治疗, 染者会进一步向肝纤维化发展,最终可发展成为肝硬化。一旦肝硬化出现,其每年发生肝癌的发病率将达到 414。 在 发的肝癌中, 蛋白在其发生发展中起关键作用 15 然而 在 导肝细胞 发生 恶性转化的机理依然没有被阐明。 与 同的是,一种 毒,缺乏基因整合能力。 该病毒可诱发肝脏的慢性炎症,使其发生代偿性再生, 炎症反应与肝细胞再生周而复始,反复相互作用,最终发生基因错配, 伤,肿瘤基质形成。除此之外,一些病毒蛋白可能与重要的细胞信号通路发生相互作用,从而促进肝 细胞 恶性转化 18, 在这些病毒中, 白被认为是最重要的 致癌 病毒蛋白。 心蛋白( 一种结构蛋白,它形成了病毒衣壳,同时 它可以和某 些与肿瘤形成相关的 信号通路发生相互作用。例如,小鼠肝细胞中过表达此病毒可发展成为肝细胞性肝癌 19, 20。 心蛋白通过激活 2 活化蛋白激酶( 1, 22、 8和转化生长因子 ( 23 来刺激肝细胞的增殖。 通过与 族蛋白 24、 磷脂酰肌醇激酶 3( 25、 6以及 7信号通路发生相互作用进而抑制细胞凋亡,促进细胞的增殖。 ),也被称作 。该基因 最初 被 发现于接受过全反式视黄酸处理后的人类支气管上皮细胞 28,之后发现其表达很广泛。该基因位于染色体3 3 个外显子和 2 个内含子组成,其蛋白集中于内质网( 高尔基体内,关于此基因其他报道相对甚少。 果蝇属 白同源,该蛋白是一个属于烯化的 体家族的小分子蛋白,在内质网与高尔基转运机制中起着一定 的作用 29。啮齿类动物脑组织富含该基因 。 小鼠中 该基因被称为为 大鼠中 则称为 神经元的分化以及调节发挥着作用 30中枢神系统中, 抗氧化防御,细胞信号转导,细胞增殖以及细胞凋亡中均起 着 必要的作用 33。 肿瘤的发生离不开癌基因与抑癌基因的改变,我们在前期胃癌的研究中显示,胃癌组织中,基因 发生了上调,该基因的上调同时影响着胃组织中相关基因( 达的变化 34。 因的突变与非小细 胞肺癌密切相关 35,前列腺素 酶通过活化早期生长因子 1 和 号轴促进肝癌的发生发展 36,基因 能是一种新型的肿瘤抑制基因,它可以通过调节 合蛋白的表达以及 导的信号通路而抑制乳腺癌的进展 37,在食管鳞状细胞癌的研究中,基因 证实为一种新发现的肿瘤抑制基因 38。 人研究发现 脂酶 肿瘤环境中促进肿瘤的生长和转移等 39。前列腺癌的研究中发现, 号通路被显著活化40其在结直肠癌中的表达增 高或被持续活化 43。 为一种新的前列腺癌生物标记物被发现,抑制 表达有助于前列腺癌的治疗44。有的基因则扮演双向或多重作用,大量研究表明, 化生长因子 )的效果是不同的,甚至是完全相反的,这完全取决于细胞的类型和周围环境,高干细胞多分化潜能同时增强细胞分化,抑制恶性癌前细胞却促进转移的发生 45。死亡结构域相关蛋白 可以促进凋亡的发生也可以扮演抗凋亡因子的角色,这取决于细胞的类型与外环境的不同, 人卵巢表面上皮细胞肿瘤的表达增高,但在卵巢颗粒细胞瘤中不增高 46。与其他许多基因在不同组织中生物学行为 一样 ,基因 肝组织及肝癌发生发展中如何发挥其功能与作用,目前还未曾有报道。 基 因 表 达 谱 尚有 争议 。 公 开 可 获 得 的 资 料 数 据 库兰州大学博士学位论文 3 ( 显示 ,来自大多数组织的肿瘤包括乳腺癌与肝癌在内,其表达水平高于相应的正常组织。相反地, 47%的卵巢癌 组 织 显 示 该 基 因 表 达 下 调 (在乳腺癌中, 人注意到 表达与肿瘤的大小,分级以及病人生存率无关 47。然而,另一个资料库显示 48, 表达水平越高,肿瘤的体积越小,同时可提高生存率。 