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教育与争鸣沃登编辑如何阅读医学论文(七)如何阅读医学论文(七)Medline 数据库How to read a paperThe Medline databaseTrisha Greenhalgh1371928 年 ,Bertrand Russell 在介绍他的本文是系列文章 之 七 , 第1 6 篇 见本刊1 9 9 9 年及怀疑学随笔时写到“:人们对于某事物的本文要点2 0 0 0 年 各 期 , 最相信程度主要是依赖想象 ,而很少以事实为依据 。”医学信仰和以之为基础的临床实 践就是一个明证 。有关单独的科学事实是 否足以指导医学决策的争论从未间断过 , 但没有医生怀疑 ,在临床实践中发现和理 解以事实为基础的研究越来越显得重要 。Medl ine 数据库现有的馆藏医学文献超过 1000 万篇 , 其中约 1/ 3 的文献经美国国立医学图书馆 编译后 ,标引收录在大型的医学文献联机 数据库 (Medline 数据库) 中 。所有公司销 售的 Medline 数据库内容完全相同 ,只是不 同软件的指令有所不同 。目前市面上出售 的用于联机和光盘检索的 Medline 数据库 有两个版本 , 即 : OVID ( 奥维德技术 , Ovid technologies) 和 WinSPIRS ( 银盘信息 , Silver Platter Information) 。查找论文的途径有两个 : 一是通过数 据库中收录的任何词汇 ,包括标题 、文摘 、作者姓名及研究所名称中出现的词汇 ; 二 是通过限定的医学标题辞典 ,即通常所说 的医学主题词 (MeSH 词表) 。本文以 OVID 版本的数据库为例 ,通Medline 中并未标引所有的医学文 献 ,许多文章的分类是错误的利用文本词检索可以补充主题词检 索的不足为了提高检索的查全率 ,可以采用 “扩展”( explode) 指令 , 并避免使用 副主题词在屏幕上浏览标题比依赖软件检索 更容易找到最准确或最相关的文章过回答检索中常见的一些问题 ,举例说明 如何使用 Medline 。问题 1 :如何查找已知的论文答案 :根据字段后缀或文本词汇检索 数据库 (标题 、作者 、期刊 、研究所等) 。首先 ,进入论文出版年限所在的数据 库部分 , 在主菜单选择“数据库”( Alt2B ) 。如果已知论文的大致标题或期刊出版者 ,就可以采用标题和期刊的检索关键词或(此法更迅速) . ti 和. jn 等字段后缀进行检 索 。后一篇文章将于下期刊出。Unit for Evidence2Based Practice and Policy , Department of Primary Care and PopulationSciences , University College London Medical School/ Royal Free Hospital School of Medicine , WhittingtonHospital , LondonN19 5NFTrisha Greenhalgh ,senior lecturerp . greenhalgh ucl . ac . uk教育与争鸣例如 ,查找一篇记忆中两年前在 B ritish J ournalof General Practice 杂志上看到的文章1 , 题目似乎是 “Confidentiality and patientscasenotes”,可键入下列检索式 :1 Confidentiality. ti2 British journal of general practice . jn3 1 and 2以上步骤也可以一步完成 :1 Confidentiality. ti and british journal of general practice . jn这一步举例说明了逻辑运算符“and”( 逻辑和)的用法 ; 即帮助检索出符合两项设置的文章 。用 “or”(逻辑或) 则是单纯的将两项相加 。需要 注 意 的 是 , 从 1988 年 起 , B ritish Medical J ournal 在 OVID 软件中缩写为 BMJ ,而 J ournal of the American Medical Association 则缩写为 JAMA 。