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文档简介
双小泛素样蛋白的化学合成、结构解析及其与结合蛋白的交联分析的任务书任务书一、任务背景和意义泛素(Ub)和其修饰在细胞生物学中扮演着重要角色,如蛋白质的降解、信号转导、DNA损伤修复、染色质调控、细胞周期调控等等。近年来,越来越多的研究表明,双小泛素样蛋白(diubiquitin,diUb)的结构和功能也非常重要,关键的一步便是通过合成的技术来获得理想结构、功效和规模的diUb。二、任务目标本任务主要目标是:1.合成diUb化合物;2.使用高分辨率质谱技术和核磁共振技术,对双小泛素样蛋白的结构进行解析;3.通过对diUb和结合蛋白的交联分析,在不同条件下分析两者结合情况。三、任务内容及阶段目标1.合成diUb化合物(1)合成diUb分子的单元:从泛素表达体系中纯化得到的泛素物质,经由酶、缬氨酸和酯化反应,可以在C端加入一分子羧基安全(BSA);而N-端则加入对羟基苯甲酸酯(FMOC),形成N-FMOC-UB-BSA结构。(2)合成diUb分子:通过核苷酸磷酸二酯缩合反应,将两份UB-BSA化合物连接起来,从而形成diUb化合物。2.对双小泛素样蛋白进行结构解析(1)使用质谱技术检测diUb化合物的纯度(2)使用核磁共振技术确定diUb化合物的结构3.对diUb和结合蛋白的交联分析(1)进行diUb和结合蛋白的结合反应(2)在不同条件下,如pH、温度、浓度、结合剂用量等,进行diUb和结合蛋白的结合反应,并通过交联试剂将二者交联,从而解析二者结合情况。四、实验条件和必要设备本任务所需实验条件和必要设备包括但不限于:(1)分子生物学实验室和设备,并具备常规蛋白表达、纯化和鉴定的能力;(2)高分辨率液质联用分析仪;(3)高分辨率核磁共振仪;(4)交联试剂、凝胶电泳仪、Westernblot仪等常规实验室设备。五、预期成果通过本次任务,预期可以完成diUb化合物的合成、结构解析和与结合蛋白的交联分析,进一步揭示双小泛素样蛋白的结构和功能,为之后针对泛素家族的药物研究提供重要的基础数据和理论依据。六、实验流程实验流程如下图所示:七、安全注意事项1.实验室使用前,必须熟知实验室安全操作规程和应急预案。2.操作前需佩戴良好的实验服和手套,操作过程中注意反应溶液的温
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