地方鸡保种效果评价技术规范

2DB13/TXXXX—XXXX地方鸡保种效果评价技术规范本文件规定了地方鸡保种效果评价的评价人员、评价频次、评价目的、评价方法、评价内容、结果判定等要求。本文件适用于河北省地方鸡保种场保种效果评价。2规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。DB32/T1974-2012地方鸡种保种场（基因库）管理规范第三次全国畜禽遗传资源普查技术规范3术语和定义本文件没有需要界定的术语和定义。4评价人员评价人员由家禽遗传育种、家禽疫病防控等领域具有高级职称专家组成，组成人数为奇数，不少于3人。5评价频次保种效果评价按照世代间隔，每年进行1次。6评价目的对地方鸡保种群工作进行动态监控，以便随时调整保种方案。7评价方法3DB13/TXXXX—XXXX7.1采样测定专家带队组织采样人员赴保种场进行采样，并将样本送至有检测资质的第三方公司进行检测。7.2现场查验现场查验保种群数量及种群外貌特征。7.3审核材料审核材料包括保种档案及第三方公司出具的测定报告。8评价内容8.1采样测定测定的指标和方法部分参考第三次全国畜禽遗传资源普查技术规范。8.1.1生长性能随机采集保种群的300日龄公、母鸡各30只，测定指标包括体重体尺及屠宰率等。8.1.2蛋品质随机采集产出后24h内的蛋样本60份，测定指标包括蛋重、蛋壳颜色、蛋黄比例、哈氏单位等。8.1.3肉品质随机采集上市日龄商品鸡公母鸡胸肉样20份，测定指标包括剪切力、失水率、肉色、PH等。8.1.4全基因组重测序按每个家系1公，2母进行血样采集，样本总数公鸡≥30只，母鸡≥60只，进行基因组重测序，获得全基因组水平合格有效SNP标记信息，计算保种群的遗传多样性（观察杂合度和核苷酸多样度）及基于ROH的近交系数等参数进行分析。8.2现场查验8.2.1保种群数量保种群家系数量不少于30个，上笼数量母鸡不少于450只，公鸡不少于90只。8.2.2外貌特征。种群外貌特征包括羽色、脚色，胫色、耳叶颜色、肤色，冠型、脚趾数量、蛋壳颜色等特征性特征，及各性状在群体中所占比例。8.3审核材料8.3.1保种档案信息5.3.1.1审核实际保种工作与保种方案与是否一致。4DB13/TXXXX—XXXX5.3.1.2审核生产性能测定记录、防疫记录、系谱孵化出雏记录、选配记录、繁殖性能记录等是否完整、科学、规范，记录须符合DB32/T1974-2012的规定。5.3.1.3查看繁殖性能记录，包括300日龄产蛋数、受精率、孵化率等，与品种标准进行比对。8.3.2测定数据5.3.2.1查看测定的体尺体重、屠宰性能及蛋肉品质的数据，与品种标准进行比对。5.3.2.2查看全基因组重测序报告，通过保种群的遗传多样性（观察杂合度和核苷酸多样度）及基于ROH的近交系数来判定群体近交状况。计算公式见附录A分子测定指标计算公式。9结果判定通过审核保种材料的规范性、完整性、科学性，遗传材料保存状况，比较世代间体型外貌等表型特征、生长性能、繁殖性能及分子检测数据与上世代鸡群记录以及河北省地方标准《太行鸡》（DB13/T2607—2017）、《坝上长尾鸡》（DB13/T748—2017）是否发生偏差来综合评价保种效果。保种效果评价结果根据各项评定指标量化（见附录B）评分得出结果，得分80分以上为合格。5DB13/TXXXX—XXXX1.观察杂合度观察杂合度He按式（1）计算：式中：Pi—第i种基因型的频率。2.核苷酸多样性核苷酸多样性π按式（2）计算：…………式中：Xi—第i个序列的对应频率Xj—第j个序列的对应频率Πij—两个序列之间不同位点所占百分比n—总样本数2.近交系数近交系数FROH按照式（3）计算：式中：LROH—基因组中连续性纯合片段（runsofhomozygosity，ROH）的总长度Lauto—基因组总长度。6DB13/TXXXX—XXXX表1地方鸡保种效果评分表指标分类评分指标具体指标赋分依据分值得分档案记录（10分）保种计划保种计划视其科学性、规范性赋分1保种技术方案保种技术方案1系谱选配方案1出雏记录视其完整性性赋分1免疫记录免疫记录1生长性能记录开产、43周龄体重视其科学性、规范性、完整性赋分1繁殖性能记录开产蛋重、300日龄蛋重1开产日龄1个体记录1受精率、孵化率记录1体型外貌特征（10分）体型外貌特征羽色、胫色、肤色等视与品种标准相比变化情况赋分5不同类群占保种群的比例5生长性能（10分）生长性能300日龄体重体尺5300日龄屠宰性能测定5繁殖性能（10分）繁殖性能300日龄产蛋数5受精率、孵化率5蛋肉品质（10分）蛋品质蛋重、蛋黄比例、蛋壳颜色等5肉品质剪切力、失水率、肉色、5实际群体数量（20分）实际群体数量保种群家系数量、每个家系公母鸡比例、常年存栏数量。40个家系，每家系公母鸡比例不低于1:5，群体数量400只以上得分子测定（30分）遗传多样性观察杂合度视与其他世代相比变化情况赋分5核苷酸多样性5有效群体数量采用家系等量留种方式