当检索 已知作者 (采用 haines2ap . au 的句法) 、研究所 (例如 , manchester . in) 或标题 ( 例如 ,evidence2based medicine .ti) 的论文时 ,可以试用其他有用的字段后缀 。问题 2 :如何解答特定的疑问答案 :通过合并两个或多个方面的广泛检索 (查 全) ,缩小检索范围 (查准) 。最近 ,一位母亲向我求助 ,她女儿患有神经性厌 食症 ,病情已经发展到为了阻止骨质疏松 ,医生要求 她使用口服避孕药的阶段 。尽管存在需要考虑的伦 理问题 ,但是这个要求似乎是合理的 。是否可以证 明在这种情况下使用口服避孕药真的能够预防长期的骨质丢失 ? 我决定利用 Medline 解答这个问题 ,这 要求对“anorexia nervosa”“、osteoporosis”和“oral contra2用于检索范围的字段后缀(OVID)句法含义举例. ab文摘中的词汇Epilepsy. ab. au作者Smith2r . au. jn期刊Lancet . jn. meMeSH 词表中的单个词Ulcer . me. ti标题中的词汇Epilepy. ti. tw标题或文摘中的词汇Epilepsy. tw. ui唯一的标志符号91574637. ui. yr出版年限87 . yr有用的副主题词( OVID)句法含义举例/ ae副作用thalidomide/ ae/ co并发症measles/ co/ ct禁忌证( 药物的)propranolol/ ct/ di诊断glioma/ di/ dt药物疗法depression/ dt/ ed教育asthma/ ed/ ep流行病学poliomyelitis/ ep/ hi历史mastectomy/ hi/ nu护理cerebral palsy/ nu/ og组织和管理health service/ og/ pc预防和控制influenza/ pc/ px心理学diabetes/ px/ th治疗hypertension/ th/ tu治疗药物( 药物的)aspirin/ tu然后屏幕会提示你是否想要“限制到核心问 题”。你是仅仅想要有关神经性厌食症的文献呢 ,还 是想要在文中顺便提到“神经性厌食症”的文献 ? 让 我们选择限制到核心问题 。下一步 ,屏幕上会提示 我们选择副主题词 , 但我们将暂时忽略 。选择“In2 clude all subheadings”( 包括所有副主题词) 。利用一 个简单的行命令 ,我们就可以实现这一步的检索 :2 3 anorexia nervosa/ceptives”等 3 个方面进行广泛的检索 。以下描述的“ 3 ”表示该术语是文章的主题内容 “,/ ”代表检索范围涉及 1992 年以来的文献 ; 在复制时 ,要确 保正在检索的数据库包括该范围 。键入 :1 anorexia nervosa由于没有键入字段后缀 ,OVID 系统会自动尝试 将你的指令“转化”为标准的医学主题词 ( 简化的 MeSH 词表和通俗所说的“mesh 术语”) 。( 注意 : 并 非所有的 Medline 软件包可以自动的将指令转化为主题词 。例如 ,用银盘检索软件时 ,需要输入标题 , 并点击“suggest”键) 。在本步骤中 ,屏幕上会显示出 “eating disorders”和“anorexia nervosa”,并要求选择意 义最相近的一个 。选择“anorexia nervosa”( 用空格键 突出显示文本 ,然后按“return”) 。MeSH 术语 。这一步可检索到约 750 篇文章 。同样 ,检索有关 osteoporosis ( 这也是一个 MeSH术语) 的文章 ,可以采用下面的行命令 :3 osteoporosis/可以检索出大约 2200 篇文章 。注意 : 在 OVID 中 ,如果你知道自己要寻找的题目是一个正式的 MeSH 术语 ,就应当在单词后键入斜杠 (/ ) 来省略转 化的步骤 。还应当注意的是 ,在这里我们没有使用3 ,因为 osteoporosis 不是我们要寻找的文章的核心 内容 。最后 ,输入“oral contraceptives”( 没有 3 和 / ) ,看看它的 MeSH 术语是什么 。