因启动子( C) 中的高频率的单核苷酸多态性( 已经被报道是一个引起膀胱癌、胃癌、食管癌、绒毛膜癌以及鳞状细胞癌的独立危险因素 49 因结构中 高频率 出现 的 454C A 被认为是中国人 群中白血病的高危因素 52。然而, 体细胞中的突变还未曾在其他实体瘤中注意到 。 迄今,对 肿瘤的发生发展过程中所起的生物学作用研究甚少。已有报道指出, 促进 胞 发生 凋亡 的作用 , 而此作用是 通过C/介导 53。 此外 , 多项研究表明, 在宫颈癌细胞、乳腺癌和白血病细胞中,全反式维甲酸与环境应激( 如 热休克,氧化应激 等 ) 所导致的 抑制增殖与促 进 凋亡 作用都有 导 作用的参与 54敲除 白血病细胞 发生凋亡的能力明显下降 56。 然而,也有 其他研究者发现, 导细胞的增殖 57 但却抑制细胞的迁移 58。例如,过 渡 表达 宫颈癌胞 的 迁移 能力明显下降 , 而此变化很可能是 通过 号通路 的抑制 作用 而实现。相反, 当 乏时, 细胞的 迁移 能力增强 59。此外,还有报道表明 软组织肿瘤的局部侵袭及转移行为密切相关70。 但是有些报道表明, 肿瘤 细胞 中的 作用 很可能 随着 细胞 的 类型以及细胞所处 的环境不同而 异。例如, 过 渡 表达 C/ 癌细胞株)细胞中 启动子活性 明显受到抑制。 然而 ,在 过 渡 表达 C/胞中 , 动子的活性 却明显地增强 53。 正常 肝组织 以及 肝癌 的 发生发展中 起什么 作用,目前还未曾有报道。但目前有些研究结果显示,在 基因结构中, 邻近启动子区域 存在着与氧化应激反应密切相关 的结构,这些结构上 存在 热休克反应元件 ( 和应激反应元件( 28。 与此 相一致的 研究表明, 当乳腺癌细胞接受氰戊菊酯或 理时,会导致 达的 增高,同时会出现 表达 增加和 8 羟基脱氧鸟苷( 8的生成 增多,而后者 是一个 反映 有力的 标志物 55, 60。 因此,推测 细胞的应激反应密切相关。 兰州大学博士学位论文 4 众所周知, 导致肝癌的最重要原因之一。同时,已经很明确地知道, 肝脏诱导氧化应激和内质网应激,这 也 是 致 肝损伤的经典机制之一61, 62。 临床上也观察到,在 染 者 的肝脏 及血清 中, 氧化应激标志物 ( 包括 8 4) 的 水平明显增加 63一些病毒蛋白与氧化应激的产生 密切 相关, 如 心蛋白 就 存在于线粒体膜上 ,而线粒体 膜也是氧化应激的发生地所在 66. 同时核心蛋白 也 与内质网应激相关 。 表达核心蛋白的转基因小鼠显示出脂质过氧化, 伤 增加 和肿瘤的形成 机率增多 67。 而 非结构蛋白 氧化应激中也扮演者中间介质的角色 。如 以活化 化酶 2, 进而产生活性氧( 68。 同样,当 合在内质网上时会刺激线粒体活性氧的产生 69。基于 这些结果 ,我们推测 导 的 氧化应激 有可能 导致 表达上调, 而后者在病毒感染诱导的慢性炎症和 肝癌 的发生过程中起有重要作用 。 本研究旨在探讨 肝癌,特别是在 关性肝癌的发生过程中是否起有重要作用。 兰州大学博士学位论文 5 第一部分 肝癌 组织及 胞 中的表达 肿瘤的发生是癌基因与抑癌基因之间 原有 平衡 发生紊乱 的结果 。 基因突变引起基因表达的改变, 进而引起其编码的蛋白发生功能异常,而 蛋白水平发生的变化最终引起细胞行为学的改变, 如 细胞的增殖 、 凋亡等 失控而最终形成肿瘤。 对于临床工作者以及 肿瘤 患者 而言 ,最关心的问题则是肿瘤的治疗问题。随着人类基因组概要完成的宣布, 肿瘤 的靶向治疗已成为 颇具潜力的治疗 各种 手术无法切除的恶性肿瘤的 关键点。 如前所述, 肝癌中 的生物学作用目前尚 未有过报道。 