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1、实验二 DNA的酶解,一、原理,所谓DNA酶解就是DNA被限制性内切酶切成大小不等的片段。可用于Southern分析或DNA体外重组等实验,限制性内切酶:共有三类,但只有第类识别位点和切点在相同部位,因而是实用的,这类内切酶通常识别DNA中46个核苷酸的顺序,识别的顺序为二重对称。酶解产生的DNA片段末尾可以是平齐末端(如Hae )或粘性末端(如EcoR I)。,限制性内切酶(restriction endonuclease),HpaI 5GTTAAC 3 3CAATTG 5 5GTT AAC 3 3CAA TTG 5,e.g. Hind I Hind II Hind III (流感嗜血杆菌中
2、三个酶 Haemophilus influenzaed)第一个字母(大写、斜体) 该酶的微生物属名第二、三个字母(小写、斜体) 代表微生物种名第四个字母(斜体) 代表寄主菌的株或型用罗马数码I、II、III等区分同一株具 有不同特异性的酶,命名:,应用:外源基因与载体的连接 (DNA连接酶),(1)互补粘端DNA或切口间的连接 5 ACGOH pAATTCGT 3 3 TGCTTAAp HOGCA 5 ATP、Mg2+ T4连接酶 5 ACGAATTCGT 3 3 TGCTTAAGCA 5,反应例解:,(2)平端连接5 C G AOH pC G T A 33 G C Tp OHG C A T
3、5 ATP、Mg2+ T4连接酶 5 CGACGTA 3 3 GCTGCAT 5,酶单位定义:在最适温度,最适pH条件下,一小时完全水解1g噬菌体DNA所需的酶量定为1个单位(u)。,二、方法,1取0.1glDNA溶液10l于一干净的0.5ml Eppendorf管中。 2加10Hind酶解缓冲液2l,0.4u/l Hind 5l,双蒸水3l,使反应总体积20l, 充分混匀。 3在37水浴中保温2hr,保温结束后加2l终止液,混匀。 4电泳观察酶解结果。,酶解体系,三、注意事项,1限制性内切酶较昂贵,且极易失活,要特别注意酶活力的保存,酶保存缓冲液一般有10mmol/LTris-HCl (pH7.4),50100mmol/L NaCl或KCl,lmmol/L DTT,100200gml BSA (保持蛋白浓度,使酶稳定),50甘油(存于-20不结冰,结冰反复解冻使酶失活) 2限制性内切酶用量极少,必须严格注意吸样量的准确性及全部放入反应体系中 3注意酶切时加样次序:水、缓冲液、DNA、最后才加酶 取液时,Tip要从溶液表面吸,以防Tip沾去过多酶,待用的内切酶要放在冰浴内,用后盖紧盖子,立即放回20冰箱,防止限制性
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