你可以得到“contra2138英国医学杂志中文版 2000 年 8 月第 3 卷第 3 期教育与争鸣ceptives ,oral”,如果你已经知道 ,就可以直接采用下列命令 :4 contraceptives ,oral这一步可以检索出大约 1200 篇文章 。通过设 置数字 1 and 2 and 3 ,或键入下列单独的行命令 :5 3 anorexia nervosa/ and osteoporosis/ and contra2ceptives ,oral 将 3 步合并 。在所有步骤中共搜索了4000 多篇文章 ,并找到想要寻找的答案2 ( 如果没有 找到 ,仔细检查检索式 ,然后采用 Alt2B 命令 ,在前 5 年的数据库中尝试运行相同的检索式) 。问题 3 :如何迅速掌握某个特定主题的概况答案 : 利用副主题词和/ 或 ( and/ or)“限制性设 置 (limit set) ”的选项 。副主题词是 Medline 检索系统中的微调 ;它们将某个特定主题下的文章分为病因 、预防 、治疗等类 。 由于估计 Medline 中约有 50 %的文章被副主题词不 适当地或错误地分类 ,因此除非寻找一组非受控文章 ,我尽量不使用副主题词 。在屏幕上浏览 50 篇左 右的文章实际上并不需要花费太长的时间 。这样做 要比依赖“限制性设置”命令更易寻找到最适当的文 章 。“AIM journal (核心期刊) ”选项代表医学索引缩略本上列举的所有期刊 ,即“主流”医学期刊 。换句 话说 ,如果你想要查找有关护理而不是医疗保健方 面的文献 ,你可以限定设置为“nursing journals ( 护理 期刊) ”。这种方法在限定一大项设置方面优于查询 local holdings ( 局部存储) 。如果你对查看非英文文献不感兴趣 (即使文摘为英文) ,可以选择该选项 ,但 要记住 ,这是从你的设置中排除文章的一种非系统 性 (实际上有较大的偏差性) 途径3 。注意 :可以直接采用单纯的行命令来取代“limit set”功能键 ,例如 :9 limit 4 to local holdings10 limit 5 to human有用的“限制性设置”选项AIM journal ( 核心期刊) Abstract ( 文摘)Nursing journal ( 护理期刊) Local holdings ( 局部存储) Dental journal ( 牙科期刊) English language ( 英语语种)Cancer journal ( 癌症期刊) Male ( 雄性) Review articles ( 综述性文献) Human ( 人类)Editorials ( 述评) Publication year ( 出版年代)1 ( surrogate not mother ) . tw决定使用运算符“not ”是如何 ( 及应当) 在检索 过程中改进检索式的一个范例 ,远比绞尽脑汁设计出完美的检索式容易的多 。我采用截词符 找出所有与 某 个 词 干 有 关 的 单 词 , 例 如 mother 、mothers 、motherhood 等等 。 另一个排除不相关文献的方法是利用运算符“adj”将文本词检索压缩为相近的单词 。例如 ,术语 “home help”是在某一特定上下文中彼此相连的两个非常常见的单词组成 。可以采用下列方式将它们连 接起来 :1 home adj help . tw问题 5 :没有检出文献 ,或检出的文献量很小答案 :首先 ,不要使用副主题词或“限制性设置” 选项 。其次 , 采用文本词和 MeSH 术语共同检索 。 第三 ,掌握并常规使用“扩展”(explode) 命令 。许多重要文献的漏查不是因为检索策略有误 ,而是由于过分依赖有缺陷的转换系统 。因此 ,应当 采用一种“兼顾”的方法 ,利用文本词和 MeSH 术语 共同检索 。毕竟 ,写一篇有关糖尿病心理学方面的 文章而不提及“diabetes”、“diabetic”、“p sychology”或“p sychological”等词是困难的 , 所以截取词干“diabet. tw”和“p sychol . tw”可以补充 MeSH 术语“dia2 betes mellitus”与副主题词“/ px”( 心理学) 检索的不 足 。另一种预防不完全检索的重要策略是利用强大 的“扩展”命令 。MeSH 词表就象一棵树的枝干 , 例如“,哮喘”(asthma) 可以细分为“儿童性哮喘”( asth2问题 4 :检索出不相关的文献答案 :不断根据检索的中间结果改进检索式 。 