因此,该基因在肝癌的发生发展中究竟有无作用,有何作用,如何起作用等是我们 本研究的主要目的。 在本章节中,我们的主要实验目的为: ( 1) 在人类 肝癌组织,特别是 关性肝癌组织中, 平和 蛋白水平的表达情况 , 并比较 癌组织与 癌旁组织 中该基因 的表达情况; ( 2)检测经过致癌剂 理的 小鼠肝脏 肿瘤 组织 和非肿瘤组织 中 表达情况; ( 3) 在人肝癌细胞株 染 心蛋白 后,检测 和 比较 该基因的表达情况 。 这 些实验结 果 会初步揭示 该基因在肝癌中的可能作用,并 为后续检测该基因的生物学功能实验提供明确的方向。 验材料 组织标本、细胞株和主要试剂 ( 1) 组织标本:所有人肝癌组织标本均由澳大利亚 院提供,其中包括 性病例和阴性病例,每个患者标本包括癌组织与癌旁组织; ( 2) 细胞株: 院细胞库提供); ( 3) 胎牛血清( 由澳大利亚 司提供; ( 4) 美国 公司 司提供; ( 5) 杜氏磷酸盐缓冲液( 由美国 公司 司提供; ( 6) 含有 胰酶( 10X):由美国 司提供; ( 7) 二甲基亚砜( 由美国 司提供; ( 8) 细胞计数板:由美国 司提供; 兰州大学博士学位论文 6 ( 9) 提试剂盒( :由中国台湾 ( 10) 录合成试剂盒: a. 转录酶, b. 转录酶缓冲液( 5X),由美国 司提供; ( 11) 由美国 司提供; ( 12) 18s 针: 5由美国 司提供; ( 13) :由美国 司提供; ( 14) 10X 美国 司提供 ; ( 15) 50美国 司提供; ( 16) 10mM 美国 司提供; ( 17) 250ng/美国 司提供; ( 18) 基因 物:正向引物: 5反向引物: 5由美国 司提供; ( 19) 白定量试剂盒:由美国 司提供; ( 20) 二烷基磺 酸钠 ):由美国生化试剂公司 供; ( 21) 美国生化试剂公司 供; ( 22) 甘氨酸:由美国 司提供; ( 23) 超纯三羟甲基氨基甲烷( :由澳大利亚司提供; ( 24) 过硫酸铵( 由美国 司提供; ( 25) 30%甲叉双丙烯酰胺混合液:由美国 司提供; ( 26) 美国 司提供; ( 27) 美国 司提供; ( 28) 号为 26619,由美国 ( 29) 硝酸纤维素膜 (编号为 162美国 司提供; ( 30) 脱脂奶粉:由澳大利亚 粉公司提供; ( 31) 牛血清白蛋白( 由美国 司提供; ( 32) 无菌去离子冲洗水( :由澳大利亚 疗公司提供; ( 33) 抗: 抗人抗体,由美国 司提供; ( 34) 抗: 抗人单克隆抗体,由美国 司兰州大学博士学位论文 7 提供; ( 35) 抗: 抗人单克隆抗体,由美国 司提供; ( 36) 一抗: 4370S, 2)(兔抗人单克隆抗体,由美国 司提供; ( 37) 抗: 4631S, 兔抗人单克隆抗体,由美国 司提供; ( 38) 抗: 9255S, 鼠抗人单克隆抗体,由美国 司提供; ( 39) 二抗:抗兔,由美国 司提供; ( 40) 二抗:抗鼠,由美国 司提供; ( 41) 敏感化学发光试剂盒 ):由美国 司提供; ( 42) 通化学发光试剂盒 ):由美国 司提供; ( 43) 高性能化学发光片:由英国 司提供; ( 44) 显影液:由比利时 疗公司提供; ( 45) 定影液:由比利时 疗公司提供; ( 46) 细胞培养瓶( 美国 司提供,英国制造; ( 47) 吸管( 25102550美国 ( 48) 细胞培养多孔板 : 6 孔, 12 孔, 24 孔, 48 孔, 96 孔,由美国 ( 49) 50ml 丙烯锥形收集管):由美国 司提供; ( 50) 15ml 丙烯锥形收集管):由美国 司提供; ( 51) 无菌细胞冻存管: 德国 司提供; ( 52) 微量可调移液器: 210202001000德国 ( 53) 微量移液器过滤枪头: 10202001000美国 司提供; ( 54) 量离心管:由美国 司提供。 