毕业论文任务书2.doc

毕业论文(设计)任务书及成绩评定表 题 目 湖南石门雄黄矿矿坑水的生物多样性分析 学生姓名 向 小 明 指导教师 杨 宇 学 院 资源加工与生物工程学院 专业班级 生 物 技 术 0801 班 本科生院制中 南 大 学毕业论文（设计）任务书毕业论文（设计）题目 湖南石门雄黄矿矿坑水的生物多样性分析题目类型 实验研究 题目来源 教师科研题 毕业论文（设计）时间从 2012.3.1 至 2012.6.10 1. 毕业论文（设计）内容要求：1） 了解微生物浸矿的意义、现状、发展和研究方向。2） 查阅中英文文献，完成与研究内容有关的约3000-5000字的英文翻译。完成实验研究的方案设计。3） 掌握试验准备，试验操作及相关检测仪器的使用，掌握基本的科研方法。4） 掌握菌种采样、收藏、取样、接种等操作方法。掌握实验准备、培养基配制的操作方法。掌握菌种的液体培养、固体培养的实验方法和技术。 5） 完成以下实验：a)样品的采集和保存:b)提取细菌基因组DNA，琼脂糖凝胶电泳，及16s DNA序列的PCR扩增。 c)完成目的16S DNA序列在大肠杆菌感受态中的克隆。 d)获得单克隆子后，进行序列分析。 e)分析数据，绘制系统发育树。 f)通过实验研究，掌握科学研究的基本方法，培养综合运用专业知识分析 和解决问题的能力。 g)整理实验数据，完成毕业论文。 h)准备论文答辩。 1题目类型：(1)理论研究(2)应用研究(3)工程设计(4)工业艺术设计(5)其它2题目来源：(1)教师科研题(2)生产实际题(3)其它2. 主要参考资料:1杨宇，钱森，代沁芸，万民熙，黄芝英，师舞阳，邱冠周。湖南岳阳洞庭湖3 个样点的表层水体细菌多样性研究J生命科学研究，2005,12（4）2杨宇等，嗜酸氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化酶基因多态性研究。J遗传，2005,27 （5）生物群落多样性简介.上海市检测中心.3王献华. 生物多样性保护与利用的主要研究方向.资源科学.1994,4:16.4林先贵.胡君科土壤微生物多样性的科学内涵及其生态服务功能J.土壤学 报,2008.45 (5):892-900.5姚晓华.土壤微生物群落多样性研究疗法及进展J.广西农业生物科学.2008,27 (SI):8488.6郑璐，尹华群，刘学端等，德兴铜矿酸性矿坑水水样与底泥中微生物群落多 样性及其群落结构变化J.生态学报,2008.28(10).7陈平，李辉，牟伯中，油藏水样细菌群落16S rRNA基因的RFLP分析，微生 物杂志,2005.25(6).8揭雨成，邢虎成，鲁雁伟，康万利等，湖南石门、冷水江、浏阳3个矿区的 苎麻重金属含量及累积特征J.生态学报.2011,31 (3).9王振刚，何海燕，严于伦，杨云等，石门雄黄矿地区居民砷暴露研究J.卫生 研究.1999,28(1).10李莲芳，曾希柏，白玲玉，李树辉，石门雄黄矿周边地区土壤砷分布及农产 品健康风险评估J.应用生态学报.2010,21 (11).11曾敏，廖柏寒，曾清如，欧阳彬等，湖南郴州、石门、冷水江3个矿区As 污染状况的初步调查J.农业环境科学学报.2006,25(2).12刘许生，石门雄黄采矿史，J.国土资源导刊.2009,6(6).13郭腾飞，毛海霞,微生物多样性研究技术进展，J.山西师范大学学报， 2010,24(zl).14 Akihiro Ohnishi*,Shinko Abe,Shiho Nashirozawa,Sayaka Shimada,Development of a 16S rDNA primer and PCR-RFLP method for the rapid detection of genus Megasphaera and species level identification,JApplied and Environmental M2011, doi: 10.1128/AEM.00359-11 AEM.00359-11 15 Kornelia Smallaa,Miruna Oros-Sichlera,Annett Millinga.ect.Bacterial diversity of soils assessed by DGGE, T-RFLP ，SSCP fingerprints of PCR-amplified 16S rRNA gene fragments: Do the different methods provide similar results?JJournal of Microbiological Methods, 2007,7,69(3): 47047916 Kathrin Euringer,Tillmann Lueders.,An optimised PCR/T-RFLP fingerprinting approach for the investigation of protistan communities in groundwater environments.JJournal of Microbiological Methods,2008,10,75(2):262-2683. 毕业论文（设计）进度安排阶段阶 段 内 容起止时间文献查阅资料，翻译与研究相关的论文一篇2012.3.12012.3.10实验准备实验方案设计，实验试剂仪器及样品的准备2012.3.112012.3.20实验研究样品的采集； 细菌总DNA的提取及目的基因的克隆；目的基因在大肠杆菌感受态中的克隆；单克隆子的获得及16sDNA的序列分析；数据处理和系