一次检索通常可以检出许多与问题不相关的文献 。在这里使用逻辑运算符“not ”会有所帮助 。最近 ,我检索了临床药理学替代终点方面的内容 ,结果 检出数百篇我并不需要的文献 全是有关母亲期 的文献 。排除不需要文献的句法为 :ma in children) 、“职业性哮喘”( occupational asthma) 等等 。Medline 的索引编制人员被要求尽可能的使 用最专业的 MeSH 术语来进行项目的标引 。如果你 仅仅查询了“asthma”方面的文献 , 就会漏掉标引在 “asthma in children”下的文献 ,除非利用下列句法“扩 展”(explode) 了该术语 :1 exp asthma/英国医学杂志中文版 2000 年 8 月第 3 卷第 3 期139教育与争鸣问题 6 :不知道从何入口开始检索答案 :利用“置换索引”(permuted index) 选项 。 让我们以术语“应激 ( stress) ”为例 。这个词经常被提到 ,但是 ,寻找特殊类型的 stress 比较困难 ,而 将“stress”作为文本词进行检索又太不具体 。我们 需要了解不同类型的 stress 在 MeSH 索引中的位置 , 这样 ,当我们看到时 ,就可以选择我们想要的种类 。为了达到这个目的 ,我们可以采用 ptx 命令 ( 置换索 引) :1 ptx stress屏幕上会显示出许多选项 , 包括 post2traumatic stress disorder 、stress fracture 、oxidative stress 、stress in2continence 等等 。 当某个术语可能属于几个主题的范畴时 ,就可以使用“ptx”命令 。如果所要寻找的主题是一个专 用的 MeSH 术语 , 就可以采用树状 ( tree ) 命令 。例 如 :2 tree epilep sy将会 显 示 出 epilep sy 在 MeSH 索 引 中 的 位 置是“脑部疾病”( brain diseases) 的一个下位词 ,其 本身又可以分为 generalised epilep sy 、partial epilep sy 、 post2traumatic epilep sy 等等 。问题 7 :限制性设置丢失了重要的文献 ,但却没 有排除因方法学对检索内容性质不明确而检出的无 关文献答案 : 适用 EBQF 法 ( 以事实为依据的定性筛选) 。如果非常具体的检索仍然检出了几百篇文献 , 并且如果采用副主题词或限制性设置功能看来会丢 失有价值 (并且有效的) 的论文时 ,就应当插入表明 检索内容属性的字符串 ,将设置限制为治疗性的干 预 、病因学 、诊断方法或流行病学等方面 。此外 ,还 可以输入用以明确出版物类型 ,如随机对照试验 、系 统性综述或汇总分析等的字符串 。附录 1 列举了此类 EBQF 方法 , 这些是由世界 上某些最有经验的医学信息专家提供的综合检索策 略 。你可以将这些内容复制到你的个人电脑内 ,保 存并添加到你的主题检索菜单中 。英国 Cochrane 中 心 ( Summertown Pavillion , Middle Way , Oxford OX27L G;general cochrane . co . uk) 不久将提出确定队列 研究 、病例对照研究等方面的其他检索策略 。问题 8 :Medline 无法提供帮助答案 :搜索其他的医学和与医学有关的数据库 。 文献在收入 Medline 数据库时不排除有人为的错误 ,这些错误可能是由选择标引关键词的作者和 编辑 ,或进行副主题分类和打印文摘的图书馆员造 成的 。此外 ,对于索引收录的杂志 ,其某些部分并没 有收录在 Medline 中 (例如 ,BMJ 的新闻部分) 。根据一项估计 ,有 40 %本应收录在 Medline 中的文献 ,实 际上只能通过再次手工浏览全部期刊才能获得 。不 仅如此 ,许多重要的医学和与医学有关的期刊并未 完全被 Medline 收录 。据说 ,Medline 中没有全面收 录心理学 、医学社会学和非临床药理学等领域内的文献 。 如果你希望进一步扩大搜索其他的电子数据库 ,可以向所在地的图书馆员询问在哪里可以获得 以下的数据库 : AIDSL IN E 收录了 1980 年以来有关艾滋病和艾滋病病毒 ( HIV) 方面的文献 。 