兰州大学博士学位论文 8 相关溶液的配制 ( 1) 含 10%胎牛血清的细胞培养基:将一支分装好的胎牛血清从 箱取出,放入 37水浴箱,大概 15 分钟由冰冻状态溶解为液态,取出放入超净台,同时将一瓶购买好备用的 500入超净台,将溶解好的胎牛血清 56入 500 ,配成含有 10%胎牛血清的 封好瓶盖,将其放入 4储藏室保存。 ( 2) 1X 胰酶:将含有 胰酶( 10X)使用杜氏磷酸缓冲液( 行 10 倍稀释,稀释成为工作浓度的胰酶, 1酶,加入 9封好瓶盖,将其放入 箱保存,以上操作均为无菌操作,需在超净台下进行稀释。 ( 3) 细胞冻存液( 10% 从 箱中取出一支分装好的胎牛血清,将其放入 37水浴箱中,大概 15 分钟后溶解,取出放入超净台,将一支未打开的 5装的 入超净台,并打开,将其加入 45胎牛血清中,配成含有 10% 90%胎牛血清的细胞冻 存液,混匀后, 箱保存。 ( 4) 细胞组织蛋白抽提缓冲液( :总体系为 1L,所需加入试剂如下, 50 1M 150 1M 化钠) ,50M 化钠), 5000,2 二胺四乙酸), 2 二醇四乙酸酯),加入 3蒸水)至总体积为 1L。此缓冲液可长期保存于室温 中,每次使用时,需使用此缓冲液来配制新鲜蛋白裂解缓冲液。 ( 5) 新鲜蛋白裂解缓冲液( :此缓冲液只能每次使用时新鲜配制,配好之后,置于冰上,一个小时之内用完。配方如下, 5M 硫苏糖醇 ), 4 125甲基磺酰氟 ,蛋白酶抑制剂 ), 200 氏蛋白酶抑制剂混合物,25X), 10 500酸钠 ), 50甘油 , 50乙二醇辛基苯基醚) ,加水至 5匀并使用。 ( 6) 10%过硫酸铵( 以 10总体系,将 1g 过硫酸铵溶于 104保存。 ( 7) 离胶( 10%):以 10总体系,所需试剂及其体积分别为, 蒸水), 30%丙烯酰胺混合液, 10% 10%4 兰州大学博士学位论文 9 ( 8) 离胶( 12%):以 10总体系,所需试 剂及其体积分别为, 蒸水), 30%丙烯酰胺混合液, 10% 10%4 ( 9) 缩胶( 5%):以 6总体系,所需试剂及其体积分别为, 蒸水), 30%丙烯酰胺混合液, 60 10%60 10%6 ( 10) 10X 泳缓冲液( 以 1L 为总体系,所需试剂及其量分别如下, 30g 44g 甘氨酸 ,10g 先溶解在 700蒸水中,进行搅拌充分混匀,然后继续加入双蒸水至 1L,室温保存,每次使用时,将其进行 10 倍稀释,然后使用。 ( 11) 4X 样缓冲液: 200400硫苏糖醇 ),8%酚蓝, 40%甘油,室温保存,用时再加 8%。 ( 12) 10X 膜缓冲液( 以 1L 为总体系,所需试剂及其量分别如下, 30g 144g 甘氨酸 ,加入双蒸水至 700充分搅拌混匀,定容至 1L,室温保存。 ( 13) 1X 以 1 1000X 膜缓冲液,加入甲醇 200去离子水至 1L, 4保存。 ( 14) 10X 冲液:以 2L 为总体系,所需试剂和剂量分别为, 入去离子水至 进行充分搅拌混匀,使用浓盐酸( 调整 至 大概需要 80用 监测仪进行实时监控,当 ,继续加入去离子水至 2L,室温保存,避光。 ( 15) 1X 缓冲液:以 1L 为总体系,用 50管分两次从 10X 00入 45%的 4005%的 水定容至 1L,4保存。 ( 16) 5%脱脂奶粉:奶粉 5g,加入 100X ,充分搅拌混匀, 4保存。 ( 17) 5%0X ,充分搅拌混匀, 4保存。 ( 18) 1:1000 一抗: 10体,加入 10%脱脂奶粉或 5%充分搅拌混匀, 存。 ( 19) 1:10000 一抗: 1体,加入 10%脱脂奶粉或 5%充分搅拌混匀, 存。 ( 20) 1:10000 二抗: 1体,加入 10%脱脂奶粉或 5%充分搅拌混匀, 存。 兰州大学博士学位论文 10 相关仪器设备 ( 1) 养箱:由美国 司提供; ( 2) 细胞培养用超净台:由澳大利亚 司提供; ( 3) 电子秤: 日本 司提供; ( 4) 分光光度计: 美 国 司提供; ( 5) 时荧光定量 :由美国 司提供; ( 6) 涡旋混合器:由美国 司提供; ( 7) 通用台式摇床:由美国 司提供; ( 8) 组织均质器:由德国 司提供; ( 9) 干式加热器:由澳大利亚 司提供; ( 10) 迷你微孔板离心机:由美国莱伯特( 公司提供; ( 11) 制冰机: 日本星崎 ( 司提供; ( 12) 37孵育箱:由德国 司提供; ( 13) : 700,由美国 供; ( 14) : CR 美国 司提供,英国制造; ( 15) 变压器: C,由美国 司提供; ( 16) 变压器: 200/美国 司提供; ( 17) 小型台式高速冷冻离心机: 5424R,由德国 司提供; ( 18) 超速低温离心机: 德国 造商提供; ( 19) 流体动力通风橱:由澳大利亚 司提供; ( 20) 普通荧光显微镜 : 日本奥林巴斯公司提供; ( 21) 显影定影仪: 德国 司提供,中国注册。 验方法 胞的培养、冻存与复苏 ( 1) 细胞的培养:来自 病研究所培养好的第二代 胞株(肝癌细胞株),培养于 养瓶中,生长状态良好,将其放入超净台,取出配好的含 10%血清的 全培养基),将其加入 3 支新的 养瓶中,每瓶加入 10生长好的培养瓶打开,弃去上清液,加入温热好的 行冲洗 1,弃去 入 2X 胰酶,盖好瓶盖,来回轻轻摇晃,使 胰酶平铺于培养瓶中,将其放入 37孵育箱中,大概 3分钟后(由于 胞株贴壁能力很强,需要较长时间胰酶的消化作用),兰州大学博士学位论文 11 取出,肉眼观察,可见大片细胞从瓶壁上逐渐脱落,镜下观察,细胞突起消失并回缩,外周变圆,变钝。放入超净台,打开,即刻加入 5全培养基,此时,培养基中的血清可终止胰酶的消化作用,防止胰酶进一步作用而损伤细胞,用吸管来回吹打大概 50,这样的作用可使细胞尽量分散为单细胞,吹打好之后,将其分别加入三个已配好的新鲜培养基中( 1/3 传开),置于 37 ,含 5%培养箱中。每天在显微镜底 下观察其生长状态,一般首先置于低倍镜下 (10察 ,主要有细胞生长密度,细胞的形态,细胞生长指数等。细胞生长状态很重要,当受到污染时,会影响后续实验结果,包括各种基因蛋白在细胞中的表达情况,一般的污染容易发现,但是当感染支原体时,很难在显微镜下观察到,主要鉴别点在于其生长速度明显慢于正常情况,当感染程度严重时,在高倍镜下观察,可以看到细泥沙样改变,但是很难明确鉴别。一般当细胞生长密度达到 50%时为最佳状态,此时可以进行传代或者后续实验,最高生长密度不要超过70%,否则会影响各类因子的正常表达。当进行细 胞传代时,先弃去上清液,使用 洗 1,加入胰酶消化等,如前所述,方法一样。 ( 2) 细胞的冻存:当细胞生长代数处在早期时,可以大量传代培养一批细胞,冻存起来,可以以后随时复苏使用。一般选择大培养瓶( ,培养 5其生长密度达到 50%,开始收集细胞。