Allied and Alternative Medicine 收录了补充 药物和替代药物方面的文献 。 American Medical Association J ournals 提供 了 1982 年以来 JAMA 和美国医学协会出版的 10 种专业期刊的全文 。 ASS IA 一种实用的社会科学数据库 , 收 录了 1987 年以来的心理学 、社会学 、政治和经济等 领域的文献 ,以文摘形式收录 。 Cancer2CD 收 录 了 1984 年 以 来 SilverPlatter of CANCERL IT 和 Embase cancer 中的有关记 录 。其光盘版本每季度更新 1 次 。 CINA HL 护理及其相关卫生数据库 , 收 录了 1983 年以来护理 、健康教育 、职业治疗 、卫生保 健社会服务 ,和其他相关学科的所有文献 。其光盘版本每月更新 1 次 。 Cochrane Library Cochrane 对照试验注册 (Cochrane Controlled Trials Register , CCTR) , Cochrane 系统性综述数据库 ( Cochrane Database of Systematic Reviews ,CDSR) ,有效性综述文摘数据库 (Database ofAbstracts of Reviews of Effectiveness ,DARE) 和 Cochrane 综述 方 法 学 数 据 库 ( Cochrane Review Methodology Database ,CRMD ) 都是每季度更新 1 次 ; CDSR 中收 录的系统性综述的作者承诺周期性更新他们的综 述4 。140英国医学杂志中文版 2000 年 8 月第 3 卷第 3 期教育与争鸣 Current Contents Search 收录了 1990 年以来出版的现刊或过刊 。可用于查询最近时期内就某 一主题发表的文献量 。每周更新 1 次 。 Current Research in B rain 是英国国家进展性试验研究数据库 。 DHData (以前的 DHSS - Data) 英国卫生 部门索引的数据库 ,收录了 1983 年以来卫生服务和 医院管理方面的文献 。 Embase 集中收录了药物和药理学 ,及其 他生物医学专业方面的文献 。更新速度优于 Med2 line ,在欧洲文献的收录范围方面更广 。其光盘版本 每月更新 1 次 。 HELMIS 英国利兹 Nuffield 卫生研究所提供的卫生管理信息服务 ,收录了卫生服务管理方 面的文献 。 Psychlit 由美国心理学协会发行的机检版的心理学文摘 ;收录了心理学 、精神病学及其相关 课题方面的文献 ; 期刊的收录范围自 1974 年起 ,书 的收录范围自 1987 年起 (仅收录英语文献) 。 Science Citation Index 收录了文献中引用的参考资料 ,通常为作者 、标题 、文章本身引用的文 献 。可用于查找重点论文涉及的随访工作 ,并追溯 作者的地址 。 S HAR E 由伦敦国王基金图书馆提供 ;收附录 1 :经常使用的循证定性筛选(a) 治疗性干预( 如何进行 ?) 3 exp risk1 exp clinical trials 2 exp research design 4 1 or 2 or 33 randomized controlled trial . pt . (c) 诊断措施4 clinical trial . pt . 1 exp“sensitivity and specificity”5 ( single or double or treble or triple) . tw. 2 exp diagnostic errors6 (mask or blind ) . tw. 3 exp mass screening7 5and 6 4 1 or 2 or 38 placebos/ or placebo . tw. ( d) 流行病学9 1or 2 or 3 or 4 or 7 or 8 1 sn. xs( b) 病因学( 发病原因 ? 危险因素是什么 ?) ( 以上步骤可以检索到所有标引在“statistics”“, epidemiology”,1 exp causality “ethnology”,或“mortality”等副主题词下的文献 ,而主题词的2 exp cohort studies 范围则不限) 。