首先,如前所述,弃去培养液,使用 行冲洗,然后加入 3X 胰酶于每个大培养瓶中,放入 37细胞培养箱中,大概 3 分钟,取出,加入完全培养基 5止胰酶作用,开始吹打细胞,将所有培养瓶中细胞吹打下来,混合在一个 无菌的 50料离心管中,开始离心, 800 4出后立即弃去上清液,加入 10吹打混匀,再次离心, 800 4出后立即弃去上清液,尽量将 干净,此时加入事先已经配好的细胞冻存液(含 10% 胎牛血清),要逐渐少量加入,否则会杀死更多的细胞。以 5 个大培养瓶计算,一般需要 15存液,混匀后,将其分装于 10 个冻存管中,密封好,贴上标签,包括日期,名称,以及细胞的代数(比如 第六代),实验人员的姓名等。放入细胞管架上,将细胞管架放入一个白色 泡沫盒中,盖上盖子,里面有较大空间(这样细胞的温度可以逐渐下降,以免速冻而冻伤或冻死细胞),密封好放入 箱中,第二天将其取出,将细胞冻存管移至普通试剂储存盒中,一般可保存 1 年。 ( 3) 细胞的复苏:首先,准备好完全培养基,预热培养基,之后放入超净台,吸管吸出 15养液加入一支新的中培养瓶中( 此时,从 兰州大学博士学位论文 12 箱中取出一支冻存的 胞株,将其取出后迅速放入 38水浴锅中,此时可用手拿着在水浴锅中进行来回摇晃,使其溶解,大概需要一分钟,拿出后放入超净台,打开,小心缓慢的使用加样枪将其吸出再加 入含有新鲜培养基的培养瓶中,盖好瓶盖,来回轻轻摇晃,置于 37, 5%胞培养箱中。这里有个原则:慢冻快溶,冻存细胞时,使其温度逐渐降低,溶解细胞时,使其温度迅速升高,这会把对细胞的损伤降到最低。刚才的操作中,没有进行离心并弃去冻存液,这是由于离心对细胞的损伤远大于残留的 细胞的损伤,而且加入培养基后, 浓度已由原来的 10%降至小于 1%,因此我们选择不离心。观察细胞,一般过夜后,为细胞换新鲜培养基,首先弃去上清液, 洗 1,直接加入新鲜完全培养基,观察细胞生长状态,当细胞生长 密度达到 50%时,可进行传代,一般刚刚复苏的细胞,需要传代 2后方可使用,使其细胞内各因子的表达恢复到正常状态,后续细胞培养方法与之前所述一样。(所有实验室的任何操作,需全程戴实验室专用手套和白大褂)。 织标本的收集 ( 1) 人肝癌组织:所有人肝癌组织及癌旁组织均由 院手术外科医生提供,由 病研究所乔梁教授收集并核查,组织均为新鲜标本,并冻存于 箱中,所有获得的组织均受到患者本人及其家属的同意,每个标本存于冻存管中,每个冻存管都贴上相关标签,包括标本的编号及其是否 性, 每组标本均由一对组成,癌组织与癌旁组织。共 8 对组织, 4 对 性, 4 对 性。 ( 2) 急性 理小鼠肝组织:从获得小鼠到拿到肝组织,均由 病研究所 士后完成并予提供。组织标本为, 6龄小鼠,一次性腹腔内注射 150mg/ 二 乙 基 亚 硝 胺 ) ,分别在 0h ,12h,24h,36h,48h,72h,96h,144h 给予小鼠安乐死,同时摘取小鼠肝组织。 ( 3) 慢性 理小鼠肝组织:从获得小鼠到拿到肝肿瘤组织,均由 授研究小组完成并予提供。 组织标本为 经过 48 周理后形成的小鼠肝肿瘤组织: 2 周龄小鼠,一次性单剂量腹腔内注射 50mg/重),经过 48 周的正常饲养后,行安乐死,并摘取小鼠肝癌组织及非癌肝组织 。 ( 4) 第 1 代 相同代数 胞株:由 病研究所 1 代 胞株是指在普通 胞株感染 13 核心蛋白 录 后经过第一次传代以后所获得的细胞,亦即第 1 代感染 胞株,而这里的普通 胞株可以是 50 代)以内的细胞 株,在感染 后的 般在5 代以内均可使用,其转染效率在 5 代以内可维持至 70%以上,第 2,3 代最佳,均能达到 90%以上, 5 代之后会迅速下降,不能使用。 时荧光定量 测 织 提取:首先,获取一些干冰置于一个大小适中的白色泡沫盒内,将获得的组织从 箱中取出,置于干冰上,拿出少量干冰放于一个不锈钢托盘底下,使托盘低温冷却。此时切取每个标本组织,从干冰中取出一个标本,用镊子拿出,放于托盘上,使用实验室解剖刀进行切割,切取大小为大概30右,第一块组织可进行称 重,其余肉眼观大小同前差不多即可,切取后迅速将其置于 心管中,置于干冰上,每个组织标本的切取方法一致。切好之后,准备 提液,从 提试剂盒中取出 解液,使用前,每 1加入 10巯基乙醇。具体实验步骤如下: ( 1) 加入 350解液(含 每个离心管中,裂解液会在干冰环境下迅速结为固态,每个离心管中加入一个不锈钢金属小球(匀质专用),全部加好后,将其置于匀质器内,开始振荡, 302 ( 2) 取出离心管,室温放置 3心吸出全部上清液,转入一个过滤柱( 中 ,置于离心机内, 1100024; ( 3) 将过滤得到的澄清液转入新的离心管中,加入等体积( 35070%乙醇,来回吹打混匀; ( 4) 将上述混悬液转入 型柱 ), 110000 ,弃去过滤液; ( 5) 加入 500 于每个柱子中, 1100010,弃去过滤液; ( 6) 加入 750 于每个柱子中, 1100010,弃去过滤液; ( 7) 重复步骤 6; ( 8) 将含有柱子的离心管继续放回离心机内, 14000 速) ,30 ,此步用来干燥柱子; ( 9) 将柱子放入新的离心收集管中,每个收集管中加入 50 的去离子水,盖上柱子的盖子,室温放置 1去离子水完全浸透于柱子中的兰州大学博士学位论文 14 滤膜内; ( 10) 离心, 11000; ( 11) 弃去柱子,此时得到的过滤液则为 速置于普通冰上; ( 12) 使用 光光度计检测 度; ( 13) 贴上每个 本的编号以及浓度于每个收集管上 , 存。 胞 提取: ( 1) 首先,加入 350解液(含 每个孔(六孔板,细胞培养用)中,室温静置 3 分钟; ( 2) 加入等体积( 35070%乙醇,来回吹打混匀; ( 3) 将上述混悬液转入 型柱 ), 110000 ,弃去过滤液; ( 4) 其余步骤同组织 提取(第 5 步以后)。 合成:首先计算所需 体积,以 10总体系,一般合 成 需要的 500体如下: ( 1) 2O= 500 ( 2) 10=( 3) 随机引物( 250ng/=( 4) 混合上述试剂,置于 66 ,5即迅速将其放置冰上 1( 5) 加入 转录酶, 2转录酶缓冲液( 5X), ( 6) 吹打混匀,置于 37 ,1 小时 时 10 分钟, ( 7) 将合成的 于 箱中。 时荧光定量多聚酶链反应): ( 1) 管家基因 18s 探针):以 20总体系,所需试剂及其剂量如下:10X 210mM 50:18s 家基因) 离子水: ( 2) 目的基因(引物):以 20总体系,所需试剂及其剂量分别如下: 2X 10游引物( 10M) : 1游引物( 10M) :1离子水: 35 ( 3) 上述体系配好之后,开始上机( 时荧光定量 )进行扩增反应,反应条件分别为: 18s:第一阶段,预变性, 95 /3二阶段,变性 95 /15(40 个循环 )。由于我们所选用的管家基因 18s 探针,在分析结果时不会产生融解曲线( ,因此在第二阶段结束后,即可终止反应;目的基因:第一阶段,预变性,兰州大学博士学位论文 15 95 /20s,第二阶段,变性 95 /3(40 个循环 ),第三阶段,延伸反应, 95 /15 /15s(此阶段所需时间较长 ),在这里,我们所选用 的目的基因反应条件为 司推荐的标准条件,
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