附录 2 :最敏感的搜索字符串( 主要用于研究类文献)(a) 针对随机对照试验的最敏感的定性搜索字符串22 exp EVALUTAION STUDIES/1 RANDOMIZED CONTROLL ED TRIAL . pt . 23 FOLLOW UP STUDIES. sh2 CONTROLL ED CL INICAL TRIAL . pt . 24 PROSPECTIVE STUDIES. sh.3 RANDOMIZED CONTROLL ED TRIALS. sh. 25 (controlS or prospectiv or volunteer ) . ti ,ab.4 RANDOMIZED ALLOCATION. sh. 26 or/ 212255 DOUBL E2BL IND METHOD. sh. 27 26 not 86 SINGL E2BL IND METHOD. sh. 28 26 not (9 or 20)7 or/ 126 29 9 or 20 or 288 ANIMAL . sh. not human. sh9 7 not 8 10 CL INICAL TRIAL . PT在这些例子中 ,上面的例子代表受控的词汇 ,而下面的例子代表自由的文本词。如果检索运行的时间太长 ,可以省略 8 ,9 ,19 ,和 27 步检索式。11 exp CL INICAL TRIALS ( b) 确定系统性综述的最敏感的定性搜索字符串12 (clin adj25 trial ) . ti ,ab. 1 REVIEW , ACADEMIC. pt .13 ( single or double or treble or triple) 2 REVIEW ,TUTORIAL . pt .adj25 ( blind or mas ) . ti ,ab. 3 META2ANAL YSIS. pt .14 PLACEBOS. sh. 4 META2ANAL YSIS. sh.15 placebo . ti ,ab. 5 systematic adj25 review 16 random . ti ,ab. 6 systematic adj25 overeview 17 RESEARCH DESIGN. sh 7 meta2analy or metaanaly or (meta analy )18 or/ 10217 8 or/ 12719 18 not 8 9 ANIMAL . sh. not HUMAN. sh20 19 not 9 10 8 not 921 COMPARATIVE STUDY. sh 如果检索运行的时间太长 ,可以省略 9 、10 两步。英国医学杂志中文版 2000 年 8 月第 3 卷第 3 期141教育与争鸣录了已经发表的和正在进行的 ,有关黑人及其他少数族裔的 ,卫生和卫生服务领域研究的文献 。 Toxline 收录了 1981 年以来有关化学物 质和药物对生物系统的毒理学影响方面的文献 。 UN ICORN 是伦敦国王基金捐助建立的 主要数据库 。收录了卫生 、卫生管理 、卫生经济和社 会科学等方面的文献 。尤其侧重初级卫生保健和伦 敦市民的健康等领域 。感谢 Reinhard Wentz 先生、Jane Rowlands 女士、Carol Lefebvre 女 士 ,和 Valerie Wildridge 女士为本文提出建议。并对英国 Cochrane 中 心的 Carol Lefebvre 女士允许本文在附录 1 中转载 EBQFs 法致以谢 意。参考文献BMJ 1997 ;315 :18023(孔朝霞 译)为什么对照试验的治疗组分配要遵循随机化原则 ?Treatment allocation in controlled trials : why randomise ?Douglas G Altman , J Martin Bland自 1991 年起,英国医学杂志( BMJ )者选择一种治疗方案 ,但接受不同治疗的ICRF MedicalStatistics Group ,规定除少数合理的特殊情况外 ,不再刊登那些未经恰当地随机处理的实验结果1 。 其原因何在 ? 评价一种新疗法的最简单的 方法是将